More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0277 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_0277  30S ribosomal protein S9P  100 
 
 
132 aa  256  7e-68  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1476  ribosomal protein S9P  52.27 
 
 
132 aa  141  3e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.699246  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1241  30S ribosomal protein S9P  51.52 
 
 
132 aa  140  4e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00137168  normal  0.592005 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2382  30S ribosomal protein S9P  51.52 
 
 
133 aa  140  5e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.0000163984  normal  0.637702 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0481  30S ribosomal protein S9P  50 
 
 
132 aa  136  7e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1806  30S ribosomal protein S9P  52.67 
 
 
133 aa  134  3.0000000000000003e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0570  30S ribosomal protein S9P  48.51 
 
 
134 aa  133  7.000000000000001e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.270013 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0694  30S ribosomal protein S9P  53.44 
 
 
146 aa  133  7.000000000000001e-31  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.459392  normal  0.10195 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1348  30S ribosomal protein S9P  48.51 
 
 
134 aa  133  7.000000000000001e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.374439  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0268  30S ribosomal protein S9P  48.51 
 
 
134 aa  133  9.999999999999999e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2219  30S ribosomal protein S9P  49.62 
 
 
133 aa  132  9.999999999999999e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1972  30S ribosomal protein S9P  53.44 
 
 
146 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.038178  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2390  30S ribosomal protein S9P  51.15 
 
 
134 aa  131  1.9999999999999998e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000000011092  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2330  30S ribosomal protein S9P  53.44 
 
 
144 aa  131  3e-30  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.00000018587  hitchhiker  0.0000157231 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2548  ribosomal protein S9P  52.34 
 
 
132 aa  131  3e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2100  30S ribosomal protein S9P  53.44 
 
 
142 aa  131  3e-30  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0636  30S ribosomal protein S9P  46.27 
 
 
134 aa  130  5e-30  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2518  30S ribosomal protein S9P  51.56 
 
 
132 aa  130  5e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.535604  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1095  30S ribosomal protein S9P  47.76 
 
 
134 aa  130  6e-30  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1822  30S ribosomal protein S9P  53.91 
 
 
132 aa  129  9e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0426  ribosomal protein S9P  51.56 
 
 
132 aa  129  2.0000000000000002e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1571  30S ribosomal protein S9P  52.27 
 
 
154 aa  127  4.0000000000000003e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.867321  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2896  30S ribosomal protein S9P  48.48 
 
 
132 aa  126  9.000000000000001e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00665181  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1426  30S ribosomal protein S9P  45.86 
 
 
134 aa  123  8.000000000000001e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0327998 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2595  30S ribosomal protein S9P  48.44 
 
 
132 aa  123  9e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.22552  normal  0.0960002 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1049  ribosomal protein S9P  56.06 
 
 
137 aa  121  3e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0529864  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2142  30S ribosomal protein S9P  52.27 
 
 
137 aa  117  3.9999999999999996e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000924754  hitchhiker  0.000062227 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17519  predicted protein  43.57 
 
 
143 aa  114  3.9999999999999997e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_73324  40S ribosomal protein S16  43.07 
 
 
142 aa  113  1.0000000000000001e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.954213  normal  0.0669518 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_09468  40S ribosomal protein S16 (Broad)  44.6 
 
 
143 aa  108  2.0000000000000002e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.97674  normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31856  Ribosomal protein S16, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  45.99 
 
 
139 aa  109  2.0000000000000002e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.442922  normal  0.257335 
 
 
-
 
NC_006684  CNB02750  PRCDNA95, putative  45 
 
 
140 aa  106  9.000000000000001e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0301747  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0425  30S ribosomal protein S9  40 
 
 
149 aa  101  4e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0289267 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0797  30S ribosomal protein S9  44.36 
 
 
128 aa  80.1  0.00000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000494469  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1940  30S ribosomal protein S9  36.57 
 
 
139 aa  73.9  0.0000000000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000532731  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0253  30S ribosomal protein S9  36.57 
 
 
139 aa  73.9  0.0000000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000656502  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13050  30S ribosomal protein S9  39.06 
 
 
130 aa  73.9  0.0000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3070  30S ribosomal protein S9  40.62 
 
 
130 aa  73.6  0.0000000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000352838  normal  0.198807 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0923  30S ribosomal protein S9  41.54 
 
 
130 aa  72.8  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1316  30S ribosomal protein S9  40.77 
 
 
130 aa  71.6  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.428523  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0423  30S ribosomal protein S9  40.3 
 
 
129 aa  71.6  0.000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00762488  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0006  ribosomal protein S9  41.09 
 
 
133 aa  71.6  0.000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.819912  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4408  30S ribosomal protein S9  40.77 
 
 
130 aa  71.6  0.000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.40853 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03090  30S ribosomal protein S9  38.46 
 
 
130 aa  70.9  0.000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000557445  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0476  ribosomal protein S9  38.46 
 
 
130 aa  70.9  0.000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000601039  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3546  30S ribosomal protein S9  38.46 
 
 
130 aa  70.9  0.000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000104404  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03041  hypothetical protein  38.46 
 
 
130 aa  70.9  0.000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000287646  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3525  30S ribosomal protein S9  38.46 
 
 
130 aa  70.9  0.000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000016286  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0476  30S ribosomal protein S9  38.46 
 
