More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0402 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002620  TC0402  30S ribosomal protein S9  100 
 
 		 133 aa  266  1e-70  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  hitchhiker  0.00835733  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0006  ribosomal protein S9  51.13 
 
 		 133 aa  143  8.000000000000001e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.819912  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2151  30S ribosomal protein S9  53.6 
 
 		 158 aa  138  3e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.45731  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2650  30S ribosomal protein S9  50.4 
 
 		 161 aa  130  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.550147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0562  SSU ribosomal protein S9P  51.64 
 
 		 131 aa  128  2.0000000000000002e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000000134066  normal  0.199008 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2620  30S ribosomal protein S9  49.6 
 
 		 161 aa  128  3e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.159482 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2843  30S ribosomal protein S9  49.6 
 
 		 161 aa  128  3e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0902  30S ribosomal protein S9  50.79 
 
 		 130 aa  128  3e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000079624  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6017  ribosomal protein S9  53.66 
 
 		 135 aa  127  4.0000000000000003e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0328969  normal  0.0856034 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2069  30S ribosomal protein S9  52.85 
 
 		 130 aa  127  4.0000000000000003e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000831765  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2297  ribosomal protein S9  52.46 
 
 		 130 aa  127  5.0000000000000004e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000207473  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0149  30S ribosomal protein S9  49.6 
 
 		 162 aa  127  7.000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2608  30S ribosomal protein S9  50.39 
 
 		 130 aa  126  8.000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0410125  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4611  30S ribosomal protein S9  48.8 
 
 		 162 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0520803 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1379  30S ribosomal protein S9  49.6 
 
 		 159 aa  126  1.0000000000000001e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0851685 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02470  ribosomal protein S9  51.22 
 
 		 131 aa  125  1.0000000000000001e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000158686  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01520  ribosomal protein S9  51.22 
 
 		 131 aa  125  1.0000000000000001e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000216085  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0342  SSU ribosomal protein S9P  50.38 
 
 		 170 aa  126  1.0000000000000001e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0651444  hitchhiker  0.00386337 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0600  30S ribosomal protein S9  50 
 
 		 173 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.190844  normal  0.458366 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0342  30S ribosomal protein S9  49.61 
 
 		 136 aa  125  2.0000000000000002e-28  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00140539  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2249  30S ribosomal protein S9  48.09 
 
 		 163 aa  125  2.0000000000000002e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0795  30S ribosomal protein S9  50.82 
 
 		 130 aa  124  4.0000000000000003e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000718866  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4742  ribosomal protein S9  49.59 
 
 		 128 aa  124  5e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000000153745  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1179  30S ribosomal protein S9  48 
 
 		 161 aa  124  5e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.554063  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0231  SSU ribosomal protein S9P  48.84 
 
 		 131 aa  123  6e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.0000192076  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0734  30S ribosomal protein S9  48.39 
 
 		 130 aa  123  7e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000000144699  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0800  30S ribosomal protein S9  53.85 
 
 		 135 aa  122  1e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.435176  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0230  SSU ribosomal protein S9P  51.64 
 
 		 132 aa  122  1e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000443747  normal  0.670048 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1782  30S ribosomal protein S9  49.21 
 
 		 130 aa  123  1e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000024243  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1476  30S ribosomal protein S9  50.4 
 
 		 166 aa  122  1e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.270542 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1126  30S ribosomal protein S9  50 
 
 		 172 aa  122  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.482238 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3496  30S ribosomal protein S9  47.93 
 
 		 128 aa  122  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000030471  normal  0.91876 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1158  30S ribosomal protein S9  52.07 
 
 		 158 aa  122  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.356107 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0913  ribosomal protein S9  47.15 
 
 		 129 aa  122  2e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000269489  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1131  30S ribosomal protein S9  52.07 
 
 		 158 aa  122  2e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0051  30S ribosomal protein S9  48.78 
 
 		 128 aa  122  2e-27  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1148  30S ribosomal protein S9  52.07 
 
 		 158 aa  122  2e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.542588  normal  0.417001 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21980  SSU ribosomal protein S9P  54.1 
 
 		 130 aa  121  3e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000149562  hitchhiker  0.00529045 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2120  SSU ribosomal protein S9P  49.18 
 
 		 130 aa  121  3e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.39803  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1940  ribosomal protein S9  50.39 
 
 		 129 aa  121  3e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1031  30S ribosomal protein S9  51.97 
 
 		 132 aa  121  3e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.791116  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3348  ribosomal protein S9  47.15 
 
 		 129 aa  121  3e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0614997 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5159  ribosomal protein S9  52.38 
 
 		 169 aa  121  4e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.623801  normal  0.298446 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2678  30S ribosomal protein S9  48.41 
 
 		 130 aa  120  4e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000125135  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2363  30S ribosomal protein S9  48.41 
 
 		 130 aa  120  4e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000350135  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0719  30S ribosomal protein S9  49.59 
 
 		 138 aa  120  6e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000482758  normal  0.593544 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0321  30S ribosomal protein S9  49.59 
 
 		 130 aa  120  6e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000288169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1624  30S ribosomal protein S9  50 
 
 		 136 aa  120  6e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.567552  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04450  SSU ribosomal protein S9P  52.07 
 
