More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0388 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008599  CFF8240_0388  30S ribosomal protein S9  100 
 
 		 129 aa  261  2e-69  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0385  30S ribosomal protein S9  91.47 
 
 		 129 aa  242  9.999999999999999e-64  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.704674  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1652  30S ribosomal protein S9  90.7 
 
 		 129 aa  241  3e-63  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.386728  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1472  30S ribosomal protein S9  90.7 
 
 		 129 aa  241  3e-63  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000347675  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1826  30S ribosomal protein S9  90.7 
 
 		 129 aa  241  3e-63  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.0000606063  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0912  30S ribosomal protein S9  88.37 
 
 		 129 aa  237  5e-62  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0738  30S ribosomal protein S9  87.6 
 
 		 129 aa  236  6.999999999999999e-62  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.211677  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1598  30S ribosomal protein S9  86.82 
 
 		 129 aa  234  2e-61  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00000000158082  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1908  ribosomal protein S9  75.19 
 
 		 129 aa  205  2e-52  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0093  30S ribosomal protein S9  62.79 
 
 		 129 aa  174  4e-43  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2938  ribosomal protein S9  59.2 
 
 		 162 aa  149  2e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000844995 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3025  30S ribosomal protein S9  56.8 
 
 		 157 aa  142  2e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.795745 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1384  30S ribosomal protein S9  55.04 
 
 		 161 aa  142  2e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.839793 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1163  30S ribosomal protein S9  56.8 
 
 		 160 aa  142  2e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.456788  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2151  30S ribosomal protein S9  54.76 
 
 		 158 aa  140  5e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.45731  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1872  30S ribosomal protein S9  55.2 
 
 		 159 aa  140  5e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.952658 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1601  30S ribosomal protein S9  53.49 
 
 		 164 aa  138  3e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.292372  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1234  30S ribosomal protein S9  53.49 
 
 		 155 aa  137  3.9999999999999997e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.745621  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1321  30S ribosomal protein S9  53.49 
 
 		 155 aa  137  4.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.243338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1379  30S ribosomal protein S9  53.6 
 
 		 159 aa  135  1e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0851685 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0021  30S ribosomal protein S9  53.49 
 
 		 160 aa  136  1e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.849835  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1650  30S ribosomal protein S9  53.49 
 
 		 160 aa  136  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.377487 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0861  30S ribosomal protein S9  55.56 
 
 		 155 aa  136  1e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0415089  normal  0.103809 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0902  30S ribosomal protein S9  53.17 
 
 		 161 aa  136  1e-31  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.829966  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2620  30S ribosomal protein S9  52.8 
 
 		 161 aa  135  2e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.159482 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2425  30S ribosomal protein S9  52.71 
 
 		 164 aa  135  2e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.149157  normal  0.160414 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2843  30S ribosomal protein S9  52.8 
 
 		 161 aa  135  2e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2697  30S ribosomal protein S9  53.6 
 
 		 161 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.145825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2175  30S ribosomal protein S9  52.71 
 
 		 160 aa  134  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0915323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2249  30S ribosomal protein S9  51.94 
 
 		 163 aa  134  4e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3627  30S ribosomal protein S9  50.78 
 
 		 130 aa  134  4e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000023775  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1681  30S ribosomal protein S9  53.6 
 
 		 155 aa  134  5e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00362695  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1476  30S ribosomal protein S9  53.17 
 
 		 166 aa  134  6.0000000000000005e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.270542 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4345  30S ribosomal protein S9  53.6 
 
 		 160 aa  133  7.000000000000001e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.59912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3107  30S ribosomal protein S9  52.8 
 
 		 160 aa  133  7.000000000000001e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.966484  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0913  ribosomal protein S9  52.8 
 
 		 129 aa  133  8e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000269489  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2650  30S ribosomal protein S9  52.8 
 
 		 161 aa  133  8e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.550147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2970  30S ribosomal protein S9  53.49 
 
 		 159 aa  133  9e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0570988  normal  0.349655 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2672  30S ribosomal protein S9  52 
 
 		 158 aa  132  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.569835  normal  0.132209 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3285  30S ribosomal protein S9  53.17 
 
 		 180 aa  132  9.999999999999999e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0128  30S ribosomal protein S9  52.85 
 
 		 130 aa  132  9.999999999999999e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000606121  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1422  30S ribosomal protein S9  51.2 
 
 		 158 aa  132  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.51395  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1179  30S ribosomal protein S9  53.6 
 
 		 161 aa  131  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.554063  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1513  SSU ribosomal protein S9P  54.76 
 
 		 165 aa  132  1.9999999999999998e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.472306 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4591  30S ribosomal protein S9  52 
 
 		 160 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3348  ribosomal protein S9  52 
 
 		 129 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0614997 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04080  30S ribosomal protein S9  49.61 
 
 		 128 aa  131  3e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0215  30S ribosomal protein S9  52.85 
 
 		 130 aa  131  3e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00249156  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13050  30S ribosomal protein S9  52.38 
 
 		 130 aa  131  3e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0149  30S ribosomal protein S9  52.8 
 
 		 162 aa  131  3e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4693  30S ribosomal protein S9  52.38 
 
