More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_2993 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_2993  ribosomal protein S9  100 
 
 
132 aa  265  2e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.113743  hitchhiker  0.00813341 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3995  ribosomal protein S9  71.97 
 
 
132 aa  188  2e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.850021  hitchhiker  0.000512267 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1154  ribosomal protein S9  70.45 
 
 
132 aa  186  1e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.252489  normal  0.0143228 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0746  ribosomal protein S9  68.75 
 
 
134 aa  175  2e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4944  ribosomal protein S9  61.36 
 
 
132 aa  172  1.9999999999999998e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02470  ribosomal protein S9  62.12 
 
 
131 aa  161  3e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000158686  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01520  ribosomal protein S9  62.12 
 
 
131 aa  161  3e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000216085  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1782  30S ribosomal protein S9  61.9 
 
 
130 aa  156  1e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000024243  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0902  30S ribosomal protein S9  60.32 
 
 
130 aa  154  3e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000079624  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0795  30S ribosomal protein S9  59.23 
 
 
130 aa  151  2.9999999999999998e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000718866  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0734  30S ribosomal protein S9  59.06 
 
 
130 aa  149  8.999999999999999e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000000144699  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2678  30S ribosomal protein S9  60.32 
 
 
130 aa  147  3e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000125135  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2363  30S ribosomal protein S9  60.32 
 
 
130 aa  147  3e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000350135  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0145  30S ribosomal protein S9  61.11 
 
 
130 aa  147  4e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000670079  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0212  ribosomal protein S9  58.27 
 
 
131 aa  146  7e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000467508  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2069  30S ribosomal protein S9  61.11 
 
 
130 aa  146  1.0000000000000001e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000831765  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2679  ribosomal protein S9  58.73 
 
 
130 aa  145  2.0000000000000003e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0151101  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2726  ribosomal protein S9  53.79 
 
 
132 aa  145  3e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000561308  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0382  30S ribosomal protein S9  57.48 
 
 
130 aa  144  4.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0184231  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0367  30S ribosomal protein S9  57.48 
 
 
130 aa  144  4.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000448381  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2471  ribosomal protein S9  54.84 
 
 
130 aa  144  4.0000000000000006e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0151898  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0230  SSU ribosomal protein S9P  59.52 
 
 
132 aa  144  5e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000443747  normal  0.670048 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0725  30S ribosomal protein S9  58.91 
 
 
130 aa  144  5e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.616344  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2703  30S ribosomal protein S9  57.48 
 
 
130 aa  143  8.000000000000001e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.490029  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2342  30S ribosomal protein S9  56.69 
 
 
130 aa  143  9e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1345  30S ribosomal protein S9  60.47 
 
 
134 aa  143  9e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00368639  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3420  30S ribosomal protein S9  56.69 
 
 
130 aa  143  9e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000202027  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3413  30S ribosomal protein S9  56.69 
 
 
130 aa  143  9e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0107857  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0254  30S ribosomal protein S9  56.69 
 
 
130 aa  143  9e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1116  30S ribosomal protein S9  56.69 
 
 
130 aa  143  9e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3377  30S ribosomal protein S9  56.69 
 
 
130 aa  143  9e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000325455  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2520  30S ribosomal protein S9  56.69 
 
 
130 aa  143  9e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2639  30S ribosomal protein S9  55.47 
 
 
130 aa  143  1e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.17438  normal  0.393546 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3766  30S ribosomal protein S9  57.48 
 
 
130 aa  142  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.658387  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1234  30S ribosomal protein S9  57.48 
 
 
130 aa  142  1e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000000854245  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4052  30S ribosomal protein S9  56.69 
 
 
130 aa  142  1e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.809908  normal  0.564948 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0197  30S ribosomal protein S9  57.48 
 
 
130 aa  142  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.202545  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3627  30S ribosomal protein S9  57.94 
 
 
130 aa  142  1e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000023775  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0680  30S ribosomal protein S9  57.48 
 
 
130 aa  142  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000222538  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0647  30S ribosomal protein S9  57.48 
 
 
130 aa  142  1e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00285977  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1341  30S ribosomal protein S9  60.47 
 
 
134 aa  142  2e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000324124  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0626  30S ribosomal protein S9  55.91 
 
 
130 aa  142  2e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0600  30S ribosomal protein S9  57.48 
 
 
130 aa  142  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000648007  normal  0.790405 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0574  30S ribosomal protein S9  57.48 
 
 
130 aa  142  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00443027  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0605  30S ribosomal protein S9  55.91 
 
 
130 aa  142  2e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5913  30S ribosomal protein S9  55.91 
 
 
130 aa  141  3e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.208895  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4677  ribosomal protein S9  55.91 
 
 
130 aa  140  5e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.278967  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0321  30S ribosomal protein S9  58.73 
 
 
130 aa  140  5e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000288169  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1233  30S ribosomal protein S9  57.48 
 
 
130 aa  140  6e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000147442  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0491  30S ribosomal protein S9  57.48 
 
 
130 aa  140  7e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0372353  normal  0.193269 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21980  SSU ribosomal protein S9P  54.55 
 
 
130 aa  140  7e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000149562  hitchhiker  0.00529045 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0331  ribosomal protein S9  58.27 
 