 		 162 aa  120  6e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.271227 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3517  30S ribosomal protein S9  44.19 
 
 		 130 aa  120  7e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.143376  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3453  30S ribosomal protein S9  44.19 
 
 		 130 aa  120  7e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1872  30S ribosomal protein S9  48.8 
 
 		 159 aa  120  7e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.952658 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1345  30S ribosomal protein S9  51.59 
 
 		 134 aa  120  7e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00368639  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3371  30S ribosomal protein S9  44.19 
 
 		 130 aa  120  7e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0767368  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2613  30S ribosomal protein S9  50.39 
 
 		 169 aa  120  8e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2878  ribosomal protein S9  49.6 
 
 		 180 aa  120  9e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1394  ribosomal protein S9  50.41 
 
 		 129 aa  119  9.999999999999999e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000135637  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17391  30S ribosomal protein S9  50 
 
 		 136 aa  119  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0430  ribosomal protein S9  49.62 
 
 		 130 aa  119  9.999999999999999e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.912667  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3731  30S ribosomal protein S9  50.41 
 
 		 137 aa  119  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1320  30S ribosomal protein S9  48.8 
 
 		 137 aa  119  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.540344  normal  0.687353 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0923  30S ribosomal protein S9  50.41 
 
 		 154 aa  119  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0970  30S ribosomal protein S9  48 
 
 		 130 aa  119  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.476085 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2612  ribosomal protein S9  51.61 
 
 		 162 aa  119  9.999999999999999e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.523931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1470  30S ribosomal protein S9  50.82 
 
 		 171 aa  119  9.999999999999999e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.828818 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2587  30S ribosomal protein S9  51.22 
 
 		 138 aa  118  1.9999999999999998e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1341  30S ribosomal protein S9  51.59 
 
 		 134 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000324124  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2984  30S ribosomal protein S9  49.19 
 
 		 136 aa  119  1.9999999999999998e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.414721 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1537  30S ribosomal protein S9  46.88 
 
 		 128 aa  118  3e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000000611504  normal  0.14818 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3190  30S ribosomal protein S9  47.54 
 
 		 130 aa  118  3e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000452354  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1601  30S ribosomal protein S9  46.56 
 
 		 164 aa  118  3e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.292372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1611  30S ribosomal protein S9  49.59 
 
 		 128 aa  117  3.9999999999999996e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0149645  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17231  30S ribosomal protein S9  50 
 
 		 136 aa  117  3.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1513  SSU ribosomal protein S9P  50.4 
 
 		 165 aa  117  3.9999999999999996e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.472306 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1686  ribosomal protein S9  51.22 
 
 		 161 aa  117  4.9999999999999996e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1899  30S ribosomal protein S9  45.67 
 
 		 130 aa  117  4.9999999999999996e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  3.1303899999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0224  30S ribosomal protein S9  49.59 
 
 		 135 aa  117  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4949  30S ribosomal protein S9  49.59 
 
 		 171 aa  117  6e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.143487  normal  0.446856 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1882  ribosomal protein S9  50 
 
 		 264 aa  117  6e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.178814  normal  0.068579 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29350  SSU ribosomal protein S9P  51.61 
 
 		 162 aa  117  6e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.100136  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0615  SSU ribosomal protein S9P  56.1 
 
 		 135 aa  117  7e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.733906  normal  0.442005 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20520  SSU ribosomal protein S9P  52.46 
 
 		 171 aa  117  7e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.476775  normal  0.598664 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0221  30S ribosomal protein S9  49.59 
 
 		 135 aa  117  7.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0143774  normal  0.010853 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0746  ribosomal protein S9  46.27 
 
 		 134 aa  116  7.999999999999999e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17131  30S ribosomal protein S9  48.39 
 
 		 136 aa  116  9e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0453537  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3285  30S ribosomal protein S9  48 
 
 		 180 aa  116  9e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0870  ribosomal protein S9  48.76 
 
 		 167 aa  116  9e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1450  SSU ribosomal protein S9P  50 
 
 		 131 aa  116  9.999999999999999e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000188818  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3627  30S ribosomal protein S9  47.54 
 
 		 130 aa  115  9.999999999999999e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000023775  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3436  30S ribosomal protein S9  44.09 
 
 		 131 aa  116  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.113849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2043  ribosomal protein S9  45.31 
 
 		 130 aa  115  1.9999999999999998e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000585971  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0349  30S ribosomal protein S9  45.52 
 
 		 133 aa  115  1.9999999999999998e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.842088 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0048  30S ribosomal protein S9  48.78 
 
 		 130 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3038  30S ribosomal protein S9  47.15 
 
 		 128 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0109364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2583  30S ribosomal protein S9  52.46 
 
 		 130 aa  115  1.9999999999999998e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000028456  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13479  30S ribosomal protein S9  54.1 
 
 		 151 aa  114  3e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0104915  hitchhiker  0.000207065 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16511  30S ribosomal protein S9  48.78 
 
 		 137 aa  115  3e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0633365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1650  30S ribosomal protein S9  43.18 
 
 		 160 aa  114  3e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.377487 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0662  30S ribosomal protein S9  49.18 
 
 		 132 aa  115  3e-25  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.219101  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2697  30S ribosomal protein S9  49.6 
 
 		 161 aa  114  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.145825  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>