More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0481 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008553  Mthe_0481  30S ribosomal protein S9P  100 
 
 
132 aa  267  4e-71  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2390  30S ribosomal protein S9P  64.12 
 
 
134 aa  181  3e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000000011092  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1426  30S ribosomal protein S9P  61.65 
 
 
134 aa  174  3e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0327998 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2548  ribosomal protein S9P  61.83 
 
 
132 aa  174  3e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1241  30S ribosomal protein S9P  62.12 
 
 
132 aa  173  7e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00137168  normal  0.592005 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1806  30S ribosomal protein S9P  61.83 
 
 
133 aa  169  1e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2595  30S ribosomal protein S9P  61.07 
 
 
132 aa  169  2e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.22552  normal  0.0960002 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2518  30S ribosomal protein S9P  61.07 
 
 
132 aa  167  3e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.535604  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2219  30S ribosomal protein S9P  62.6 
 
 
133 aa  167  5e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0426  ribosomal protein S9P  59.54 
 
 
132 aa  167  7e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1822  30S ribosomal protein S9P  58.78 
 
 
132 aa  162  1.0000000000000001e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2382  30S ribosomal protein S9P  61.36 
 
 
133 aa  162  1.0000000000000001e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.0000163984  normal  0.637702 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2896  30S ribosomal protein S9P  56.06 
 
 
132 aa  157  5e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00665181  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1348  30S ribosomal protein S9P  58.21 
 
 
134 aa  156  9e-38  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.374439  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0570  30S ribosomal protein S9P  58.21 
 
 
134 aa  156  9e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.270013 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0268  30S ribosomal protein S9P  58.21 
 
 
134 aa  155  1e-37  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1095  30S ribosomal protein S9P  55.22 
 
 
134 aa  153  9e-37  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0636  30S ribosomal protein S9P  56.72 
 
 
134 aa  150  7e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1476  ribosomal protein S9P  57.58 
 
 
132 aa  149  2e-35  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.699246  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0277  30S ribosomal protein S9P  50 
 
 
132 aa  136  7e-32  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0694  30S ribosomal protein S9P  52.67 
 
 
146 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.459392  normal  0.10195 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1972  30S ribosomal protein S9P  51.91 
 
 
146 aa  128  3e-29  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.038178  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_09468  40S ribosomal protein S16 (Broad)  47.45 
 
 
143 aa  126  9.000000000000001e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.97674  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2100  30S ribosomal protein S9P  50.38 
 
 
142 aa  124  3e-28  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2330  30S ribosomal protein S9P  50.38 
 
 
144 aa  124  6e-28  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.00000018587  hitchhiker  0.0000157231 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_73324  40S ribosomal protein S16  45.26 
 
 
142 aa  120  4e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.954213  normal  0.0669518 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17519  predicted protein  45.26 
 
 
143 aa  119  9.999999999999999e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB02750  PRCDNA95, putative  46.43 
 
 
140 aa  115  9.999999999999999e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0301747  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1571  30S ribosomal protein S9P  46.21 
 
 
154 aa  114  3e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.867321  normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31856  Ribosomal protein S16, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  43.8 
 
 
139 aa  112  1.0000000000000001e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.442922  normal  0.257335 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2142  30S ribosomal protein S9P  46.21 
 
 
137 aa  103  1e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000924754  hitchhiker  0.000062227 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0425  30S ribosomal protein S9  39.42 
 
 
149 aa  101  3e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0289267 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1049  ribosomal protein S9P  45.45 
 
 
137 aa  98.6  2e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0529864  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0111  ribosomal protein S9  40.91 
 
 
128 aa  84  7e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000221009  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0970  30S ribosomal protein S9  38.76 
 
 
130 aa  80.5  0.000000000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.476085 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0734  30S ribosomal protein S9  36.72 
 
 
130 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000000144699  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0051  30S ribosomal protein S9  35.82 
 
 
128 aa  79  0.00000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1235  ribosomal protein S9  38.28 
 
 
131 aa  78.6  0.00000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.026641  normal  0.24615 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0725  30S ribosomal protein S9  39.37 
 
 
130 aa  78.2  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.616344  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1611  30S ribosomal protein S9  39.26 
 
 
128 aa  77.4  0.00000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0149645  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1527  ribosomal protein S9  39.84 
 
 
132 aa  76.3  0.0000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000273794  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2011  30S ribosomal protein S9  36.84 
 
 
129 aa  76.6  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00763906  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2608  30S ribosomal protein S9  35.94 
 
 
130 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0410125  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0722  30S ribosomal protein S9  38.69 
 
 
128 aa  75.5  0.0000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1811  30S ribosomal protein S9  36.92 
 
 
131 aa  75.9  0.0000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.170614  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0402  30S ribosomal protein S9  35.07 
 
 
129 aa  75.1  0.0000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.248058  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3496  30S ribosomal protein S9  32.84 
 
 
128 aa  75.1  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000030471  normal  0.91876 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0423  30S ribosomal protein S9  35.11 
 
 
129 aa  75.1  0.0000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00762488  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1063  30S ribosomal protein S9  39.37 
 
