More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_1598 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009714  CHAB381_1598  30S ribosomal protein S9  100 
 
 		 129 aa  262  1e-69  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00000000158082  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0385  30S ribosomal protein S9  89.15 
 
 		 129 aa  237  2.9999999999999997e-62  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.704674  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1652  30S ribosomal protein S9  88.37 
 
 		 129 aa  236  1e-61  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.386728  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1826  30S ribosomal protein S9  88.37 
 
 		 129 aa  236  1e-61  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.0000606063  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1472  30S ribosomal protein S9  88.37 
 
 		 129 aa  236  1e-61  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000347675  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0388  30S ribosomal protein S9  86.82 
 
 		 129 aa  234  2e-61  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0738  30S ribosomal protein S9  87.6 
 
 		 129 aa  233  5.0000000000000005e-61  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.211677  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0912  30S ribosomal protein S9  86.82 
 
 		 129 aa  232  1.0000000000000001e-60  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1908  ribosomal protein S9  74.42 
 
 		 129 aa  201  4e-51  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0093  30S ribosomal protein S9  59.69 
 
 		 129 aa  165  2e-40  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1163  30S ribosomal protein S9  56 
 
 		 160 aa  142  2e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.456788  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2938  ribosomal protein S9  54.4 
 
 		 162 aa  139  1.9999999999999998e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000844995 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1384  30S ribosomal protein S9  55.2 
 
 		 161 aa  137  4.999999999999999e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.839793 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2151  30S ribosomal protein S9  53.6 
 
 		 158 aa  136  8.999999999999999e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.45731  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3107  30S ribosomal protein S9  52.8 
 
 		 160 aa  136  1e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.966484  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2697  30S ribosomal protein S9  53.6 
 
 		 161 aa  136  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.145825  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3627  30S ribosomal protein S9  49.22 
 
 		 130 aa  135  2e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000023775  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0861  30S ribosomal protein S9  55.2 
 
 		 155 aa  135  2e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0415089  normal  0.103809 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4345  30S ribosomal protein S9  51.2 
 
 		 160 aa  135  2e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.59912  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04080  30S ribosomal protein S9  51.16 
 
 		 128 aa  135  2e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4591  30S ribosomal protein S9  52 
 
 		 160 aa  135  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3025  30S ribosomal protein S9  52.8 
 
 		 157 aa  134  3.0000000000000003e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.795745 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2672  30S ribosomal protein S9  51.2 
 
 		 158 aa  134  4e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.569835  normal  0.132209 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1321  30S ribosomal protein S9  53.6 
 
 		 155 aa  134  6.0000000000000005e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.243338  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0790  30S ribosomal protein S9  52.8 
 
 		 158 aa  133  9.999999999999999e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.552498  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2496  30S ribosomal protein S9  52.8 
 
 		 158 aa  133  9.999999999999999e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0786  30S ribosomal protein S9  52.8 
 
 		 158 aa  133  9.999999999999999e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.637937  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1422  30S ribosomal protein S9  51.2 
 
 		 158 aa  133  9.999999999999999e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.51395  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0913  ribosomal protein S9  50.39 
 
 		 129 aa  132  9.999999999999999e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000269489  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1234  30S ribosomal protein S9  52.8 
 
 		 155 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.745621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2708  30S ribosomal protein S9  51.2 
 
 		 158 aa  132  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.421371  normal  0.509442 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2454  30S ribosomal protein S9  51.2 
 
 		 158 aa  132  9.999999999999999e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.812734  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1782  30S ribosomal protein S9  52.8 
 
 		 130 aa  132  9.999999999999999e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000024243  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0230  SSU ribosomal protein S9P  52 
 
 		 132 aa  132  1.9999999999999998e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000443747  normal  0.670048 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1681  30S ribosomal protein S9  52 
 
 		 155 aa  132  1.9999999999999998e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00362695  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1476  30S ribosomal protein S9  52 
 
 		 166 aa  132  1.9999999999999998e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.270542 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3348  ribosomal protein S9  49.61 
 
 		 129 aa  131  3e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0614997 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0902  30S ribosomal protein S9  52 
 
 		 161 aa  131  3e-30  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.829966  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3285  30S ribosomal protein S9  52.8 
 
 		 180 aa  131  3e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2069  30S ribosomal protein S9  52.67 
 
 		 130 aa  131  3e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000831765  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0149  30S ribosomal protein S9  51.2 
 
 		 162 aa  130  5e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1872  30S ribosomal protein S9  52 
 
 		 159 aa  130  5e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.952658 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2425  30S ribosomal protein S9  52.8 
 
 		 164 aa  130  6e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.149157  normal  0.160414 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0128  30S ribosomal protein S9  50.78 
 
 		 130 aa  130  6e-30  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000606121  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1601  30S ribosomal protein S9  52 
 
 		 164 aa  130  6.999999999999999e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.292372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0722  30S ribosomal protein S9  51.16 
 
 		 128 aa  130  6.999999999999999e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2249  30S ribosomal protein S9  51.2 
 
 		 163 aa  130  7.999999999999999e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4611  30S ribosomal protein S9  51.2 
 
 		 162 aa  130  7.999999999999999e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0520803 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1379  30S ribosomal protein S9  51.2 
 
 		 159 aa  129  9e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0851685 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0021  30S ribosomal protein S9  52.8 
 
