260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0374 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_0374  amino acid/peptide transporter  100 
 
 		 627 aa  1249    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2239  amino acid/peptide transporter  42.26 
 
 		 603 aa  436  1e-121  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.478529  normal  0.0257492 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0078  amino acid/peptide transporter  38.69 
 
 		 603 aa  396  1e-109  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3369  proton/peptide symporter family protein  39.7 
 
 		 544 aa  372  1e-102  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.31641  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1105  alkaline phosphatase  39.03 
 
 		 544 aa  368  1e-100  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.377732 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0163  amino acid/peptide transporter  37.84 
 
 		 707 aa  365  1e-100  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0954  amino acid/peptide transporter  42.89 
 
 		 527 aa  321  1.9999999999999998e-86  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.935259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0945  amino acid/peptide transporter  34.27 
 
 		 534 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.985856  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1585  amino acid/peptide transporter  32.57 
 
 		 539 aa  304  3.0000000000000004e-81  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2795  amino acid/peptide transporter  32.41 
 
 		 539 aa  302  9e-81  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.274379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1551  amino acid/peptide transporter  32.41 
 
 		 539 aa  301  2e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1555  amino acid/peptide transporter  32.41 
 
 		 539 aa  301  2e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1088  amino acid/peptide transporter  33.39 
 
 		 584 aa  296  9e-79  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3303  amino acid/peptide transporter  37.38 
 
 		 516 aa  260  6e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4484  amino acid/peptide transporter  36 
 
 		 516 aa  243  1e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0470977  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4332  amino acid/peptide transporter  31.72 
 
 		 497 aa  188  3e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1845  amino acid/peptide transporter  33.16 
 
 		 504 aa  186  1.0000000000000001e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.241988 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0834  amino acid/peptide transporter  31.43 
 
 		 499 aa  184  6e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000422142 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6851  amino acid/peptide transporter  35.8 
 
 		 498 aa  182  2e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0689877 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3596  amino acid/peptide transporter  30.05 
 
 		 501 aa  178  2e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.161382  normal  0.0248648 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3244  amino acid/peptide transporter  30.68 
 
 		 495 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.950565  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0623  amino acid/peptide transporter  28.14 
 
 		 495 aa  175  2.9999999999999996e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000100169  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3942  amino acid/peptide transporter  30.52 
 
 		 496 aa  173  1e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0547773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0825  di-/tripeptide transporter  26.92 
 
 		 451 aa  172  1e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1393  amino acid/peptide transporter  27.97 
 
 		 501 aa  172  2e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.825614  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1421  amino acid/peptide transporter  30.55 
 
 		 494 aa  171  3e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1649  amino acid/peptide transporter  29.39 
 
 		 490 aa  171  4e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000051541  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04805  proton/peptide symporter family protein  28.76 
 
 		 533 aa  171  5e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2266  amino acid/peptide transporter  30.26 
 
 		 490 aa  170  6e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000291592  hitchhiker  0.00874925 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5954  hypothetical protein  32.3 
 
 		 509 aa  170  9e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0911535  normal  0.0715474 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0757  proton/peptide symporter family protein  29.89 
 
 		 461 aa  169  1e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000369558  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0655  proton/peptide symporter family protein  29.89 
 
 		 461 aa  169  1e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000039773  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0599  peptide symporter family protein  29.89 
 
 		 461 aa  169  1e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000279304  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0600  peptide symporter family protein  29.89 
 
 		 461 aa  169  1e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000822499  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2545  amino acid/peptide transporter  27.92 
 
 		 501 aa  169  1e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4615  proton/peptide symporter family protein  29.89 
 
 		 461 aa  169  1e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000740471  normal  0.0901188 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0689  proton/peptide symporter family protein  29.89 
 
 		 461 aa  169  1e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000179263  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0744  proton/peptide symporter family protein  29.89 
 
 		 461 aa  169  1e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000387987 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0721  proton/peptide symporter family protein  29.89 
 
 		 461 aa  169  2e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000879332  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0817  proton/peptide symporter family protein  29.89 
 
 		 461 aa  169  2e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000167379  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1313  amino acid/peptide transporter  29.61 
 
 		 489 aa  169  2e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000607679  normal  0.565693 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1380  amino acid/peptide transporter  29.61 
 
 		 489 aa  169  2e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00016017  normal  0.180173 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1373  amino acid/peptide transporter  29.26 
 
 		 489 aa  168  2e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000302128  hitchhiker  0.00000791426 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0604  amino acid/peptide transporter  29.89 
 
 		 461 aa  169  2e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000192962  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0823  amino acid/peptide transporter  30.93 
 
 		 517 aa  167  4e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3744  amino acid/peptide transporter  31.86 
 
 		 499 aa  168  4e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.971567 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03062  putative proton-dependent peptide transporter  30.03 
 
 		 483 aa  167  5e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.000506345  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03345  predicted transporter  28.7 
 
 		 489 aa  165  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.199197  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3978  inner membrane transporter YhiP  28.7 
 
 		 489 aa  165  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03298  hypothetical protein  28.7 
 
 		 489 aa  165  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.240113  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3826  inner membrane transporter YhiP  28.7 
 
