More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0425 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_0425  30S ribosomal protein S9  100 
 
 
149 aa  303  7e-82  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0289267 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0426  ribosomal protein S9P  44.93 
 
 
132 aa  113  7.999999999999999e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2100  30S ribosomal protein S9P  42.86 
 
 
142 aa  113  8.999999999999998e-25  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2548  ribosomal protein S9P  43.48 
 
 
132 aa  111  4.0000000000000004e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0694  30S ribosomal protein S9P  42.18 
 
 
146 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.459392  normal  0.10195 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1972  30S ribosomal protein S9P  42.18 
 
 
146 aa  110  7.000000000000001e-24  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.038178  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2330  30S ribosomal protein S9P  41.5 
 
 
144 aa  108  3e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.00000018587  hitchhiker  0.0000157231 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1426  30S ribosomal protein S9P  43.07 
 
 
134 aa  107  6e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0327998 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1822  30S ribosomal protein S9P  43.48 
 
 
132 aa  106  1e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1476  ribosomal protein S9P  41.38 
 
 
132 aa  106  1e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.699246  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2595  30S ribosomal protein S9P  42.03 
 
 
132 aa  104  4e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.22552  normal  0.0960002 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2518  30S ribosomal protein S9P  42.75 
 
 
132 aa  104  4e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.535604  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2390  30S ribosomal protein S9P  41.91 
 
 
134 aa  103  6e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000000011092  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1571  30S ribosomal protein S9P  43.48 
 
 
154 aa  102  2e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.867321  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0481  30S ribosomal protein S9P  39.42 
 
 
132 aa  101  3e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0277  30S ribosomal protein S9P  40 
 
 
132 aa  101  4e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_73324  40S ribosomal protein S16  37.59 
 
 
142 aa  99.4  2e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.954213  normal  0.0669518 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17519  predicted protein  35.46 
 
 
143 aa  97.4  6e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB02750  PRCDNA95, putative  35.46 
 
 
140 aa  94  7e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0301747  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1806  30S ribosomal protein S9P  40.15 
 
 
133 aa  93.6  7e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_09468  40S ribosomal protein S16 (Broad)  34.9 
 
 
143 aa  93.2  1e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.97674  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2219  30S ribosomal protein S9P  40.88 
 
 
133 aa  92.8  1e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1241  30S ribosomal protein S9P  40.15 
 
 
132 aa  92.4  2e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00137168  normal  0.592005 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31856  Ribosomal protein S16, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  35.46 
 
 
139 aa  92.4  2e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.442922  normal  0.257335 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2382  30S ribosomal protein S9P  38.69 
 
 
133 aa  90.1  8e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.0000163984  normal  0.637702 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1049  ribosomal protein S9P  42.47 
 
 
137 aa  89  2e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0529864  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2896  30S ribosomal protein S9P  37.23 
 
 
132 aa  86.7  1e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00665181  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1095  30S ribosomal protein S9P  33.81 
 
 
134 aa  80.9  0.000000000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2761  30S ribosomal protein S9  38.19 
 
 
143 aa  79.7  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2634  30S ribosomal protein S9  38.19 
 
 
143 aa  79.7  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0006  ribosomal protein S9  38.41 
 
 
133 aa  79  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.819912  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2142  30S ribosomal protein S9P  35.51 
 
 
137 aa  77.8  0.00000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000924754  hitchhiker  0.000062227 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0636  30S ribosomal protein S9P  33.09 
 
 
134 aa  77.8  0.00000000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0560  30S ribosomal protein S9  40.58 
 
 
130 aa  77.4  0.00000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000599765  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03090  30S ribosomal protein S9  38.89 
 
 
130 aa  76.3  0.0000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000557445  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0476  ribosomal protein S9  38.89 
 
 
130 aa  76.3  0.0000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000601039  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03041  hypothetical protein  38.89 
 
 
130 aa  76.3  0.0000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000287646  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3713  30S ribosomal protein S9  38.89 
 
 
130 aa  76.3  0.0000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000596943  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3546  30S ribosomal protein S9  38.89 
 
 
130 aa  76.3  0.0000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000104404  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4547  30S ribosomal protein S9  38.89 
 
 
130 aa  76.3  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000371086  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3525  30S ribosomal protein S9  38.89 
 
 
130 aa  76.3  0.0000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000016286  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3419  30S ribosomal protein S9  38.89 
 
 
130 aa  76.3  0.0000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000112038  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0476  30S ribosomal protein S9  38.89 
 
 
130 aa  76.3  0.0000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000111446  normal  0.163216 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3607  30S ribosomal protein S9  38.89 
 
 
130 aa  75.5  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000867127  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3642  30S ribosomal protein S9  38.89 
 
 
130 aa  75.5  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000331692  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0570  30S ribosomal protein S9P  30.94 
 
 
134 aa  75.5  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.270013 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3704  30S ribosomal protein S9  38.89 
 
 
130 aa  75.5  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00817033  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1348  30S ribosomal protein S9P  30.94 
 
 
134 aa  75.5  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.374439  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3665  30S ribosomal protein S9  38.89 
 
 
130 aa  76.3  0.0000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0023412  normal  0.0755267 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3535  30S ribosomal protein S9  38.89 
 
