More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_1972 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010525  Tneu_1972  30S ribosomal protein S9P  100 
 
 		 146 aa  291  1e-78  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.038178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0694  30S ribosomal protein S9P  89.04 
 
 		 146 aa  268  2.9999999999999997e-71  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.459392  normal  0.10195 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2330  30S ribosomal protein S9P  86.3 
 
 		 144 aa  258  1e-68  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.00000018587  hitchhiker  0.0000157231 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2100  30S ribosomal protein S9P  85.11 
 
 		 142 aa  252  9e-67  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1571  30S ribosomal protein S9P  71.97 
 
 		 154 aa  194  4.0000000000000005e-49  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.867321  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1476  ribosomal protein S9P  52.67 
 
 		 132 aa  135  2e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.699246  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0277  30S ribosomal protein S9P  53.44 
 
 		 132 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1822  30S ribosomal protein S9P  54.2 
 
 		 132 aa  129  2.0000000000000002e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2548  ribosomal protein S9P  53.44 
 
 		 132 aa  128  2.0000000000000002e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0481  30S ribosomal protein S9P  51.91 
 
 		 132 aa  128  3e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1806  30S ribosomal protein S9P  48.09 
 
 		 133 aa  127  6e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0426  ribosomal protein S9P  53.44 
 
 		 132 aa  125  2.0000000000000002e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2518  30S ribosomal protein S9P  52.67 
 
 		 132 aa  124  3e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.535604  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1241  30S ribosomal protein S9P  46.56 
 
 		 132 aa  124  5e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00137168  normal  0.592005 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2896  30S ribosomal protein S9P  48.85 
 
 		 132 aa  122  1e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00665181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2390  30S ribosomal protein S9P  47.33 
 
 		 134 aa  122  1e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000000011092  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2382  30S ribosomal protein S9P  47.33 
 
 		 133 aa  120  6e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.0000163984  normal  0.637702 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2595  30S ribosomal protein S9P  50.38 
 
 		 132 aa  119  9.999999999999999e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.22552  normal  0.0960002 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1095  30S ribosomal protein S9P  47.37 
 
 		 134 aa  118  1.9999999999999998e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0570  30S ribosomal protein S9P  45.86 
 
 		 134 aa  118  3e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.270013 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1348  30S ribosomal protein S9P  45.86 
 
 		 134 aa  118  3e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.374439  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0268  30S ribosomal protein S9P  45.86 
 
 		 134 aa  118  3e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2219  30S ribosomal protein S9P  44.27 
 
 		 133 aa  117  3.9999999999999996e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1426  30S ribosomal protein S9P  46.21 
 
 		 134 aa  117  7e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0327998 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0636  30S ribosomal protein S9P  44.36 
 
 		 134 aa  116  7.999999999999999e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0425  30S ribosomal protein S9  42.18 
 
 		 149 aa  110  7.000000000000001e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0289267 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2142  30S ribosomal protein S9P  47.45 
 
 		 137 aa  110  9e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000924754  hitchhiker  0.000062227 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_73324  40S ribosomal protein S16  43.97 
 
 		 142 aa  109  1.0000000000000001e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.954213  normal  0.0669518 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1049  ribosomal protein S9P  49.64 
 
 		 137 aa  108  2.0000000000000002e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0529864  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_09468  40S ribosomal protein S16 (Broad)  45.26 
 
 		 143 aa  106  1e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.97674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31856  Ribosomal protein S16, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  45.26 
 
 		 139 aa  103  8e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.442922  normal  0.257335 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17519  predicted protein  44.53 
 
 		 143 aa  100  6e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB02750  PRCDNA95, putative  43.8 
 
 		 140 aa  99.8  1e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0301747  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0560  30S ribosomal protein S9  40.62 
 
 		 130 aa  80.9  0.000000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000599765  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1811  30S ribosomal protein S9  41.54 
 
 		 131 aa  79.7  0.00000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.170614  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1233  30S ribosomal protein S9  41.3 
 
 		 130 aa  79  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000147442  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0725  30S ribosomal protein S9  38.06 
 
 		 130 aa  77.8  0.00000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.616344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2014  30S ribosomal protein S9  41.98 
 
 		 131 aa  77.8  0.00000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.27603  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0402  30S ribosomal protein S9  41.22 
 
 		 129 aa  77.4  0.00000000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.248058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0006  ribosomal protein S9  40.31 
 
 		 133 aa  77  0.00000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.819912  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0423  30S ribosomal protein S9  41.98 
 
 		 129 aa  77  0.00000000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00762488  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2011  30S ribosomal protein S9  42.75 
 
 		 129 aa  76.6  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00763906  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0093  30S ribosomal protein S9  38.17 
 
 		 129 aa  74.3  0.0000000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1394  ribosomal protein S9  35.88 
 
 		 129 aa  73.9  0.0000000000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000135637  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1341  30S ribosomal protein S9  40.65 
 
 		 134 aa  73.6  0.0000000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000324124  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1872  30S ribosomal protein S9  39.35 
 
 		 159 aa  73.6  0.0000000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.952658 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1345  30S ribosomal protein S9  40.65 
 
 		 134 aa  73.9  0.0000000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00368639  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3496  30S ribosomal protein S9  37.59 
 
 		 128 aa  73.2  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000030471  normal  0.91876 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1063  30S ribosomal protein S9  39.84 
 
