More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_2014 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_2014  30S ribosomal protein S9  100 
 
 
131 aa  263  7e-70  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.27603  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1811  30S ribosomal protein S9  74.05 
 
 
131 aa  204  5e-52  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.170614  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0423  30S ribosomal protein S9  68.22 
 
 
129 aa  184  3e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00762488  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2011  30S ribosomal protein S9  67.44 
 
 
129 aa  184  3e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00763906  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0402  30S ribosomal protein S9  66.67 
 
 
129 aa  182  1.0000000000000001e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.248058  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1649  30S ribosomal protein S9  73.64 
 
 
129 aa  172  9.999999999999999e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2354  30S ribosomal protein S9  68.22 
 
 
129 aa  170  5e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0958602  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0722  30S ribosomal protein S9  58.27 
 
 
128 aa  146  8e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04080  30S ribosomal protein S9  55.12 
 
 
128 aa  144  3e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0006  ribosomal protein S9  57.72 
 
 
133 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.819912  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1611  30S ribosomal protein S9  52.8 
 
 
128 aa  134  3.0000000000000003e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0149645  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3038  30S ribosomal protein S9  54.33 
 
 
128 aa  134  5e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0109364  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3496  30S ribosomal protein S9  51.18 
 
 
128 aa  130  7.999999999999999e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000030471  normal  0.91876 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0051  30S ribosomal protein S9  53.54 
 
 
128 aa  129  9e-30  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0342  30S ribosomal protein S9  50.41 
 
 
136 aa  127  5.0000000000000004e-29  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00140539  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2678  30S ribosomal protein S9  55.28 
 
 
130 aa  126  8.000000000000001e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000125135  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2363  30S ribosomal protein S9  55.28 
 
 
130 aa  126  8.000000000000001e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000350135  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0853  30S ribosomal protein S9  49.59 
 
 
124 aa  126  1.0000000000000001e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000119355  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0902  30S ribosomal protein S9  53.66 
 
 
130 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000079624  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1546  ribosomal protein S9  51.16 
 
 
131 aa  125  2.0000000000000002e-28  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000425465  hitchhiker  0.00000000000000208113 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1235  ribosomal protein S9  47.33 
 
 
131 aa  124  4.0000000000000003e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.026641  normal  0.24615 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20520  SSU ribosomal protein S9P  54.84 
 
 
171 aa  124  6e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.476775  normal  0.598664 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0323  30S ribosomal protein S9  51.15 
 
 
131 aa  123  8.000000000000001e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000255899  hitchhiker  5.84326e-17 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2679  ribosomal protein S9  53.66 
 
 
130 aa  121  3e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0151101  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3627  30S ribosomal protein S9  50 
 
 
130 aa  121  3e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000023775  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0247  SSU ribosomal protein S9P  50 
 
 
130 aa  121  4e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00762963  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0149  30S ribosomal protein S9  48.78 
 
 
162 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4611  30S ribosomal protein S9  48.78 
 
 
162 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0520803 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1179  30S ribosomal protein S9  48.78 
 
 
161 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.554063  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0212  ribosomal protein S9  53.23 
 
 
131 aa  119  9.999999999999999e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000467508  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0800  30S ribosomal protein S9  52.76 
 
 
135 aa  118  1.9999999999999998e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.435176  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01520  ribosomal protein S9  51.15 
 
 
131 aa  118  1.9999999999999998e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000216085  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0562  SSU ribosomal protein S9P  52.03 
 
 
131 aa  119  1.9999999999999998e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000000134066  normal  0.199008 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02470  ribosomal protein S9  51.15 
 
 
131 aa  118  1.9999999999999998e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000158686  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4742  ribosomal protein S9  48 
 
 
128 aa  118  3e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000000153745  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1748  30S ribosomal protein S9  50.41 
 
 
128 aa  118  3e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00000973218  normal  0.252579 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3105  ribosomal protein S9  51.61 
 
 
162 aa  117  3.9999999999999996e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2471  ribosomal protein S9  47.97 
 
 
130 aa  117  3.9999999999999996e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0151898  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2297  ribosomal protein S9  47.97 
 
 
130 aa  117  6e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000207473  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1341  30S ribosomal protein S9  49.25 
 
 
134 aa  117  6e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000324124  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2843  30S ribosomal protein S9  47.97 
 
 
161 aa  116  7.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1345  30S ribosomal protein S9  50.79 
 
 
134 aa  117  7.999999999999999e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00368639  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2620  30S ribosomal protein S9  47.97 
 
 
161 aa  116  7.999999999999999e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.159482 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0560  30S ribosomal protein S9  49.59 
 
 
130 aa  116  7.999999999999999e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000599765  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2069  30S ribosomal protein S9  53.66 
 
 
130 aa  116  7.999999999999999e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000831765  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0433  30S ribosomal protein S9  48.48 
 
 
132 aa  116  9.999999999999999e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0713606  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3517  30S ribosomal protein S9  48.09 
 
 
130 aa  115  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.143376  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3453  30S ribosomal protein S9  48.09 
 
 
130 aa  115  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1566  30S ribosomal protein S9  49.59 
 
 
128 aa  115  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000968491  normal  0.322438 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1031  30S ribosomal protein S9  48.48 
 
