More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_2142 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_2142  30S ribosomal protein S9P  100 
 
 		 137 aa  280  4.0000000000000003e-75  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000924754  hitchhiker  0.000062227 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1049  ribosomal protein S9P  74.45 
 
 		 137 aa  201  2e-51  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0529864  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0277  30S ribosomal protein S9P  52.27 
 
 		 132 aa  134  5e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0694  30S ribosomal protein S9P  48.91 
 
 		 146 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.459392  normal  0.10195 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2330  30S ribosomal protein S9P  48.18 
 
 		 144 aa  127  4.0000000000000003e-29  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.00000018587  hitchhiker  0.0000157231 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1972  30S ribosomal protein S9P  47.45 
 
 		 146 aa  126  9.000000000000001e-29  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.038178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1571  30S ribosomal protein S9P  49.24 
 
 		 154 aa  126  1.0000000000000001e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.867321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2100  30S ribosomal protein S9P  46.72 
 
 		 142 aa  124  3e-28  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0481  30S ribosomal protein S9P  46.21 
 
 		 132 aa  122  2e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2382  30S ribosomal protein S9P  50.76 
 
 		 133 aa  121  3e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.0000163984  normal  0.637702 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2548  ribosomal protein S9P  42.75 
 
 		 132 aa  117  4.9999999999999996e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2595  30S ribosomal protein S9P  41.22 
 
 		 132 aa  116  9.999999999999999e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.22552  normal  0.0960002 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2219  30S ribosomal protein S9P  46.62 
 
 		 133 aa  115  1.9999999999999998e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0570  30S ribosomal protein S9P  46.27 
 
 		 134 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.270013 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1095  30S ribosomal protein S9P  45.52 
 
 		 134 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1348  30S ribosomal protein S9P  46.27 
 
 		 134 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.374439  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0268  30S ribosomal protein S9P  46.27 
 
 		 134 aa  114  5e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1241  30S ribosomal protein S9P  46.97 
 
 		 132 aa  114  6e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00137168  normal  0.592005 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1476  ribosomal protein S9P  43.94 
 
 		 132 aa  114  6e-25  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.699246  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1822  30S ribosomal protein S9P  41.98 
 
 		 132 aa  114  6e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0636  30S ribosomal protein S9P  44.78 
 
 		 134 aa  113  8.999999999999998e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2518  30S ribosomal protein S9P  41.22 
 
 		 132 aa  112  2.0000000000000002e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.535604  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2896  30S ribosomal protein S9P  44.7 
 
 		 132 aa  111  3e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00665181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0426  ribosomal protein S9P  38.93 
 
 		 132 aa  110  6e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1806  30S ribosomal protein S9P  42.11 
 
 		 133 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1426  30S ribosomal protein S9P  37.12 
 
 		 134 aa  107  7.000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0327998 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2390  30S ribosomal protein S9P  38.35 
 
 		 134 aa  103  7e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000000011092  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17519  predicted protein  39.39 
 
 		 143 aa  92.8  1e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0425  30S ribosomal protein S9  35.51 
 
 		 149 aa  92  2e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0289267 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31856  Ribosomal protein S16, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  39.26 
 
 		 139 aa  89.4  1e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.442922  normal  0.257335 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_73324  40S ribosomal protein S16  34.72 
 
 		 142 aa  89.4  2e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.954213  normal  0.0669518 
 
 
-
 
NC_006684  CNB02750  PRCDNA95, putative  37.04 
 
 		 140 aa  87  7e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0301747  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_09468  40S ribosomal protein S16 (Broad)  35.61 
 
 		 143 aa  83.6  8e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.97674  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3496  30S ribosomal protein S9  42.42 
 
 		 128 aa  79  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000030471  normal  0.91876 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0423  30S ribosomal protein S9  36.36 
 
 		 129 aa  76.6  0.0000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00762488  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0402  30S ribosomal protein S9  36.36 
 
 		 129 aa  75.9  0.0000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.248058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2011  30S ribosomal protein S9  36.36 
 
 		 129 aa  73.9  0.0000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00763906  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2014  30S ribosomal protein S9  38.89 
 
 		 131 aa  72  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.27603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0433  30S ribosomal protein S9  35.77 
 
 		 132 aa  72  0.000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0713606  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0006  ribosomal protein S9  38.46 
 
 		 133 aa  71.2  0.000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.819912  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1811  30S ribosomal protein S9  38.1 
 
 		 131 aa  70.1  0.00000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.170614  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0902  30S ribosomal protein S9  37.5 
 
 		 130 aa  68.6  0.00000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000079624  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2069  30S ribosomal protein S9  38.28 
 
 		 130 aa  67.8  0.00000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000831765  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0093  30S ribosomal protein S9  35.61 
 
 		 129 aa  67.4  0.00000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0321  30S ribosomal protein S9  37.01 
 
 		 130 aa  66.2  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000288169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4611  30S ribosomal protein S9  36.51 
 
 		 162 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0520803 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0212  ribosomal protein S9  37.01 
 
 		 131 aa  65.9  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000467508  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0725  30S ribosomal protein S9  35.94 
 
 		 130 aa  65.5  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.616344  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0149  30S ribosomal protein S9  35.94 
 
 		 162 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0734  30S ribosomal protein S9  37.3 
 
