More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0385 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_0385  30S ribosomal protein S9  100 
 
 		 129 aa  261  3e-69  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.704674  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1652  30S ribosomal protein S9  96.12 
 
 		 129 aa  252  1.0000000000000001e-66  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.386728  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1472  30S ribosomal protein S9  96.12 
 
 		 129 aa  252  1.0000000000000001e-66  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000347675  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1826  30S ribosomal protein S9  96.12 
 
 		 129 aa  252  1.0000000000000001e-66  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.0000606063  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0388  30S ribosomal protein S9  91.47 
 
 		 129 aa  242  9.999999999999999e-64  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0738  30S ribosomal protein S9  89.15 
 
 		 129 aa  239  1e-62  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.211677  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1598  30S ribosomal protein S9  89.15 
 
 		 129 aa  237  2.9999999999999997e-62  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00000000158082  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0912  30S ribosomal protein S9  89.15 
 
 		 129 aa  237  4e-62  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1908  ribosomal protein S9  78.29 
 
 		 129 aa  209  1e-53  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0093  30S ribosomal protein S9  61.24 
 
 		 129 aa  168  2e-41  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2151  30S ribosomal protein S9  56.35 
 
 		 158 aa  144  4.0000000000000006e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.45731  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2938  ribosomal protein S9  56.8 
 
 		 162 aa  143  8.000000000000001e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000844995 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1163  30S ribosomal protein S9  56.8 
 
 		 160 aa  140  7e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.456788  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1384  30S ribosomal protein S9  53.49 
 
 		 161 aa  137  7e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.839793 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2249  30S ribosomal protein S9  51.94 
 
 		 163 aa  136  8.999999999999999e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0861  30S ribosomal protein S9  55.56 
 
 		 155 aa  136  1e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0415089  normal  0.103809 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1379  30S ribosomal protein S9  54.4 
 
 		 159 aa  135  1e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0851685 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3025  30S ribosomal protein S9  54.4 
 
 		 157 aa  136  1e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.795745 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1234  30S ribosomal protein S9  53.49 
 
 		 155 aa  136  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.745621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1872  30S ribosomal protein S9  53.6 
 
 		 159 aa  136  1e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.952658 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1321  30S ribosomal protein S9  53.49 
 
 		 155 aa  135  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.243338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0902  30S ribosomal protein S9  53.17 
 
 		 161 aa  135  2e-31  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.829966  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1476  30S ribosomal protein S9  53.17 
 
 		 166 aa  134  3.0000000000000003e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.270542 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2697  30S ribosomal protein S9  53.17 
 
 		 161 aa  134  4e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.145825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1513  SSU ribosomal protein S9P  55.56 
 
 		 165 aa  134  4e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.472306 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3107  30S ribosomal protein S9  52.8 
 
 		 160 aa  134  6.0000000000000005e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.966484  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04080  30S ribosomal protein S9  50.39 
 
 		 128 aa  133  8e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4591  30S ribosomal protein S9  52 
 
 		 160 aa  132  9.999999999999999e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1681  30S ribosomal protein S9  53.6 
 
 		 155 aa  132  9.999999999999999e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00362695  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2672  30S ribosomal protein S9  52 
 
 		 158 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.569835  normal  0.132209 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0913  ribosomal protein S9  53.6 
 
 		 129 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000269489  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0021  30S ribosomal protein S9  52.71 
 
 		 160 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.849835  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1601  30S ribosomal protein S9  51.94 
 
 		 164 aa  132  1.9999999999999998e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.292372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1650  30S ribosomal protein S9  52.71 
 
 		 160 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.377487 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1422  30S ribosomal protein S9  51.2 
 
 		 158 aa  131  3e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.51395  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2454  30S ribosomal protein S9  51.2 
 
 		 158 aa  131  3e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.812734  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2708  30S ribosomal protein S9  51.2 
 
 		 158 aa  130  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.421371  normal  0.509442 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2069  30S ribosomal protein S9  54.4 
 
 		 130 aa  131  3.9999999999999996e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000831765  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3348  ribosomal protein S9  52.8 
 
 		 129 aa  130  5e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0614997 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4345  30S ribosomal protein S9  52 
 
 		 160 aa  130  5e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.59912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2175  30S ribosomal protein S9  51.94 
 
 		 160 aa  130  6.999999999999999e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0915323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2970  30S ribosomal protein S9  52.71 
 
 		 159 aa  130  6.999999999999999e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0570988  normal  0.349655 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3627  30S ribosomal protein S9  49.22 
 
 		 130 aa  130  6.999999999999999e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000023775  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2843  30S ribosomal protein S9  52 
 
 		 161 aa  130  7.999999999999999e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2620  30S ribosomal protein S9  52 
 
 		 161 aa  130  7.999999999999999e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.159482 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3285  30S ribosomal protein S9  52.38 
 
 		 180 aa  130  7.999999999999999e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2425  30S ribosomal protein S9  51.16 
 
 		 164 aa  129  9e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.149157  normal  0.160414 
 
 
-
 
NC_004310  BR0790  30S ribosomal protein S9  53.6 
 
 		 158 aa  129  1.0000000000000001e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.552498  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0786  30S ribosomal protein S9  53.6 
 
 		 158 aa  129  1.0000000000000001e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.637937  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2496  30S ribosomal protein S9  53.6 
 
 		 158 aa  129  1.0000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0230  SSU ribosomal protein S9P  51.2 
 