 		 489 aa  165  3e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0219  amino acid/peptide transporter  28.47 
 
 		 489 aa  164  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3696  inner membrane transporter YhiP  28.47 
 
 		 489 aa  164  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0220  inner membrane transporter YhiP  28.47 
 
 		 489 aa  164  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3034  alkaline phosphatase  29.89 
 
 		 491 aa  164  5.0000000000000005e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.513893  hitchhiker  0.00921345 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3647  peptide/proton symporter family protein  28.54 
 
 		 479 aa  164  5.0000000000000005e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1397  amino acid/peptide transporter  28.82 
 
 		 489 aa  164  5.0000000000000005e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000128075  normal  0.33376 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4843  inner membrane transporter YhiP  28.47 
 
 		 489 aa  164  6e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.953433 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1549  putative tripeptide transporter permease  28.41 
 
 		 501 aa  163  8.000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.507438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3785  inner membrane transporter YhiP  28.8 
 
 		 489 aa  163  8.000000000000001e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1881  amino acid/peptide transporter  29.64 
 
 		 517 aa  162  1e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0879055  hitchhiker  0.00292537 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0922  amino acid/peptide transporter  30.95 
 
 		 477 aa  163  1e-38  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000322625  unclonable  8.27442e-19 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1562  putative tripeptide transporter permease  28.41 
 
 		 501 aa  161  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0485322  normal  0.102163 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1722  putative tripeptide transporter permease  28.41 
 
 		 501 aa  161  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00217506  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1890  putative tripeptide transporter permease  28.18 
 
 		 501 aa  161  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1344  di-/tripeptide transporter  30.31 
 
 		 507 aa  161  3e-38  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.938084  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0509  putative tripeptide transporter permease  29 
 
 		 514 aa  161  4e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1622  putative tripeptide transporter permease  28.18 
 
 		 501 aa  161  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.185719  normal  0.452221 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01330  hypothetical protein  28.64 
 
 		 462 aa  160  5e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1572  di-/tripeptide transporter  29.36 
 
 		 492 aa  160  5e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.827276  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1357  amino acid/peptide transporter  29.03 
 
 		 489 aa  160  5e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000317071  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0955  amino acid/peptide transporter  29.03 
 
 		 510 aa  160  8e-38  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.334898  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2274  amino acid/peptide transporter  30.46 
 
 		 520 aa  160  8e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000484906 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0615  proton/peptide symporter family protein  29.12 
 
 		 492 aa  159  1e-37  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2905  amino acid/peptide transporter  28.92 
 
 		 500 aa  159  1e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000347826  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0734  di-/tripeptide transporter  30.95 
 
 		 497 aa  158  3e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0279102  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2346  putative tripeptide transporter permease  28.47 
 
 		 500 aa  158  3e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0609489  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2904  amino acid/peptide transporter  29.34 
 
 		 497 aa  157  4e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00155043 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2895  amino acid/peptide transporter  28.6 
 
 		 501 aa  157  4e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000544318  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3037  amino acid/peptide transporter  28.82 
 
 		 501 aa  157  6e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000164206  normal  0.191533 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1468  amino acid/peptide transporter  29.05 
 
 		 501 aa  157  7e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00129299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004134  di-/tripeptide transporter  28.54 
 
 		 462 aa  156  1e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01604  putative tripeptide transporter permease  28.24 
 
 		 500 aa  155  2e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00542523  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2006  amino acid/peptide transporter  28.24 
 
 		 500 aa  155  2e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0749107  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1995  putative tripeptide transporter permease  28.24 
 
 		 500 aa  155  2e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.46141  normal  0.0309863 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1710  putative tripeptide transporter permease  28.24 
 
 		 500 aa  155  2e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0064967  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1844  putative tripeptide transporter permease  28.24 
 
 		 500 aa  155  2e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000345542  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01594  hypothetical protein  28.24 
 
 		 500 aa  155  2e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00471162  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1565  putative tripeptide transporter permease  28.24 
 
 		 500 aa  155  2e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1824  putative tripeptide transporter permease  28.24 
 
 		 500 aa  155  2e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1737  amino acid/peptide transporter  28.31 
 
 		 497 aa  155  2.9999999999999998e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.824621  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2335  amino acid/peptide transporter  30.23 
 
 		 524 aa  154  2.9999999999999998e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0988959  normal  0.193339 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1074  di-tripeptide ABC transporter membrane protein  29.49 
 
 		 510 aa  154  5e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0093  di-tripeptide ABC transporter  30.13 
 
 		 497 aa  154  5e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.569603  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0669  proton/peptide symporter family protein  30.13 
 
 		 461 aa  153  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.3578e-43 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2318  putative tripeptide transporter permease  27.57 
 
 		 506 aa  152  1e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0682  proton/peptide symporter family protein  30.13 
 
 		 461 aa  151  3e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00298567  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2925  amino acid/peptide transporter  30.3 
 
 		 528 aa  150  6e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.69108  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0651  proton/peptide symporter family protein  29.62 
 
 		 461 aa  150  7e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000984184  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2017  putative tripeptide transporter permease  27.51 
 
 		 506 aa  150  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.617443  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>