More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_1940 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_1940  ribosomal protein S9  100 
 
 		 129 aa  257  4e-68  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1537  30S ribosomal protein S9  83.46 
 
 		 128 aa  216  8.999999999999998e-56  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000000611504  normal  0.14818 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1735  30S ribosomal protein S9  69.29 
 
 		 131 aa  174  3e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0401133 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1031  30S ribosomal protein S9  60.61 
 
 		 132 aa  152  1e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.791116  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0433  30S ribosomal protein S9  59.09 
 
 		 132 aa  149  1e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0713606  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1345  30S ribosomal protein S9  58.96 
 
 		 134 aa  147  4e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00368639  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2876  ribosomal protein S9  53.49 
 
 		 129 aa  147  5e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0513337  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2761  30S ribosomal protein S9  54.55 
 
 		 143 aa  147  7e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2634  30S ribosomal protein S9  54.55 
 
 		 143 aa  147  7e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1341  30S ribosomal protein S9  58.96 
 
 		 134 aa  146  7e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000324124  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2241  SSU ribosomal protein S9P  57.69 
 
 		 130 aa  144  3e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.201316  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03090  30S ribosomal protein S9  54.62 
 
 		 130 aa  143  6e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000557445  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0476  ribosomal protein S9  54.62 
 
 		 130 aa  143  6e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000601039  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3419  30S ribosomal protein S9  54.62 
 
 		 130 aa  143  6e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000112038  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0525  30S ribosomal protein S9  56.15 
 
 		 130 aa  143  6e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000883336  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3525  30S ribosomal protein S9  54.62 
 
 		 130 aa  143  6e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000016286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3546  30S ribosomal protein S9  54.62 
 
 		 130 aa  143  6e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000104404  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3713  30S ribosomal protein S9  54.62 
 
 		 130 aa  143  6e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000596943  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1133  30S ribosomal protein S9  56.15 
 
 		 130 aa  143  6e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000113025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0461  30S ribosomal protein S9  56.15 
 
 		 130 aa  143  6e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000140237  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03041  hypothetical protein  54.62 
 
 		 130 aa  143  6e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000287646  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4547  30S ribosomal protein S9  54.62 
 
 		 130 aa  143  6e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000371086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0476  30S ribosomal protein S9  54.62 
 
 		 130 aa  143  6e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000111446  normal  0.163216 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2043  ribosomal protein S9  57.94 
 
 		 130 aa  143  9e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000585971  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3642  30S ribosomal protein S9  54.62 
 
 		 130 aa  142  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000331692  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0300  30S ribosomal protein S9  54.62 
 
 		 130 aa  142  1e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00212654  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3536  30S ribosomal protein S9  54.62 
 
 		 130 aa  142  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.0000037617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3607  30S ribosomal protein S9  54.62 
 
 		 130 aa  142  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000867127  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3535  30S ribosomal protein S9  54.62 
 
 		 130 aa  142  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000799314  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3704  30S ribosomal protein S9  54.62 
 
 		 130 aa  142  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00817033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0014  ribosomal protein S9  56.06 
 
 		 130 aa  141  2e-33  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3665  30S ribosomal protein S9  53.85 
 
 		 130 aa  141  3e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0023412  normal  0.0755267 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3163  30S ribosomal protein S9  55.47 
 
 		 130 aa  140  4e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.247444  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0293  ribosomal protein S9  53.85 
 
 		 130 aa  140  4e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.000515876  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0230  SSU ribosomal protein S9P  57.14 
 
 		 132 aa  139  9e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000443747  normal  0.670048 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2399  ribosomal protein S9  54.69 
 
 		 130 aa  139  9.999999999999999e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.696602  normal  0.066769 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4348  30S ribosomal protein S9  53.08 
 
 		 130 aa  138  1.9999999999999998e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000012665  hitchhiker  0.00291766 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3796  ribosomal protein S9  52.31 
 
 		 130 aa  138  3e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000182281  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3638  ribosomal protein S9  52.31 
 
 		 130 aa  137  3e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00994207  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0104  30S ribosomal protein S9  52.31 
 
 		 130 aa  137  3.9999999999999997e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000569691  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4052  30S ribosomal protein S9  52.71 
 
 		 130 aa  137  3.9999999999999997e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.809908  normal  0.564948 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4442  ribosomal protein S9  52.38 
 
 		 130 aa  137  4.999999999999999e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0626  30S ribosomal protein S9  53.49 
 
 		 130 aa  136  7.999999999999999e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0605  30S ribosomal protein S9  53.49 
 
 		 130 aa  136  7.999999999999999e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0562  SSU ribosomal protein S9P  54.2 
 
 		 131 aa  136  1e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000000134066  normal  0.199008 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0753  30S ribosomal protein S9  53.08 
 
 		 130 aa  135  1e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000116915  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0800  30S ribosomal protein S9  55.56 
 
 		 135 aa  135  2e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.435176  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1782  30S ribosomal protein S9  55.56 
 
 		 130 aa  134  3.0000000000000003e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000024243  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13050  30S ribosomal protein S9  50 
 
 		 130 aa  133  6.0000000000000005e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2206  SSU ribosomal protein S9P  54.26 
 