 		 130 aa  64.7  0.0000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000000144699  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2678  30S ribosomal protein S9  35.43 
 
 		 130 aa  64.7  0.0000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000125135  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2363  30S ribosomal protein S9  35.43 
 
 		 130 aa  64.7  0.0000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000350135  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1611  30S ribosomal protein S9  34.85 
 
 		 128 aa  64.3  0.0000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0149645  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0722  30S ribosomal protein S9  36.36 
 
 		 128 aa  63.9  0.0000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0560  30S ribosomal protein S9  34.65 
 
 		 130 aa  63.5  0.0000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000599765  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0402  30S ribosomal protein S9  33.85 
 
 		 133 aa  63.2  0.000000001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  hitchhiker  0.00835733  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1652  30S ribosomal protein S9  34.11 
 
 		 129 aa  63.5  0.000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.386728  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl492  30S ribosomal protein S9  35.38 
 
 		 131 aa  62.8  0.000000001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.263137  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4742  ribosomal protein S9  37.4 
 
 		 128 aa  63.5  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000000153745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1537  30S ribosomal protein S9  33.86 
 
 		 128 aa  63.2  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000000611504  normal  0.14818 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1472  30S ribosomal protein S9  34.11 
 
 		 129 aa  63.5  0.000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000347675  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3038  30S ribosomal protein S9  34.92 
 
 		 128 aa  63.2  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0109364  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0676  30S ribosomal protein S9  34.65 
 
 		 133 aa  63.2  0.000000001  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.958847  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0970  30S ribosomal protein S9  33.86 
 
 		 130 aa  62.8  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.476085 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1826  30S ribosomal protein S9  34.11 
 
 		 129 aa  63.5  0.000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.0000606063  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2761  30S ribosomal protein S9  36.03 
 
 		 143 aa  62.4  0.000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2634  30S ribosomal protein S9  36.03 
 
 		 143 aa  62.4  0.000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1341  30S ribosomal protein S9  35.38 
 
 		 134 aa  62.8  0.000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000324124  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2151  30S ribosomal protein S9  37.3 
 
 		 158 aa  62.8  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.45731  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1345  30S ribosomal protein S9  35.38 
 
 		 134 aa  62.4  0.000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00368639  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1015  ribosomal protein S9  35.97 
 
 		 138 aa  61.6  0.000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.230141  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2297  ribosomal protein S9  30.71 
 
 		 130 aa  62  0.000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000207473  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0491  30S ribosomal protein S9  34.65 
 
 		 130 aa  61.2  0.000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0372353  normal  0.193269 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1598  30S ribosomal protein S9  32.33 
 
 		 129 aa  60.8  0.000000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00000000158082  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0230  SSU ribosomal protein S9P  36.22 
 
 		 132 aa  60.8  0.000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000443747  normal  0.670048 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0385  30S ribosomal protein S9  33.33 
 
 		 129 aa  60.8  0.000000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.704674  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3353  30S ribosomal protein S9  35.43 
 
 		 130 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000000507288  hitchhiker  0.0000404008 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2679  ribosomal protein S9  34.65 
 
 		 130 aa  60.8  0.000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0151101  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0608  30S ribosomal protein S9  35.43 
 
 		 130 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000451686  normal  0.262066 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1233  30S ribosomal protein S9  34.65 
 
 		 130 aa  60.5  0.000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000147442  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1031  30S ribosomal protein S9  33.85 
 
 		 132 aa  60.5  0.000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.791116  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1782  30S ribosomal protein S9  33.59 
 
 		 130 aa  60.5  0.000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000024243  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04080  30S ribosomal protein S9  33.86 
 
 		 128 aa  60.1  0.00000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2454  30S ribosomal protein S9  34.88 
 
 		 158 aa  59.7  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.812734  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1589  ribosomal protein S9  34.92 
 
 		 133 aa  59.7  0.00000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000582599  normal  0.735167 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1379  30S ribosomal protein S9  33.59 
 
 		 159 aa  59.7  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0851685 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1527  ribosomal protein S9  33.86 
 
 		 132 aa  59.7  0.00000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000273794  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1476  30S ribosomal protein S9  35.94 
 
 		 166 aa  59.3  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.270542 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1235  ribosomal protein S9  35.16 
 
 		 131 aa  58.9  0.00000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.026641  normal  0.24615 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4591  30S ribosomal protein S9  34.88 
 
 		 160 aa  59.3  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0662  30S ribosomal protein S9  32.81 
 
 		 132 aa  58.9  0.00000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.219101  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3371  30S ribosomal protein S9  36.15 
 
 		 130 aa  59.3  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0767368  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2843  30S ribosomal protein S9  33.33 
 
 		 161 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2697  30S ribosomal protein S9  35.66 
 
 		 161 aa  58.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.145825  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0795  30S ribosomal protein S9  32.81 
 
 		 130 aa  58.9  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000718866  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3453  30S ribosomal protein S9  36.15 
 
 		 130 aa  59.3  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0247  SSU ribosomal protein S9P  30.16 
 
 		 130 aa  58.9  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00762963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2620  30S ribosomal protein S9  33.33 
 
 		 161 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.159482 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0430  ribosomal protein S9  34.85 
 
 		 130 aa  58.9  0.00000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.912667  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3517  30S ribosomal protein S9  36.15 
 
 		 130 aa  59.3  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.143376  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>