 		 130 aa  72.8  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00000313432  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2938  ribosomal protein S9  42.19 
 
 		 162 aa  72.4  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000844995 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0923  30S ribosomal protein S9  37.5 
 
 		 130 aa  71.6  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1589  ribosomal protein S9  36.72 
 
 		 133 aa  71.6  0.000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000582599  normal  0.735167 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13050  30S ribosomal protein S9  36.72 
 
 		 130 aa  72  0.000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0433  30S ribosomal protein S9  36.51 
 
 		 132 aa  71.2  0.000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0713606  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0902  30S ribosomal protein S9  39.06 
 
 		 130 aa  71.6  0.000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000079624  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3038  30S ribosomal protein S9  37.4 
 
 		 128 aa  70.9  0.000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0109364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1885  ribosomal protein S9  36.72 
 
 		 133 aa  70.9  0.000000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000534939  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0454  30S ribosomal protein S9  37.5 
 
 		 130 aa  70.5  0.000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0255963  normal  0.796217 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1379  30S ribosomal protein S9  41.41 
 
 		 159 aa  70.5  0.000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0851685 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0469  30S ribosomal protein S9  39.06 
 
 		 130 aa  70.1  0.000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000193557  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1782  30S ribosomal protein S9  39.17 
 
 		 130 aa  70.1  0.000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000024243  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2069  30S ribosomal protein S9  39.84 
 
 		 130 aa  69.7  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000831765  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20520  SSU ribosomal protein S9P  38.28 
 
 		 171 aa  69.3  0.00000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.476775  normal  0.598664 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0662  30S ribosomal protein S9  35.38 
 
 		 132 aa  70.1  0.00000000001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.219101  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0970  30S ribosomal protein S9  36.72 
 
 		 130 aa  70.1  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.476085 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2241  SSU ribosomal protein S9P  38.28 
 
 		 130 aa  69.7  0.00000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.201316  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0402  30S ribosomal protein S9  34.88 
 
 		 133 aa  69.3  0.00000000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  hitchhiker  0.00835733  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2761  30S ribosomal protein S9  33.82 
 
 		 143 aa  68.9  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2634  30S ribosomal protein S9  33.82 
 
 		 143 aa  68.9  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0734  30S ribosomal protein S9  38.28 
 
 		 130 aa  69.3  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000000144699  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4677  ribosomal protein S9  35.94 
 
 		 130 aa  68.6  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.278967  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4693  30S ribosomal protein S9  35.94 
 
 		 130 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00380118  normal  0.0220476 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3665  30S ribosomal protein S9  36.15 
 
 		 130 aa  68.6  0.00000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0023412  normal  0.0755267 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0800  30S ribosomal protein S9  34.31 
 
 		 135 aa  68.2  0.00000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.435176  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0411  30S ribosomal protein S9  39.06 
 
 		 130 aa  68.6  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000014619  normal  0.0708981 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0562  SSU ribosomal protein S9P  36.72 
 
 		 131 aa  68.2  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000000134066  normal  0.199008 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2678  30S ribosomal protein S9  37.4 
 
 		 130 aa  68.6  0.00000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000125135  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2363  30S ribosomal protein S9  37.4 
 
 		 130 aa  68.6  0.00000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000350135  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0902  30S ribosomal protein S9  36.72 
 
 		 130 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3627  30S ribosomal protein S9  36 
 
 		 130 aa  68.2  0.00000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000023775  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03090  30S ribosomal protein S9  36.15 
 
 		 130 aa  68.2  0.00000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000557445  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0476  ribosomal protein S9  36.15 
 
 		 130 aa  68.2  0.00000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000601039  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3525  30S ribosomal protein S9  36.15 
 
 		 130 aa  68.2  0.00000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000016286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3713  30S ribosomal protein S9  36.15 
 
 		 130 aa  68.2  0.00000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000596943  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3419  30S ribosomal protein S9  36.15 
 
 		 130 aa  68.2  0.00000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000112038  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4533  30S ribosomal protein S9  35.94 
 
 		 130 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.848049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3546  30S ribosomal protein S9  36.15 
 
 		 130 aa  68.2  0.00000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000104404  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03041  hypothetical protein  36.15 
 
 		 130 aa  68.2  0.00000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000287646  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0476  30S ribosomal protein S9  36.15 
 
 		 130 aa  68.2  0.00000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000111446  normal  0.163216 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4547  30S ribosomal protein S9  36.15 
 
 		 130 aa  68.2  0.00000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000371086  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2878  ribosomal protein S9  40.46 
 
 		 180 aa  68.2  0.00000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1316  30S ribosomal protein S9  35.94 
 
 		 130 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.428523  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4425  ribosomal protein S9  35.94 
 
 		 130 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.146621  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0430  ribosomal protein S9  38.17 
 
 		 130 aa  67.8  0.00000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.912667  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl492  30S ribosomal protein S9  35.16 
 
 		 131 aa  67.8  0.00000000005  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.263137  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4119  30S ribosomal protein S9  35.94 
 
 		 130 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0342  30S ribosomal protein S9  32.06 
 
 		 136 aa  67.8  0.00000000005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00140539  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4408  30S ribosomal protein S9  35.94 
 
 		 130 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.40853 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3704  30S ribosomal protein S9  36.15 
 
 		 130 aa  67.4  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00817033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3371  30S ribosomal protein S9  37.31 
 
 		 130 aa  67  0.00000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0767368  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>