More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_04080 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_04080  30S ribosomal protein S9  100 
 
 		 128 aa  263  8e-70  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0722  30S ribosomal protein S9  77.34 
 
 		 128 aa  209  9e-54  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1611  30S ribosomal protein S9  73.44 
 
 		 128 aa  205  1e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0149645  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0111  ribosomal protein S9  60.94 
 
 		 128 aa  155  2e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000221009  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1811  30S ribosomal protein S9  58.27 
 
 		 131 aa  154  4e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.170614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3038  30S ribosomal protein S9  58.59 
 
 		 128 aa  154  4e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0109364  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4742  ribosomal protein S9  56.25 
 
 		 128 aa  151  2.9999999999999998e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000000153745  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0342  30S ribosomal protein S9  59.5 
 
 		 136 aa  150  4e-36  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00140539  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0853  30S ribosomal protein S9  59.5 
 
 		 124 aa  150  5e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000119355  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0051  30S ribosomal protein S9  55.47 
 
 		 128 aa  148  3e-35  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3496  30S ribosomal protein S9  56.25 
 
 		 128 aa  147  4e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000030471  normal  0.91876 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2014  30S ribosomal protein S9  55.12 
 
 		 131 aa  144  3e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.27603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0423  30S ribosomal protein S9  55.12 
 
 		 129 aa  142  1e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00762488  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2011  30S ribosomal protein S9  53.54 
 
 		 129 aa  141  3e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00763906  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0402  30S ribosomal protein S9  53.54 
 
 		 129 aa  139  9.999999999999999e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.248058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0902  30S ribosomal protein S9  55.38 
 
 		 130 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000079624  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3627  30S ribosomal protein S9  56.2 
 
 		 130 aa  138  3e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000023775  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0881  ribosomal protein S9  57.38 
 
 		 129 aa  137  4.999999999999999e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0912  30S ribosomal protein S9  51.16 
 
 		 129 aa  137  7e-32  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0006  ribosomal protein S9  54.1 
 
 		 133 aa  136  1e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.819912  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3085  30S ribosomal protein S9  55.12 
 
 		 130 aa  136  1e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000996861  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1598  30S ribosomal protein S9  51.16 
 
 		 129 aa  135  2e-31  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00000000158082  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0376  30S ribosomal protein S9  54.69 
 
 		 128 aa  135  2e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1798  30S ribosomal protein S9  58.68 
 
 		 130 aa  134  3.0000000000000003e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0323  30S ribosomal protein S9  57.85 
 
 		 131 aa  134  6.0000000000000005e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000255899  hitchhiker  5.84326e-17 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2069  30S ribosomal protein S9  55.65 
 
 		 130 aa  133  7.000000000000001e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000831765  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0738  30S ribosomal protein S9  50.39 
 
 		 129 aa  133  8e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.211677  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0385  30S ribosomal protein S9  50.39 
 
 		 129 aa  133  8e-31  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.704674  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1566  30S ribosomal protein S9  54.69 
 
 		 128 aa  133  9e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000968491  normal  0.322438 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1899  30S ribosomal protein S9  51.18 
 
 		 130 aa  133  9e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  3.1303899999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1826  30S ribosomal protein S9  49.61 
 
 		 129 aa  132  9.999999999999999e-31  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.0000606063  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1652  30S ribosomal protein S9  49.61 
 
 		 129 aa  132  9.999999999999999e-31  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.386728  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1472  30S ribosomal protein S9  49.61 
 
 		 129 aa  132  9.999999999999999e-31  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000347675  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0230  SSU ribosomal protein S9P  57.85 
 
 		 132 aa  133  9.999999999999999e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000443747  normal  0.670048 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0945  ribosomal protein S9  51.97 
 
 		 130 aa  132  1.9999999999999998e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000533623  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0215  30S ribosomal protein S9  57.02 
 
 		 130 aa  131  3e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00249156  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0970  30S ribosomal protein S9  53.23 
 
 		 130 aa  131  3e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.476085 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0388  30S ribosomal protein S9  49.61 
 
 		 129 aa  131  3e-30  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2151  30S ribosomal protein S9  50 
 
 		 158 aa  130  5e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.45731  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2285  30S ribosomal protein S9  57.02 
 
 		 130 aa  130  6e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000447741  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0128  30S ribosomal protein S9  56.2 
 
 		 130 aa  130  6e-30  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000606121  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2244  30S ribosomal protein S9  57.02 
 
 		 130 aa  130  6e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000238567  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1050  30S ribosomal protein S9  50.79 
 
 		 130 aa  129  1.0000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000126027  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3453  30S ribosomal protein S9  53.28 
 
 		 130 aa  129  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3190  30S ribosomal protein S9  51.59 
 
 		 130 aa  129  1.0000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000452354  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2679  ribosomal protein S9  54.92 
 
 		 130 aa  129  1.0000000000000001e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0151101  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3371  30S ribosomal protein S9  53.28 
 
 		 130 aa  129  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0767368  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3285  30S ribosomal protein S9  49.19 
 
 		 180 aa  129  1.0000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0056  SSU ribosomal protein S9P  52.42 
 
 		 130 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0128063  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3517  30S ribosomal protein S9  53.28 
 
 		 130 aa  129  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.143376  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0149  30S ribosomal protein S9  50 
 
