More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0433 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_0433  30S ribosomal protein S9  100 
 
 
132 aa  271  3e-72  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0713606  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1031  30S ribosomal protein S9  74.24 
 
 
132 aa  216  1e-55  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.791116  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1345  30S ribosomal protein S9  62.69 
 
 
134 aa  175  2e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00368639  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1341  30S ribosomal protein S9  62.69 
 
 
134 aa  175  2e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000324124  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0800  30S ribosomal protein S9  57.78 
 
 
135 aa  158  3e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.435176  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1940  ribosomal protein S9  59.09 
 
 
129 aa  149  1e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2069  30S ribosomal protein S9  57.89 
 
 
130 aa  147  6e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000831765  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2297  ribosomal protein S9  54.14 
 
 
130 aa  145  1.0000000000000001e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000207473  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1537  30S ribosomal protein S9  58.46 
 
 
128 aa  144  3e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000000611504  normal  0.14818 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0331  ribosomal protein S9  55.64 
 
 
130 aa  144  5e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00016739  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0006  ribosomal protein S9  56.25 
 
 
133 aa  143  7.0000000000000006e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.819912  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1782  30S ribosomal protein S9  56.39 
 
 
130 aa  143  9e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000024243  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01520  ribosomal protein S9  57.58 
 
 
131 aa  141  3e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000216085  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1735  30S ribosomal protein S9  53.85 
 
 
131 aa  141  3e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0401133 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02470  ribosomal protein S9  57.58 
 
 
131 aa  141  3e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000158686  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0230  SSU ribosomal protein S9P  56.92 
 
 
132 aa  140  5e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000443747  normal  0.670048 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3627  30S ribosomal protein S9  55.47 
 
 
130 aa  139  9.999999999999999e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000023775  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2399  ribosomal protein S9  55.73 
 
 
130 aa  139  9.999999999999999e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.696602  normal  0.066769 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3665  30S ribosomal protein S9  55.64 
 
 
130 aa  139  1.9999999999999998e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0023412  normal  0.0755267 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00882  30S ribosomal protein S9  55.64 
 
 
130 aa  138  1.9999999999999998e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0321  30S ribosomal protein S9  54.14 
 
 
130 aa  139  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000288169  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3638  ribosomal protein S9  54.89 
 
 
130 aa  138  3e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00994207  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0600  30S ribosomal protein S9  55.12 
 
 
173 aa  138  3e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.190844  normal  0.458366 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2205  30S ribosomal protein S9  56.59 
 
 
135 aa  137  3e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0212  ribosomal protein S9  55.81 
 
 
131 aa  137  3e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000467508  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3796  ribosomal protein S9  54.89 
 
 
130 aa  138  3e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000182281  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03090  30S ribosomal protein S9  54.89 
 
 
130 aa  137  4.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000557445  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0476  ribosomal protein S9  54.89 
 
 
130 aa  137  4.999999999999999e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000601039  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3546  30S ribosomal protein S9  54.89 
 
 
130 aa  137  4.999999999999999e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000104404  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3713  30S ribosomal protein S9  54.89 
 
 
130 aa  137  4.999999999999999e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000596943  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3419  30S ribosomal protein S9  54.89 
 
 
130 aa  137  4.999999999999999e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000112038  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3525  30S ribosomal protein S9  54.89 
 
 
130 aa  137  4.999999999999999e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000016286  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03041  hypothetical protein  54.89 
 
 
130 aa  137  4.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000287646  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0476  30S ribosomal protein S9  54.89 
 
 
130 aa  137  4.999999999999999e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000111446  normal  0.163216 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4547  30S ribosomal protein S9  54.89 
 
 
130 aa  137  4.999999999999999e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000371086  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4348  30S ribosomal protein S9  54.89 
 
 
130 aa  137  7e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000012665  hitchhiker  0.00291766 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004510  SSU ribosomal protein S9p (S16e)  54.14 
 
 
130 aa  137  7e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000229051  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3536  30S ribosomal protein S9  54.89 
 
 
130 aa  136  7.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.0000037617  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3642  30S ribosomal protein S9  54.89 
 
 
130 aa  136  7.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000331692  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3704  30S ribosomal protein S9  54.89 
 
 
130 aa  136  7.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00817033  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3607  30S ribosomal protein S9  54.89 
 
 
130 aa  136  7.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000867127  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3535  30S ribosomal protein S9  54.89 
 
 
130 aa  136  7.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000799314  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1233  30S ribosomal protein S9  54.14 
 
 
130 aa  135  1e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000147442  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0104  30S ribosomal protein S9  54.89 
 
 
130 aa  135  1e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000569691  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0300  30S ribosomal protein S9  54.14 
 
 
130 aa  135  1e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00212654  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2678  30S ribosomal protein S9  52.63 
 
 
130 aa  135  1e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000125135  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2363  30S ribosomal protein S9  52.63 
 
 
130 aa  135  1e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000350135  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0461  30S ribosomal protein S9  55.64 
 
 
130 aa  135  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000140237  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0525  30S ribosomal protein S9  55.64 
 
 
130 aa  135  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000883336  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1133  30S ribosomal protein S9  55.64 
 
