More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_01720 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013170  Ccur_01720  SSU ribosomal protein S9P  100 
 
 
130 aa  264  2.9999999999999995e-70  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.0000000110111  hitchhiker  0.000000000473134 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21980  SSU ribosomal protein S9P  89.23 
 
 
130 aa  239  7.999999999999999e-63  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000149562  hitchhiker  0.00529045 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0347  ribosomal protein S9  86.15 
 
 
130 aa  231  2.0000000000000002e-60  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000129825  normal  0.751178 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1249  ribosomal protein S9  77.78 
 
 
131 aa  204  3e-52  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01520  ribosomal protein S9  66.41 
 
 
131 aa  177  2.9999999999999997e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000216085  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02470  ribosomal protein S9  66.41 
 
 
131 aa  177  2.9999999999999997e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000158686  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3627  30S ribosomal protein S9  65.62 
 
 
130 aa  164  2.9999999999999998e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000023775  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2678  30S ribosomal protein S9  62.5 
 
 
130 aa  161  3e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000125135  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2363  30S ribosomal protein S9  62.5 
 
 
130 aa  161  3e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000350135  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0795  30S ribosomal protein S9  64 
 
 
130 aa  157  4e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000718866  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2583  30S ribosomal protein S9  61.72 
 
 
130 aa  155  1e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000028456  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1782  30S ribosomal protein S9  60.94 
 
 
130 aa  154  3e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000024243  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0230  SSU ribosomal protein S9P  59.23 
 
 
132 aa  154  5.0000000000000005e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000443747  normal  0.670048 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0145  30S ribosomal protein S9  57.81 
 
 
130 aa  152  2e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000670079  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0902  30S ribosomal protein S9  61.6 
 
 
130 aa  150  4e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000079624  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1450  SSU ribosomal protein S9P  61.07 
 
 
131 aa  150  4e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000188818  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0321  30S ribosomal protein S9  59.38 
 
 
130 aa  150  5e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000288169  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2244  30S ribosomal protein S9  60.94 
 
 
130 aa  150  5e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000238567  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2285  30S ribosomal protein S9  60.94 
 
 
130 aa  150  5e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000447741  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2069  30S ribosomal protein S9  60.8 
 
 
130 aa  150  5e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000831765  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1798  30S ribosomal protein S9  60.94 
 
 
130 aa  150  5.9999999999999996e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1126  30S ribosomal protein S9  64.57 
 
 
172 aa  150  5.9999999999999996e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.482238 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0128  30S ribosomal protein S9  62.5 
 
 
130 aa  150  7e-36  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000606121  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0342  SSU ribosomal protein S9P  63.41 
 
 
170 aa  150  8e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0651444  hitchhiker  0.00386337 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf385  30S ribosomal protein S9  57.58 
 
 
132 aa  149  8.999999999999999e-36  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0579956  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0215  30S ribosomal protein S9  60.16 
 
 
130 aa  149  1e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00249156  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0138  30S ribosomal protein S9  60.16 
 
 
130 aa  149  1e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000590069  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0144  30S ribosomal protein S9  59.38 
 
 
130 aa  148  2e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000361179  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0139  30S ribosomal protein S9  59.38 
 
 
130 aa  148  2e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.11946e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0137  30S ribosomal protein S9  59.38 
 
 
130 aa  148  2e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000359543  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0176  30S ribosomal protein S9  59.38 
 
 
130 aa  148  2e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000140848  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5160  30S ribosomal protein S9  59.38 
 
 
130 aa  148  2e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000743375  hitchhiker  0.0000000912351 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0157  30S ribosomal protein S9  59.38 
 
 
130 aa  148  2e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.4920599999999996e-31 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0166  30S ribosomal protein S9  59.38 
 
 
130 aa  148  2e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00347352  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0727  30S ribosomal protein S9  65.65 
 
 
131 aa  147  4e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000341683  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2120  SSU ribosomal protein S9P  60.16 
 
 
130 aa  147  4e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.39803  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0139  30S ribosomal protein S9  58.59 
 
 
130 aa  147  6e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000424807  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2612  ribosomal protein S9  62.3 
 
 
162 aa  147  6e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.523931  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0331  ribosomal protein S9  61.72 
 
 
130 aa  146  8e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00016739  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2679  ribosomal protein S9  60 
 
 
130 aa  146  8e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0151101  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0247  SSU ribosomal protein S9P  57.25 
 
 
130 aa  146  9e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00762963  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2471  ribosomal protein S9  56.69 
 
 
130 aa  145  1.0000000000000001e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0151898  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0231  SSU ribosomal protein S9P  58.78 
 
 
131 aa  145  1.0000000000000001e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.0000192076  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0144  30S ribosomal protein S9  58.59 
 
 
130 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133435  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0144  30S ribosomal protein S9  58.59 
 
 
130 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000533856  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2726  ribosomal protein S9  55.3 
 
 
132 aa  145  2.0000000000000003e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000561308  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0800  30S ribosomal protein S9  59.26 
 
 
135 aa  145  2.0000000000000003e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.435176  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3105  ribosomal protein S9  61.48 
 
 
162 aa  145  2.0000000000000003e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0890  30S ribosomal protein S9  62.9 
 
