More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1668 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_1668  ribosomal protein S9  100 
 
 		 130 aa  263  5.999999999999999e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.0000154129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1899  30S ribosomal protein S9  73.85 
 
 		 130 aa  204  3e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  3.1303899999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3190  30S ribosomal protein S9  70 
 
 		 130 aa  191  4e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000452354  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3085  30S ribosomal protein S9  70 
 
 		 130 aa  189  1e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000996861  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1050  30S ribosomal protein S9  64.62 
 
 		 130 aa  182  2.0000000000000003e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000126027  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0913  ribosomal protein S9  62.4 
 
 		 129 aa  173  6e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000269489  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3348  ribosomal protein S9  62.4 
 
 		 129 aa  172  9.999999999999999e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0614997 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0607  30S ribosomal protein S9  62.31 
 
 		 130 aa  171  3.9999999999999995e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000206629  hitchhiker  0.00149279 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3371  30S ribosomal protein S9  64.62 
 
 		 130 aa  170  5e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0767368  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3453  30S ribosomal protein S9  64.62 
 
 		 130 aa  170  5e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3517  30S ribosomal protein S9  64.62 
 
 		 130 aa  170  5e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.143376  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2875  30S ribosomal protein S9  62.31 
 
 		 130 aa  170  7.999999999999999e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0195834  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0048  30S ribosomal protein S9  63.85 
 
 		 130 aa  167  5e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1179  30S ribosomal protein S9  62.79 
 
 		 161 aa  165  2e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.554063  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3107  30S ribosomal protein S9  63.49 
 
 		 160 aa  164  4e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.966484  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3436  30S ribosomal protein S9  61.54 
 
 		 131 aa  164  4e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.113849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4591  30S ribosomal protein S9  65.08 
 
 		 160 aa  163  8e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2708  30S ribosomal protein S9  64.29 
 
 		 158 aa  163  9e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.421371  normal  0.509442 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0725  30S ribosomal protein S9  63.85 
 
 		 130 aa  161  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.616344  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0970  30S ribosomal protein S9  60.77 
 
 		 130 aa  161  3e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.476085 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2672  30S ribosomal protein S9  63.49 
 
 		 158 aa  160  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.569835  normal  0.132209 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1872  30S ribosomal protein S9  61.24 
 
 		 159 aa  160  7e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.952658 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2650  30S ribosomal protein S9  60.47 
 
 		 161 aa  159  9e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.550147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2454  30S ribosomal protein S9  61.9 
 
 		 158 aa  159  1e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.812734  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0145  30S ribosomal protein S9  61.54 
 
 		 130 aa  158  2e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000670079  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1422  30S ribosomal protein S9  61.11 
 
 		 158 aa  158  2e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.51395  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3638  ribosomal protein S9  57.69 
 
 		 130 aa  159  2e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00994207  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3627  30S ribosomal protein S9  60 
 
 		 130 aa  159  2e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000023775  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4611  30S ribosomal protein S9  58.91 
 
 		 162 aa  158  2e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0520803 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3796  ribosomal protein S9  57.69 
 
 		 130 aa  158  2e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000182281  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2843  30S ribosomal protein S9  59.69 
 
 		 161 aa  157  4e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0861  30S ribosomal protein S9  60.47 
 
 		 155 aa  157  4e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0415089  normal  0.103809 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2620  30S ribosomal protein S9  59.69 
 
 		 161 aa  157  4e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.159482 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2697  30S ribosomal protein S9  61.11 
 
 		 161 aa  157  5e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.145825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2679  ribosomal protein S9  58.46 
 
 		 130 aa  157  6e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0151101  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1163  30S ribosomal protein S9  58.14 
 
 		 160 aa  156  7e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.456788  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2938  ribosomal protein S9  62.7 
 
 		 162 aa  156  8e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000844995 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2069  30S ribosomal protein S9  56.92 
 
 		 130 aa  156  8e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000831765  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0734  30S ribosomal protein S9  58.46 
 
 		 130 aa  156  8e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000000144699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2496  30S ribosomal protein S9  58.14 
 
 		 158 aa  155  1e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0790  30S ribosomal protein S9  58.14 
 
 		 158 aa  155  1e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.552498  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0786  30S ribosomal protein S9  58.14 
 
 		 158 aa  155  1e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.637937  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1063  30S ribosomal protein S9  60.77 
 
 		 130 aa  155  1e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00000313432  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1782  30S ribosomal protein S9  59.23 
 
 		 130 aa  155  2e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000024243  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2175  30S ribosomal protein S9  59.52 
 
 		 160 aa  155  2e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0915323  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1321  30S ribosomal protein S9  59.52 
 
 		 155 aa  155  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.243338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0149  30S ribosomal protein S9  56.59 
 
 		 162 aa  155  2e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4348  30S ribosomal protein S9  56.15 
 
 		 130 aa  154  4e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000012665  hitchhiker  0.00291766 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13050  30S ribosomal protein S9  56.92 
 
 		 130 aa  154  5.0000000000000005e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1681  30S ribosomal protein S9  58.91 
 
 		 155 aa  154  5.0000000000000005e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00362695  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0215  30S ribosomal protein S9  58.46 
 