 		 130 aa  131  3e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00380118  normal  0.0220476 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2454  30S ribosomal protein S9  51.2 
 
 		 158 aa  131  3e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.812734  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2069  30S ribosomal protein S9  53.6 
 
 		 130 aa  131  3e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000831765  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0790  30S ribosomal protein S9  53.6 
 
 		 158 aa  130  3.9999999999999996e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.552498  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0786  30S ribosomal protein S9  53.6 
 
 		 158 aa  130  3.9999999999999996e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.637937  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1233  30S ribosomal protein S9  51.15 
 
 		 130 aa  131  3.9999999999999996e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000147442  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2678  30S ribosomal protein S9  51.61 
 
 		 130 aa  131  3.9999999999999996e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000125135  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2363  30S ribosomal protein S9  51.61 
 
 		 130 aa  131  3.9999999999999996e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000350135  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2496  30S ribosomal protein S9  53.6 
 
 		 158 aa  130  3.9999999999999996e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4611  30S ribosomal protein S9  52.8 
 
 		 162 aa  130  5e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0520803 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2471  ribosomal protein S9  50.39 
 
 		 130 aa  130  6e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0151898  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2708  30S ribosomal protein S9  51.2 
 
 		 158 aa  130  6e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.421371  normal  0.509442 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2726  ribosomal protein S9  51.2 
 
 		 132 aa  130  6.999999999999999e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000561308  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4594  30S ribosomal protein S9  53.6 
 
 		 188 aa  130  7.999999999999999e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0746  ribosomal protein S9  48.8 
 
 		 134 aa  130  9e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4425  ribosomal protein S9  51.59 
 
 		 130 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.146621  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0902  30S ribosomal protein S9  51.59 
 
 		 130 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4119  30S ribosomal protein S9  51.59 
 
 		 130 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2583  30S ribosomal protein S9  52.85 
 
 		 130 aa  129  1.0000000000000001e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000028456  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0230  SSU ribosomal protein S9P  50.4 
 
 		 132 aa  129  1.0000000000000001e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000443747  normal  0.670048 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1782  30S ribosomal protein S9  53.6 
 
 		 130 aa  129  1.0000000000000001e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000024243  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1133  30S ribosomal protein S9  52 
 
 		 130 aa  128  2.0000000000000002e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000113025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0525  30S ribosomal protein S9  52 
 
 		 130 aa  128  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000883336  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3665  30S ribosomal protein S9  51.2 
 
 		 130 aa  128  2.0000000000000002e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0023412  normal  0.0755267 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0461  30S ribosomal protein S9  52 
 
 		 130 aa  128  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000140237  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0923  30S ribosomal protein S9  51.59 
 
 		 130 aa  128  3e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0607  30S ribosomal protein S9  49.61 
 
 		 130 aa  127  4.0000000000000003e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000206629  hitchhiker  0.00149279 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03090  30S ribosomal protein S9  50.4 
 
 		 130 aa  127  6e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000557445  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0476  ribosomal protein S9  50.4 
 
 		 130 aa  127  6e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000601039  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03041  hypothetical protein  50.4 
 
 		 130 aa  127  6e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000287646  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0476  30S ribosomal protein S9  50.4 
 
 		 130 aa  127  6e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000111446  normal  0.163216 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3419  30S ribosomal protein S9  50.4 
 
 		 130 aa  127  6e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000112038  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3525  30S ribosomal protein S9  50.4 
 
 		 130 aa  127  6e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000016286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3546  30S ribosomal protein S9  50.4 
 
 		 130 aa  127  6e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000104404  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0145  30S ribosomal protein S9  50.4 
 
 		 130 aa  127  6e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000670079  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0795  30S ribosomal protein S9  52.8 
 
 		 130 aa  127  6e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000718866  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3713  30S ribosomal protein S9  50.4 
 
 		 130 aa  127  6e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000596943  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4547  30S ribosomal protein S9  50.4 
 
 		 130 aa  127  6e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000371086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3704  30S ribosomal protein S9  50.4 
 
 		 130 aa  126  8.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00817033  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3607  30S ribosomal protein S9  50.4 
 
 		 130 aa  126  8.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000867127  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3642  30S ribosomal protein S9  50.4 
 
 		 130 aa  126  8.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000331692  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004510  SSU ribosomal protein S9p (S16e)  50.4 
 
 		 130 aa  126  8.000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000229051  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3536  30S ribosomal protein S9  50.4 
 
 		 130 aa  126  8.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.0000037617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3535  30S ribosomal protein S9  50.4 
 
 		 130 aa  126  8.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000799314  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4348  30S ribosomal protein S9  51.2 
 
 		 130 aa  126  9.000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000012665  hitchhiker  0.00291766 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2875  30S ribosomal protein S9  49.61 
 
 		 130 aa  125  1.0000000000000001e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0195834  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4533  30S ribosomal protein S9  50.79 
 
 		 130 aa  125  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.848049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4408  30S ribosomal protein S9  50.79 
 
 		 130 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.40853 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1050  30S ribosomal protein S9  50 
 
 		 130 aa  126  1.0000000000000001e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000126027  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0231  SSU ribosomal protein S9P  51.94 
 
 		 131 aa  126  1.0000000000000001e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.0000192076  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>