 
130 aa  139  9.999999999999999e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00016739  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20520  SSU ribosomal protein S9P  61.6 
 
 
171 aa  138  1.9999999999999998e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.476775  normal  0.598664 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0454  30S ribosomal protein S9  55.12 
 
 
130 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0255963  normal  0.796217 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0560  30S ribosomal protein S9  56.69 
 
 
130 aa  139  1.9999999999999998e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000599765  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0722  ribosomal protein S9  54.33 
 
 
130 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4693  30S ribosomal protein S9  55.65 
 
 
130 aa  138  3e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00380118  normal  0.0220476 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2563  30S ribosomal protein S9  55.12 
 
 
130 aa  137  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000000714908  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0501  30S ribosomal protein S9  51.97 
 
 
130 aa  137  3.9999999999999997e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1450  SSU ribosomal protein S9P  58.73 
 
 
131 aa  137  3.9999999999999997e-32  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000188818  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0139  30S ribosomal protein S9  58.73 
 
 
130 aa  137  3.9999999999999997e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000424807  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0342  SSU ribosomal protein S9P  58.06 
 
 
170 aa  137  3.9999999999999997e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0651444  hitchhiker  0.00386337 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1885  ribosomal protein S9  55.12 
 
 
133 aa  137  4.999999999999999e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000534939  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4348  30S ribosomal protein S9  52.38 
 
 
130 aa  137  4.999999999999999e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000012665  hitchhiker  0.00291766 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2399  ribosomal protein S9  51.52 
 
 
130 aa  137  6e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.696602  normal  0.066769 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0138  30S ribosomal protein S9  58.73 
 
 
130 aa  137  7e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000590069  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3638  ribosomal protein S9  51.59 
 
 
130 aa  137  7e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00994207  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2583  30S ribosomal protein S9  57.14 
 
 
130 aa  136  7.999999999999999e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000028456  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1031  30S ribosomal protein S9  54.26 
 
 
132 aa  136  8.999999999999999e-32  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.791116  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0144  30S ribosomal protein S9  57.94 
 
 
130 aa  135  1e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000361179  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0166  30S ribosomal protein S9  57.94 
 
 
130 aa  135  1e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00347352  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3796  ribosomal protein S9  51.59 
 
 
130 aa  135  1e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000182281  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0139  30S ribosomal protein S9  57.94 
 
 
130 aa  135  1e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.11946e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0137  30S ribosomal protein S9  57.94 
 
 
130 aa  135  1e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000359543  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0157  30S ribosomal protein S9  57.94 
 
 
130 aa  135  1e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.4920599999999996e-31 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5160  30S ribosomal protein S9  57.94 
 
 
130 aa  135  1e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000743375  hitchhiker  0.0000000912351 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0104  30S ribosomal protein S9  51.59 
 
 
130 aa  135  1e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000569691  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3163  30S ribosomal protein S9  52.27 
 
 
130 aa  135  1e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.247444  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0056  SSU ribosomal protein S9P  53.91 
 
 
130 aa  135  1e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0128063  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4112  30S ribosomal protein S9  51.97 
 
 
130 aa  136  1e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0411  30S ribosomal protein S9  55.12 
 
 
130 aa  136  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000014619  normal  0.0708981 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0176  30S ribosomal protein S9  57.94 
 
 
130 aa  135  1e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000140848  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2297  ribosomal protein S9  54.76 
 
 
130 aa  135  1e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000207473  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0231  SSU ribosomal protein S9P  58.73 
 
 
131 aa  136  1e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.0000192076  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1316  30S ribosomal protein S9  54.84 
 
 
130 aa  135  2e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.428523  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4425  ribosomal protein S9  54.84 
 
 
130 aa  135  2e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.146621  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4408  30S ribosomal protein S9  54.84 
 
 
130 aa  135  2e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.40853 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4119  30S ribosomal protein S9  54.84 
 
 
130 aa  135  2e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0719  30S ribosomal protein S9  54.96 
 
 
138 aa  135  2e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000482758  normal  0.593544 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0483  30S ribosomal protein S9  54.55 
 
 
132 aa  135  2e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000145044  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0797  30S ribosomal protein S9  53.23 
 
 
128 aa  135  2e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000494469  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1882  ribosomal protein S9  56.35 
 
 
264 aa  135  2e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.178814  normal  0.068579 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0608  30S ribosomal protein S9  55.12 
 
 
130 aa  135  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000451686  normal  0.262066 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3353  30S ribosomal protein S9  55.12 
 
 
130 aa  135  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000000507288  hitchhiker  0.0000404008 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01720  SSU ribosomal protein S9P  53.79 
 
 
130 aa  135  2e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.0000000110111  hitchhiker  0.000000000473134 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0247  SSU ribosomal protein S9P  53.17 
 
 
130 aa  135  2e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00762963  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0800  30S ribosomal protein S9  53.49 
 
 
135 aa  135  2e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.435176  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13050  30S ribosomal protein S9  54.84 
 
 
130 aa  135  3.0000000000000003e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04450  SSU ribosomal protein S9P  56 
 
 
162 aa  135  3.0000000000000003e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.271227 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4533  30S ribosomal protein S9  54.84 
 
 
130 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.848049  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>