 
166 aa  145  2.0000000000000003e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0600  30S ribosomal protein S9  60.8 
 
 
173 aa  144  5e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.190844  normal  0.458366 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3453  30S ribosomal protein S9  60.66 
 
 
130 aa  144  5e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3371  30S ribosomal protein S9  60.66 
 
 
130 aa  144  5e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0767368  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3517  30S ribosomal protein S9  60.66 
 
 
130 aa  144  5e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.143376  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0323  30S ribosomal protein S9  57.25 
 
 
131 aa  143  8.000000000000001e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000255899  hitchhiker  5.84326e-17 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0212  ribosomal protein S9  59.52 
 
 
131 aa  142  2e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000467508  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2424  SSU ribosomal protein S9P  63.57 
 
 
130 aa  141  3e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000332574  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0797  30S ribosomal protein S9  57.26 
 
 
128 aa  141  4e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000494469  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13050  30S ribosomal protein S9  56.45 
 
 
130 aa  140  5e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3665  30S ribosomal protein S9  54.69 
 
 
130 aa  140  5e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0023412  normal  0.0755267 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0746  ribosomal protein S9  58.73 
 
 
134 aa  140  5e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0618  ribosomal protein S9  61.29 
 
 
163 aa  140  6e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6017  ribosomal protein S9  59.02 
 
 
135 aa  140  6e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0328969  normal  0.0856034 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03090  30S ribosomal protein S9  54.69 
 
 
130 aa  140  8e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000557445  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0476  ribosomal protein S9  54.69 
 
 
130 aa  140  8e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000601039  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3713  30S ribosomal protein S9  54.69 
 
 
130 aa  140  8e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000596943  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1154  ribosomal protein S9  55.22 
 
 
132 aa  140  8e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.252489  normal  0.0143228 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4547  30S ribosomal protein S9  54.69 
 
 
130 aa  140  8e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000371086  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03041  hypothetical protein  54.69 
 
 
130 aa  140  8e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000287646  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3546  30S ribosomal protein S9  54.69 
 
 
130 aa  140  8e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000104404  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0476  30S ribosomal protein S9  54.69 
 
 
130 aa  140  8e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000111446  normal  0.163216 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3419  30S ribosomal protein S9  54.69 
 
 
130 aa  140  8e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000112038  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3525  30S ribosomal protein S9  54.69 
 
 
130 aa  140  8e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000016286  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4348  30S ribosomal protein S9  55.47 
 
 
130 aa  140  8e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000012665  hitchhiker  0.00291766 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1341  30S ribosomal protein S9  58.21 
 
 
134 aa  139  9e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000324124  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0525  30S ribosomal protein S9  56.25 
 
 
130 aa  139  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000883336  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2663  30S ribosomal protein S9  54.69 
 
 
130 aa  139  9.999999999999999e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00134428  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4677  ribosomal protein S9  56.49 
 
 
130 aa  139  9.999999999999999e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.278967  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0461  30S ribosomal protein S9  56.25 
 
 
130 aa  139  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000140237  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1133  30S ribosomal protein S9  56.25 
 
 
130 aa  139  9.999999999999999e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000113025  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1345  30S ribosomal protein S9  58.21 
 
 
134 aa  139  9.999999999999999e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00368639  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3704  30S ribosomal protein S9  54.69 
 
 
130 aa  139  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00817033  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0104  30S ribosomal protein S9  54.69 
 
 
130 aa  138  1.9999999999999998e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000569691  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2613  30S ribosomal protein S9  59.68 
 
 
169 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3535  30S ribosomal protein S9  54.69 
 
 
130 aa  139  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000799314  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29350  SSU ribosomal protein S9P  62.3 
 
 
162 aa  138  1.9999999999999998e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.100136  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0021  30S ribosomal protein S9  58.87 
 
 
160 aa  138  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.849835  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3436  30S ribosomal protein S9  59.02 
 
 
131 aa  139  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.113849  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1882  ribosomal protein S9  57.25 
 
 
264 aa  139  1.9999999999999998e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.178814  normal  0.068579 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3607  30S ribosomal protein S9  54.69 
 
 
130 aa  139  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000867127  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1650  30S ribosomal protein S9  58.87 
 
 
160 aa  138  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.377487 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3536  30S ribosomal protein S9  54.69 
 
 
130 aa  139  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.0000037617  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3642  30S ribosomal protein S9  54.69 
 
 
130 aa  139  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000331692  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0902  30S ribosomal protein S9  56.45 
 
 
130 aa  138  3e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004510  SSU ribosomal protein S9p (S16e)  54.69 
 
 
130 aa  138  3e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000229051  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0300  30S ribosomal protein S9  54.69 
 
 
130 aa  137  3.9999999999999997e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00212654  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2297  ribosomal protein S9  53.12 
 
 
130 aa  137  3.9999999999999997e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000207473  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1601  30S ribosomal protein S9  58.06 
 
 
164 aa  137  4.999999999999999e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.292372  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3163  30S ribosomal protein S9  56.49 
 
 
130 aa  137  4.999999999999999e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.247444  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2630  30S ribosomal protein S9  59.35 
 
 
168 aa  137  6e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00882  30S ribosomal protein S9  53.91 
 
 
130 aa  137  6e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>