280 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNB02750 on replicon NC_006684
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006684  CNB02750  PRCDNA95, putative  100 
 
 		 140 aa  280  4.0000000000000003e-75  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0301747  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_73324  40S ribosomal protein S16  71.01 
 
 		 142 aa  209  1e-53  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.954213  normal  0.0669518 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31856  Ribosomal protein S16, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  73.19 
 
 		 139 aa  203  5e-52  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.442922  normal  0.257335 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_09468  40S ribosomal protein S16 (Broad)  68.84 
 
 		 143 aa  199  9.999999999999999e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.97674  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17519  predicted protein  64.29 
 
 		 143 aa  188  2e-47  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2548  ribosomal protein S9P  49.64 
 
 		 132 aa  122  2e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0426  ribosomal protein S9P  48.18 
 
 		 132 aa  122  2e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1822  30S ribosomal protein S9P  49.64 
 
 		 132 aa  120  6e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0570  30S ribosomal protein S9P  46.48 
 
 		 134 aa  119  9.999999999999999e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.270013 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1348  30S ribosomal protein S9P  46.48 
 
 		 134 aa  119  9.999999999999999e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.374439  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0636  30S ribosomal protein S9P  46.48 
 
 		 134 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0268  30S ribosomal protein S9P  45.77 
 
 		 134 aa  117  3.9999999999999996e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0481  30S ribosomal protein S9P  46.43 
 
 		 132 aa  115  9.999999999999999e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2518  30S ribosomal protein S9P  46.72 
 
 		 132 aa  113  6.9999999999999995e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.535604  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2390  30S ribosomal protein S9P  45.26 
 
 		 134 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000000011092  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1426  30S ribosomal protein S9P  42.34 
 
 		 134 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0327998 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2595  30S ribosomal protein S9P  43.07 
 
 		 132 aa  107  5e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.22552  normal  0.0960002 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1095  30S ribosomal protein S9P  43.66 
 
 		 134 aa  107  7.000000000000001e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0277  30S ribosomal protein S9P  45 
 
 		 132 aa  106  9.000000000000001e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2382  30S ribosomal protein S9P  43.07 
 
 		 133 aa  103  6e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.0000163984  normal  0.637702 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1806  30S ribosomal protein S9P  42.34 
 
 		 133 aa  102  1e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2100  30S ribosomal protein S9P  43.7 
 
 		 142 aa  102  2e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0694  30S ribosomal protein S9P  43.8 
 
 		 146 aa  100  6e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.459392  normal  0.10195 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1972  30S ribosomal protein S9P  43.8 
 
 		 146 aa  99.8  1e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.038178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1241  30S ribosomal protein S9P  39.29 
 
 		 132 aa  98.2  4e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00137168  normal  0.592005 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1476  ribosomal protein S9P  43.61 
 
 		 132 aa  97.8  5e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.699246  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1571  30S ribosomal protein S9P  39.85 
 
 		 154 aa  96.7  1e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.867321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2330  30S ribosomal protein S9P  42.34 
 
 		 144 aa  95.5  2e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.00000018587  hitchhiker  0.0000157231 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2219  30S ribosomal protein S9P  41.61 
 
 		 133 aa  95.1  2e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0425  30S ribosomal protein S9  35.46 
 
 		 149 aa  94  7e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0289267 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2896  30S ribosomal protein S9P  37.86 
 
 		 132 aa  89.4  1e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00665181  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1049  ribosomal protein S9P  36.5 
 
 		 137 aa  77.4  0.00000000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0529864  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2142  30S ribosomal protein S9P  37.04 
 
 		 137 aa  77  0.00000000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000924754  hitchhiker  0.000062227 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1611  30S ribosomal protein S9  33.33 
 
 		 128 aa  66.2  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0149645  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0722  30S ribosomal protein S9  34.51 
 
 		 128 aa  63.2  0.000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0006  ribosomal protein S9  36.57 
 
 		 133 aa  62.8  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.819912  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1527  ribosomal protein S9  37.31 
 
 		 132 aa  60.8  0.000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000273794  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04080  30S ribosomal protein S9  31.91 
 
 		 128 aa  60.8  0.000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0423  30S ribosomal protein S9  33.33 
 
 		 129 aa  61.2  0.000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00762488  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0800  30S ribosomal protein S9  36.23 
 
 		 135 aa  60.8  0.000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.435176  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1652  30S ribosomal protein S9  35.92 
 
 		 129 aa  60.5  0.000000007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.386728  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1826  30S ribosomal protein S9  35.92 
 
 		 129 aa  60.5  0.000000007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.0000606063  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1472  30S ribosomal protein S9  35.92 
 
 		 129 aa  60.5  0.000000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000347675  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2011  30S ribosomal protein S9  34.06 
 
 		 129 aa  60.5  0.000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00763906  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0402  30S ribosomal protein S9  34.06 
 
 		 129 aa  59.7  0.00000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.248058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3496  30S ribosomal protein S9  33.56 
 
 		 128 aa  59.7  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000030471  normal  0.91876 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0725  30S ribosomal protein S9  33.58 
 
 		 130 aa  58.9  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.616344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4467  ribosomal protein S9  37.68 
 
