More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3496 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3496  30S ribosomal protein S9  100 
 
 		 128 aa  258  2e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000030471  normal  0.91876 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4742  ribosomal protein S9  75 
 
 		 128 aa  201  3e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000000153745  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3038  30S ribosomal protein S9  61.72 
 
 		 128 aa  166  1e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0109364  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0051  30S ribosomal protein S9  59.38 
 
 		 128 aa  163  6.9999999999999995e-40  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0722  30S ribosomal protein S9  60.16 
 
 		 128 aa  159  2e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1611  30S ribosomal protein S9  57.81 
 
 		 128 aa  156  1e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0149645  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0006  ribosomal protein S9  61.48 
 
 		 133 aa  155  2e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.819912  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04080  30S ribosomal protein S9  56.25 
 
 		 128 aa  147  4e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0111  ribosomal protein S9  57.03 
 
 		 128 aa  146  9e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000221009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2011  30S ribosomal protein S9  55.12 
 
 		 129 aa  145  2.0000000000000003e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00763906  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2843  30S ribosomal protein S9  57.85 
 
 		 161 aa  145  3e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2620  30S ribosomal protein S9  57.85 
 
 		 161 aa  145  3e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.159482 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0881  ribosomal protein S9  58.87 
 
 		 129 aa  144  3e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1476  30S ribosomal protein S9  59.5 
 
 		 166 aa  144  4.0000000000000006e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.270542 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2151  30S ribosomal protein S9  57.85 
 
 		 158 aa  144  4.0000000000000006e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.45731  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0423  30S ribosomal protein S9  54.33 
 
 		 129 aa  142  1e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00762488  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0402  30S ribosomal protein S9  52.76 
 
 		 129 aa  142  2e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.248058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2938  ribosomal protein S9  57.85 
 
 		 162 aa  142  2e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000844995 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2650  30S ribosomal protein S9  57.02 
 
 		 161 aa  141  3e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.550147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0230  SSU ribosomal protein S9P  58.68 
 
 		 132 aa  141  3e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000443747  normal  0.670048 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4467  ribosomal protein S9  53.6 
 
 		 139 aa  140  4e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4611  30S ribosomal protein S9  57.02 
 
 		 162 aa  140  4e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0520803 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2249  30S ribosomal protein S9  57.02 
 
 		 163 aa  140  5e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0149  30S ribosomal protein S9  57.85 
 
 		 162 aa  139  9e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1379  30S ribosomal protein S9  57.02 
 
 		 159 aa  139  9.999999999999999e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0851685 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3371  30S ribosomal protein S9  56.91 
 
 		 130 aa  139  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0767368  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3453  30S ribosomal protein S9  56.91 
 
 		 130 aa  139  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3517  30S ribosomal protein S9  56.91 
 
 		 130 aa  139  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.143376  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1872  30S ribosomal protein S9  57.02 
 
 		 159 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.952658 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2069  30S ribosomal protein S9  55.37 
 
 		 130 aa  139  1.9999999999999998e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000831765  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1163  30S ribosomal protein S9  57.02 
 
 		 160 aa  139  1.9999999999999998e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.456788  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1798  30S ribosomal protein S9  56.2 
 
 		 130 aa  138  3e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2425  30S ribosomal protein S9  57.38 
 
 		 164 aa  138  3e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.149157  normal  0.160414 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2244  30S ribosomal protein S9  56.2 
 
 		 130 aa  138  3e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000238567  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2285  30S ribosomal protein S9  56.2 
 
 		 130 aa  138  3e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000447741  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0870  ribosomal protein S9  52.8 
 
 		 167 aa  137  4.999999999999999e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3285  30S ribosomal protein S9  54.92 
 
 		 180 aa  137  6e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0376  30S ribosomal protein S9  56.25 
 
 		 128 aa  137  7e-32  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1601  30S ribosomal protein S9  55.37 
 
 		 164 aa  136  8.999999999999999e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.292372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3627  30S ribosomal protein S9  53.72 
 
 		 130 aa  136  8.999999999999999e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000023775  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2583  30S ribosomal protein S9  57.02 
 
 		 130 aa  135  1e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000028456  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1686  ribosomal protein S9  53.97 
 
 		 161 aa  135  2e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0725  30S ribosomal protein S9  55.37 
 
 		 130 aa  135  2e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.616344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04450  SSU ribosomal protein S9P  49.19 
 
 		 162 aa  135  2e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.271227 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2175  30S ribosomal protein S9  53.72 
 
 		 160 aa  134  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0915323  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1321  30S ribosomal protein S9  55.37 
 
 		 155 aa  134  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.243338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4591  30S ribosomal protein S9  54.55 
 
 		 160 aa  134  3.0000000000000003e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2708  30S ribosomal protein S9  53.72 
 
 		 158 aa  134  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.421371  normal  0.509442 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2454  30S ribosomal protein S9  54.55 
 
 		 158 aa  134  3.0000000000000003e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.812734  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0800  30S ribosomal protein S9  55.2 
 
 		 135 aa  134  4e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.435176  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1681  30S ribosomal protein S9  54.55 
 
 		 155 aa  134  4e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00362695  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3107  30S ribosomal protein S9  53.72 
 
 		 160 aa  134  4e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.966484  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1422  30S ribosomal protein S9  54.55 
 
