More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_0402 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_0402  30S ribosomal protein S9  100 
 
 
129 aa  255  1e-67  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.248058  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2011  30S ribosomal protein S9  89.15 
 
 
129 aa  231  3e-60  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00763906  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0423  30S ribosomal protein S9  86.82 
 
 
129 aa  227  5e-59  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00762488  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2354  30S ribosomal protein S9  82.95 
 
 
129 aa  198  1.9999999999999998e-50  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0958602  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1811  30S ribosomal protein S9  71.32 
 
 
131 aa  192  2e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.170614  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1649  30S ribosomal protein S9  82.17 
 
 
129 aa  191  4e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2014  30S ribosomal protein S9  66.67 
 
 
131 aa  182  1.0000000000000001e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.27603  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0051  30S ribosomal protein S9  57.48 
 
 
128 aa  145  2.0000000000000003e-34  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0722  30S ribosomal protein S9  56.69 
 
 
128 aa  142  1e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3496  30S ribosomal protein S9  52.76 
 
 
128 aa  142  2e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000030471  normal  0.91876 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1611  30S ribosomal protein S9  53.97 
 
 
128 aa  140  6e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0149645  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2620  30S ribosomal protein S9  55.74 
 
 
161 aa  140  8e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.159482 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2843  30S ribosomal protein S9  55.74 
 
 
161 aa  140  8e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04080  30S ribosomal protein S9  53.54 
 
 
128 aa  139  9.999999999999999e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2069  30S ribosomal protein S9  58.68 
 
 
130 aa  138  1.9999999999999998e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000831765  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4611  30S ribosomal protein S9  54.47 
 
 
162 aa  137  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0520803 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0902  30S ribosomal protein S9  57.02 
 
 
130 aa  137  3.9999999999999997e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000079624  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0149  30S ribosomal protein S9  54.92 
 
 
162 aa  137  6e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1345  30S ribosomal protein S9  54.48 
 
 
134 aa  137  7e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00368639  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1341  30S ribosomal protein S9  54.48 
 
 
134 aa  137  7e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000324124  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2678  30S ribosomal protein S9  60.33 
 
 
130 aa  137  7e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000125135  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2363  30S ribosomal protein S9  60.33 
 
 
130 aa  137  7e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000350135  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0212  ribosomal protein S9  56.1 
 
 
131 aa  136  1e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000467508  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1179  30S ribosomal protein S9  56.56 
 
 
161 aa  136  1e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.554063  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0247  SSU ribosomal protein S9P  53.12 
 
 
130 aa  135  1e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00762963  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2650  30S ribosomal protein S9  54.92 
 
 
161 aa  135  2e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.550147  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0800  30S ribosomal protein S9  54.81 
 
 
135 aa  135  2e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.435176  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3038  30S ribosomal protein S9  51.18 
 
 
128 aa  135  2e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0109364  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0006  ribosomal protein S9  54.92 
 
 
133 aa  134  3.0000000000000003e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.819912  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2679  ribosomal protein S9  55.28 
 
 
130 aa  134  4e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0151101  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1031  30S ribosomal protein S9  51.52 
 
 
132 aa  134  6.0000000000000005e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.791116  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3627  30S ribosomal protein S9  54.92 
 
 
130 aa  133  7.000000000000001e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000023775  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2151  30S ribosomal protein S9  54.92 
 
 
158 aa  133  8e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.45731  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0342  30S ribosomal protein S9  54.1 
 
 
136 aa  133  9e-31  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00140539  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1476  30S ribosomal protein S9  52.46 
 
 
166 aa  132  9.999999999999999e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.270542 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2875  30S ribosomal protein S9  52.89 
 
 
130 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0195834  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0562  SSU ribosomal protein S9P  51.91 
 
 
131 aa  131  3e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000000134066  normal  0.199008 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2938  ribosomal protein S9  54.47 
 
 
162 aa  131  3e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000844995 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2249  30S ribosomal protein S9  51.64 
 
 
163 aa  130  5e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1872  30S ribosomal protein S9  52.03 
 
 
159 aa  130  7.999999999999999e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.952658 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0923  30S ribosomal protein S9  54.1 
 
 
130 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0607  30S ribosomal protein S9  51.24 
 
 
130 aa  129  1.0000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000206629  hitchhiker  0.00149279 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2672  30S ribosomal protein S9  53.72 
 
 
158 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.569835  normal  0.132209 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0853  30S ribosomal protein S9  53.28 
 
 
124 aa  128  2.0000000000000002e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000119355  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0861  30S ribosomal protein S9  52.03 
 
 
155 aa  129  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0415089  normal  0.103809 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3594  30S ribosomal protein S9  55.74 
 
 
130 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000165532  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3107  30S ribosomal protein S9  51.64 
 
 
160 aa  128  3e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.966484  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0454  30S ribosomal protein S9  55.37 
 
 
130 aa  127  3e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0255963  normal  0.796217 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3285  30S ribosomal protein S9  52.85 
 
 
180 aa  128  3e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3702  ribosomal protein S9  54.1 
 
 
130 aa  128  3e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000244977  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1379  30S ribosomal protein S9  50.41 
 
