More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0111 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_0111  ribosomal protein S9  100 
 
 		 128 aa  258  2e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000221009  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4742  ribosomal protein S9  64.84 
 
 		 128 aa  169  7.999999999999999e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000000153745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0722  30S ribosomal protein S9  64.84 
 
 		 128 aa  160  7e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3038  30S ribosomal protein S9  60.94 
 
 		 128 aa  157  3e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0109364  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04080  30S ribosomal protein S9  60.94 
 
 		 128 aa  155  2e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1611  30S ribosomal protein S9  59.38 
 
 		 128 aa  153  8e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0149645  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3496  30S ribosomal protein S9  57.03 
 
 		 128 aa  146  9e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000030471  normal  0.91876 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0051  30S ribosomal protein S9  53.12 
 
 		 128 aa  144  5e-34  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0881  ribosomal protein S9  56.45 
 
 		 129 aa  143  7.0000000000000006e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1235  ribosomal protein S9  52.42 
 
 		 131 aa  137  3.9999999999999997e-32  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.026641  normal  0.24615 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2151  30S ribosomal protein S9  53.28 
 
 		 158 aa  136  8.999999999999999e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.45731  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0376  30S ribosomal protein S9  56.25 
 
 		 128 aa  136  1e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0006  ribosomal protein S9  56.2 
 
 		 133 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.819912  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2583  30S ribosomal protein S9  54.1 
 
 		 130 aa  134  3.0000000000000003e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000028456  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0128  30S ribosomal protein S9  54.92 
 
 		 130 aa  134  3.0000000000000003e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000606121  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3285  30S ribosomal protein S9  52.46 
 
 		 180 aa  133  9e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0215  30S ribosomal protein S9  54.1 
 
 		 130 aa  132  1.9999999999999998e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00249156  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0231  SSU ribosomal protein S9P  56.56 
 
 		 131 aa  132  1.9999999999999998e-30  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.0000192076  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2970  30S ribosomal protein S9  52.8 
 
 		 159 aa  131  3e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0570988  normal  0.349655 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1798  30S ribosomal protein S9  54.92 
 
 		 130 aa  129  1.0000000000000001e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0725  30S ribosomal protein S9  50.82 
 
 		 130 aa  128  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.616344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2285  30S ribosomal protein S9  54.1 
 
 		 130 aa  128  3e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000447741  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2244  30S ribosomal protein S9  54.1 
 
 		 130 aa  128  3e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000238567  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1379  30S ribosomal protein S9  53.28 
 
 		 159 aa  128  3e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0851685 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1450  SSU ribosomal protein S9P  55.74 
 
 		 131 aa  127  5.0000000000000004e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000188818  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4594  30S ribosomal protein S9  52.46 
 
 		 188 aa  127  5.0000000000000004e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0244  30S ribosomal protein S9  52.46 
 
 		 165 aa  127  5.0000000000000004e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.411662 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2608  30S ribosomal protein S9  50.82 
 
 		 130 aa  127  6e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0410125  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1179  30S ribosomal protein S9  50.82 
 
 		 161 aa  127  7.000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.554063  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2843  30S ribosomal protein S9  50.82 
 
 		 161 aa  126  9.000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2620  30S ribosomal protein S9  50.82 
 
 		 161 aa  126  9.000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.159482 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0247  SSU ribosomal protein S9P  51.61 
 
 		 130 aa  126  1.0000000000000001e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00762963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1566  30S ribosomal protein S9  51.64 
 
 		 128 aa  125  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000968491  normal  0.322438 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2069  30S ribosomal protein S9  53.28 
 
 		 130 aa  125  2.0000000000000002e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000831765  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2425  30S ribosomal protein S9  52.46 
 
 		 164 aa  125  2.0000000000000002e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.149157  normal  0.160414 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1872  30S ribosomal protein S9  50.82 
 
 		 159 aa  124  3e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.952658 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2175  30S ribosomal protein S9  51.64 
 
 		 160 aa  124  3e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0915323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1513  SSU ribosomal protein S9P  49.59 
 
 		 165 aa  125  3e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.472306 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2650  30S ribosomal protein S9  50.82 
 
 		 161 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.550147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3085  30S ribosomal protein S9  52.46 
 
 		 130 aa  124  6e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000996861  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0342  30S ribosomal protein S9  47.54 
 
 		 136 aa  123  7e-28  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00140539  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0890  30S ribosomal protein S9  48.84 
 
 		 166 aa  123  7e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4345  30S ribosomal protein S9  48.78 
 
 		 160 aa  123  8.000000000000001e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.59912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0021  30S ribosomal protein S9  50.4 
 
 		 160 aa  123  8.000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.849835  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1650  30S ribosomal protein S9  50.4 
 
 		 160 aa  123  8.000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.377487 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1748  30S ribosomal protein S9  50 
 
 		 128 aa  122  2e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00000973218  normal  0.252579 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4611  30S ribosomal protein S9  50 
 
 		 162 aa  122  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0520803 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0149  30S ribosomal protein S9  50.82 
 
 		 162 aa  122  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1601  30S ribosomal protein S9  50.82 
 
 		 164 aa  122  2e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.292372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0323  30S ribosomal protein S9  52.46 
 