 
130 aa  75.5  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000799314  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3536  30S ribosomal protein S9  38.89 
 
 
130 aa  75.5  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.0000037617  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0268  30S ribosomal protein S9P  30.94 
 
 
134 aa  75.1  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2011  30S ribosomal protein S9  40.58 
 
 
129 aa  74.7  0.0000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00763906  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0293  ribosomal protein S9  38.19 
 
 
130 aa  73.9  0.0000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.000515876  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3796  ribosomal protein S9  38.19 
 
 
130 aa  73.6  0.0000000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000182281  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1133  30S ribosomal protein S9  38.89 
 
 
130 aa  73.2  0.000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000113025  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0525  30S ribosomal protein S9  38.89 
 
 
130 aa  73.2  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000883336  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl492  30S ribosomal protein S9  40.58 
 
 
131 aa  72.8  0.000000000001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.263137  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0734  30S ribosomal protein S9  38.36 
 
 
130 aa  72.8  0.000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000000144699  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3638  ribosomal protein S9  38.19 
 
 
130 aa  73.2  0.000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00994207  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0461  30S ribosomal protein S9  38.89 
 
 
130 aa  73.2  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000140237  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1235  ribosomal protein S9  35.76 
 
 
131 aa  72.4  0.000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.026641  normal  0.24615 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4348  30S ribosomal protein S9  38.19 
 
 
130 aa  72.4  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000012665  hitchhiker  0.00291766 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0753  30S ribosomal protein S9  38.41 
 
 
130 aa  72  0.000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000116915  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0423  30S ribosomal protein S9  39.13 
 
 
129 aa  72.4  0.000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00762488  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0300  30S ribosomal protein S9  38.19 
 
 
130 aa  72  0.000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00212654  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0454  30S ribosomal protein S9  39.86 
 
 
130 aa  70.9  0.000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0255963  normal  0.796217 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0662  30S ribosomal protein S9  39.86 
 
 
132 aa  70.9  0.000000000005  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.219101  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3702  ribosomal protein S9  36.11 
 
 
130 aa  70.9  0.000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000244977  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0032  ribosomal protein S9  37.93 
 
 
132 aa  70.9  0.000000000006  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0703  30S ribosomal protein S9  36.81 
 
 
130 aa  70.5  0.000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000775692  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3939  30S ribosomal protein S9  36.81 
 
 
130 aa  70.5  0.000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0733  30S ribosomal protein S9  36.81 
 
 
130 aa  70.5  0.000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000589004  hitchhiker  0.00344758 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3651  30S ribosomal protein S9  36.81 
 
 
130 aa  70.5  0.000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000456747  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3268  30S ribosomal protein S9  36.81 
 
 
130 aa  70.5  0.000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000222713  hitchhiker  0.0000090404 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0679  30S ribosomal protein S9  36.81 
 
 
130 aa  70.5  0.000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000564509  hitchhiker  0.00025421 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0745  30S ribosomal protein S9  36.81 
 
 
130 aa  70.5  0.000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000051972  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0693  30S ribosomal protein S9  36.81 
 
 
130 aa  70.5  0.000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000579549  decreased coverage  0.00000193008 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0724  30S ribosomal protein S9  36.81 
 
 
130 aa  70.5  0.000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00489418  hitchhiker  0.0000321207 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13050  30S ribosomal protein S9  39.86 
 
 
130 aa  70.1  0.000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4221  30S ribosomal protein S9  36.81 
 
 
130 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000135609  hitchhiker  0.000316349 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0748  30S ribosomal protein S9  36.81 
 
 
130 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000172866  normal  0.041404 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3070  30S ribosomal protein S9  37.5 
 
 
130 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000352838  normal  0.198807 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1589  ribosomal protein S9  37.68 
 
 
133 aa  68.9  0.00000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000582599  normal  0.735167 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0144  30S ribosomal protein S9  40.28 
 
 
130 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133435  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1811  30S ribosomal protein S9  35.51 
 
 
131 aa  68.9  0.00000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.170614  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0144  30S ribosomal protein S9  40.28 
 
 
130 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000533856  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3293  30S ribosomal protein S9  36.81 
 
 
130 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000148641  hitchhiker  0.00108393 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2399  ribosomal protein S9  36.11 
 
 
130 aa  69.3  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.696602  normal  0.066769 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3594  30S ribosomal protein S9  36.81 
 
 
130 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000165532  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0166  30S ribosomal protein S9  40.28 
 
 
130 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00347352  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0144  30S ribosomal protein S9  40.28 
 
 
130 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000361179  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4442  ribosomal protein S9  35.42 
 
 
130 aa  68.2  0.00000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0139  30S ribosomal protein S9  40.28 
 
 
130 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.11946e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0137  30S ribosomal protein S9  40.28 
 
 
130 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000359543  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5160  30S ribosomal protein S9  40.28 
 
 
130 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000743375  hitchhiker  0.0000000912351 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0402  30S ribosomal protein S9  39.13 
 
 
129 aa  68.6  0.00000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.248058  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0145  30S ribosomal protein S9  38.19 
 
 
130 aa  68.6  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000670079  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0176  30S ribosomal protein S9  40.28 
 
 
130 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000140848  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0157  30S ribosomal protein S9  40.28 
 
 
130 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.4920599999999996e-31 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>