More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_2390 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007955  Mbur_2390  30S ribosomal protein S9P  100 
 
 		 134 aa  271  2.0000000000000002e-72  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000000011092  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1426  30S ribosomal protein S9P  71.97 
 
 		 134 aa  196  7e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0327998 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0426  ribosomal protein S9P  66.41 
 
 		 132 aa  184  3e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2548  ribosomal protein S9P  65.65 
 
 		 132 aa  184  5e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0481  30S ribosomal protein S9P  64.12 
 
 		 132 aa  181  3e-45  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2518  30S ribosomal protein S9P  65.65 
 
 		 132 aa  181  4.0000000000000006e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.535604  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1806  30S ribosomal protein S9P  64.12 
 
 		 133 aa  180  6e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2595  30S ribosomal protein S9P  61.83 
 
 		 132 aa  175  2e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.22552  normal  0.0960002 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1822  30S ribosomal protein S9P  61.83 
 
 		 132 aa  168  2e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2219  30S ribosomal protein S9P  60.31 
 
 		 133 aa  167  3e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1241  30S ribosomal protein S9P  57.25 
 
 		 132 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00137168  normal  0.592005 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2382  30S ribosomal protein S9P  58.33 
 
 		 133 aa  159  1e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.0000163984  normal  0.637702 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2896  30S ribosomal protein S9P  57.25 
 
 		 132 aa  159  2e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00665181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0570  30S ribosomal protein S9P  53.38 
 
 		 134 aa  149  2e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.270013 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1348  30S ribosomal protein S9P  53.38 
 
 		 134 aa  149  2e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.374439  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0268  30S ribosomal protein S9P  53.38 
 
 		 134 aa  148  2e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1095  30S ribosomal protein S9P  54.14 
 
 		 134 aa  147  6e-35  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0636  30S ribosomal protein S9P  50.38 
 
 		 134 aa  142  1e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1476  ribosomal protein S9P  51.91 
 
 		 132 aa  137  4.999999999999999e-32  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.699246  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0277  30S ribosomal protein S9P  51.15 
 
 		 132 aa  131  3e-30  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0694  30S ribosomal protein S9P  48.85 
 
 		 146 aa  127  6e-29  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.459392  normal  0.10195 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_73324  40S ribosomal protein S16  46.48 
 
 		 142 aa  124  4.0000000000000003e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.954213  normal  0.0669518 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2330  30S ribosomal protein S9P  47.37 
 
 		 144 aa  124  5e-28  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.00000018587  hitchhiker  0.0000157231 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1571  30S ribosomal protein S9P  47.73 
 
 		 154 aa  122  1e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.867321  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1972  30S ribosomal protein S9P  47.33 
 
 		 146 aa  122  2e-27  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.038178  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17519  predicted protein  44.53 
 
 		 143 aa  119  1.9999999999999998e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2100  30S ribosomal protein S9P  45.8 
 
 		 142 aa  116  7.999999999999999e-26  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_09468  40S ribosomal protein S16 (Broad)  44.53 
 
 		 143 aa  115  9.999999999999999e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.97674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31856  Ribosomal protein S16, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  43.8 
 
 		 139 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.442922  normal  0.257335 
 
 
-
 
NC_006684  CNB02750  PRCDNA95, putative  45.26 
 
 		 140 aa  113  1.0000000000000001e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0301747  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0425  30S ribosomal protein S9  41.91 
 
 		 149 aa  103  6e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0289267 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1049  ribosomal protein S9P  42.42 
 
 		 137 aa  89.4  1e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0529864  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2142  30S ribosomal protein S9P  38.35 
 
 		 137 aa  87.4  5e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000924754  hitchhiker  0.000062227 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2608  30S ribosomal protein S9  40.94 
 
 		 130 aa  85.1  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0410125  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0970  30S ribosomal protein S9  39.26 
 
 		 130 aa  84  6e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.476085 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0734  30S ribosomal protein S9  37.78 
 
 		 130 aa  83.6  8e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000000144699  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0111  ribosomal protein S9  40 
 
 		 128 aa  81.6  0.000000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000221009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0402  30S ribosomal protein S9  40.15 
 
 		 129 aa  81.3  0.000000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.248058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1611  30S ribosomal protein S9  38.93 
 
 		 128 aa  81.3  0.000000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0149645  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0423  30S ribosomal protein S9  39.39 
 
 		 129 aa  80.9  0.000000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00762488  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1811  30S ribosomal protein S9  39.71 
 
 		 131 aa  79.7  0.00000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.170614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0725  30S ribosomal protein S9  39.37 
 
 		 130 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.616344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1235  ribosomal protein S9  38.35 
 
 		 131 aa  79.7  0.00000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.026641  normal  0.24615 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2011  30S ribosomal protein S9  39.39 
 
 		 129 aa  79.7  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00763906  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3453  30S ribosomal protein S9  37.96 
 
 		 130 aa  79  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3371  30S ribosomal protein S9  37.96 
 
 		 130 aa  79  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0767368  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3517  30S ribosomal protein S9  37.96 
 
 		 130 aa  79  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.143376  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3070  30S ribosomal protein S9  40.74 
 
 		 130 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000352838  normal  0.198807 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04080  30S ribosomal protein S9  38.64 
 
 		 128 aa  78.6  0.00000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0006  ribosomal protein S9  38.93 
 
