More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_2011 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_2011  30S ribosomal protein S9  100 
 
 
129 aa  257  4e-68  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00763906  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0402  30S ribosomal protein S9  89.15 
 
 
129 aa  231  3e-60  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.248058  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0423  30S ribosomal protein S9  85.27 
 
 
129 aa  227  4e-59  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00762488  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2354  30S ribosomal protein S9  86.05 
 
 
129 aa  204  4e-52  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0958602  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1811  30S ribosomal protein S9  72.87 
 
 
131 aa  200  4e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.170614  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1649  30S ribosomal protein S9  80.62 
 
 
129 aa  193  5.000000000000001e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2014  30S ribosomal protein S9  67.44 
 
 
131 aa  184  3e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.27603  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0722  30S ribosomal protein S9  58.27 
 
 
128 aa  149  8.999999999999999e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1611  30S ribosomal protein S9  56.35 
 
 
128 aa  149  8.999999999999999e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0149645  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3496  30S ribosomal protein S9  55.12 
 
 
128 aa  145  2.0000000000000003e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000030471  normal  0.91876 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0051  30S ribosomal protein S9  57.48 
 
 
128 aa  142  2e-33  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04080  30S ribosomal protein S9  53.54 
 
 
128 aa  141  3e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3038  30S ribosomal protein S9  52.76 
 
 
128 aa  136  7.999999999999999e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0109364  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1345  30S ribosomal protein S9  52.99 
 
 
134 aa  135  2e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00368639  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0800  30S ribosomal protein S9  55.56 
 
 
135 aa  135  2e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.435176  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1341  30S ribosomal protein S9  52.99 
 
 
134 aa  134  3.0000000000000003e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000324124  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0562  SSU ribosomal protein S9P  52.67 
 
 
131 aa  134  3.0000000000000003e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000000134066  normal  0.199008 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0247  SSU ribosomal protein S9P  53.12 
 
 
130 aa  135  3.0000000000000003e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00762963  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2069  30S ribosomal protein S9  57.85 
 
 
130 aa  134  4e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000831765  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4742  ribosomal protein S9  52.8 
 
 
128 aa  134  5e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000000153745  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0006  ribosomal protein S9  53.28 
 
 
133 aa  133  7.000000000000001e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.819912  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0212  ribosomal protein S9  55.28 
 
 
131 aa  133  9e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000467508  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0902  30S ribosomal protein S9  55.74 
 
 
130 aa  133  9.999999999999999e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000079624  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2678  30S ribosomal protein S9  58.68 
 
 
130 aa  132  9.999999999999999e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000125135  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2363  30S ribosomal protein S9  58.68 
 
 
130 aa  132  9.999999999999999e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000350135  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0342  30S ribosomal protein S9  51.64 
 
 
136 aa  132  1.9999999999999998e-30  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00140539  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2620  30S ribosomal protein S9  51.64 
 
 
161 aa  131  3e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.159482 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2843  30S ribosomal protein S9  51.64 
 
 
161 aa  131  3e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0149  30S ribosomal protein S9  51.64 
 
 
162 aa  130  6.999999999999999e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4611  30S ribosomal protein S9  51.64 
 
 
162 aa  129  9e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0520803 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3627  30S ribosomal protein S9  54.1 
 
 
130 aa  129  1.0000000000000001e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000023775  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0560  30S ribosomal protein S9  53.72 
 
 
130 aa  129  1.0000000000000001e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000599765  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1179  30S ribosomal protein S9  53.28 
 
 
161 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.554063  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0853  30S ribosomal protein S9  54.1 
 
 
124 aa  128  2.0000000000000002e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000119355  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1899  30S ribosomal protein S9  53.28 
 
 
130 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  3.1303899999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1589  ribosomal protein S9  54.1 
 
 
133 aa  128  2.0000000000000002e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000582599  normal  0.735167 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1885  ribosomal protein S9  54.1 
 
 
133 aa  128  2.0000000000000002e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000534939  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0923  30S ribosomal protein S9  54.1 
 
 
130 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3190  30S ribosomal protein S9  53.28 
 
 
130 aa  128  3e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000452354  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2679  ribosomal protein S9  53.66 
 
 
130 aa  127  4.0000000000000003e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0151101  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04450  SSU ribosomal protein S9P  54.47 
 
 
162 aa  127  5.0000000000000004e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.271227 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3702  ribosomal protein S9  54.1 
 
 
130 aa  127  5.0000000000000004e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000244977  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03090  30S ribosomal protein S9  51.64 
 
 
130 aa  127  6e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000557445  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0476  ribosomal protein S9  51.64 
 
 
130 aa  127  6e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000601039  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0476  30S ribosomal protein S9  51.64 
 
 
130 aa  127  6e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000111446  normal  0.163216 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3546  30S ribosomal protein S9  51.64 
 
 
130 aa  127  6e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000104404  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0056  SSU ribosomal protein S9P  54.1 
 
 
130 aa  127  6e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0128063  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3419  30S ribosomal protein S9  51.64 
 
 
130 aa  127  6e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000112038  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3713  30S ribosomal protein S9  51.64 
 
