More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0430 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_0430  ribosomal protein S9  100 
 
 		 130 aa  256  1e-67  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.912667  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0923  30S ribosomal protein S9  60.8 
 
 		 154 aa  146  7e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0138  30S ribosomal protein S9  53.85 
 
 		 130 aa  140  4e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000590069  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0144  30S ribosomal protein S9  53.08 
 
 		 130 aa  140  8e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000361179  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0139  30S ribosomal protein S9  53.08 
 
 		 130 aa  140  8e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.11946e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0137  30S ribosomal protein S9  53.08 
 
 		 130 aa  140  8e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000359543  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0176  30S ribosomal protein S9  53.08 
 
 		 130 aa  140  8e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000140848  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5160  30S ribosomal protein S9  53.08 
 
 		 130 aa  140  8e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000743375  hitchhiker  0.0000000912351 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0166  30S ribosomal protein S9  53.08 
 
 		 130 aa  140  8e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00347352  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0157  30S ribosomal protein S9  53.08 
 
 		 130 aa  140  8e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.4920599999999996e-31 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2120  SSU ribosomal protein S9P  58.02 
 
 		 130 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.39803  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0139  30S ribosomal protein S9  52.31 
 
 		 130 aa  138  3e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000424807  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0144  30S ribosomal protein S9  52.31 
 
 		 130 aa  136  7.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133435  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0144  30S ribosomal protein S9  52.31 
 
 		 130 aa  136  7.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000533856  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0342  SSU ribosomal protein S9P  57.72 
 
 		 170 aa  136  7.999999999999999e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0651444  hitchhiker  0.00386337 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2583  30S ribosomal protein S9  53.08 
 
 		 130 aa  136  1e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000028456  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2297  ribosomal protein S9  48.46 
 
 		 130 aa  135  2e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000207473  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6017  ribosomal protein S9  57.26 
 
 		 135 aa  135  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0328969  normal  0.0856034 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0145  30S ribosomal protein S9  51.54 
 
 		 130 aa  134  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000670079  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5159  ribosomal protein S9  61.29 
 
 		 169 aa  134  4e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.623801  normal  0.298446 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2613  30S ribosomal protein S9  58.87 
 
 		 169 aa  134  5e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2679  ribosomal protein S9  51.54 
 
 		 130 aa  134  6.0000000000000005e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0151101  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3105  ribosomal protein S9  59.52 
 
 		 162 aa  133  7.000000000000001e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0230  SSU ribosomal protein S9P  54.47 
 
 		 132 aa  132  9.999999999999999e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000443747  normal  0.670048 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2069  30S ribosomal protein S9  52.31 
 
 		 130 aa  132  1.9999999999999998e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000831765  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04450  SSU ribosomal protein S9P  55.65 
 
 		 162 aa  131  3.9999999999999996e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.271227 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0562  SSU ribosomal protein S9P  57.81 
 
 		 131 aa  131  3.9999999999999996e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000000134066  normal  0.199008 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1177  ribosomal protein S9  55.2 
 
 		 174 aa  130  5e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.904807  normal  0.699948 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0215  30S ribosomal protein S9  51.54 
 
 		 130 aa  128  2.0000000000000002e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00249156  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0048  30S ribosomal protein S9  48.46 
 
 		 130 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1126  30S ribosomal protein S9  54.84 
 
 		 172 aa  129  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.482238 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1782  30S ribosomal protein S9  49.23 
 
 		 130 aa  128  2.0000000000000002e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000024243  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02470  ribosomal protein S9  51.59 
 
 		 131 aa  129  2.0000000000000002e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000158686  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1450  SSU ribosomal protein S9P  50.78 
 
 		 131 aa  128  2.0000000000000002e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000188818  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0128  30S ribosomal protein S9  53.08 
 
 		 130 aa  128  2.0000000000000002e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000606121  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01520  ribosomal protein S9  51.59 
 
 		 131 aa  129  2.0000000000000002e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000216085  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2205  30S ribosomal protein S9  55.81 
 
 		 135 aa  128  3e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0902  30S ribosomal protein S9  50 
 
 		 130 aa  127  4.0000000000000003e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000079624  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01720  SSU ribosomal protein S9P  50.78 
 
 		 130 aa  127  5.0000000000000004e-29  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.0000000110111  hitchhiker  0.000000000473134 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0945  ribosomal protein S9  51.94 
 
 		 130 aa  127  6e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000533623  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21980  SSU ribosomal protein S9P  51.94 
 
 		 130 aa  127  8.000000000000001e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000149562  hitchhiker  0.00529045 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0923  30S ribosomal protein S9  51.54 
 
 		 130 aa  126  8.000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0902  30S ribosomal protein S9  50.77 
 
 		 130 aa  126  9.000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1798  30S ribosomal protein S9  50 
 
 		 130 aa  126  1.0000000000000001e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0795  30S ribosomal protein S9  48.46 
 
 		 130 aa  126  1.0000000000000001e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000718866  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0972  ribosomal protein S9  53.17 
 
 		 173 aa  125  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0537605 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2917  30S ribosomal protein S9  56.8 
 
 		 168 aa  125  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.954546  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1154  ribosomal protein S9  50.75 
 
