More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_73324 on replicon NC_009046
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009046  PICST_73324  40S ribosomal protein S16  100 
 
 
142 aa  288  2e-77  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.954213  normal  0.0669518 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_09468  40S ribosomal protein S16 (Broad)  76.6 
 
 
143 aa  229  1e-59  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.97674  normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31856  Ribosomal protein S16, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  72.46 
 
 
139 aa  216  1e-55  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.442922  normal  0.257335 
 
 
-
 
NC_006684  CNB02750  PRCDNA95, putative  71.01 
 
 
140 aa  209  1e-53  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0301747  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17519  predicted protein  68.57 
 
 
143 aa  206  8e-53  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1822  30S ribosomal protein S9P  48.18 
 
 
132 aa  128  2.0000000000000002e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2548  ribosomal protein S9P  45.26 
 
 
132 aa  126  8.000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0426  ribosomal protein S9P  45.99 
 
 
132 aa  126  1.0000000000000001e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2390  30S ribosomal protein S9P  46.48 
 
 
134 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000000011092  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2518  30S ribosomal protein S9P  45.59 
 
 
132 aa  123  1e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.535604  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1426  30S ribosomal protein S9P  44.53 
 
 
134 aa  121  3e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0327998 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0481  30S ribosomal protein S9P  45.26 
 
 
132 aa  120  4e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2595  30S ribosomal protein S9P  44.85 
 
 
132 aa  119  9.999999999999999e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.22552  normal  0.0960002 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1476  ribosomal protein S9P  51.13 
 
 
132 aa  119  9.999999999999999e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.699246  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1571  30S ribosomal protein S9P  44.36 
 
 
154 aa  115  1.9999999999999998e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.867321  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1241  30S ribosomal protein S9P  43.8 
 
 
132 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00137168  normal  0.592005 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2382  30S ribosomal protein S9P  42.34 
 
 
133 aa  115  3e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.0000163984  normal  0.637702 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1806  30S ribosomal protein S9P  43.07 
 
 
133 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0570  30S ribosomal protein S9P  45.32 
 
 
134 aa  114  5e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.270013 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1348  30S ribosomal protein S9P  45.32 
 
 
134 aa  114  5e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.374439  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0636  30S ribosomal protein S9P  46.04 
 
 
134 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0277  30S ribosomal protein S9P  43.07 
 
 
132 aa  113  1.0000000000000001e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0268  30S ribosomal protein S9P  44.6 
 
 
134 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0694  30S ribosomal protein S9P  45.39 
 
 
146 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.459392  normal  0.10195 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2100  30S ribosomal protein S9P  44.68 
 
 
142 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1972  30S ribosomal protein S9P  43.97 
 
 
146 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.038178  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2219  30S ribosomal protein S9P  44.53 
 
 
133 aa  109  1.0000000000000001e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2896  30S ribosomal protein S9P  42.03 
 
 
132 aa  107  4.0000000000000004e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00665181  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2330  30S ribosomal protein S9P  43.26 
 
 
144 aa  107  6e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.00000018587  hitchhiker  0.0000157231 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1095  30S ribosomal protein S9P  43.17 
 
 
134 aa  103  8e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0425  30S ribosomal protein S9  37.59 
 
 
149 aa  99.4  2e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0289267 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1049  ribosomal protein S9P  37.23 
 
 
137 aa  80.9  0.000000000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0529864  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2142  30S ribosomal protein S9P  34.72 
 
 
137 aa  76.6  0.0000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000924754  hitchhiker  0.000062227 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2011  30S ribosomal protein S9  37.68 
 
 
129 aa  72.4  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00763906  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0722  30S ribosomal protein S9  37.59 
 
 
128 aa  71.2  0.000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3038  30S ribosomal protein S9  36.96 
 
 
128 aa  70.9  0.000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0109364  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0970  30S ribosomal protein S9  37.04 
 
 
130 aa  69.7  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.476085 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2608  30S ribosomal protein S9  38.52 
 
 
130 aa  70.1  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0410125  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0402  30S ribosomal protein S9  35.71 
 
 
129 aa  68.9  0.00000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.248058  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1063  30S ribosomal protein S9  36.36 
 
 
130 aa  69.3  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00000313432  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0725  30S ribosomal protein S9  37.04 
 
 
130 aa  68.2  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.616344  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1611  30S ribosomal protein S9  34.78 
 
 
128 aa  68.2  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0149645  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0423  30S ribosomal protein S9  35.71 
 
 
129 aa  67.8  0.00000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00762488  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0800  30S ribosomal protein S9  37.68 
 
 
135 aa  67.8  0.00000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.435176  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0734  30S ribosomal protein S9  36.81 
 
 
130 aa  67.4  0.00000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000000144699  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4742  ribosomal protein S9  35.97 
 
 
128 aa  67  0.00000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000000153745  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1527  ribosomal protein S9  35.82 
 
 
132 aa  66.6  0.0000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000273794  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0923  30S ribosomal protein S9  38.73 
 
 
130 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1546  ribosomal protein S9  39.58 
 