 
130 aa  72.8  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00000313432  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0945  ribosomal protein S9  36.64 
 
 
130 aa  71.6  0.000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000533623  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04080  30S ribosomal protein S9  33.83 
 
 
128 aa  71.6  0.000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3038  30S ribosomal protein S9  33.58 
 
 
128 aa  70.9  0.000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0109364  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0650  SSU ribosomal protein S9P  36.22 
 
 
130 aa  70.5  0.000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  1.4124e-16  normal  0.0939463 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0145  30S ribosomal protein S9  36.72 
 
 
130 aa  70.1  0.000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000670079  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1589  ribosomal protein S9  35.43 
 
 
133 aa  69.3  0.00000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000582599  normal  0.735167 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0923  30S ribosomal protein S9  37.21 
 
 
130 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2014  30S ribosomal protein S9  35.88 
 
 
131 aa  69.7  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.27603  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1885  ribosomal protein S9  35.43 
 
 
133 aa  69.7  0.00000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000534939  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13050  30S ribosomal protein S9  36.43 
 
 
130 aa  69.7  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0056  SSU ribosomal protein S9P  36.22 
 
 
130 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0128063  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0138  30S ribosomal protein S9  36.51 
 
 
130 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000590069  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0006  ribosomal protein S9  33.86 
 
 
133 aa  68.6  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.819912  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0144  30S ribosomal protein S9  35.71 
 
 
130 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133435  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1379  30S ribosomal protein S9  35.88 
 
 
159 aa  68.6  0.00000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0851685 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0144  30S ribosomal protein S9  35.71 
 
 
130 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000533856  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0662  30S ribosomal protein S9  33.33 
 
 
132 aa  68.6  0.00000000003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.219101  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2938  ribosomal protein S9  35.88 
 
 
162 aa  68.6  0.00000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000844995 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1537  30S ribosomal protein S9  34.07 
 
 
128 aa  68.2  0.00000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000000611504  normal  0.14818 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0144  30S ribosomal protein S9  35.71 
 
 
130 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000361179  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0139  30S ribosomal protein S9  35.71 
 
 
130 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.11946e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0137  30S ribosomal protein S9  35.71 
 
 
130 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000359543  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2761  30S ribosomal protein S9  34.04 
 
 
143 aa  67.8  0.00000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2634  30S ribosomal protein S9  34.04 
 
 
143 aa  67.8  0.00000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0157  30S ribosomal protein S9  35.71 
 
 
130 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.4920599999999996e-31 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5160  30S ribosomal protein S9  35.71 
 
 
130 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000743375  hitchhiker  0.0000000912351 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0562  SSU ribosomal protein S9P  34.65 
 
 
131 aa  68.2  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000000134066  normal  0.199008 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0176  30S ribosomal protein S9  35.71 
 
 
130 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000140848  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0166  30S ribosomal protein S9  35.71 
 
 
130 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00347352  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4693  30S ribosomal protein S9  35.43 
 
 
130 aa  67.4  0.00000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00380118  normal  0.0220476 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1316  30S ribosomal protein S9  36.43 
 
 
130 aa  67.4  0.00000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.428523  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3190  30S ribosomal protein S9  36.43 
 
 
130 aa  67  0.00000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000452354  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4408  30S ribosomal protein S9  36.43 
 
 
130 aa  67.4  0.00000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.40853 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4425  ribosomal protein S9  35.66 
 
 
130 aa  67  0.00000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.146621  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4119  30S ribosomal protein S9  35.66 
 
 
130 aa  67  0.00000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4533  30S ribosomal protein S9  36.43 
 
 
130 aa  67  0.00000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.848049  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1394  ribosomal protein S9  36.09 
 
 
129 aa  67  0.00000000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000135637  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3156  30S ribosomal protein S9  37.69 
 
 
130 aa  66.6  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00359372 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl492  30S ribosomal protein S9  34.85 
 
 
131 aa  66.6  0.0000000001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.263137  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1899  30S ribosomal protein S9  34.62 
 
 
130 aa  66.6  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  3.1303899999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0560  30S ribosomal protein S9  34.65 
 
 
130 aa  66.2  0.0000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000599765  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0722  ribosomal protein S9  34.11 
 
 
130 aa  66.6  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4112  30S ribosomal protein S9  31.25 
 
 
130 aa  66.2  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0048  30S ribosomal protein S9  34.11 
 
 
130 aa  66.6  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4611  30S ribosomal protein S9  36.64 
 
 
162 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0520803 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0139  30S ribosomal protein S9  34.92 
 
 
130 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000424807  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0853  30S ribosomal protein S9  34.11 
 
 
124 aa  65.9  0.0000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000119355  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0469  30S ribosomal protein S9  35.43 
 
 
130 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000193557  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1031  30S ribosomal protein S9  34.09 
 
 
132 aa  65.5  0.0000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.791116  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0247  SSU ribosomal protein S9P  34.62 
 
 
130 aa  65.9  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00762963  normal 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0676  30S ribosomal protein S9  35.94 
 
 
133 aa  66.2  0.0000000002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.958847  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>