 		 130 aa  153  6e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00249156  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2151  30S ribosomal protein S9  58.91 
 
 		 158 aa  153  6e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.45731  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4345  30S ribosomal protein S9  61.11 
 
 		 160 aa  153  7e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.59912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0902  30S ribosomal protein S9  58.73 
 
 		 161 aa  153  7e-37  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.829966  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0021  30S ribosomal protein S9  59.52 
 
 		 160 aa  153  7e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.849835  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1650  30S ribosomal protein S9  59.52 
 
 		 160 aa  153  7e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.377487 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1379  30S ribosomal protein S9  57.94 
 
 		 159 aa  153  8e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0851685 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0104  30S ribosomal protein S9  56.92 
 
 		 130 aa  152  1e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000569691  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1234  30S ribosomal protein S9  58.73 
 
 		 155 aa  152  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.745621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0006  ribosomal protein S9  58.73 
 
 		 133 aa  153  1e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.819912  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3665  30S ribosomal protein S9  55.38 
 
 		 130 aa  152  1e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0023412  normal  0.0755267 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1601  30S ribosomal protein S9  57.94 
 
 		 164 aa  151  2e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.292372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0300  30S ribosomal protein S9  54.62 
 
 		 130 aa  152  2e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00212654  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0321  30S ribosomal protein S9  57.69 
 
 		 130 aa  152  2e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000288169  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03090  30S ribosomal protein S9  54.62 
 
 		 130 aa  151  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000557445  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0476  ribosomal protein S9  54.62 
 
 		 130 aa  151  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000601039  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3713  30S ribosomal protein S9  54.62 
 
 		 130 aa  151  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000596943  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4693  30S ribosomal protein S9  55.38 
 
 		 130 aa  151  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00380118  normal  0.0220476 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3546  30S ribosomal protein S9  54.62 
 
 		 130 aa  151  2.9999999999999998e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000104404  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3419  30S ribosomal protein S9  54.62 
 
 		 130 aa  151  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000112038  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4547  30S ribosomal protein S9  54.62 
 
 		 130 aa  151  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000371086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3525  30S ribosomal protein S9  54.62 
 
 		 130 aa  151  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000016286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0476  30S ribosomal protein S9  54.62 
 
 		 130 aa  151  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000111446  normal  0.163216 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00882  30S ribosomal protein S9  56.15 
 
 		 130 aa  151  2.9999999999999998e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03041  hypothetical protein  54.62 
 
 		 130 aa  151  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000287646  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2970  30S ribosomal protein S9  60.32 
 
 		 159 aa  151  2.9999999999999998e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0570988  normal  0.349655 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0293  ribosomal protein S9  54.62 
 
 		 130 aa  150  4e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.000515876  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3025  30S ribosomal protein S9  59.69 
 
 		 157 aa  150  4e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.795745 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0128  30S ribosomal protein S9  56.15 
 
 		 130 aa  150  4e-36  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000606121  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4425  ribosomal protein S9  55.38 
 
 		 130 aa  150  5e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.146621  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4119  30S ribosomal protein S9  55.38 
 
 		 130 aa  150  5e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1476  30S ribosomal protein S9  56.59 
 
 		 166 aa  150  5e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.270542 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3535  30S ribosomal protein S9  54.62 
 
 		 130 aa  150  5.9999999999999996e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000799314  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3704  30S ribosomal protein S9  54.62 
 
 		 130 aa  150  5.9999999999999996e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00817033  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3642  30S ribosomal protein S9  54.62 
 
 		 130 aa  150  5.9999999999999996e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000331692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2608  30S ribosomal protein S9  58.46 
 
 		 130 aa  150  5.9999999999999996e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0410125  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0945  ribosomal protein S9  54.62 
 
 		 130 aa  150  5.9999999999999996e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000533623  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1384  30S ribosomal protein S9  58.73 
 
 		 161 aa  150  5.9999999999999996e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.839793 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3607  30S ribosomal protein S9  54.62 
 
 		 130 aa  150  5.9999999999999996e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000867127  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3536  30S ribosomal protein S9  54.62 
 
 		 130 aa  150  5.9999999999999996e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.0000037617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2425  30S ribosomal protein S9  57.94 
 
 		 164 aa  149  8.999999999999999e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.149157  normal  0.160414 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0144  30S ribosomal protein S9  60 
 
 		 130 aa  149  1e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000361179  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0139  30S ribosomal protein S9  60 
 
 		 130 aa  149  1e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.11946e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0137  30S ribosomal protein S9  60 
 
 		 130 aa  149  1e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000359543  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4533  30S ribosomal protein S9  56.15 
 
 		 130 aa  149  1e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.848049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0166  30S ribosomal protein S9  60 
 
 		 130 aa  149  1e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00347352  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0560  30S ribosomal protein S9  55.65 
 
 		 130 aa  149  1e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000599765  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3285  30S ribosomal protein S9  58.91 
 
 		 180 aa  149  1e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5160  30S ribosomal protein S9  60 
 
 		 130 aa  149  1e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000743375  hitchhiker  0.0000000912351 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0902  30S ribosomal protein S9  55.38 
 
 		 130 aa  149  1e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>