More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2896 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_2896  30S ribosomal protein S9P  100 
 
 		 132 aa  269  9e-72  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00665181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2219  30S ribosomal protein S9P  71.76 
 
 		 133 aa  203  5e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1806  30S ribosomal protein S9P  70.99 
 
 		 133 aa  202  2e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1241  30S ribosomal protein S9P  71.97 
 
 		 132 aa  199  9.999999999999999e-51  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00137168  normal  0.592005 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2382  30S ribosomal protein S9P  71.21 
 
 		 133 aa  199  9.999999999999999e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.0000163984  normal  0.637702 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2390  30S ribosomal protein S9P  57.25 
 
 		 134 aa  159  2e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000000011092  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0481  30S ribosomal protein S9P  56.06 
 
 		 132 aa  157  5e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1476  ribosomal protein S9P  55.3 
 
 		 132 aa  150  5e-36  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.699246  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1426  30S ribosomal protein S9P  55.97 
 
 		 134 aa  147  3e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0327998 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2595  30S ribosomal protein S9P  56.49 
 
 		 132 aa  144  4.0000000000000006e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.22552  normal  0.0960002 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2548  ribosomal protein S9P  54.96 
 
 		 132 aa  140  4e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0426  ribosomal protein S9P  53.44 
 
 		 132 aa  138  1.9999999999999998e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2518  30S ribosomal protein S9P  53.44 
 
 		 132 aa  138  1.9999999999999998e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.535604  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1822  30S ribosomal protein S9P  52.67 
 
 		 132 aa  132  1.9999999999999998e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0277  30S ribosomal protein S9P  48.48 
 
 		 132 aa  126  9.000000000000001e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1972  30S ribosomal protein S9P  48.85 
 
 		 146 aa  122  1e-27  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.038178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0694  30S ribosomal protein S9P  47.33 
 
 		 146 aa  122  2e-27  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.459392  normal  0.10195 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1095  30S ribosomal protein S9P  45.52 
 
 		 134 aa  120  5e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1571  30S ribosomal protein S9P  44.7 
 
 		 154 aa  120  7e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.867321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2330  30S ribosomal protein S9P  46.56 
 
 		 144 aa  120  9e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.00000018587  hitchhiker  0.0000157231 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2100  30S ribosomal protein S9P  47.33 
 
 		 142 aa  117  3.9999999999999996e-26  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0570  30S ribosomal protein S9P  44.03 
 
 		 134 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.270013 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0268  30S ribosomal protein S9P  44.03 
 
 		 134 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1348  30S ribosomal protein S9P  44.03 
 
 		 134 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.374439  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0636  30S ribosomal protein S9P  41.79 
 
 		 134 aa  110  5e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_73324  40S ribosomal protein S16  42.03 
 
 		 142 aa  107  4.0000000000000004e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.954213  normal  0.0669518 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31856  Ribosomal protein S16, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  41.61 
 
 		 139 aa  99.8  1e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.442922  normal  0.257335 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_09468  40S ribosomal protein S16 (Broad)  39.86 
 
 		 143 aa  97.1  8e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.97674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2142  30S ribosomal protein S9P  44.7 
 
 		 137 aa  92.8  1e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000924754  hitchhiker  0.000062227 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17519  predicted protein  37.68 
 
 		 143 aa  91.7  3e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB02750  PRCDNA95, putative  37.86 
 
 		 140 aa  89.4  1e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0301747  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0425  30S ribosomal protein S9  37.23 
 
 		 149 aa  86.7  1e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0289267 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1049  ribosomal protein S9P  42.86 
 
 		 137 aa  84  6e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0529864  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3496  30S ribosomal protein S9  38.81 
 
 		 128 aa  79.7  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000030471  normal  0.91876 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0722  30S ribosomal protein S9  39.1 
 
 		 128 aa  79  0.00000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0945  ribosomal protein S9  40.94 
 
 		 130 aa  78.6  0.00000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000533623  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0111  ribosomal protein S9  39.39 
 
 		 128 aa  77.8  0.00000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000221009  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4742  ribosomal protein S9  38.64 
 
 		 128 aa  77.4  0.00000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000000153745  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3038  30S ribosomal protein S9  37.5 
 
 		 128 aa  76.6  0.00000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0109364  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0048  30S ribosomal protein S9  38.58 
 
 		 130 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2014  30S ribosomal protein S9  42.31 
 
 		 131 aa  76.3  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.27603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0725  30S ribosomal protein S9  40.62 
 
 		 130 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.616344  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1316  30S ribosomal protein S9  40.16 
 
 		 130 aa  75.5  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.428523  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1394  ribosomal protein S9  39.69 
 
 		 129 aa  75.5  0.0000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000135637  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0430  ribosomal protein S9  39.69 
 
 		 130 aa  75.1  0.0000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.912667  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4408  30S ribosomal protein S9  40.16 
 
 		 130 aa  75.5  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.40853 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04080  30S ribosomal protein S9  40.3 
 
 		 128 aa  75.1  0.0000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4533  30S ribosomal protein S9  40.16 
 
 		 130 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.848049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0562  SSU ribosomal protein S9P  37.01 
 
 		 131 aa  73.9  0.0000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000000134066  normal  0.199008 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0051  30S ribosomal protein S9  37.78 
 
