More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2878 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_2878  ribosomal protein S9  100 
 
 		 180 aa  366  1e-101  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4345  30S ribosomal protein S9  52.03 
 
 		 160 aa  142  2e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.59912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3107  30S ribosomal protein S9  54.55 
 
 		 160 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.966484  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4591  30S ribosomal protein S9  51.3 
 
 		 160 aa  138  3.9999999999999997e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2069  30S ribosomal protein S9  56.56 
 
 		 130 aa  138  4.999999999999999e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000831765  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2697  30S ribosomal protein S9  51.61 
 
 		 161 aa  137  7.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.145825  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0790  30S ribosomal protein S9  49.67 
 
 		 158 aa  136  1e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.552498  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0786  30S ribosomal protein S9  49.67 
 
 		 158 aa  136  1e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.637937  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2496  30S ribosomal protein S9  49.67 
 
 		 158 aa  136  1e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4611  30S ribosomal protein S9  49.07 
 
 		 162 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0520803 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0149  30S ribosomal protein S9  49.07 
 
 		 162 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0244  30S ribosomal protein S9  48.07 
 
 		 165 aa  135  3.0000000000000003e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.411662 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2672  30S ribosomal protein S9  53.03 
 
 		 158 aa  135  4e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.569835  normal  0.132209 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2454  30S ribosomal protein S9  53.03 
 
 		 158 aa  133  9.999999999999999e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.812734  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0006  ribosomal protein S9  55.65 
 
 		 133 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.819912  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1163  30S ribosomal protein S9  52.27 
 
 		 160 aa  133  9.999999999999999e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.456788  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2708  30S ribosomal protein S9  53.03 
 
 		 158 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.421371  normal  0.509442 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2297  ribosomal protein S9  54.47 
 
 		 130 aa  132  3e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000207473  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3025  30S ribosomal protein S9  54.55 
 
 		 157 aa  131  3.9999999999999996e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.795745 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0433  30S ribosomal protein S9  55.81 
 
 		 132 aa  131  5e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0713606  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1422  30S ribosomal protein S9  51.52 
 
 		 158 aa  131  5e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.51395  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1379  30S ribosomal protein S9  49.04 
 
 		 159 aa  130  9e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0851685 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2679  ribosomal protein S9  55.74 
 
 		 130 aa  130  9e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0151101  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0138  30S ribosomal protein S9  57.72 
 
 		 130 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000590069  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1681  30S ribosomal protein S9  51.09 
 
 		 155 aa  130  1.0000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00362695  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1513  SSU ribosomal protein S9P  52.27 
 
 		 165 aa  130  1.0000000000000001e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.472306 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1321  30S ribosomal protein S9  45.73 
 
 		 155 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.243338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0176  30S ribosomal protein S9  56.91 
 
 		 130 aa  129  3e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000140848  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0144  30S ribosomal protein S9  56.91 
 
 		 130 aa  129  3e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000361179  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5160  30S ribosomal protein S9  56.91 
 
 		 130 aa  129  3e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000743375  hitchhiker  0.0000000912351 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0139  30S ribosomal protein S9  56.91 
 
 		 130 aa  129  3e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.11946e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0137  30S ribosomal protein S9  56.91 
 
 		 130 aa  129  3e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000359543  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0157  30S ribosomal protein S9  56.91 
 
 		 130 aa  129  3e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.4920599999999996e-31 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0166  30S ribosomal protein S9  56.91 
 
 		 130 aa  129  3e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00347352  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0861  30S ribosomal protein S9  51.52 
 
 		 155 aa  128  4.0000000000000003e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0415089  normal  0.103809 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3285  30S ribosomal protein S9  53.44 
 
 		 180 aa  128  4.0000000000000003e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2938  ribosomal protein S9  52.27 
 
 		 162 aa  128  4.0000000000000003e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000844995 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0051  30S ribosomal protein S9  53.17 
 
 		 128 aa  128  5.0000000000000004e-29  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1234  30S ribosomal protein S9  44.51 
 
 		 155 aa  127  6e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.745621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0139  30S ribosomal protein S9  56.1 
 
 		 130 aa  127  6e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000424807  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0902  30S ribosomal protein S9  45.57 
 
 		 161 aa  127  7.000000000000001e-29  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.829966  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0021  30S ribosomal protein S9  47.3 
 
 		 160 aa  127  8.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.849835  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1650  30S ribosomal protein S9  47.3 
 
 		 160 aa  127  8.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.377487 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2678  30S ribosomal protein S9  54.84 
 
 		 130 aa  127  9.000000000000001e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000125135  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2363  30S ribosomal protein S9  54.84 
 
 		 130 aa  127  9.000000000000001e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000350135  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0607  30S ribosomal protein S9  52.03 
 
 		 130 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000206629  hitchhiker  0.00149279 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1872  30S ribosomal protein S9  46.58 
 
 		 159 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.952658 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4594  30S ribosomal protein S9  54.07 
 
 		 188 aa  127  1.0000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0342  30S ribosomal protein S9  50 
 
 		 136 aa  125  2.0000000000000002e-28  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00140539  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0144  30S ribosomal protein S9  56.1 
 
 		 130 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133435  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0144  30S ribosomal protein S9  56.1 
 