 		 158 aa  134  4e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.51395  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2608  30S ribosomal protein S9  56.2 
 
 		 130 aa  134  4e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0410125  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0861  30S ribosomal protein S9  54.55 
 
 		 155 aa  134  4e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0415089  normal  0.103809 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2672  30S ribosomal protein S9  53.72 
 
 		 158 aa  134  6.0000000000000005e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.569835  normal  0.132209 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0562  SSU ribosomal protein S9P  50.82 
 
 		 131 aa  134  6.0000000000000005e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000000134066  normal  0.199008 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1384  30S ribosomal protein S9  52.07 
 
 		 161 aa  133  7.000000000000001e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.839793 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2970  30S ribosomal protein S9  54.55 
 
 		 159 aa  133  8e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0570988  normal  0.349655 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0021  30S ribosomal protein S9  53.72 
 
 		 160 aa  133  9e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.849835  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2697  30S ribosomal protein S9  54.55 
 
 		 161 aa  133  9e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.145825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1650  30S ribosomal protein S9  53.72 
 
 		 160 aa  133  9e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.377487 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0786  30S ribosomal protein S9  54.55 
 
 		 158 aa  132  9.999999999999999e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.637937  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0790  30S ribosomal protein S9  54.55 
 
 		 158 aa  132  9.999999999999999e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.552498  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3436  30S ribosomal protein S9  53.66 
 
 		 131 aa  132  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.113849  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1234  30S ribosomal protein S9  54.55 
 
 		 155 aa  132  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.745621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4345  30S ribosomal protein S9  53.72 
 
 		 160 aa  132  9.999999999999999e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.59912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1179  30S ribosomal protein S9  54.55 
 
 		 161 aa  132  9.999999999999999e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.554063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2496  30S ribosomal protein S9  54.55 
 
 		 158 aa  132  9.999999999999999e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1177  ribosomal protein S9  49.6 
 
 		 174 aa  132  9.999999999999999e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.904807  normal  0.699948 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0128  30S ribosomal protein S9  55.37 
 
 		 130 aa  132  9.999999999999999e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000606121  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0970  30S ribosomal protein S9  55.37 
 
 		 130 aa  133  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.476085 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0342  SSU ribosomal protein S9P  54.55 
 
 		 170 aa  133  9.999999999999999e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0651444  hitchhiker  0.00386337 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4594  30S ribosomal protein S9  54.55 
 
 		 188 aa  132  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1394  ribosomal protein S9  51.97 
 
 		 129 aa  132  1.9999999999999998e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000135637  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1811  30S ribosomal protein S9  52.71 
 
 		 131 aa  132  1.9999999999999998e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.170614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2678  30S ribosomal protein S9  55.37 
 
 		 130 aa  132  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000125135  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2363  30S ribosomal protein S9  55.37 
 
 		 130 aa  132  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000350135  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2241  SSU ribosomal protein S9P  54.55 
 
 		 130 aa  132  1.9999999999999998e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.201316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0247  SSU ribosomal protein S9P  51.97 
 
 		 130 aa  132  1.9999999999999998e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00762963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1470  30S ribosomal protein S9  52 
 
 		 171 aa  132  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.828818 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0902  30S ribosomal protein S9  53.72 
 
 		 161 aa  131  3e-30  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.829966  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3025  30S ribosomal protein S9  53.72 
 
 		 157 aa  131  3.9999999999999996e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.795745 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0244  30S ribosomal protein S9  53.72 
 
 		 165 aa  130  3.9999999999999996e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.411662 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0734  30S ribosomal protein S9  53.72 
 
 		 130 aa  130  6e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000000144699  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0469  30S ribosomal protein S9  53.72 
 
 		 130 aa  130  6e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000193557  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0215  30S ribosomal protein S9  54.55 
 
 		 130 aa  130  6.999999999999999e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00249156  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1899  30S ribosomal protein S9  53.72 
 
 		 130 aa  130  6.999999999999999e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  3.1303899999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1131  30S ribosomal protein S9  50.4 
 
 		 158 aa  130  7.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1158  30S ribosomal protein S9  50.4 
 
 		 158 aa  130  7.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.356107 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1148  30S ribosomal protein S9  50.4 
 
 		 158 aa  130  7.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.542588  normal  0.417001 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2014  30S ribosomal protein S9  51.18 
 
 		 131 aa  130  9e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.27603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4949  30S ribosomal protein S9  50.4 
 
 		 171 aa  129  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.143487  normal  0.446856 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1649  30S ribosomal protein S9  53.54 
 
 		 129 aa  129  1.0000000000000001e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6017  ribosomal protein S9  52.07 
 
 		 135 aa  129  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0328969  normal  0.0856034 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0600  30S ribosomal protein S9  54.1 
 
 		 173 aa  128  2.0000000000000002e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.190844  normal  0.458366 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0411  30S ribosomal protein S9  52.89 
 
 		 130 aa  129  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000014619  normal  0.0708981 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02470  ribosomal protein S9  53.72 
 
 		 131 aa  127  4.0000000000000003e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000158686  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0923  30S ribosomal protein S9  47.2 
 
 		 154 aa  127  4.0000000000000003e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2563  30S ribosomal protein S9  52.89 
 
 		 130 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000000714908  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>