 		 128 aa  73.9  0.0000000000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13050  30S ribosomal protein S9  38.58 
 
 		 130 aa  73.6  0.0000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4425  ribosomal protein S9  38.58 
 
 		 130 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.146621  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4119  30S ribosomal protein S9  38.58 
 
 		 130 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4693  30S ribosomal protein S9  38.58 
 
 		 130 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00380118  normal  0.0220476 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0902  30S ribosomal protein S9  38.46 
 
 		 130 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0560  30S ribosomal protein S9  37.8 
 
 		 130 aa  73.2  0.000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000599765  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0923  30S ribosomal protein S9  39.37 
 
 		 130 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1811  30S ribosomal protein S9  38.46 
 
 		 131 aa  72  0.000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.170614  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2761  30S ribosomal protein S9  36.17 
 
 		 143 aa  72.8  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2634  30S ribosomal protein S9  36.17 
 
 		 143 aa  72.8  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1899  30S ribosomal protein S9  36.22 
 
 		 130 aa  72.8  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  3.1303899999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2011  30S ribosomal protein S9  38.17 
 
 		 129 aa  72  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00763906  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0734  30S ribosomal protein S9  37.21 
 
 		 130 aa  71.6  0.000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000000144699  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2043  ribosomal protein S9  38.58 
 
 		 130 aa  72  0.000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000585971  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0423  30S ribosomal protein S9  38.93 
 
 		 129 aa  71.2  0.000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00762488  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1379  30S ribosomal protein S9  39.37 
 
 		 159 aa  70.9  0.000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0851685 
 
 
-
 
NC_002620  TC0402  30S ribosomal protein S9  37.8 
 
 		 133 aa  69.7  0.00000000001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  hitchhiker  0.00835733  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03090  30S ribosomal protein S9  36.22 
 
 		 130 aa  68.6  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000557445  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0476  ribosomal protein S9  36.22 
 
 		 130 aa  68.6  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000601039  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03041  hypothetical protein  36.22 
 
 		 130 aa  68.6  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000287646  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3546  30S ribosomal protein S9  36.22 
 
 		 130 aa  68.6  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000104404  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4547  30S ribosomal protein S9  36.22 
 
 		 130 aa  68.6  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000371086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3419  30S ribosomal protein S9  36.22 
 
 		 130 aa  68.6  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000112038  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0402  30S ribosomal protein S9  37.4 
 
 		 129 aa  68.9  0.00000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.248058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3665  30S ribosomal protein S9  36.22 
 
 		 130 aa  68.6  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0023412  normal  0.0755267 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3713  30S ribosomal protein S9  36.22 
 
 		 130 aa  68.6  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000596943  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3525  30S ribosomal protein S9  36.22 
 
 		 130 aa  68.6  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000016286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0476  30S ribosomal protein S9  36.22 
 
 		 130 aa  68.6  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000111446  normal  0.163216 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3517  30S ribosomal protein S9  39.53 
 
 		 130 aa  68.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.143376  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3371  30S ribosomal protein S9  39.53 
 
 		 130 aa  68.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0767368  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0006  ribosomal protein S9  38.1 
 
 		 133 aa  68.6  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.819912  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3453  30S ribosomal protein S9  39.53 
 
 		 130 aa  68.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3642  30S ribosomal protein S9  36.22 
 
 		 130 aa  68.2  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000331692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3607  30S ribosomal protein S9  36.22 
 
 		 130 aa  68.2  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000867127  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3704  30S ribosomal protein S9  36.22 
 
 		 130 aa  68.2  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00817033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3190  30S ribosomal protein S9  35.43 
 
 		 130 aa  68.2  0.00000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000452354  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0293  ribosomal protein S9  36.22 
 
 		 130 aa  68.2  0.00000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.000515876  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3536  30S ribosomal protein S9  36.22 
 
 		 130 aa  68.2  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.0000037617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1611  30S ribosomal protein S9  37.59 
 
 		 128 aa  67.8  0.00000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0149645  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3535  30S ribosomal protein S9  36.22 
 
 		 130 aa  68.2  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000799314  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0970  30S ribosomal protein S9  35.43 
 
 		 130 aa  67.8  0.00000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.476085 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1235  ribosomal protein S9  36.43 
 
 		 131 aa  67.8  0.00000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.026641  normal  0.24615 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1872  30S ribosomal protein S9  37.8 
 
 		 159 aa  67.8  0.00000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.952658 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1179  30S ribosomal protein S9  35.43 
 
 		 161 aa  67.4  0.00000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.554063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1566  30S ribosomal protein S9  38.76 
 
 		 128 aa  67  0.00000000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000968491  normal  0.322438 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2608  30S ribosomal protein S9  37.01 
 
 		 130 aa  67  0.00000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0410125  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0662  30S ribosomal protein S9  34.35 
 
 		 132 aa  67  0.00000000008  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.219101  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2399  ribosomal protein S9  37.01 
 
 		 130 aa  67  0.00000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.696602  normal  0.066769 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1748  30S ribosomal protein S9  38.76 
 
 		 128 aa  67  0.00000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00000973218  normal  0.252579 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2241  SSU ribosomal protein S9P  37.69 
 
 		 130 aa  67  0.00000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.201316  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>