 
130 aa  135  2e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000113025  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0902  30S ribosomal protein S9  55.64 
 
 
130 aa  135  2e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000079624  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0753  30S ribosomal protein S9  55.56 
 
 
130 aa  135  2e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000116915  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2876  ribosomal protein S9  51.52 
 
 
129 aa  135  2e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0513337  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0293  ribosomal protein S9  54.14 
 
 
130 aa  134  4e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.000515876  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0795  30S ribosomal protein S9  54.89 
 
 
130 aa  134  4e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000718866  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2761  30S ribosomal protein S9  52.05 
 
 
143 aa  133  6.0000000000000005e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2634  30S ribosomal protein S9  52.05 
 
 
143 aa  133  6.0000000000000005e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1527  ribosomal protein S9  50.78 
 
 
132 aa  133  8e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000273794  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3939  30S ribosomal protein S9  52.67 
 
 
130 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0745  30S ribosomal protein S9  52.67 
 
 
130 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000051972  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0724  30S ribosomal protein S9  52.67 
 
 
130 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00489418  hitchhiker  0.0000321207 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0703  30S ribosomal protein S9  52.67 
 
 
130 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000775692  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3268  30S ribosomal protein S9  52.67 
 
 
130 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000222713  hitchhiker  0.0000090404 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0679  30S ribosomal protein S9  52.67 
 
 
130 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000564509  hitchhiker  0.00025421 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2241  SSU ribosomal protein S9P  53.38 
 
 
130 aa  132  9.999999999999999e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.201316  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0733  30S ribosomal protein S9  52.67 
 
 
130 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000589004  hitchhiker  0.00344758 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0693  30S ribosomal protein S9  52.67 
 
 
130 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000579549  decreased coverage  0.00000193008 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3651  30S ribosomal protein S9  52.67 
 
 
130 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000456747  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3594  30S ribosomal protein S9  51.91 
 
 
130 aa  131  1.9999999999999998e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000165532  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0145  30S ribosomal protein S9  53.38 
 
 
130 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000670079  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2424  SSU ribosomal protein S9P  56.39 
 
 
130 aa  132  1.9999999999999998e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000332574  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0746  ribosomal protein S9  51.16 
 
 
134 aa  131  1.9999999999999998e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3293  30S ribosomal protein S9  53.44 
 
 
130 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000148641  hitchhiker  0.00108393 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2878  ribosomal protein S9  55.81 
 
 
180 aa  131  3e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4611  30S ribosomal protein S9  53.97 
 
 
162 aa  131  3e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0520803 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21980  SSU ribosomal protein S9P  53.49 
 
 
130 aa  131  3e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000149562  hitchhiker  0.00529045 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2206  SSU ribosomal protein S9P  56.82 
 
 
129 aa  131  3e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.453357  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0014  ribosomal protein S9  51.88 
 
 
130 aa  131  3.9999999999999996e-30  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0056  SSU ribosomal protein S9P  53.17 
 
 
130 aa  131  3.9999999999999996e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0128063  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0149  30S ribosomal protein S9  53.97 
 
 
162 aa  131  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0676  30S ribosomal protein S9  53.12 
 
 
133 aa  130  3.9999999999999996e-30  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.958847  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2471  ribosomal protein S9  54.76 
 
 
130 aa  131  3.9999999999999996e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0151898  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0221  30S ribosomal protein S9  50.39 
 
 
135 aa  130  5e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0143774  normal  0.010853 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1982  30S ribosomal protein S9  51.94 
 
 
133 aa  130  5e-30  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0810268  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf385  30S ribosomal protein S9  51.11 
 
 
132 aa  130  5e-30  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0579956  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0349  30S ribosomal protein S9  51.16 
 
 
133 aa  130  6e-30  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.842088 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3070  30S ribosomal protein S9  52.67 
 
 
130 aa  130  6e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000352838  normal  0.198807 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20520  SSU ribosomal protein S9P  56.69 
 
 
171 aa  130  7.999999999999999e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.476775  normal  0.598664 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2663  30S ribosomal protein S9  51.88 
 
 
130 aa  129  1.0000000000000001e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00134428  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4221  30S ribosomal protein S9  51.15 
 
 
130 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000135609  hitchhiker  0.000316349 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0748  30S ribosomal protein S9  51.15 
 
 
130 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000172866  normal  0.041404 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0224  30S ribosomal protein S9  49.61 
 
 
135 aa  129  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2679  ribosomal protein S9  53.38 
 
 
130 aa  128  2.0000000000000002e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0151101  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1624  30S ribosomal protein S9  51.94 
 
 
136 aa  128  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.567552  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1249  ribosomal protein S9  53.79 
 
 
131 aa  129  2.0000000000000002e-29  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3163  30S ribosomal protein S9  51.91 
 
 
130 aa  129  2.0000000000000002e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.247444  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0626  30S ribosomal protein S9  50.76 
 
 
130 aa  128  2.0000000000000002e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0605  30S ribosomal protein S9  50.76 
 
 
130 aa  128  2.0000000000000002e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17131  30S ribosomal protein S9  51.94 
 
 
136 aa  129  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0453537  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16511  30S ribosomal protein S9  51.94 
 
 
137 aa  128  3e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0633365  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>