 
131 aa  66.2  0.0000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000425465  hitchhiker  0.00000000000000208113 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1589  ribosomal protein S9  36.57 
 
 
133 aa  65.9  0.0000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000582599  normal  0.735167 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1885  ribosomal protein S9  36.57 
 
 
133 aa  65.5  0.0000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000534939  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0006  ribosomal protein S9  34.25 
 
 
133 aa  65.9  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.819912  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1811  30S ribosomal protein S9  33.57 
 
 
131 aa  65.9  0.0000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.170614  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0902  30S ribosomal protein S9  39.44 
 
 
130 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0650  SSU ribosomal protein S9P  37.31 
 
 
130 aa  64.7  0.0000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  1.4124e-16  normal  0.0939463 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0469  30S ribosomal protein S9  38.81 
 
 
130 aa  64.7  0.0000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000193557  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1235  ribosomal protein S9  38.06 
 
 
131 aa  63.5  0.0000000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.026641  normal  0.24615 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0853  30S ribosomal protein S9  37.04 
 
 
124 aa  63.2  0.000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000119355  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4693  30S ribosomal protein S9  39.16 
 
 
130 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00380118  normal  0.0220476 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3496  30S ribosomal protein S9  34.75 
 
 
128 aa  62.8  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000030471  normal  0.91876 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1668  ribosomal protein S9  37.06 
 
 
130 aa  63.2  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.0000154129  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1379  30S ribosomal protein S9  34.07 
 
 
159 aa  63.2  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0851685 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4533  30S ribosomal protein S9  39.16 
 
 
130 aa  62  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.848049  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1316  30S ribosomal protein S9  39.16 
 
 
130 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.428523  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1652  30S ribosomal protein S9  37.04 
 
 
129 aa  62.4  0.000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.386728  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4408  30S ribosomal protein S9  39.16 
 
 
130 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.40853 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1826  30S ribosomal protein S9  37.04 
 
 
129 aa  62.4  0.000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.0000606063  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1394  ribosomal protein S9  34.06 
 
 
129 aa  62.4  0.000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000135637  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1472  30S ribosomal protein S9  37.04 
 
 
129 aa  62.4  0.000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000347675  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0342  30S ribosomal protein S9  33.58 
 
 
136 aa  62  0.000000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00140539  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0048  30S ribosomal protein S9  35.56 
 
 
130 aa  62.4  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0608  30S ribosomal protein S9  38.24 
 
 
130 aa  62  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000451686  normal  0.262066 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3353  30S ribosomal protein S9  38.24 
 
 
130 aa  62  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000000507288  hitchhiker  0.0000404008 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13050  30S ribosomal protein S9  39.86 
 
 
130 aa  62  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2471  ribosomal protein S9  36.36 
 
 
130 aa  61.6  0.000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0151898  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4425  ribosomal protein S9  38.46 
 
 
130 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.146621  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4119  30S ribosomal protein S9  38.46 
 
 
130 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1384  30S ribosomal protein S9  35.56 
 
 
161 aa  60.8  0.000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.839793 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0600  30S ribosomal protein S9  37.31 
 
 
130 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000648007  normal  0.790405 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2843  30S ribosomal protein S9  33.58 
 
 
161 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3453  30S ribosomal protein S9  33.57 
 
 
130 aa  60.8  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1649  30S ribosomal protein S9  35.71 
 
 
129 aa  60.8  0.000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0560  30S ribosomal protein S9  33.58 
 
 
130 aa  60.8  0.000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000599765  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3517  30S ribosomal protein S9  33.57 
 
 
130 aa  60.8  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.143376  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3371  30S ribosomal protein S9  33.57 
 
 
130 aa  60.8  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0767368  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2620  30S ribosomal protein S9  33.58 
 
 
161 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.159482 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0385  30S ribosomal protein S9  36.3 
 
 
129 aa  60.8  0.000000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.704674  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2241  SSU ribosomal protein S9P  35.66 
 
 
130 aa  60.8  0.000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.201316  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0574  30S ribosomal protein S9  37.31 
 
 
130 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00443027  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0433  30S ribosomal protein S9  34.06 
 
 
132 aa  60.8  0.000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0713606  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1233  30S ribosomal protein S9  35.82 
 
 
130 aa  60.5  0.000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000147442  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0411  30S ribosomal protein S9  38.06 
 
 
130 aa  60.8  0.000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000014619  normal  0.0708981 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3156  30S ribosomal protein S9  36.5 
 
 
130 aa  60.5  0.000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00359372 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3163  30S ribosomal protein S9  36.11 
 
 
130 aa  60.5  0.000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.247444  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4611  30S ribosomal protein S9  34.33 
 
 
162 aa  60.5  0.000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0520803 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4442  ribosomal protein S9  35.07 
 
 
130 aa  60.1  0.000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0912  30S ribosomal protein S9  36.3 
 
 
129 aa  60.1  0.000000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2875  30S ribosomal protein S9  37.76 
 
 
130 aa  59.7  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0195834  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1234  30S ribosomal protein S9  36.57 
 
 
130 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000000854245  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0647  30S ribosomal protein S9  36.57 
 
 
130 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00285977  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>