 		 160 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.849835  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1650  30S ribosomal protein S9  52.8 
 
 		 160 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.377487 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2843  30S ribosomal protein S9  51.2 
 
 		 161 aa  128  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0607  30S ribosomal protein S9  49.62 
 
 		 130 aa  128  2.0000000000000002e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000206629  hitchhiker  0.00149279 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2620  30S ribosomal protein S9  51.2 
 
 		 161 aa  128  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.159482 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1513  SSU ribosomal protein S9P  54.4 
 
 		 165 aa  128  2.0000000000000002e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.472306 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4594  30S ribosomal protein S9  52 
 
 		 188 aa  129  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0145  30S ribosomal protein S9  49.6 
 
 		 130 aa  128  3e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000670079  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1179  30S ribosomal protein S9  50.4 
 
 		 161 aa  128  3e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.554063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2175  30S ribosomal protein S9  52 
 
 		 160 aa  128  3e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0915323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1050  30S ribosomal protein S9  49.22 
 
 		 130 aa  127  4.0000000000000003e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000126027  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0215  30S ribosomal protein S9  50.41 
 
 		 130 aa  127  5.0000000000000004e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00249156  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4693  30S ribosomal protein S9  49.6 
 
 		 130 aa  127  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00380118  normal  0.0220476 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2970  30S ribosomal protein S9  52.8 
 
 		 159 aa  127  5.0000000000000004e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0570988  normal  0.349655 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13050  30S ribosomal protein S9  49.6 
 
 		 130 aa  127  5.0000000000000004e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2650  30S ribosomal protein S9  51.2 
 
 		 161 aa  127  6e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.550147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3190  30S ribosomal protein S9  50.39 
 
 		 130 aa  127  6e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000452354  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2875  30S ribosomal protein S9  48.82 
 
 		 130 aa  126  9.000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0195834  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2583  30S ribosomal protein S9  52.67 
 
 		 130 aa  126  9.000000000000001e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000028456  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4425  ribosomal protein S9  48.8 
 
 		 130 aa  125  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.146621  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4119  30S ribosomal protein S9  48.8 
 
 		 130 aa  125  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2726  ribosomal protein S9  49.6 
 
 		 132 aa  126  1.0000000000000001e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000561308  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0902  30S ribosomal protein S9  48.8 
 
 		 130 aa  125  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2678  30S ribosomal protein S9  50.81 
 
 		 130 aa  126  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000125135  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2363  30S ribosomal protein S9  50.81 
 
 		 130 aa  126  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000350135  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0795  30S ribosomal protein S9  50.4 
 
 		 130 aa  126  1.0000000000000001e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000718866  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0247  SSU ribosomal protein S9P  49.61 
 
 		 130 aa  126  1.0000000000000001e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00762963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1611  30S ribosomal protein S9  46.51 
 
 		 128 aa  125  2.0000000000000002e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0149645  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3085  30S ribosomal protein S9  50.39 
 
 		 130 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000996861  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0923  30S ribosomal protein S9  49.6 
 
 		 130 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3665  30S ribosomal protein S9  49.6 
 
 		 130 aa  125  2.0000000000000002e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0023412  normal  0.0755267 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1031  30S ribosomal protein S9  53.38 
 
 		 132 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.791116  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004510  SSU ribosomal protein S9p (S16e)  50.4 
 
 		 130 aa  125  2.0000000000000002e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000229051  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0746  ribosomal protein S9  46.4 
 
 		 134 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2679  ribosomal protein S9  51.15 
 
 		 130 aa  125  2.0000000000000002e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0151101  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0853  30S ribosomal protein S9  50 
 
 		 124 aa  124  3e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000119355  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5160  30S ribosomal protein S9  48.8 
 
 		 130 aa  125  3e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000743375  hitchhiker  0.0000000912351 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0144  30S ribosomal protein S9  48.8 
 
 		 130 aa  125  3e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000361179  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0139  30S ribosomal protein S9  48.8 
 
 		 130 aa  125  3e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.11946e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0137  30S ribosomal protein S9  48.8 
 
 		 130 aa  125  3e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000359543  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0166  30S ribosomal protein S9  48.8 
 
 		 130 aa  125  3e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00347352  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0176  30S ribosomal protein S9  48.8 
 
 		 130 aa  125  3e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000140848  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0157  30S ribosomal protein S9  48.8 
 
 		 130 aa  125  3e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.4920599999999996e-31 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0753  30S ribosomal protein S9  48.8 
 
 		 130 aa  124  4.0000000000000003e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000116915  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0212  ribosomal protein S9  47.62 
 
 		 131 aa  124  4.0000000000000003e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000467508  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1233  30S ribosomal protein S9  51.2 
 
 		 130 aa  124  5e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000147442  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0525  30S ribosomal protein S9  49.6 
 
 		 130 aa  124  5e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000883336  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0461  30S ribosomal protein S9  49.6 
 
 		 130 aa  124  5e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000140237  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1133  30S ribosomal protein S9  49.6 
 
 		 130 aa  124  5e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000113025  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3939  30S ribosomal protein S9  49.6 
 
 		 130 aa  124  6e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0733  30S ribosomal protein S9  49.6 
 
 		 130 aa  124  6e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000589004  hitchhiker  0.00344758 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>