274 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_2239 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_2239  amino acid/peptide transporter  100 
 
 
603 aa  1202    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.478529  normal  0.0257492 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0374  amino acid/peptide transporter  42.26 
 
 
627 aa  424  1e-117  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3369  proton/peptide symporter family protein  43.36 
 
 
544 aa  403  1e-111  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.31641  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3303  amino acid/peptide transporter  39.93 
 
 
516 aa  394  1e-108  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4484  amino acid/peptide transporter  39.69 
 
 
516 aa  387  1e-106  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0470977  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1105  alkaline phosphatase  43.08 
 
 
544 aa  388  1e-106  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.377732 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0078  amino acid/peptide transporter  38.64 
 
 
603 aa  383  1e-105  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1551  amino acid/peptide transporter  39.69 
 
 
539 aa  366  1e-100  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1555  amino acid/peptide transporter  38.9 
 
 
539 aa  369  1e-100  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2795  amino acid/peptide transporter  37.06 
 
 
539 aa  344  2.9999999999999997e-93  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.274379  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1585  amino acid/peptide transporter  37.06 
 
 
539 aa  344  2.9999999999999997e-93  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0954  amino acid/peptide transporter  50.26 
 
 
527 aa  343  5.999999999999999e-93  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.935259  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0945  amino acid/peptide transporter  37.12 
 
 
534 aa  341  2e-92  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.985856  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0163  amino acid/peptide transporter  36.75 
 
 
707 aa  251  2e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4332  amino acid/peptide transporter  33.4 
 
 
497 aa  234  5e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0825  di-/tripeptide transporter  36.71 
 
 
451 aa  212  1e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1393  amino acid/peptide transporter  35.68 
 
 
501 aa  210  5e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.825614  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1649  amino acid/peptide transporter  37.13 
 
 
490 aa  209  1e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000051541  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01330  hypothetical protein  34.56 
 
 
462 aa  207  4e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2545  amino acid/peptide transporter  36.26 
 
 
501 aa  207  5e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1313  amino acid/peptide transporter  36.89 
 
 
489 aa  206  1e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000607679  normal  0.565693 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1380  amino acid/peptide transporter  36.89 
 
 
489 aa  206  1e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00016017  normal  0.180173 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3034  alkaline phosphatase  37.13 
 
 
491 aa  206  1e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.513893  hitchhiker  0.00921345 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0615  proton/peptide symporter family protein  33.93 
 
 
492 aa  205  2e-51  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1373  amino acid/peptide transporter  36.89 
 
 
489 aa  204  3e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000302128  hitchhiker  0.00000791426 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1572  di-/tripeptide transporter  33.68 
 
 
492 aa  204  4e-51  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.827276  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1468  amino acid/peptide transporter  36.24 
 
 
501 aa  204  4e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00129299  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3037  amino acid/peptide transporter  36.24 
 
 
501 aa  204  4e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000164206  normal  0.191533 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3647  peptide/proton symporter family protein  36.52 
 
 
479 aa  203  7e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2905  amino acid/peptide transporter  36.52 
 
 
500 aa  203  7e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000347826  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2895  amino acid/peptide transporter  36.24 
 
 
501 aa  203  8e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000544318  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2266  amino acid/peptide transporter  36.41 
 
 
490 aa  203  9e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000291592  hitchhiker  0.00874925 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3744  amino acid/peptide transporter  36.19 
 
 
499 aa  202  9.999999999999999e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.971567 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1420  amino acid/peptide transporter  31.69 
 
 
558 aa  202  9.999999999999999e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004134  di-/tripeptide transporter  35 
 
 
462 aa  201  1.9999999999999998e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2849  amino acid/peptide transporter  38.78 
 
 
498 aa  200  5e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1344  di-/tripeptide transporter  36.46 
 
 
507 aa  199  7.999999999999999e-50  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.938084  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6851  amino acid/peptide transporter  39.3 
 
 
498 aa  199  9e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0689877 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0604  amino acid/peptide transporter  35.89 
 
 
461 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000192962  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0834  amino acid/peptide transporter  35.37 
 
 
499 aa  198  2.0000000000000003e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000422142 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0531  amino acid/peptide transporter  33.84 
 
 
463 aa  197  5.000000000000001e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0236293  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0457  hypothetical protein  37.9 
 
 
446 aa  197  5.000000000000001e-49  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0463  hypothetical protein  37.9 
 
 
446 aa  197  5.000000000000001e-49  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0669  proton/peptide symporter family protein  33.83 
 
 
461 aa  197  6e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.3578e-43 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0744  proton/peptide symporter family protein  35.53 
 
 
461 aa  196  7e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000387987 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0655  proton/peptide symporter family protein  35.53 
 
 
461 aa  196  8.000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000039773  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0599  peptide symporter family protein  35.53 
 
 
461 aa  196  8.000000000000001e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000279304  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0600  peptide symporter family protein  35.53 
 
 
461 aa  196  8.000000000000001e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000822499  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0689  proton/peptide symporter family protein  35.53 
 
 
461 aa  196  8.000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000179263  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0721  proton/peptide symporter family protein  35.53 
 