 		 162 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4611  30S ribosomal protein S9  50 
 
 		 162 aa  128  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0520803 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3025  30S ribosomal protein S9  47.58 
 
 		 157 aa  129  2.0000000000000002e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.795745 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0048  30S ribosomal protein S9  50.4 
 
 		 130 aa  128  2.0000000000000002e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1782  30S ribosomal protein S9  56.2 
 
 		 130 aa  128  2.0000000000000002e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000024243  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1748  30S ribosomal protein S9  53.12 
 
 		 128 aa  129  2.0000000000000002e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00000973218  normal  0.252579 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0562  SSU ribosomal protein S9P  50 
 
 		 131 aa  129  2.0000000000000002e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000000134066  normal  0.199008 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1163  30S ribosomal protein S9  50.81 
 
 		 160 aa  128  2.0000000000000002e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.456788  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2678  30S ribosomal protein S9  56.2 
 
 		 130 aa  128  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000125135  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2363  30S ribosomal protein S9  56.2 
 
 		 130 aa  128  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000350135  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3107  30S ribosomal protein S9  50 
 
 		 160 aa  128  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.966484  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1908  ribosomal protein S9  48.06 
 
 		 129 aa  128  3e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2608  30S ribosomal protein S9  52.89 
 
 		 130 aa  128  3e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0410125  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1233  30S ribosomal protein S9  52.42 
 
 		 130 aa  127  4.0000000000000003e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000147442  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1031  30S ribosomal protein S9  53.23 
 
 		 132 aa  127  4.0000000000000003e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.791116  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2938  ribosomal protein S9  50 
 
 		 162 aa  127  4.0000000000000003e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000844995 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2583  30S ribosomal protein S9  54.55 
 
 		 130 aa  127  5.0000000000000004e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000028456  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0224  30S ribosomal protein S9  54.1 
 
 		 135 aa  127  6e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0221  30S ribosomal protein S9  54.1 
 
 		 135 aa  127  7.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0143774  normal  0.010853 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0861  30S ribosomal protein S9  50 
 
 		 155 aa  127  7.000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0415089  normal  0.103809 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1872  30S ribosomal protein S9  50 
 
 		 159 aa  127  7.000000000000001e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.952658 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4591  30S ribosomal protein S9  49.19 
 
 		 160 aa  127  7.000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1476  30S ribosomal protein S9  48.39 
 
 		 166 aa  126  8.000000000000001e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.270542 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1649  30S ribosomal protein S9  55.12 
 
 		 129 aa  126  8.000000000000001e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0331  ribosomal protein S9  50.77 
 
 		 130 aa  126  9.000000000000001e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00016739  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0454  30S ribosomal protein S9  53.72 
 
 		 130 aa  126  9.000000000000001e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0255963  normal  0.796217 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2708  30S ribosomal protein S9  49.19 
 
 		 158 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.421371  normal  0.509442 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0725  30S ribosomal protein S9  53.72 
 
 		 130 aa  125  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.616344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3436  30S ribosomal protein S9  50.82 
 
 		 131 aa  125  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.113849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0321  30S ribosomal protein S9  49.6 
 
 		 130 aa  125  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000288169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1422  30S ribosomal protein S9  48.39 
 
 		 158 aa  124  3e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.51395  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2620  30S ribosomal protein S9  48.39 
 
 		 161 aa  124  3e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.159482 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2843  30S ribosomal protein S9  48.39 
 
 		 161 aa  124  3e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1527  ribosomal protein S9  52.07 
 
 		 132 aa  124  3e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000273794  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1179  30S ribosomal protein S9  48.39 
 
 		 161 aa  124  3e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.554063  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1321  30S ribosomal protein S9  48.39 
 
 		 155 aa  124  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.243338  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0145  30S ribosomal protein S9  53.72 
 
 		 130 aa  125  3e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000670079  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0144  30S ribosomal protein S9  53.23 
 
 		 130 aa  124  4.0000000000000003e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133435  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0144  30S ribosomal protein S9  53.23 
 
 		 130 aa  124  4.0000000000000003e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000533856  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0870  ribosomal protein S9  50.4 
 
 		 167 aa  124  4.0000000000000003e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1450  SSU ribosomal protein S9P  54.55 
 
 		 131 aa  124  5e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000188818  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2672  30S ribosomal protein S9  48.39 
 
 		 158 aa  124  5e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.569835  normal  0.132209 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0913  ribosomal protein S9  49.21 
 
 		 129 aa  124  5e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000269489  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0144  30S ribosomal protein S9  53.23 
 
 		 130 aa  124  6e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000361179  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0139  30S ribosomal protein S9  53.23 
 
 		 130 aa  124  6e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.11946e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0137  30S ribosomal protein S9  53.23 
 
 		 130 aa  124  6e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000359543  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0157  30S ribosomal protein S9  53.23 
 
 		 130 aa  124  6e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.4920599999999996e-31 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2354  30S ribosomal protein S9  52.76 
 
 		 129 aa  124  6e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0958602  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1341  30S ribosomal protein S9  53.23 
 
 		 134 aa  124  6e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000324124  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0247  SSU ribosomal protein S9P  49.61 
 
 		 130 aa  124  6e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00762963  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>