More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_1102 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1102  30S ribosomal protein S9  100 
 
 
135 aa  275  1e-73  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19771  30S ribosomal protein S9  98.52 
 
 
135 aa  270  3e-72  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23301  30S ribosomal protein S9  87.41 
 
 
135 aa  247  5e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16511  30S ribosomal protein S9  88.06 
 
 
137 aa  246  6e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0633365  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1982  30S ribosomal protein S9  87.12 
 
 
133 aa  236  8e-62  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0810268  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0349  30S ribosomal protein S9  85.61 
 
 
133 aa  234  3e-61  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.842088 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1624  30S ribosomal protein S9  83.08 
 
 
136 aa  227  4e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.567552  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17131  30S ribosomal protein S9  83.08 
 
 
136 aa  227  4e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0453537  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17391  30S ribosomal protein S9  83.08 
 
 
136 aa  225  2e-58  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17231  30S ribosomal protein S9  82.31 
 
 
136 aa  221  2e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2205  30S ribosomal protein S9  72.59 
 
 
135 aa  210  4.9999999999999996e-54  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0221  30S ribosomal protein S9  65.93 
 
 
135 aa  196  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0143774  normal  0.010853 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0224  30S ribosomal protein S9  65.93 
 
 
135 aa  196  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3731  30S ribosomal protein S9  65.67 
 
 
137 aa  192  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2587  30S ribosomal protein S9  63.91 
 
 
138 aa  189  1e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0719  30S ribosomal protein S9  63.91 
 
 
138 aa  189  1e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000482758  normal  0.593544 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1320  30S ribosomal protein S9  63.7 
 
 
137 aa  188  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.540344  normal  0.687353 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2984  30S ribosomal protein S9  63.64 
 
 
136 aa  182  1.0000000000000001e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.414721 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02470  ribosomal protein S9  61.24 
 
 
131 aa  152  1e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000158686  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01520  ribosomal protein S9  61.24 
 
 
131 aa  152  1e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000216085  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0230  SSU ribosomal protein S9P  55.3 
 
 
132 aa  147  6e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000443747  normal  0.670048 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0902  30S ribosomal protein S9  57.81 
 
 
130 aa  137  4.999999999999999e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000079624  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0746  ribosomal protein S9  51.13 
 
 
134 aa  135  2e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0138  30S ribosomal protein S9  58.14 
 
 
130 aa  135  2e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000590069  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0144  30S ribosomal protein S9  57.36 
 
 
130 aa  134  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000361179  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0139  30S ribosomal protein S9  57.36 
 
 
130 aa  134  3.0000000000000003e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.11946e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0137  30S ribosomal protein S9  57.36 
 
 
130 aa  134  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000359543  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0176  30S ribosomal protein S9  57.36 
 
 
130 aa  134  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000140848  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5160  30S ribosomal protein S9  57.36 
 
 
130 aa  134  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000743375  hitchhiker  0.0000000912351 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0157  30S ribosomal protein S9  57.36 
 
 
130 aa  134  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.4920599999999996e-31 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0166  30S ribosomal protein S9  57.36 
 
 
130 aa  134  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00347352  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1126  30S ribosomal protein S9  55.56 
 
 
172 aa  134  4e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.482238 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl492  30S ribosomal protein S9  53.08 
 
 
131 aa  132  9.999999999999999e-31  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.263137  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0139  30S ribosomal protein S9  56.59 
 
 
130 aa  132  9.999999999999999e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000424807  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3627  30S ribosomal protein S9  53.49 
 
 
130 aa  132  9.999999999999999e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000023775  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0145  30S ribosomal protein S9  58.33 
 
 
130 aa  133  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000670079  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0144  30S ribosomal protein S9  56.59 
 
 
130 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133435  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0144  30S ribosomal protein S9  56.59 
 
 
130 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000533856  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1782  30S ribosomal protein S9  56.59 
 
 
130 aa  132  1.9999999999999998e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000024243  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2679  ribosomal protein S9  55.47 
 
 
130 aa  132  1.9999999999999998e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0151101  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2120  SSU ribosomal protein S9P  55.04 
 
 
130 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.39803  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0795  30S ribosomal protein S9  54.26 
 
 
130 aa  130  9e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000718866  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2678  30S ribosomal protein S9  53.49 
 
 
130 aa  129  1.0000000000000001e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000125135  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2363  30S ribosomal protein S9  53.49 
 
 
130 aa  129  1.0000000000000001e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000350135  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1798  30S ribosomal protein S9  55.04 
 
 
130 aa  129  2.0000000000000002e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2297  ribosomal protein S9  52.67 
 
 
130 aa  128  2.0000000000000002e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000207473  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2285  30S ribosomal protein S9  54.26 
 
 
130 aa  128  3e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000447741  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2244  30S ribosomal protein S9  54.26 
 
 
130 aa  128  3e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000238567  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2726  ribosomal protein S9  52.31 
 
 
132 aa  126  1.0000000000000001e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000561308  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0323  30S ribosomal protein S9  53.85 
 
 
131 aa  126  1.0000000000000001e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000255899  hitchhiker  5.84326e-17 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0433  30S ribosomal protein S9  52.27 
 
 
132 aa  126  1.0000000000000001e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0713606  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1154  ribosomal protein S9  49.23 
 
