109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_5602 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_5602  polysulphide reductase, NrfD  100 
 
 
315 aa  608  1e-173  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0832881  normal  0.536935 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5222  polysulphide reductase, NrfD  97.48 
 
 
318 aa  550  1e-156  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5310  polysulphide reductase, NrfD  97.48 
 
 
318 aa  550  1e-156  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.373187  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19170  formate-dependent nitrite reductase, membrane component  65.29 
 
 
357 aa  299  5e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0135014  normal  0.524347 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0023  Polysulphide reductase NrfD  54.17 
 
 
366 aa  278  1e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.14854 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5278  Polysulphide reductase NrfD  51.32 
 
 
323 aa  273  3e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1604  Polysulphide reductase NrfD  56.49 
 
 
370 aa  256  5e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.110974  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3577  Polysulphide reductase NrfD  47.56 
 
 
361 aa  253  4.0000000000000004e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.629636  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3730  polysulphide reductase NrfD  52.1 
 
 
326 aa  232  6e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0861929  normal  0.0225451 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0346  Polysulphide reductase NrfD  49.67 
 
 
346 aa  219  5e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09620  formate-dependent nitrite reductase, membrane component  46.31 
 
 
371 aa  218  1e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.79137  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04220  formate-dependent nitrite reductase, membrane component  44.31 
 
 
412 aa  184  2.0000000000000003e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0739759  normal  0.0894023 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2726  polysulphide reductase, NrfD  48.36 
 
 
318 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0680334  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0822  polysulphide reductase, NrfD  38.44 
 
 
399 aa  136  6.0000000000000005e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0870  Polysulphide reductase NrfD  38.27 
 
 
399 aa  132  7.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0862  cyclic nucleotide-binding protein  34.85 
 
 
327 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0860  polysulphide reductase NrfD  39.27 
 
 
389 aa  124  1e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.104175 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0874  Polysulphide reductase NrfD  37.62 
 
 
399 aa  123  5e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2179  Polysulphide reductase NrfD  34.52 
 
 
345 aa  122  6e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2293  polysulphide reductase, NrfD  35.62 
 
 
373 aa  98.6  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.882646  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5826  polysulphide reductase NrfD  42.26 
 
 
385 aa  85.9  8e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.122979  normal  0.087256 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0610  Polysulphide reductase NrfD  35.23 
 
 
309 aa  78.6  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1162  Polysulphide reductase NrfD  34.36 
 
 
323 aa  69.7  0.00000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.130935  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0910  Polysulphide reductase NrfD  29.83 
 
 
330 aa  68.2  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.241015  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1196  Polysulphide reductase NrfD  32.57 
 
 
348 aa  66.6  0.0000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2564  polysulphide reductase, NrfD  30.96 
 
 
331 aa  62.4  0.000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.564055  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1772  protein NrfD  30.22 
 
 
323 aa  62  0.00000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2001  polysulphide reductase, NrfD  31.28 
 
 
313 aa  61.6  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.438759  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3037  polysulphide reductase NrfD  31.03 
 
 
315 aa  61.2  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0267  Polysulphide reductase NrfD  32.09 
 
 
321 aa  59.7  0.00000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0128763  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4045  polysulfide reductase, subunit C  32.29 
 
 
313 aa  59.3  0.00000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0618  formate-dependent nitrite reductase membrane component-like  27.44 
 
 
330 aa  58.5  0.0000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0787087  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0606  polysulphide reductase, NrfD  32.5 
 
 
313 aa  58.5  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.865603 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0509  polysulphide reductase, NrfD  31.89 
 
 
314 aa  57.8  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2141  Polysulphide reductase NrfD  32.46 
 
 
330 aa  56.2  0.0000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0724041  normal  0.879505 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3442  polysulphide reductase, NrfD  32.3 
 
 
314 aa  55.1  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0387  phosphatidylglycerophosphatase A  28.8 
 
 
311 aa  54.7  0.000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.682978  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3984  polysulphide reductase, NrfD  27.23 
 
 
298 aa  53.9  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2000  cytochrome c-type biogenesis protein NrfD  26.07 
 