 		 132 aa  126  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.252489  normal  0.0143228 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4949  30S ribosomal protein S9  53.6 
 
 		 171 aa  126  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.143487  normal  0.446856 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4533  30S ribosomal protein S9  50.77 
 
 		 130 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.848049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29350  SSU ribosomal protein S9P  54.4 
 
 		 162 aa  125  2.0000000000000002e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.100136  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1624  30S ribosomal protein S9  49.62 
 
 		 136 aa  125  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.567552  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23301  30S ribosomal protein S9  51.54 
 
 		 135 aa  125  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2993  ribosomal protein S9  53.91 
 
 		 132 aa  125  2.0000000000000002e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.113743  hitchhiker  0.00813341 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2678  30S ribosomal protein S9  49.23 
 
 		 130 aa  125  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000125135  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2363  30S ribosomal protein S9  49.23 
 
 		 130 aa  125  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000350135  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1316  30S ribosomal protein S9  50.77 
 
 		 130 aa  125  3e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.428523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17391  30S ribosomal protein S9  49.62 
 
 		 136 aa  124  3e-28  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2285  30S ribosomal protein S9  49.23 
 
 		 130 aa  124  3e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000447741  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4693  30S ribosomal protein S9  49.23 
 
 		 130 aa  124  3e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00380118  normal  0.0220476 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4408  30S ribosomal protein S9  50.77 
 
 		 130 aa  125  3e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.40853 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2244  30S ribosomal protein S9  49.23 
 
 		 130 aa  124  3e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000238567  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0231  SSU ribosomal protein S9P  51.22 
 
 		 131 aa  124  3e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.0000192076  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2612  ribosomal protein S9  55.2 
 
 		 162 aa  125  3e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.523931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1158  30S ribosomal protein S9  52.8 
 
 		 158 aa  124  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.356107 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2587  30S ribosomal protein S9  53.12 
 
 		 138 aa  124  4.0000000000000003e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1131  30S ribosomal protein S9  52.8 
 
 		 158 aa  124  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3731  30S ribosomal protein S9  54.33 
 
 		 137 aa  124  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1148  30S ribosomal protein S9  52.8 
 
 		 158 aa  124  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.542588  normal  0.417001 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0725  30S ribosomal protein S9  50 
 
 		 130 aa  124  4.0000000000000003e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.616344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0719  30S ribosomal protein S9  52.76 
 
 		 138 aa  124  5e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000482758  normal  0.593544 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1345  30S ribosomal protein S9  54.76 
 
 		 134 aa  124  6e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00368639  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4425  ribosomal protein S9  49.23 
 
 		 130 aa  124  6e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.146621  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4119  30S ribosomal protein S9  49.23 
 
 		 130 aa  124  6e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0970  30S ribosomal protein S9  50.77 
 
 		 130 aa  124  6e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.476085 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17131  30S ribosomal protein S9  47.69 
 
 		 136 aa  124  6e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0453537  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1341  30S ribosomal protein S9  54.76 
 
 		 134 aa  123  7e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000324124  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0347  ribosomal protein S9  48.84 
 
 		 130 aa  123  8.000000000000001e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000129825  normal  0.751178 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1982  30S ribosomal protein S9  50.77 
 
 		 133 aa  123  8.000000000000001e-28  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0810268  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1379  30S ribosomal protein S9  52.03 
 
 		 159 aa  122  1e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0851685 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17231  30S ribosomal protein S9  49.62 
 
 		 136 aa  122  1e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16511  30S ribosomal protein S9  50 
 
 		 137 aa  122  1e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0633365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0224  30S ribosomal protein S9  52.31 
 
 		 135 aa  123  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0221  30S ribosomal protein S9  52.31 
 
 		 135 aa  122  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0143774  normal  0.010853 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0734  30S ribosomal protein S9  48.85 
 
 		 130 aa  122  1e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000000144699  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0331  ribosomal protein S9  50 
 
 		 130 aa  122  1e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00016739  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1320  30S ribosomal protein S9  53.54 
 
 		 137 aa  122  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.540344  normal  0.687353 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0149  30S ribosomal protein S9  51.22 
 
 		 162 aa  123  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0890  30S ribosomal protein S9  56.35 
 
 		 166 aa  122  1e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2843  30S ribosomal protein S9  49.59 
 
 		 161 aa  122  2e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2630  30S ribosomal protein S9  54.4 
 
 		 168 aa  122  2e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16860  30S ribosomal protein S9  56 
 
 		 162 aa  122  2e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.944317  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0349  30S ribosomal protein S9  49.23 
 
 		 133 aa  122  2e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.842088 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13050  30S ribosomal protein S9  49.23 
 
 		 130 aa  122  2e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2620  30S ribosomal protein S9  49.59 
 
 		 161 aa  122  2e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.159482 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1394  ribosomal protein S9  47.62 
 
 		 129 aa  122  2e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000135637  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4611  30S ribosomal protein S9  51.22 
 
 		 162 aa  122  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0520803 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1470  30S ribosomal protein S9  51.2 
 
 		 171 aa  122  2e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.828818 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1882  ribosomal protein S9  54.84 
 
 		 264 aa  121  3e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.178814  normal  0.068579 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4467  ribosomal protein S9  52.8 
 
 		 139 aa  121  3e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>