 
132 aa  125  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.252489  normal  0.0143228 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0600  30S ribosomal protein S9  53.17 
 
 
173 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.190844  normal  0.458366 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0231  SSU ribosomal protein S9P  54.2 
 
 
131 aa  125  2.0000000000000002e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.0000192076  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0722  30S ribosomal protein S9  51.97 
 
 
128 aa  124  3e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1450  SSU ribosomal protein S9P  53.03 
 
 
131 aa  124  4.0000000000000003e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000188818  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0662  30S ribosomal protein S9  50 
 
 
132 aa  124  5e-28  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.219101  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1177  ribosomal protein S9  51.22 
 
 
174 aa  124  5e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.904807  normal  0.699948 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0923  30S ribosomal protein S9  52.46 
 
 
154 aa  123  9e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2613  30S ribosomal protein S9  53.6 
 
 
169 aa  123  1e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1394  ribosomal protein S9  51.18 
 
 
129 aa  122  2e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000135637  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0212  ribosomal protein S9  49.22 
 
 
131 aa  122  2e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000467508  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0006  ribosomal protein S9  49.62 
 
 
133 aa  122  2e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.819912  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0321  30S ribosomal protein S9  49.61 
 
 
130 aa  122  2e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000288169  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3995  ribosomal protein S9  47.69 
 
 
132 aa  122  2e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.850021  hitchhiker  0.000512267 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1031  30S ribosomal protein S9  50 
 
 
132 aa  121  3e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.791116  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6017  ribosomal protein S9  52.42 
 
 
135 aa  121  3e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0328969  normal  0.0856034 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2583  30S ribosomal protein S9  51.94 
 
 
130 aa  120  5e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000028456  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1249  ribosomal protein S9  50.76 
 
 
131 aa  120  5e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2069  30S ribosomal protein S9  51.16 
 
 
130 aa  120  7e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000831765  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2993  ribosomal protein S9  50 
 
 
132 aa  120  8e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.113743  hitchhiker  0.00813341 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04450  SSU ribosomal protein S9P  49.18 
 
 
162 aa  119  9.999999999999999e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.271227 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1566  30S ribosomal protein S9  48.8 
 
 
128 aa  118  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000968491  normal  0.322438 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0430  ribosomal protein S9  49.23 
 
 
130 aa  119  1.9999999999999998e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.912667  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1748  30S ribosomal protein S9  48.8 
 
 
128 aa  119  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00000973218  normal  0.252579 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0562  SSU ribosomal protein S9P  48.44 
 
 
131 aa  119  1.9999999999999998e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000000134066  normal  0.199008 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1735  30S ribosomal protein S9  50.79 
 
 
131 aa  118  1.9999999999999998e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0401133 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21980  SSU ribosomal protein S9P  47.33 
 
 
130 aa  119  1.9999999999999998e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000149562  hitchhiker  0.00529045 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0347  ribosomal protein S9  48.06 
 
 
130 aa  118  1.9999999999999998e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000129825  normal  0.751178 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0618  ribosomal protein S9  52 
 
 
163 aa  118  1.9999999999999998e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5159  ribosomal protein S9  50.4 
 
 
169 aa  118  3e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.623801  normal  0.298446 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3038  30S ribosomal protein S9  50.39 
 
 
128 aa  118  3e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0109364  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0342  SSU ribosomal protein S9P  50.79 
 
 
170 aa  118  3e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0651444  hitchhiker  0.00386337 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01720  SSU ribosomal protein S9P  47.29 
 
 
130 aa  117  3.9999999999999996e-26  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.0000000110111  hitchhiker  0.000000000473134 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0890  30S ribosomal protein S9  52 
 
 
166 aa  117  3.9999999999999996e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1345  30S ribosomal protein S9  49.22 
 
 
134 aa  117  3.9999999999999996e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00368639  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2424  SSU ribosomal protein S9P  55.04 
 
 
130 aa  117  4.9999999999999996e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000332574  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0141  30S ribosomal protein S9  58.33 
 
 
130 aa  117  4.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0149  30S ribosomal protein S9  48.8 
 
 
162 aa  117  6e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1341  30S ribosomal protein S9  49.22 
 
 
134 aa  117  7e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000324124  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3293  30S ribosomal protein S9  48.41 
 
 
130 aa  117  7.999999999999999e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000148641  hitchhiker  0.00108393 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0051  30S ribosomal protein S9  50 
 
 
128 aa  117  7.999999999999999e-26  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0331  ribosomal protein S9  49.61 
 
 
130 aa  116  9e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00016739  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0972  ribosomal protein S9  52 
 
 
173 aa  116  9e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0537605 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3070  30S ribosomal protein S9  49.21 
 
 
130 aa  116  9e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000352838  normal  0.198807 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1537  30S ribosomal protein S9  51.59 
 
 
128 aa  116  9.999999999999999e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000000611504  normal  0.14818 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0215  30S ribosomal protein S9  51.59 
 
 
130 aa  115  1.9999999999999998e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00249156  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3939  30S ribosomal protein S9  47.62 
 
 
130 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0733  30S ribosomal protein S9  47.62 
 
 
130 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000589004  hitchhiker  0.00344758 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4611  30S ribosomal protein S9  47.2 
 
 
162 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0520803 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>