More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_1235 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_1235  ribosomal protein S9  100 
 
 
131 aa  270  5.000000000000001e-72  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.026641  normal  0.24615 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0111  ribosomal protein S9  52.42 
 
 
128 aa  137  3.9999999999999997e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000221009  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0231  SSU ribosomal protein S9P  54.2 
 
 
131 aa  136  8.999999999999999e-32  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.0000192076  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0006  ribosomal protein S9  55.91 
 
 
133 aa  134  3.0000000000000003e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.819912  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0128  30S ribosomal protein S9  55.2 
 
 
130 aa  134  3.0000000000000003e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000606121  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1611  30S ribosomal protein S9  53.72 
 
 
128 aa  133  8e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0149645  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1450  SSU ribosomal protein S9P  52.67 
 
 
131 aa  132  1.9999999999999998e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000188818  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0215  30S ribosomal protein S9  54.4 
 
 
130 aa  131  3.9999999999999996e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00249156  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0734  30S ribosomal protein S9  51.15 
 
 
130 aa  130  6.999999999999999e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000000144699  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2583  30S ribosomal protein S9  53.6 
 
 
130 aa  128  2.0000000000000002e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000028456  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2069  30S ribosomal protein S9  52 
 
 
130 aa  127  4.0000000000000003e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000831765  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1899  30S ribosomal protein S9  50.4 
 
 
130 aa  127  4.0000000000000003e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  3.1303899999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2151  30S ribosomal protein S9  52.85 
 
 
158 aa  127  4.0000000000000003e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.45731  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0145  30S ribosomal protein S9  52.67 
 
 
130 aa  127  5.0000000000000004e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000670079  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1546  ribosomal protein S9  51.56 
 
 
131 aa  127  5.0000000000000004e-29  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000425465  hitchhiker  0.00000000000000208113 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4742  ribosomal protein S9  51.61 
 
 
128 aa  127  7.000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000000153745  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0323  30S ribosomal protein S9  49.62 
 
 
131 aa  127  7.000000000000001e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000255899  hitchhiker  5.84326e-17 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0342  30S ribosomal protein S9  49.59 
 
 
136 aa  126  1.0000000000000001e-28  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00140539  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0629  SSU ribosomal protein S9P  59.06 
 
 
130 aa  125  2.0000000000000002e-28  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000391075  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0051  30S ribosomal protein S9  48.39 
 
 
128 aa  125  3e-28  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0138  30S ribosomal protein S9  52.8 
 
 
130 aa  125  3e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000590069  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0144  30S ribosomal protein S9  52 
 
 
130 aa  124  4.0000000000000003e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133435  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0144  30S ribosomal protein S9  52 
 
 
130 aa  124  4.0000000000000003e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000533856  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2014  30S ribosomal protein S9  47.33 
 
 
131 aa  124  4.0000000000000003e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.27603  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3038  30S ribosomal protein S9  51.61 
 
 
128 aa  124  5e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0109364  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0144  30S ribosomal protein S9  52 
 
 
130 aa  124  6e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000361179  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0139  30S ribosomal protein S9  52 
 
 
130 aa  124  6e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.11946e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0137  30S ribosomal protein S9  52 
 
 
130 aa  124  6e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000359543  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0157  30S ribosomal protein S9  52 
 
 
130 aa  124  6e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.4920599999999996e-31 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5160  30S ribosomal protein S9  52 
 
 
130 aa  124  6e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000743375  hitchhiker  0.0000000912351 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0176  30S ribosomal protein S9  52 
 
 
130 aa  124  6e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000140848  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0166  30S ribosomal protein S9  52 
 
 
130 aa  124  6e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00347352  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0902  30S ribosomal protein S9  52.34 
 
 
130 aa  123  7e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000079624  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1050  30S ribosomal protein S9  46.83 
 
 
130 aa  123  8.000000000000001e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000126027  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0247  SSU ribosomal protein S9P  51.15 
 
 
130 aa  123  8.000000000000001e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00762963  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3496  30S ribosomal protein S9  51.61 
 
 
128 aa  123  9e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000030471  normal  0.91876 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2679  ribosomal protein S9  52 
 
 
130 aa  122  1e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0151101  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2876  ribosomal protein S9  50.4 
 
 
129 aa  122  1e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0513337  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2608  30S ribosomal protein S9  48.09 
 
 
130 aa  122  2e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0410125  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0321  30S ribosomal protein S9  48.09 
 
 
130 aa  122  2e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000288169  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0562  SSU ribosomal protein S9P  45.04 
 
 
131 aa  122  2e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000000134066  normal  0.199008 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2011  30S ribosomal protein S9  48.39 
 
 
129 aa  122  2e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00763906  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0662  30S ribosomal protein S9  52 
 
 
132 aa  121  3e-27  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.219101  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2244  30S ribosomal protein S9  52.8 
 
 
130 aa  121  3e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000238567  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2285  30S ribosomal protein S9  52.8 
 
 
130 aa  121  3e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000447741  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0139  30S ribosomal protein S9  51.2 
 
 
130 aa  121  3e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000424807  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04080  30S ribosomal protein S9  49.59 
 
 
128 aa  121  4e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1798  30S ribosomal protein S9  52 
 
 
130 aa  120  6e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13050  30S ribosomal protein S9  50.38 
 