 		 131 aa  122  2e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000255899  hitchhiker  5.84326e-17 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0562  SSU ribosomal protein S9P  48.36 
 
 		 131 aa  121  3e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000000134066  normal  0.199008 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0970  30S ribosomal protein S9  50 
 
 		 130 aa  121  3e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.476085 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0945  ribosomal protein S9  47.54 
 
 		 130 aa  121  3e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000533623  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0600  30S ribosomal protein S9  50.41 
 
 		 173 aa  120  5e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.190844  normal  0.458366 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1063  30S ribosomal protein S9  50 
 
 		 130 aa  120  5e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00000313432  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3453  30S ribosomal protein S9  51.22 
 
 		 130 aa  120  6e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1681  30S ribosomal protein S9  49.18 
 
 		 155 aa  120  6e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00362695  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3517  30S ribosomal protein S9  51.22 
 
 		 130 aa  120  6e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.143376  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3371  30S ribosomal protein S9  51.22 
 
 		 130 aa  120  6e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0767368  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2663  30S ribosomal protein S9  47.54 
 
 		 130 aa  120  6e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00134428  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3025  30S ribosomal protein S9  46.34 
 
 		 157 aa  120  7e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.795745 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0861  30S ribosomal protein S9  48.8 
 
 		 155 aa  120  9e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0415089  normal  0.103809 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1476  30S ribosomal protein S9  49.18 
 
 		 166 aa  119  9.999999999999999e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.270542 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1384  30S ribosomal protein S9  49.59 
 
 		 161 aa  119  9.999999999999999e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.839793 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0629  SSU ribosomal protein S9P  54.1 
 
 		 130 aa  119  9.999999999999999e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000391075  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0734  30S ribosomal protein S9  45.08 
 
 		 130 aa  119  9.999999999999999e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000000144699  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0367  30S ribosomal protein S9  51.64 
 
 		 130 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000448381  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0626  30S ribosomal protein S9  49.19 
 
 		 130 aa  118  1.9999999999999998e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0454  30S ribosomal protein S9  50.82 
 
 		 130 aa  118  1.9999999999999998e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0255963  normal  0.796217 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0382  30S ribosomal protein S9  51.64 
 
 		 130 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0184231  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2679  ribosomal protein S9  52.07 
 
 		 130 aa  119  1.9999999999999998e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0151101  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2120  SSU ribosomal protein S9P  51.64 
 
 		 130 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.39803  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0605  30S ribosomal protein S9  49.19 
 
 		 130 aa  118  1.9999999999999998e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4591  30S ribosomal protein S9  48.36 
 
 		 160 aa  118  3e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3107  30S ribosomal protein S9  48.36 
 
 		 160 aa  118  3e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.966484  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0331  ribosomal protein S9  48.36 
 
 		 130 aa  118  3e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00016739  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0014  ribosomal protein S9  52.03 
 
 		 130 aa  118  3e-26  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2708  30S ribosomal protein S9  48.36 
 
 		 158 aa  118  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.421371  normal  0.509442 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16860  30S ribosomal protein S9  51.64 
 
 		 162 aa  118  3e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.944317  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1031  30S ribosomal protein S9  48.8 
 
 		 132 aa  117  3.9999999999999996e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.791116  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0048  30S ribosomal protein S9  45.08 
 
 		 130 aa  117  4.9999999999999996e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0853  30S ribosomal protein S9  47.54 
 
 		 124 aa  117  6e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000119355  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2639  30S ribosomal protein S9  48.39 
 
 		 130 aa  117  6e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.17438  normal  0.393546 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0902  30S ribosomal protein S9  50 
 
 		 130 aa  117  6e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000079624  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0230  SSU ribosomal protein S9P  51.64 
 
 		 132 aa  117  6e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000443747  normal  0.670048 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3190  30S ribosomal protein S9  50 
 
 		 130 aa  117  6e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000452354  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0145  30S ribosomal protein S9  48.36 
 
 		 130 aa  117  7e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000670079  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0469  30S ribosomal protein S9  51.64 
 
 		 130 aa  117  7e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000193557  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3627  30S ribosomal protein S9  47.54 
 
 		 130 aa  117  7e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000023775  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1321  30S ribosomal protein S9  47.97 
 
 		 155 aa  117  7e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.243338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2938  ribosomal protein S9  45.9 
 
 		 162 aa  117  7e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000844995 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2520  30S ribosomal protein S9  50.82 
 
 		 130 aa  116  7.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1116  30S ribosomal protein S9  50.82 
 
 		 130 aa  116  7.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2342  30S ribosomal protein S9  50.82 
 
 		 130 aa  116  7.999999999999999e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3420  30S ribosomal protein S9  50.82 
 
 		 130 aa  116  7.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000202027  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0254  30S ribosomal protein S9  50.82 
 
 		 130 aa  116  7.999999999999999e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3413  30S ribosomal protein S9  50.82 
 
 		 130 aa  116  7.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0107857  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1811  30S ribosomal protein S9  51.61 
 
 		 131 aa  116  7.999999999999999e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.170614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3377  30S ribosomal protein S9  50.82 
 
 		 130 aa  116  7.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000325455  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3070  30S ribosomal protein S9  48.36 
 
 		 130 aa  116  7.999999999999999e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000352838  normal  0.198807 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>