 
132 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.791116  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3371  30S ribosomal protein S9  48.09 
 
 
130 aa  115  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0767368  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2650  30S ribosomal protein S9  47.97 
 
 
161 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.550147  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0230  SSU ribosomal protein S9P  53.66 
 
 
132 aa  115  1.9999999999999998e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000443747  normal  0.670048 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0342  SSU ribosomal protein S9P  53.17 
 
 
170 aa  115  1.9999999999999998e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0651444  hitchhiker  0.00386337 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0821  30S ribosomal protein S9  49.59 
 
 
149 aa  114  3.9999999999999997e-25  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.766995  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1899  30S ribosomal protein S9  48.78 
 
 
130 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  3.1303899999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0321  30S ribosomal protein S9  49.59 
 
 
130 aa  114  5e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000288169  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1177  ribosomal protein S9  46.51 
 
 
174 aa  114  5e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.904807  normal  0.699948 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04450  SSU ribosomal protein S9P  49.21 
 
 
162 aa  114  5e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.271227 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0923  30S ribosomal protein S9  47.69 
 
 
130 aa  114  5e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16860  30S ribosomal protein S9  50.4 
 
 
162 aa  114  6e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.944317  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0111  ribosomal protein S9  51.97 
 
 
128 aa  113  6.9999999999999995e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000221009  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4348  30S ribosomal protein S9  49.59 
 
 
130 aa  113  7.999999999999999e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000012665  hitchhiker  0.00291766 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1233  30S ribosomal protein S9  49.23 
 
 
130 aa  113  7.999999999999999e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000147442  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1450  SSU ribosomal protein S9P  48.09 
 
 
131 aa  113  1.0000000000000001e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000188818  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3436  30S ribosomal protein S9  47.33 
 
 
131 aa  113  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.113849  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0870  ribosomal protein S9  45.04 
 
 
167 aa  113  1.0000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1379  30S ribosomal protein S9  48.78 
 
 
159 aa  113  1.0000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0851685 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1476  30S ribosomal protein S9  47.97 
 
 
166 aa  113  1.0000000000000001e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.270542 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0902  30S ribosomal protein S9  47.69 
 
 
130 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1154  ribosomal protein S9  48.12 
 
 
132 aa  112  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.252489  normal  0.0143228 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0253  30S ribosomal protein S9  47.79 
 
 
139 aa  112  2.0000000000000002e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000656502  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0331  ribosomal protein S9  50.41 
 
 
130 aa  112  2.0000000000000002e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00016739  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1782  30S ribosomal protein S9  50.41 
 
 
130 aa  112  2.0000000000000002e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000024243  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1018  30S ribosomal protein S9  48.78 
 
 
152 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3702  ribosomal protein S9  51.22 
 
 
130 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000244977  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1940  30S ribosomal protein S9  47.79 
 
 
139 aa  112  2.0000000000000002e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000532731  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3085  30S ribosomal protein S9  48.03 
 
 
130 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000996861  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0890  30S ribosomal protein S9  49.6 
 
 
166 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0300  30S ribosomal protein S9  49.59 
 
 
130 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00212654  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0215  30S ribosomal protein S9  49.59 
 
 
130 aa  111  3e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00249156  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0454  30S ribosomal protein S9  48.78 
 
 
130 aa  111  3e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0255963  normal  0.796217 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1885  ribosomal protein S9  48.78 
 
 
133 aa  111  3e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000534939  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3107  30S ribosomal protein S9  47.15 
 
 
160 aa  111  3e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.966484  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13050  30S ribosomal protein S9  47.69 
 
 
130 aa  111  4.0000000000000004e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3665  30S ribosomal protein S9  48.78 
 
 
130 aa  110  4.0000000000000004e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0023412  normal  0.0755267 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0224  30S ribosomal protein S9  47.58 
 
 
135 aa  111  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1589  ribosomal protein S9  48.78 
 
 
133 aa  111  4.0000000000000004e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000582599  normal  0.735167 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0881  ribosomal protein S9  46.51 
 
 
129 aa  110  4.0000000000000004e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1686  ribosomal protein S9  48.41 
 
 
161 aa  111  4.0000000000000004e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2583  30S ribosomal protein S9  49.59 
 
 
130 aa  111  4.0000000000000004e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000028456  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0476  ribosomal protein S9  48.78 
 
 
130 aa  110  5e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000601039  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0221  30S ribosomal protein S9  47.58 
 
 
135 aa  110  5e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0143774  normal  0.010853 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3525  30S ribosomal protein S9  48.78 
 
 
130 aa  110  5e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000016286  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3419  30S ribosomal protein S9  48.78 
 
 
130 aa  110  5e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000112038  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3713  30S ribosomal protein S9  48.78 
 
 
130 aa  110  5e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000596943  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0293  ribosomal protein S9  48.78 
 
 
130 aa  110  5e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.000515876  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4547  30S ribosomal protein S9  48.78 
 
 
130 aa  110  5e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000371086  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03041  hypothetical protein  48.78 
 
 
130 aa  110  5e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000287646  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1527  ribosomal protein S9  47.15 
 
 
132 aa  110  5e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000273794  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>