 		 139 aa  58.2  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1811  30S ribosomal protein S9  29.29 
 
 		 131 aa  57.8  0.00000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.170614  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1546  ribosomal protein S9  36.3 
 
 		 131 aa  57.4  0.00000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000425465  hitchhiker  0.00000000000000208113 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0385  30S ribosomal protein S9  34.51 
 
 		 129 aa  56.2  0.0000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.704674  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0138  30S ribosomal protein S9  32.87 
 
 		 130 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000590069  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl492  30S ribosomal protein S9  37.31 
 
 		 131 aa  56.2  0.0000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.263137  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0433  30S ribosomal protein S9  32.85 
 
 		 132 aa  56.2  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0713606  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0870  ribosomal protein S9  34.78 
 
 		 167 aa  55.8  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0388  30S ribosomal protein S9  34.51 
 
 		 129 aa  55.8  0.0000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2014  30S ribosomal protein S9  31.43 
 
 		 131 aa  55.8  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.27603  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0970  30S ribosomal protein S9  36.3 
 
 		 130 aa  55.5  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.476085 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4742  ribosomal protein S9  33.33 
 
 		 128 aa  55.1  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000000153745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0912  30S ribosomal protein S9  35.21 
 
 		 129 aa  55.1  0.0000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5160  30S ribosomal protein S9  32.17 
 
 		 130 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000743375  hitchhiker  0.0000000912351 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0144  30S ribosomal protein S9  32.17 
 
 		 130 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000361179  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0139  30S ribosomal protein S9  32.17 
 
 		 130 aa  54.7  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.11946e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0137  30S ribosomal protein S9  32.17 
 
 		 130 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000359543  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0157  30S ribosomal protein S9  32.17 
 
 		 130 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.4920599999999996e-31 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0166  30S ribosomal protein S9  32.17 
 
 		 130 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00347352  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1686  ribosomal protein S9  35 
 
 		 161 aa  54.7  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0176  30S ribosomal protein S9  32.17 
 
 		 130 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000140848  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04450  SSU ribosomal protein S9P  33.81 
 
 		 162 aa  54.7  0.0000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.271227 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0853  30S ribosomal protein S9  32.59 
 
 		 124 aa  54.3  0.0000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000119355  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1598  30S ribosomal protein S9  33.8 
 
 		 129 aa  53.9  0.0000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00000000158082  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0111  ribosomal protein S9  33.33 
 
 		 128 aa  53.1  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000221009  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2843  30S ribosomal protein S9  33.33 
 
 		 161 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0662  30S ribosomal protein S9  34.59 
 
 		 132 aa  53.1  0.000001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.219101  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0139  30S ribosomal protein S9  31.47 
 
 		 130 aa  53.1  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000424807  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2620  30S ribosomal protein S9  33.33 
 
 		 161 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.159482 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2471  ribosomal protein S9  33.99 
 
 		 130 aa  53.1  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0151898  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1233  30S ribosomal protein S9  32.84 
 
 		 130 aa  52.4  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000147442  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0738  30S ribosomal protein S9  33.8 
 
 		 129 aa  52.8  0.000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.211677  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0430  ribosomal protein S9  30.5 
 
 		 130 aa  52.4  0.000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.912667  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1882  ribosomal protein S9  35.82 
 
 		 264 aa  52.4  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.178814  normal  0.068579 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1450  SSU ribosomal protein S9P  36.57 
 
 		 131 aa  52.8  0.000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000188818  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0902  30S ribosomal protein S9  32.17 
 
 		 130 aa  52  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000079624  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1131  30S ribosomal protein S9  31.39 
 
 		 158 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1394  ribosomal protein S9  32.17 
 
 		 129 aa  52.4  0.000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000135637  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1148  30S ribosomal protein S9  31.39 
 
 		 158 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.542588  normal  0.417001 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1177  ribosomal protein S9  34.78 
 
 		 174 aa  52.4  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.904807  normal  0.699948 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1158  30S ribosomal protein S9  31.39 
 
 		 158 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.356107 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0144  30S ribosomal protein S9  31.47 
 
 		 130 aa  51.6  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133435  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1649  30S ribosomal protein S9  33.57 
 
 		 129 aa  51.6  0.000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2608  30S ribosomal protein S9  32.84 
 
 		 130 aa  52  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0410125  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0144  30S ribosomal protein S9  31.47 
 
 		 130 aa  51.6  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000533856  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0560  30S ribosomal protein S9  32.59 
 
 		 130 aa  52  0.000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000599765  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0734  30S ribosomal protein S9  32.84 
 
 		 130 aa  51.6  0.000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000000144699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4949  30S ribosomal protein S9  31.39 
 
 		 171 aa  52  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.143487  normal  0.446856 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1470  30S ribosomal protein S9  32.12 
 
 		 171 aa  51.6  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.828818 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1063  30S ribosomal protein S9  34.07 
 
 		 130 aa  51.6  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00000313432  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1908  ribosomal protein S9  32.39 
 
 		 129 aa  51.6  0.000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2354  30S ribosomal protein S9  34.06 
 
 		 129 aa  51.2  0.000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0958602  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2650  30S ribosomal protein S9  33.33 
 
 		 161 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.550147  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>