More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0945 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_0945  ribosomal protein S9  100 
 
 		 130 aa  263  5e-70  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000533623  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3190  30S ribosomal protein S9  53.85 
 
 		 130 aa  156  9e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000452354  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1899  30S ribosomal protein S9  54.62 
 
 		 130 aa  155  2e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  3.1303899999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3085  30S ribosomal protein S9  56.15 
 
 		 130 aa  155  2e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000996861  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0048  30S ribosomal protein S9  56.15 
 
 		 130 aa  152  1e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1379  30S ribosomal protein S9  54.03 
 
 		 159 aa  150  5e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0851685 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1872  30S ribosomal protein S9  54.03 
 
 		 159 aa  150  5.9999999999999996e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.952658 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2843  30S ribosomal protein S9  54.03 
 
 		 161 aa  149  1e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2620  30S ribosomal protein S9  54.03 
 
 		 161 aa  149  1e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.159482 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0970  30S ribosomal protein S9  55.38 
 
 		 130 aa  147  4e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.476085 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2650  30S ribosomal protein S9  54.03 
 
 		 161 aa  147  5e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.550147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1179  30S ribosomal protein S9  54.03 
 
 		 161 aa  147  6e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.554063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2608  30S ribosomal protein S9  55.38 
 
 		 130 aa  146  9e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0410125  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1050  30S ribosomal protein S9  50.77 
 
 		 130 aa  146  1.0000000000000001e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000126027  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0149  30S ribosomal protein S9  52.42 
 
 		 162 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4611  30S ribosomal protein S9  53.23 
 
 		 162 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0520803 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0021  30S ribosomal protein S9  56.45 
 
 		 160 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.849835  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1601  30S ribosomal protein S9  55.65 
 
 		 164 aa  145  2.0000000000000003e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.292372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1650  30S ribosomal protein S9  56.45 
 
 		 160 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.377487 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2175  30S ribosomal protein S9  55.65 
 
 		 160 aa  144  3e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0915323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1513  SSU ribosomal protein S9P  54.84 
 
 		 165 aa  143  7.0000000000000006e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.472306 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0725  30S ribosomal protein S9  55.38 
 
 		 130 aa  142  1e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.616344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0734  30S ribosomal protein S9  51.54 
 
 		 130 aa  142  1e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000000144699  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1384  30S ribosomal protein S9  55.65 
 
 		 161 aa  142  1e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.839793 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2069  30S ribosomal protein S9  54.84 
 
 		 130 aa  142  1e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000831765  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2151  30S ribosomal protein S9  53.23 
 
 		 158 aa  142  2e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.45731  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3107  30S ribosomal protein S9  54.84 
 
 		 160 aa  142  2e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.966484  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2970  30S ribosomal protein S9  55.65 
 
 		 159 aa  142  2e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0570988  normal  0.349655 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2938  ribosomal protein S9  52.42 
 
 		 162 aa  142  2e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000844995 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0902  30S ribosomal protein S9  56.45 
 
 		 161 aa  141  3e-33  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.829966  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3285  30S ribosomal protein S9  50.81 
 
 		 180 aa  140  4e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4591  30S ribosomal protein S9  54.84 
 
 		 160 aa  140  4e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2708  30S ribosomal protein S9  54.03 
 
 		 158 aa  140  4e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.421371  normal  0.509442 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2425  30S ribosomal protein S9  54.84 
 
 		 164 aa  140  5e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.149157  normal  0.160414 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3025  30S ribosomal protein S9  52.42 
 
 		 157 aa  140  8e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.795745 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0913  ribosomal protein S9  50.78 
 
 		 129 aa  139  9.999999999999999e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000269489  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1422  30S ribosomal protein S9  54.03 
 
 		 158 aa  139  9.999999999999999e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.51395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0244  30S ribosomal protein S9  52.42 
 
 		 165 aa  139  9.999999999999999e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.411662 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3348  ribosomal protein S9  50.78 
 
 		 129 aa  139  9.999999999999999e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0614997 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2672  30S ribosomal protein S9  53.23 
 
 		 158 aa  138  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.569835  normal  0.132209 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0562  SSU ribosomal protein S9P  51.61 
 
 		 131 aa  139  1.9999999999999998e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000000134066  normal  0.199008 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1163  30S ribosomal protein S9  54.84 
 
 		 160 aa  138  1.9999999999999998e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.456788  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4594  30S ribosomal protein S9  52.42 
 
 		 188 aa  137  3e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2454  30S ribosomal protein S9  53.23 
 
 		 158 aa  138  3e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.812734  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3627  30S ribosomal protein S9  52.31 
 
 		 130 aa  138  3e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000023775  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1681  30S ribosomal protein S9  54.84 
 
 		 155 aa  138  3e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00362695  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4345  30S ribosomal protein S9  51.61 
 
 		 160 aa  137  3.9999999999999997e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.59912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4693  30S ribosomal protein S9  50 
 
 		 130 aa  137  6e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00380118  normal  0.0220476 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0861  30S ribosomal protein S9  54.84 
 
 		 155 aa  137  6e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0415089  normal  0.103809 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0607  30S ribosomal protein S9  47.69 
 