 
130 aa  127  6e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000596943  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3525  30S ribosomal protein S9  51.64 
 
 
130 aa  127  6e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000016286  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4547  30S ribosomal protein S9  51.64 
 
 
130 aa  127  6e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000371086  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03041  hypothetical protein  51.64 
 
 
130 aa  127  6e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000287646  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13050  30S ribosomal protein S9  54.1 
 
 
130 aa  127  7.000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2650  30S ribosomal protein S9  50.82 
 
 
161 aa  127  7.000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.550147  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3665  30S ribosomal protein S9  51.64 
 
 
130 aa  127  7.000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0023412  normal  0.0755267 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1177  ribosomal protein S9  50.39 
 
 
174 aa  127  7.000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.904807  normal  0.699948 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3536  30S ribosomal protein S9  51.64 
 
 
130 aa  126  8.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.0000037617  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3704  30S ribosomal protein S9  51.64 
 
 
130 aa  126  8.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00817033  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4348  30S ribosomal protein S9  51.64 
 
 
130 aa  126  8.000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000012665  hitchhiker  0.00291766 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3607  30S ribosomal protein S9  51.64 
 
 
130 aa  126  8.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000867127  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3642  30S ribosomal protein S9  51.64 
 
 
130 aa  126  8.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000331692  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3535  30S ribosomal protein S9  51.64 
 
 
130 aa  126  8.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000799314  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02470  ribosomal protein S9  54.92 
 
 
131 aa  126  1.0000000000000001e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000158686  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3453  30S ribosomal protein S9  52.85 
 
 
130 aa  126  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3371  30S ribosomal protein S9  52.85 
 
 
130 aa  126  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0767368  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0293  ribosomal protein S9  51.64 
 
 
130 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.000515876  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3517  30S ribosomal protein S9  52.85 
 
 
130 aa  126  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.143376  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01520  ribosomal protein S9  54.92 
 
 
131 aa  126  1.0000000000000001e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000216085  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2875  30S ribosomal protein S9  51.24 
 
 
130 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0195834  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1316  30S ribosomal protein S9  53.28 
 
 
130 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.428523  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4408  30S ribosomal protein S9  53.28 
 
 
130 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.40853 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4425  ribosomal protein S9  53.28 
 
 
130 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.146621  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4119  30S ribosomal protein S9  53.28 
 
 
130 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0650  SSU ribosomal protein S9P  53.72 
 
 
130 aa  125  2.0000000000000002e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  1.4124e-16  normal  0.0939463 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0469  30S ribosomal protein S9  53.28 
 
 
130 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000193557  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0454  30S ribosomal protein S9  53.72 
 
 
130 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0255963  normal  0.796217 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4693  30S ribosomal protein S9  53.28 
 
 
130 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00380118  normal  0.0220476 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2249  30S ribosomal protein S9  50 
 
 
163 aa  125  2.0000000000000002e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4533  30S ribosomal protein S9  53.28 
 
 
130 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.848049  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0902  30S ribosomal protein S9  54.1 
 
 
130 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1394  ribosomal protein S9  51.16 
 
 
129 aa  125  2.0000000000000002e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000135637  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1031  30S ribosomal protein S9  49.24 
 
 
132 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.791116  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1872  30S ribosomal protein S9  50.41 
 
 
159 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.952658 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0300  30S ribosomal protein S9  51.64 
 
 
130 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00212654  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0870  ribosomal protein S9  52 
 
 
167 aa  125  2.0000000000000002e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20520  SSU ribosomal protein S9P  56.1 
 
 
171 aa  125  3e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.476775  normal  0.598664 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00882  30S ribosomal protein S9  52.46 
 
 
130 aa  124  3e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2938  ribosomal protein S9  53.28 
 
 
162 aa  124  4.0000000000000003e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000844995 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0797  30S ribosomal protein S9  51.64 
 
 
128 aa  124  4.0000000000000003e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000494469  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1476  30S ribosomal protein S9  49.18 
 
 
166 aa  124  4.0000000000000003e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.270542 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3594  30S ribosomal protein S9  54.1 
 
 
130 aa  124  5e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000165532  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1379  30S ribosomal protein S9  49.18 
 
 
159 aa  124  5e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0851685 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0461  30S ribosomal protein S9  51.64 
 
 
130 aa  123  6e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000140237  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0525  30S ribosomal protein S9  51.64 
 
 
130 aa  123  6e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000883336  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1133  30S ribosomal protein S9  51.64 
 
 
130 aa  123  6e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000113025  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0607  30S ribosomal protein S9  49.59 
 
 
130 aa  123  7e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000206629  hitchhiker  0.00149279 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004510  SSU ribosomal protein S9p (S16e)  51.64 
 
 
130 aa  123  7e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000229051  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1748  30S ribosomal protein S9  50.82 
 
 
128 aa  123  8.000000000000001e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00000973218  normal  0.252579 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5913  30S ribosomal protein S9  50.81 
 
 
130 aa  123  8.000000000000001e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.208895  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1050  30S ribosomal protein S9  50 
 
 
130 aa  123  9e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000126027  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>