 		 132 aa  129  1.0000000000000001e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000443747  normal  0.670048 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4594  30S ribosomal protein S9  54.4 
 
 		 188 aa  129  1.0000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0149  30S ribosomal protein S9  52.8 
 
 		 162 aa  128  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2650  30S ribosomal protein S9  52 
 
 		 161 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.550147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4611  30S ribosomal protein S9  52.8 
 
 		 162 aa  127  3e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0520803 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2726  ribosomal protein S9  50.4 
 
 		 132 aa  128  3e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000561308  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1031  30S ribosomal protein S9  54.89 
 
 		 132 aa  127  4.0000000000000003e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.791116  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1233  30S ribosomal protein S9  51.15 
 
 		 130 aa  127  5.0000000000000004e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000147442  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3038  30S ribosomal protein S9  48.06 
 
 		 128 aa  127  5.0000000000000004e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0109364  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0382  30S ribosomal protein S9  51.59 
 
 		 130 aa  127  7.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0184231  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0367  30S ribosomal protein S9  51.59 
 
 		 130 aa  127  7.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000448381  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0128  30S ribosomal protein S9  52.85 
 
 		 130 aa  126  9.000000000000001e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000606121  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0853  30S ribosomal protein S9  52.85 
 
 		 124 aa  125  1.0000000000000001e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000119355  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0722  30S ribosomal protein S9  48.84 
 
 		 128 aa  126  1.0000000000000001e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3070  30S ribosomal protein S9  51.15 
 
 		 130 aa  125  1.0000000000000001e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000352838  normal  0.198807 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1179  30S ribosomal protein S9  51.2 
 
 		 161 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.554063  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0144  30S ribosomal protein S9  50.4 
 
 		 130 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133435  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0144  30S ribosomal protein S9  50.4 
 
 		 130 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000533856  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0839  ribosomal protein S9  53.97 
 
 		 145 aa  125  2.0000000000000002e-28  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1782  30S ribosomal protein S9  52 
 
 		 130 aa  125  2.0000000000000002e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000024243  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0212  ribosomal protein S9  48.8 
 
 		 131 aa  124  3e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000467508  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2471  ribosomal protein S9  48.06 
 
 		 130 aa  124  3e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0151898  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3594  30S ribosomal protein S9  50.38 
 
 		 130 aa  125  3e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000165532  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0607  30S ribosomal protein S9  48.82 
 
 		 130 aa  125  3e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000206629  hitchhiker  0.00149279 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13050  30S ribosomal protein S9  50 
 
 		 130 aa  124  3e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0145  30S ribosomal protein S9  48.8 
 
 		 130 aa  125  3e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000670079  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0724  30S ribosomal protein S9  50.38 
 
 		 130 aa  124  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00489418  hitchhiker  0.0000321207 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3939  30S ribosomal protein S9  50.38 
 
 		 130 aa  124  4.0000000000000003e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3651  30S ribosomal protein S9  50.38 
 
 		 130 aa  124  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000456747  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4693  30S ribosomal protein S9  49.21 
 
 		 130 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00380118  normal  0.0220476 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0703  30S ribosomal protein S9  50.38 
 
 		 130 aa  124  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000775692  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3268  30S ribosomal protein S9  50.38 
 
 		 130 aa  124  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000222713  hitchhiker  0.0000090404 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0679  30S ribosomal protein S9  50.38 
 
 		 130 aa  124  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000564509  hitchhiker  0.00025421 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0733  30S ribosomal protein S9  50.38 
 
 		 130 aa  124  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000589004  hitchhiker  0.00344758 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0745  30S ribosomal protein S9  50.38 
 
 		 130 aa  124  4.0000000000000003e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000051972  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0247  SSU ribosomal protein S9P  50.39 
 
 		 130 aa  124  4.0000000000000003e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00762963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0693  30S ribosomal protein S9  50.38 
 
 		 130 aa  124  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000579549  decreased coverage  0.00000193008 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0244  30S ribosomal protein S9  52 
 
 		 165 aa  124  5e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.411662 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0748  30S ribosomal protein S9  49.62 
 
 		 130 aa  123  6e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000172866  normal  0.041404 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0215  30S ribosomal protein S9  51.22 
 
 		 130 aa  124  6e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00249156  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4221  30S ribosomal protein S9  49.62 
 
 		 130 aa  123  6e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000135609  hitchhiker  0.000316349 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1566  30S ribosomal protein S9  49.61 
 
 		 128 aa  124  6e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000968491  normal  0.322438 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0797  30S ribosomal protein S9  49.61 
 
 		 128 aa  124  6e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000494469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0902  30S ribosomal protein S9  49.6 
 
 		 130 aa  124  6e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1050  30S ribosomal protein S9  50.78 
 
 		 130 aa  124  6e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000126027  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0800  30S ribosomal protein S9  50.76 
 
 		 135 aa  124  6e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.435176  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2875  30S ribosomal protein S9  48.82 
 
 		 130 aa  123  7e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0195834  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3190  30S ribosomal protein S9  49.61 
 
 		 130 aa  123  8.000000000000001e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000452354  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1611  30S ribosomal protein S9  45.74 
 
 		 128 aa  123  8.000000000000001e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0149645  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3293  30S ribosomal protein S9  50.4 
 
 		 130 aa  123  8.000000000000001e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000148641  hitchhiker  0.00108393 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>