 		 130 aa  137  7e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000206629  hitchhiker  0.00149279 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1321  30S ribosomal protein S9  54.03 
 
 		 155 aa  136  7.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.243338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2697  30S ribosomal protein S9  52.42 
 
 		 161 aa  136  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.145825  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1063  30S ribosomal protein S9  53.85 
 
 		 130 aa  135  2e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00000313432  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2875  30S ribosomal protein S9  47.69 
 
 		 130 aa  135  2e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0195834  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4425  ribosomal protein S9  50 
 
 		 130 aa  135  2e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.146621  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4119  30S ribosomal protein S9  50 
 
 		 130 aa  135  2e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3517  30S ribosomal protein S9  50 
 
 		 130 aa  135  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.143376  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3371  30S ribosomal protein S9  50 
 
 		 130 aa  135  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0767368  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3453  30S ribosomal protein S9  50 
 
 		 130 aa  135  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0902  30S ribosomal protein S9  49.23 
 
 		 130 aa  134  4e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13050  30S ribosomal protein S9  49.23 
 
 		 130 aa  134  4e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1234  30S ribosomal protein S9  53.23 
 
 		 155 aa  134  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.745621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1476  30S ribosomal protein S9  51.61 
 
 		 166 aa  134  5e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.270542 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0144  30S ribosomal protein S9  52.31 
 
 		 130 aa  134  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000361179  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0139  30S ribosomal protein S9  52.31 
 
 		 130 aa  134  6.0000000000000005e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.11946e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0137  30S ribosomal protein S9  52.31 
 
 		 130 aa  134  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000359543  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5160  30S ribosomal protein S9  52.31 
 
 		 130 aa  134  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000743375  hitchhiker  0.0000000912351 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0176  30S ribosomal protein S9  52.31 
 
 		 130 aa  134  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000140848  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0157  30S ribosomal protein S9  52.31 
 
 		 130 aa  134  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.4920599999999996e-31 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0166  30S ribosomal protein S9  52.31 
 
 		 130 aa  134  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00347352  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2496  30S ribosomal protein S9  52.42 
 
 		 158 aa  133  7.000000000000001e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3436  30S ribosomal protein S9  49.23 
 
 		 131 aa  133  7.000000000000001e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.113849  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0790  30S ribosomal protein S9  52.42 
 
 		 158 aa  133  8e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.552498  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0786  30S ribosomal protein S9  52.42 
 
 		 158 aa  133  8e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.637937  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2679  ribosomal protein S9  50 
 
 		 130 aa  132  9.999999999999999e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0151101  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1668  ribosomal protein S9  54.62 
 
 		 130 aa  132  9.999999999999999e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.0000154129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0795  30S ribosomal protein S9  51.61 
 
 		 130 aa  132  1.9999999999999998e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000718866  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04080  30S ribosomal protein S9  51.97 
 
 		 128 aa  132  1.9999999999999998e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0139  30S ribosomal protein S9  51.54 
 
 		 130 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000424807  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0138  30S ribosomal protein S9  51.54 
 
 		 130 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000590069  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4533  30S ribosomal protein S9  48.46 
 
 		 130 aa  131  3e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.848049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3163  30S ribosomal protein S9  50 
 
 		 130 aa  131  3e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.247444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0247  SSU ribosomal protein S9P  50 
 
 		 130 aa  131  3.9999999999999996e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00762963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2249  30S ribosomal protein S9  50 
 
 		 163 aa  130  5e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3070  30S ribosomal protein S9  52.31 
 
 		 130 aa  130  6e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000352838  normal  0.198807 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0145  30S ribosomal protein S9  50 
 
 		 130 aa  130  6.999999999999999e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000670079  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1316  30S ribosomal protein S9  47.69 
 
 		 130 aa  130  7.999999999999999e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.428523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4408  30S ribosomal protein S9  47.69 
 
 		 130 aa  130  7.999999999999999e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.40853 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4442  ribosomal protein S9  48.46 
 
 		 130 aa  129  1.0000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0144  30S ribosomal protein S9  51.54 
 
 		 130 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133435  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0650  SSU ribosomal protein S9P  50 
 
 		 130 aa  129  1.0000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  1.4124e-16  normal  0.0939463 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0144  30S ribosomal protein S9  51.54 
 
 		 130 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000533856  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1782  30S ribosomal protein S9  51.61 
 
 		 130 aa  128  2.0000000000000002e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000024243  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0923  30S ribosomal protein S9  47.69 
 
 		 130 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3293  30S ribosomal protein S9  51.54 
 
 		 130 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000148641  hitchhiker  0.00108393 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0853  30S ribosomal protein S9  52.46 
 
 		 124 aa  128  3e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000119355  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1566  30S ribosomal protein S9  51.61 
 
 		 128 aa  128  3e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000968491  normal  0.322438 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2241  SSU ribosomal protein S9P  48.46 
 
 		 130 aa  128  3e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.201316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2399  ribosomal protein S9  48.46 
 
 		 130 aa  128  3e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.696602  normal  0.066769 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3665  30S ribosomal protein S9  48.46 
 
 		 130 aa  127  4.0000000000000003e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0023412  normal  0.0755267 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>