 
130 aa  70.9  0.000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000111446  normal  0.163216 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4547  30S ribosomal protein S9  38.46 
 
 
130 aa  70.9  0.000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000371086  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3713  30S ribosomal protein S9  38.46 
 
 
130 aa  70.9  0.000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000596943  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3293  30S ribosomal protein S9  41.41 
 
 
130 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000148641  hitchhiker  0.00108393 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3419  30S ribosomal protein S9  38.46 
 
 
130 aa  70.9  0.000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000112038  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0734  30S ribosomal protein S9  39.1 
 
 
130 aa  70.9  0.000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000000144699  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0402  30S ribosomal protein S9  40.3 
 
 
129 aa  70.9  0.000000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.248058  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4533  30S ribosomal protein S9  40 
 
 
130 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.848049  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0433  30S ribosomal protein S9  35.82 
 
 
132 aa  70.9  0.000000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0713606  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1031  30S ribosomal protein S9  39.55 
 
 
132 aa  70.5  0.000000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.791116  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1566  30S ribosomal protein S9  39.1 
 
 
128 aa  70.5  0.000000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000968491  normal  0.322438 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1882  ribosomal protein S9  40 
 
 
264 aa  70.5  0.000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.178814  normal  0.068579 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3536  30S ribosomal protein S9  38.46 
 
 
130 aa  70.5  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.0000037617  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3642  30S ribosomal protein S9  38.46 
 
 
130 aa  70.5  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000331692  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3704  30S ribosomal protein S9  38.46 
 
 
130 aa  70.5  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00817033  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3607  30S ribosomal protein S9  38.46 
 
 
130 aa  70.5  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000867127  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3665  30S ribosomal protein S9  38.46 
 
 
130 aa  70.5  0.000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0023412  normal  0.0755267 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3535  30S ribosomal protein S9  38.46 
 
 
130 aa  70.5  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000799314  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2011  30S ribosomal protein S9  40.44 
 
 
129 aa  70.5  0.000000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00763906  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0293  ribosomal protein S9  38.46 
 
 
130 aa  69.7  0.00000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.000515876  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3702  ribosomal protein S9  44.71 
 
 
130 aa  69.7  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000244977  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0525  30S ribosomal protein S9  37.69 
 
 
130 aa  68.9  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000883336  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1811  30S ribosomal protein S9  42.19 
 
 
131 aa  68.6  0.00000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.170614  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1748  30S ribosomal protein S9  38.35 
 
 
128 aa  69.3  0.00000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00000973218  normal  0.252579 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1133  30S ribosomal protein S9  37.69 
 
 
130 aa  68.9  0.00000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000113025  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0461  30S ribosomal protein S9  37.69 
 
 
130 aa  68.9  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000140237  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0902  30S ribosomal protein S9  38.28 
 
 
130 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4693  30S ribosomal protein S9  38.28 
 
 
130 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00380118  normal  0.0220476 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0560  30S ribosomal protein S9  36.72 
 
 
130 aa  68.6  0.00000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000599765  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2014  30S ribosomal protein S9  42.31 
 
 
131 aa  68.6  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.27603  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4425  ribosomal protein S9  38.28 
 
 
130 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.146621  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4119  30S ribosomal protein S9  38.28 
 
 
130 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0342  30S ribosomal protein S9  34.59 
 
 
136 aa  67.8  0.00000000005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00140539  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3939  30S ribosomal protein S9  38.28 
 
 
130 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3796  ribosomal protein S9  37.69 
 
 
130 aa  67.4  0.00000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000182281  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0745  30S ribosomal protein S9  38.28 
 
 
130 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000051972  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3651  30S ribosomal protein S9  38.28 
 
 
130 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000456747  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0733  30S ribosomal protein S9  38.28 
 
 
130 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000589004  hitchhiker  0.00344758 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0724  30S ribosomal protein S9  38.28 
 
 
130 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00489418  hitchhiker  0.0000321207 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3268  30S ribosomal protein S9  38.28 
 
 
130 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000222713  hitchhiker  0.0000090404 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0679  30S ribosomal protein S9  38.28 
 
 
130 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000564509  hitchhiker  0.00025421 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0693  30S ribosomal protein S9  38.28 
 
 
130 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000579549  decreased coverage  0.00000193008 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0703  30S ribosomal protein S9  38.28 
 
 
130 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000775692  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04080  30S ribosomal protein S9  36.84 
 
 
128 aa  67.4  0.00000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3038  30S ribosomal protein S9  39.1 
 
 
128 aa  67.4  0.00000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0109364  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2608  30S ribosomal protein S9  39.06 
 
 
130 aa  67  0.00000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0410125  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0300  30S ribosomal protein S9  37.69 
 
 
130 aa  67  0.00000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00212654  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3594  30S ribosomal protein S9  39.84 
 
 
130 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000165532  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0970  30S ribosomal protein S9  40.31 
 
 
130 aa  66.6  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.476085 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1233  30S ribosomal protein S9  37.4 
 
 
130 aa  66.6  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000147442  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0902  30S ribosomal protein S9  36.72 
 
 
130 aa  66.2  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000079624  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1341  30S ribosomal protein S9  38.64 
 
 
134 aa  66.6  0.0000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000324124  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>