 		 130 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000533856  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0902  30S ribosomal protein S9  52.85 
 
 		 130 aa  126  2.0000000000000002e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000079624  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1050  30S ribosomal protein S9  52.03 
 
 		 130 aa  126  2.0000000000000002e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000126027  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2583  30S ribosomal protein S9  54.47 
 
 		 130 aa  125  2.0000000000000002e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000028456  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1179  30S ribosomal protein S9  51.52 
 
 		 161 aa  125  3e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.554063  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2620  30S ribosomal protein S9  48.59 
 
 		 161 aa  125  3e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.159482 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2843  30S ribosomal protein S9  48.59 
 
 		 161 aa  125  3e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2175  30S ribosomal protein S9  47.3 
 
 		 160 aa  125  3e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0915323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0342  SSU ribosomal protein S9P  43.53 
 
 		 170 aa  125  3e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0651444  hitchhiker  0.00386337 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0600  30S ribosomal protein S9  49.22 
 
 		 173 aa  125  4.0000000000000003e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.190844  normal  0.458366 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3371  30S ribosomal protein S9  50 
 
 		 130 aa  124  7e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0767368  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3453  30S ribosomal protein S9  50 
 
 		 130 aa  124  7e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3517  30S ribosomal protein S9  50 
 
 		 130 aa  124  7e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.143376  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1476  30S ribosomal protein S9  51.54 
 
 		 166 aa  124  8.000000000000001e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.270542 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2249  30S ribosomal protein S9  44.38 
 
 		 163 aa  124  8.000000000000001e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1527  ribosomal protein S9  53.66 
 
 		 132 aa  124  8.000000000000001e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000273794  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2875  30S ribosomal protein S9  52.03 
 
 		 130 aa  124  9e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0195834  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3190  30S ribosomal protein S9  50.41 
 
 		 130 aa  123  1e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000452354  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2650  30S ribosomal protein S9  48.59 
 
 		 161 aa  123  1e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.550147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1470  30S ribosomal protein S9  50 
 
 		 171 aa  123  1e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.828818 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3038  30S ribosomal protein S9  52.38 
 
 		 128 aa  123  1e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0109364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3085  30S ribosomal protein S9  51.22 
 
 		 130 aa  123  1e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000996861  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0215  30S ribosomal protein S9  52.85 
 
 		 130 aa  122  2e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00249156  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0618  ribosomal protein S9  51.2 
 
 		 163 aa  122  2e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2151  30S ribosomal protein S9  47.68 
 
 		 158 aa  123  2e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.45731  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1782  30S ribosomal protein S9  52.85 
 
 		 130 aa  123  2e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000024243  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2120  SSU ribosomal protein S9P  54.47 
 
 		 130 aa  122  2e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.39803  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3436  30S ribosomal protein S9  50.81 
 
 		 131 aa  122  2e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.113849  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0913  ribosomal protein S9  50 
 
 		 129 aa  122  2e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000269489  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0128  30S ribosomal protein S9  52.85 
 
 		 130 aa  123  2e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000606121  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20520  SSU ribosomal protein S9P  51.56 
 
 		 171 aa  122  3e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.476775  normal  0.598664 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1601  30S ribosomal protein S9  44.52 
 
 		 164 aa  122  3e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.292372  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3731  30S ribosomal protein S9  54.33 
 
 		 137 aa  122  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0230  SSU ribosomal protein S9P  52.42 
 
 		 132 aa  122  3e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000443747  normal  0.670048 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3348  ribosomal protein S9  50 
 
 		 129 aa  122  4e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0614997 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0231  SSU ribosomal protein S9P  52.85 
 
 		 131 aa  122  4e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.0000192076  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1798  30S ribosomal protein S9  54.47 
 
 		 130 aa  121  5e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2241  SSU ribosomal protein S9P  52.85 
 
 		 130 aa  121  5e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.201316  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0795  30S ribosomal protein S9  52.03 
 
 		 130 aa  121  6e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000718866  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2425  30S ribosomal protein S9  43.14 
 
 		 164 aa  120  7e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.149157  normal  0.160414 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1031  30S ribosomal protein S9  52.76 
 
 		 132 aa  120  8e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.791116  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0839  ribosomal protein S9  49.3 
 
 		 145 aa  120  8e-27  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3796  ribosomal protein S9  50.41 
 
 		 130 aa  120  9e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000182281  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0402  30S ribosomal protein S9  49.6 
 
 		 133 aa  120  9.999999999999999e-27  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  hitchhiker  0.00835733  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0821  30S ribosomal protein S9  48.51 
 
 		 149 aa  120  9.999999999999999e-27  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.766995  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1899  30S ribosomal protein S9  52.46 
 
 		 130 aa  120  9.999999999999999e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  3.1303899999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0145  30S ribosomal protein S9  53.66 
 
 		 130 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000670079  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3638  ribosomal protein S9  50.41 
 
 		 130 aa  120  9.999999999999999e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00994207  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2970  30S ribosomal protein S9  46.67 
 
 		 159 aa  120  9.999999999999999e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0570988  normal  0.349655 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2613  30S ribosomal protein S9  49.22 
 
 		 169 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>