 
130 aa  120  6e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3627  30S ribosomal protein S9  50.4 
 
 
130 aa  120  6e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000023775  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3085  30S ribosomal protein S9  46.03 
 
 
130 aa  120  6e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000996861  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0853  30S ribosomal protein S9  47.54 
 
 
124 aa  120  8e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000119355  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3190  30S ribosomal protein S9  46.4 
 
 
130 aa  120  8e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000452354  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2399  ribosomal protein S9  50.39 
 
 
130 aa  119  9.999999999999999e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.696602  normal  0.066769 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3665  30S ribosomal protein S9  48 
 
 
130 aa  119  1.9999999999999998e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0023412  normal  0.0755267 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1811  30S ribosomal protein S9  46.56 
 
 
131 aa  119  1.9999999999999998e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.170614  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0722  30S ribosomal protein S9  51.24 
 
 
128 aa  119  1.9999999999999998e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0331  ribosomal protein S9  51.2 
 
 
130 aa  118  1.9999999999999998e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00016739  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0212  ribosomal protein S9  49.21 
 
 
131 aa  118  1.9999999999999998e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000467508  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4348  30S ribosomal protein S9  48.8 
 
 
130 aa  119  1.9999999999999998e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000012665  hitchhiker  0.00291766 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1601  30S ribosomal protein S9  47.15 
 
 
164 aa  118  1.9999999999999998e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.292372  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0376  30S ribosomal protein S9  52.42 
 
 
128 aa  117  3.9999999999999996e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01520  ribosomal protein S9  49.62 
 
 
131 aa  117  3.9999999999999996e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000216085  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01720  SSU ribosomal protein S9P  51.15 
 
 
130 aa  117  3.9999999999999996e-26  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.0000000110111  hitchhiker  0.000000000473134 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3371  30S ribosomal protein S9  49.18 
 
 
130 aa  117  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0767368  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3453  30S ribosomal protein S9  49.18 
 
 
130 aa  117  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3163  30S ribosomal protein S9  50.4 
 
 
130 aa  117  3.9999999999999996e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.247444  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1063  30S ribosomal protein S9  50.38 
 
 
130 aa  117  3.9999999999999996e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00000313432  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02470  ribosomal protein S9  49.62 
 
 
131 aa  117  3.9999999999999996e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000158686  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3517  30S ribosomal protein S9  49.18 
 
 
130 aa  117  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.143376  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0913  ribosomal protein S9  42.86 
 
 
129 aa  117  3.9999999999999996e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000269489  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03090  30S ribosomal protein S9  47.2 
 
 
130 aa  117  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000557445  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0476  ribosomal protein S9  47.2 
 
 
130 aa  117  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000601039  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4547  30S ribosomal protein S9  47.2 
 
 
130 aa  117  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000371086  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3546  30S ribosomal protein S9  47.2 
 
 
130 aa  117  4.9999999999999996e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000104404  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3713  30S ribosomal protein S9  47.2 
 
 
130 aa  117  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000596943  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3419  30S ribosomal protein S9  47.2 
 
 
130 aa  117  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000112038  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0402  30S ribosomal protein S9  48.39 
 
 
129 aa  117  4.9999999999999996e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.248058  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3285  30S ribosomal protein S9  47.97 
 
 
180 aa  117  4.9999999999999996e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0423  30S ribosomal protein S9  48.39 
 
 
129 aa  117  4.9999999999999996e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00762488  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3525  30S ribosomal protein S9  47.2 
 
 
130 aa  117  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000016286  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0881  ribosomal protein S9  45.97 
 
 
129 aa  117  4.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0476  30S ribosomal protein S9  47.2 
 
 
130 aa  117  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000111446  normal  0.163216 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03041  hypothetical protein  47.2 
 
 
130 aa  117  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000287646  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0725  30S ribosomal protein S9  50.39 
 
 
130 aa  117  4.9999999999999996e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.616344  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3348  ribosomal protein S9  42.86 
 
 
129 aa  117  6e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0614997 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1782  30S ribosomal protein S9  49.6 
 
 
130 aa  117  6e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000024243  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0970  30S ribosomal protein S9  49.18 
 
 
130 aa  117  6e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.476085 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0021  30S ribosomal protein S9  46.34 
 
 
160 aa  117  6e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.849835  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1650  30S ribosomal protein S9  46.34 
 
 
160 aa  117  6e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.377487 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0461  30S ribosomal protein S9  48.8 
 
 
130 aa  117  6e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000140237  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1133  30S ribosomal protein S9  48.8 
 
 
130 aa  117  6e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000113025  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0525  30S ribosomal protein S9  48.8 
 
 
130 aa  117  6e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000883336  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0676  30S ribosomal protein S9  47.69 
 
 
133 aa  117  7e-26  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.958847  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_448  ribosomal protein S9  48.09 
 
 
132 aa  116  7.999999999999999e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000184365  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl492  30S ribosomal protein S9  48.09 
 
 
131 aa  115  9.999999999999999e-26  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.263137  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4119  30S ribosomal protein S9  49.62 
 
 
130 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0902  30S ribosomal protein S9  49.62 
 
 
130 aa  115  9.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0300  30S ribosomal protein S9  47.2 
 
 
130 aa  116  9.999999999999999e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00212654  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0048  30S ribosomal protein S9  45.8 
 
 
130 aa  116  9.999999999999999e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>