 
461 aa  196  9e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000879332  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0757  proton/peptide symporter family protein  35.28 
 
 
461 aa  196  1e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000369558  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4615  proton/peptide symporter family protein  35.53 
 
 
461 aa  196  1e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000740471  normal  0.0901188 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0817  proton/peptide symporter family protein  35.53 
 
 
461 aa  196  1e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000167379  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1357  amino acid/peptide transporter  35.79 
 
 
489 aa  196  1e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000317071  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0623  amino acid/peptide transporter  32.58 
 
 
495 aa  194  5e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000100169  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0823  amino acid/peptide transporter  34.9 
 
 
517 aa  194  6e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1555  proton dependent peptide transporter  33.58 
 
 
512 aa  193  6e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1664  amino acid/peptide transporter  33.58 
 
 
512 aa  193  6e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.182008  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1397  amino acid/peptide transporter  38.05 
 
 
489 aa  193  8e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000128075  normal  0.33376 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1737  amino acid/peptide transporter  34.09 
 
 
497 aa  192  1e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.824621  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0955  amino acid/peptide transporter  30.41 
 
 
510 aa  192  1e-47  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.334898  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04219  di-tripeptide transporter  35.82 
 
 
502 aa  192  2e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.189754  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1845  amino acid/peptide transporter  36.36 
 
 
504 aa  191  2e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.241988 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03298  hypothetical protein  27.53 
 
 
489 aa  191  4e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.240113  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03345  predicted transporter  27.53 
 
 
489 aa  191  4e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.199197  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3978  inner membrane transporter YhiP  27.53 
 
 
489 aa  191  4e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0093  di-tripeptide ABC transporter  36.56 
 
 
497 aa  191  4e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.569603  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03062  putative proton-dependent peptide transporter  35.35 
 
 
483 aa  191  4e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.000506345  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3826  inner membrane transporter YhiP  27.53 
 
 
489 aa  190  5.999999999999999e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3244  amino acid/peptide transporter  36.34 
 
 
495 aa  190  7e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.950565  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0219  amino acid/peptide transporter  27.35 
 
 
489 aa  189  9e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3696  inner membrane transporter YhiP  27.35 
 
 
489 aa  189  9e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3596  amino acid/peptide transporter  34.18 
 
 
501 aa  189  9e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.161382  normal  0.0248648 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0220  inner membrane transporter YhiP  27.35 
 
 
489 aa  189  9e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0524  POT family peptide transport protein  35.45 
 
 
449 aa  189  1e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.2191900000000004e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0524  POT family peptide transport protein  35.45 
 
 
449 aa  189  1e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000299815  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1074  di-tripeptide ABC transporter membrane protein  36.78 
 
 
510 aa  189  1e-46  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4686  peptide transport protein, POT family  34.66 
 
 
449 aa  189  1e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000138038  hitchhiker  8.70422e-24 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4843  inner membrane transporter YhiP  27.35 
 
 
489 aa  189  2e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.953433 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2925  amino acid/peptide transporter  34.69 
 
 
528 aa  187  6e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.69108  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3785  inner membrane transporter YhiP  27.03 
 
 
489 aa  186  7e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0528  amino acid/peptide transporter  34.13 
 
 
449 aa  186  8e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000146171  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1881  amino acid/peptide transporter  32.54 
 
 
517 aa  186  8e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0879055  hitchhiker  0.00292537 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1421  amino acid/peptide transporter  28.39 
 
 
494 aa  186  1.0000000000000001e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3785  inner membrane transporter YhiP  26.41 
 
 
490 aa  185  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0323752  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0651  proton/peptide symporter family protein  33.42 
 
 
461 aa  183  6e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000984184  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2274  amino acid/peptide transporter  38.27 
 
 
520 aa  183  1e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000484906 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0834  amino acid/peptide transporter  38.18 
 
 
432 aa  183  1e-44  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.655453  normal  0.033682 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3905  inner membrane transporter YhiP  27.1 
 
 
490 aa  181  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3862  inner membrane transporter YhiP  27.1 
 
 
490 aa  181  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.31175  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3795  inner membrane transporter YhiP  27.1 
 
 
490 aa  181  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0682  proton/peptide symporter family protein  32.89 
 
 
461 aa  181  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00298567  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2335  amino acid/peptide transporter  35.18 
 
 
524 aa  180  7e-44  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0988959  normal  0.193339 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3966  inner membrane transporter YhiP  26.92 
 
 
490 aa  180  7e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.826151  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2868  amino acid/peptide transporter  33.59 
 
 
495 aa  177  5e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00750801  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2318  putative tripeptide transporter permease  28.47 
 
 
506 aa  177  6e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0922  amino acid/peptide transporter  38.35 
 
 
477 aa  175  1.9999999999999998e-42  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000322625  unclonable  8.27442e-19 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0134  amino acid/peptide transporter  32.99 
 
 
489 aa  174  2.9999999999999996e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2904  amino acid/peptide transporter  31.67 
 
 
497 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00155043 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2017  putative tripeptide transporter permease  29.69 
 
 
506 aa  174  5e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.617443  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>