 
159 aa  128  3e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0851685 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00882  30S ribosomal protein S9  53.28 
 
 
130 aa  127  4.0000000000000003e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3293  30S ribosomal protein S9  54.1 
 
 
130 aa  127  6e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000148641  hitchhiker  0.00108393 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02470  ribosomal protein S9  57.26 
 
 
131 aa  127  6e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000158686  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4742  ribosomal protein S9  48 
 
 
128 aa  127  6e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000000153745  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1885  ribosomal protein S9  53.28 
 
 
133 aa  127  6e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000534939  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01520  ribosomal protein S9  57.26 
 
 
131 aa  127  6e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000216085  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1589  ribosomal protein S9  53.28 
 
 
133 aa  127  6e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000582599  normal  0.735167 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004510  SSU ribosomal protein S9p (S16e)  52.46 
 
 
130 aa  127  7.000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000229051  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2708  30S ribosomal protein S9  52.46 
 
 
158 aa  127  7.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.421371  normal  0.509442 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03090  30S ribosomal protein S9  50.82 
 
 
130 aa  127  8.000000000000001e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000557445  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0476  ribosomal protein S9  50.82 
 
 
130 aa  127  8.000000000000001e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000601039  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3525  30S ribosomal protein S9  50.82 
 
 
130 aa  127  8.000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000016286  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3713  30S ribosomal protein S9  50.82 
 
 
130 aa  127  8.000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000596943  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4547  30S ribosomal protein S9  50.82 
 
 
130 aa  127  8.000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000371086  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0476  30S ribosomal protein S9  50.82 
 
 
130 aa  127  8.000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000111446  normal  0.163216 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3546  30S ribosomal protein S9  50.82 
 
 
130 aa  127  8.000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000104404  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3419  30S ribosomal protein S9  50.82 
 
 
130 aa  127  8.000000000000001e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000112038  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2454  30S ribosomal protein S9  50.41 
 
 
158 aa  126  8.000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.812734  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3190  30S ribosomal protein S9  52.46 
 
 
130 aa  126  8.000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000452354  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0433  30S ribosomal protein S9  47.73 
 
 
132 aa  126  8.000000000000001e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0713606  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03041  hypothetical protein  50.82 
 
 
130 aa  127  8.000000000000001e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000287646  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3665  30S ribosomal protein S9  50.82 
 
 
130 aa  126  8.000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0023412  normal  0.0755267 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4348  30S ribosomal protein S9  51.64 
 
 
130 aa  126  9.000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000012665  hitchhiker  0.00291766 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2241  SSU ribosomal protein S9P  52.46 
 
 
130 aa  126  9.000000000000001e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.201316  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3704  30S ribosomal protein S9  50.82 
 
 
130 aa  126  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00817033  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3607  30S ribosomal protein S9  50.82 
 
 
130 aa  126  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000867127  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0913  ribosomal protein S9  50 
 
 
129 aa  126  1.0000000000000001e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000269489  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3642  30S ribosomal protein S9  50.82 
 
 
130 aa  126  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000331692  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1537  30S ribosomal protein S9  52.71 
 
 
128 aa  126  1.0000000000000001e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000000611504  normal  0.14818 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3535  30S ribosomal protein S9  50.82 
 
 
130 aa  126  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000799314  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13050  30S ribosomal protein S9  53.28 
 
 
130 aa  125  1.0000000000000001e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3536  30S ribosomal protein S9  50.82 
 
 
130 aa  126  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.0000037617  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3348  ribosomal protein S9  50 
 
 
129 aa  125  1.0000000000000001e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0614997 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3070  30S ribosomal protein S9  54.55 
 
 
130 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000352838  normal  0.198807 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1394  ribosomal protein S9  51.16 
 
 
129 aa  125  2.0000000000000002e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000135637  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0797  30S ribosomal protein S9  51.64 
 
 
128 aa  125  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000494469  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1233  30S ribosomal protein S9  53.72 
 
 
130 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000147442  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0469  30S ribosomal protein S9  52.46 
 
 
130 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000193557  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1899  30S ribosomal protein S9  51.64 
 
 
130 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  3.1303899999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0293  ribosomal protein S9  50.82 
 
 
130 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.000515876  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5913  30S ribosomal protein S9  51.61 
 
 
130 aa  125  2.0000000000000002e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.208895  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0902  30S ribosomal protein S9  48.76 
 
 
161 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.829966  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4591  30S ribosomal protein S9  50.41 
 
 
160 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3025  30S ribosomal protein S9  51.22 
 
 
157 aa  125  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.795745 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1050  30S ribosomal protein S9  50.82 
 
 
130 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000126027  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0300  30S ribosomal protein S9  50.82 
 
 
130 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00212654  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1163  30S ribosomal protein S9  50.41 
 
 
160 aa  125  2.0000000000000002e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.456788  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2297  ribosomal protein S9  52.89 
 
 
130 aa  125  2.0000000000000002e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000207473  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2399  ribosomal protein S9  50.82 
 
 
130 aa  125  2.0000000000000002e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.696602  normal  0.066769 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>