 		 133 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.819912  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0051  30S ribosomal protein S9  35.88 
 
 		 128 aa  77.8  0.00000000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4742  ribosomal protein S9  39.23 
 
 		 128 aa  77.8  0.00000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000000153745  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1379  30S ribosomal protein S9  39.23 
 
 		 159 aa  77.8  0.00000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0851685 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2014  30S ribosomal protein S9  38.97 
 
 		 131 aa  77.4  0.00000000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.27603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3436  30S ribosomal protein S9  35.77 
 
 		 131 aa  76.6  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.113849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1527  ribosomal protein S9  39.06 
 
 		 132 aa  75.5  0.0000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000273794  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04450  SSU ribosomal protein S9P  39.53 
 
 		 162 aa  75.5  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.271227 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0247  SSU ribosomal protein S9P  36.03 
 
 		 130 aa  75.9  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00762963  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1316  30S ribosomal protein S9  40.16 
 
 		 130 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.428523  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3496  30S ribosomal protein S9  36.36 
 
 		 128 aa  75.1  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000030471  normal  0.91876 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1063  30S ribosomal protein S9  38.52 
 
 		 130 aa  75.5  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00000313432  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4408  30S ribosomal protein S9  40.16 
 
 		 130 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.40853 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4533  30S ribosomal protein S9  40.16 
 
 		 130 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.848049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0923  30S ribosomal protein S9  39.37 
 
 		 130 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0945  ribosomal protein S9  36.57 
 
 		 130 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000533623  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0048  30S ribosomal protein S9  35.29 
 
 		 130 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0650  SSU ribosomal protein S9P  36.3 
 
 		 130 aa  74.3  0.0000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  1.4124e-16  normal  0.0939463 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3293  30S ribosomal protein S9  40.94 
 
 		 130 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000148641  hitchhiker  0.00108393 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2679  ribosomal protein S9  40 
 
 		 130 aa  73.9  0.0000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0151101  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0753  30S ribosomal protein S9  38.58 
 
 		 130 aa  73.9  0.0000000000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000116915  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1177  ribosomal protein S9  37.21 
 
 		 174 aa  73.6  0.0000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.904807  normal  0.699948 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1899  30S ribosomal protein S9  37.78 
 
 		 130 aa  73.6  0.0000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  3.1303899999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0676  30S ribosomal protein S9  39.84 
 
 		 133 aa  73.6  0.0000000000009  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.958847  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1649  30S ribosomal protein S9  40.15 
 
 		 129 aa  73.6  0.000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0722  30S ribosomal protein S9  37.59 
 
 		 128 aa  73.2  0.000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13050  30S ribosomal protein S9  38.76 
 
 		 130 aa  72.4  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3594  30S ribosomal protein S9  40 
 
 		 130 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000165532  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1566  30S ribosomal protein S9  37.98 
 
 		 128 aa  71.6  0.000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000968491  normal  0.322438 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0797  30S ribosomal protein S9  40.16 
 
 		 128 aa  71.2  0.000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000494469  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0913  ribosomal protein S9  38.58 
 
 		 129 aa  70.9  0.000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000269489  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4425  ribosomal protein S9  38.58 
 
 		 130 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.146621  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4119  30S ribosomal protein S9  38.58 
 
 		 130 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4693  30S ribosomal protein S9  38.58 
 
 		 130 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00380118  normal  0.0220476 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0748  30S ribosomal protein S9  39.26 
 
 		 130 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000172866  normal  0.041404 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4221  30S ribosomal protein S9  39.26 
 
 		 130 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000135609  hitchhiker  0.000316349 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3627  30S ribosomal protein S9  39.26 
 
 		 130 aa  70.9  0.000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000023775  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3085  30S ribosomal protein S9  37.04 
 
 		 130 aa  70.9  0.000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000996861  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3348  ribosomal protein S9  38.58 
 
 		 129 aa  70.5  0.000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0614997 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3939  30S ribosomal protein S9  37.78 
 
 		 130 aa  70.5  0.000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0733  30S ribosomal protein S9  37.78 
 
 		 130 aa  70.5  0.000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000589004  hitchhiker  0.00344758 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0745  30S ribosomal protein S9  37.78 
 
 		 130 aa  70.5  0.000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000051972  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3268  30S ribosomal protein S9  37.78 
 
 		 130 aa  70.5  0.000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000222713  hitchhiker  0.0000090404 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0679  30S ribosomal protein S9  37.78 
 
 		 130 aa  70.5  0.000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000564509  hitchhiker  0.00025421 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0724  30S ribosomal protein S9  37.78 
 
 		 130 aa  70.5  0.000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00489418  hitchhiker  0.0000321207 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3651  30S ribosomal protein S9  37.78 
 
 		 130 aa  70.5  0.000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000456747  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0693  30S ribosomal protein S9  37.78 
 
 		 130 aa  70.5  0.000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000579549  decreased coverage  0.00000193008 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0703  30S ribosomal protein S9  37.78 
 
 		 130 aa  70.5  0.000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000775692  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2120  SSU ribosomal protein S9P  33.09 
 
 		 130 aa  70.1  0.000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.39803  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3702  ribosomal protein S9  35.56 
 
 		 130 aa  70.1  0.000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000244977  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2663  30S ribosomal protein S9  38.24 
 
 		 130 aa  69.7  0.00000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00134428  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>