 		 129 aa  134  6.0000000000000005e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.453357  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2639  30S ribosomal protein S9  54.47 
 
 		 130 aa  133  8e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.17438  normal  0.393546 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0212  ribosomal protein S9  54.33 
 
 		 131 aa  133  9e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000467508  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4425  ribosomal protein S9  50.78 
 
 		 130 aa  132  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.146621  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0913  ribosomal protein S9  48.84 
 
 		 129 aa  132  9.999999999999999e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000269489  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4119  30S ribosomal protein S9  50.78 
 
 		 130 aa  132  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2471  ribosomal protein S9  51.59 
 
 		 130 aa  132  9.999999999999999e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0151898  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2726  ribosomal protein S9  53.49 
 
 		 132 aa  132  9.999999999999999e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000561308  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2076  ribosomal protein S9  56.69 
 
 		 130 aa  132  1.9999999999999998e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00882  30S ribosomal protein S9  50.77 
 
 		 130 aa  131  1.9999999999999998e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4693  30S ribosomal protein S9  50.78 
 
 		 130 aa  131  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00380118  normal  0.0220476 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4677  ribosomal protein S9  51.16 
 
 		 130 aa  132  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.278967  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3348  ribosomal protein S9  48.84 
 
 		 129 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0614997 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0321  30S ribosomal protein S9  53.79 
 
 		 130 aa  131  3e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000288169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004510  SSU ribosomal protein S9p (S16e)  51.54 
 
 		 130 aa  131  3e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000229051  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5913  30S ribosomal protein S9  54.47 
 
 		 130 aa  131  3e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.208895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2120  SSU ribosomal protein S9P  53.08 
 
 		 130 aa  131  3e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.39803  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0247  SSU ribosomal protein S9P  53.54 
 
 		 130 aa  131  3e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00762963  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2069  30S ribosomal protein S9  53.08 
 
 		 130 aa  131  3.9999999999999996e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000831765  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0542  ribosomal protein S9  57.94 
 
 		 130 aa  131  3.9999999999999996e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0472409  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01520  ribosomal protein S9  53.91 
 
 		 131 aa  131  3.9999999999999996e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000216085  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0331  ribosomal protein S9  55.38 
 
 		 130 aa  130  3.9999999999999996e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00016739  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0902  30S ribosomal protein S9  50 
 
 		 130 aa  131  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3025  30S ribosomal protein S9  52.42 
 
 		 157 aa  131  3.9999999999999996e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.795745 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3702  ribosomal protein S9  51.59 
 
 		 130 aa  131  3.9999999999999996e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000244977  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02470  ribosomal protein S9  53.91 
 
 		 131 aa  131  3.9999999999999996e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000158686  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1316  30S ribosomal protein S9  50 
 
 		 130 aa  130  5e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.428523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3594  30S ribosomal protein S9  50.78 
 
 		 130 aa  130  5e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000165532  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4408  30S ribosomal protein S9  50 
 
 		 130 aa  130  5e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.40853 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0032  ribosomal protein S9  51.56 
 
 		 132 aa  130  6.999999999999999e-30  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2297  ribosomal protein S9  51.59 
 
 		 130 aa  130  6.999999999999999e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000207473  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4533  30S ribosomal protein S9  50 
 
 		 130 aa  130  7.999999999999999e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.848049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3627  30S ribosomal protein S9  52.38 
 
 		 130 aa  129  1.0000000000000001e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000023775  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1379  30S ribosomal protein S9  54.03 
 
 		 159 aa  129  1.0000000000000001e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0851685 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0748  30S ribosomal protein S9  50.78 
 
 		 130 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000172866  normal  0.041404 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4221  30S ribosomal protein S9  50.78 
 
 		 130 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000135609  hitchhiker  0.000316349 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0923  30S ribosomal protein S9  50 
 
 		 130 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3156  30S ribosomal protein S9  50.81 
 
 		 130 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00359372 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3451  30S ribosomal protein S9  49.61 
 
 		 130 aa  129  2.0000000000000002e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0078135 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2843  30S ribosomal protein S9  52.42 
 
 		 161 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0795  30S ribosomal protein S9  55.2 
 
 		 130 aa  129  2.0000000000000002e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000718866  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2620  30S ribosomal protein S9  52.42 
 
 		 161 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.159482 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0905  ribosomal protein S9  47.62 
 
 		 130 aa  128  3e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.122737  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2663  30S ribosomal protein S9  50 
 
 		 130 aa  128  3e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00134428  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0607  30S ribosomal protein S9  49.22 
 
 		 130 aa  128  3e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000206629  hitchhiker  0.00149279 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0006  ribosomal protein S9  51.59 
 
 		 133 aa  128  3e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.819912  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2520  30S ribosomal protein S9  50.81 
 
 		 130 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2342  30S ribosomal protein S9  50.81 
 
 		 130 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0650  SSU ribosomal protein S9P  51.54 
 
 		 130 aa  127  4.0000000000000003e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  1.4124e-16  normal  0.0939463 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0254  30S ribosomal protein S9  50.81 
 
 		 130 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3377  30S ribosomal protein S9  50.81 
 
 		 130 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000325455  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>