 
318 aa  54.3  0.000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0613  polysulphide reductase, NrfD  29.69 
 
 
313 aa  53.1  0.000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003117  NrfD protein  27.75 
 
 
323 aa  52.8  0.000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.894563  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2402  Polysulphide reductase NrfD  31.09 
 
 
331 aa  52.4  0.000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000296698  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02723  hypothetical protein  26.79 
 
 
323 aa  52  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0449  Polysulphide reductase NrfD  32.56 
 
 
288 aa  52  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3617  polysulphide reductase, NrfD  31.68 
 
 
314 aa  51.6  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0700  Polysulphide reductase NrfD  29.57 
 
 
318 aa  51.6  0.00002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.000000375278  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0444  Polysulphide reductase NrfD  31.03 
 
 
288 aa  51.2  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.638298  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0952  polysulfide reductase, subunit C, putative  28.7 
 
 
304 aa  50.8  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.18668  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0343  polysulphide reductase, NrfD  38 
 
 
345 aa  50.4  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.443953  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1464  polysulphide reductase NrfD  31.12 
 
 
347 aa  50.1  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1207  Polysulphide reductase NrfD  34.07 
 
 
305 aa  50.4  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1872  Polysulphide reductase NrfD  31.03 
 
 
287 aa  50.1  0.00005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0177217 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0271  Polysulphide reductase NrfD  28.72 
 
 
322 aa  49.7  0.00006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3175  polysulfide reductase, subunit C  32.46 
 
 
328 aa  49.7  0.00007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4568  formate-dependent nitrite reductase, nrfD protein  29.76 
 
 
313 aa  48.9  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0561  Polysulphide reductase NrfD  33.65 
 
 
315 aa  48.9  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0481  Polysulphide reductase NrfD  29.55 
 
 
413 aa  48.9  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4782  Polysulphide reductase NrfD  32.18 
 
 
400 aa  48.9  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4060  polysulfide reductase, subunit C  31.06 
 
 
314 aa  47.8  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0183  polysulphide reductase, NrfD  36.46 
 
 
313 aa  47.8  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4151  polysulphide reductase NrfD  36.46 
 
 
313 aa  47.8  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1916  polysulphide reductase  29.89 
 
 
324 aa  48.1  0.0002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2318  tRNA uridine 5-carboxymethylaminomethyl modification enzyme GidA  27.78 
 
 
294 aa  48.1  0.0002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0557  polysulphide reductase NrfD  29.81 
 
 
315 aa  48.1  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4283  cytochrome c nitrite reductase, NrfD subunit  33.33 
 
 
313 aa  47.8  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.137693 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4451  polysulphide reductase NrfD  29.73 
 
 
315 aa  48.1  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1865  Polysulphide reductase NrfD  27.87 
 
 
304 aa  48.1  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0342025 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2388  Polysulphide reductase NrfD  27.06 
 
 
330 aa  47.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.31766  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0184  cytochrome c nitrite reductase, NrfD subunit  36.46 
 
 
313 aa  47.8  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2429  cytochrome c nitrite reductase, NrfD subunit  26.32 
 
 
320 aa  47.8  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2044  polysulfide reductase, subunit C, putative  24.89 
 
 
304 aa  47  0.0004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.292161  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3779  polysulphide reductase, NrfD  30.86 
 
 
315 aa  47  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.245778  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3245  polysulphide reductase, NrfD  28.78 
 
 
298 aa  47.4  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.832914 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0613  polysulphide reductase, NrfD  29.55 
 
 
315 aa  47.4  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1337  Polysulphide reductase NrfD  30.89 
 
 
304 aa  47  0.0004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.794344  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3537  polysulphide reductase, NrfD  28.42 
 
 
315 aa  46.6  0.0005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0315  polysulphide reductase, NrfD  36.46 
 
 
313 aa  47  0.0005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.52148  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0533  polysulphide reductase NrfD  32.69 
 
 
315 aa  47  0.0005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2523  Polysulphide reductase NrfD  32.14 
 
 
416 aa  46.6  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2732  cytochrome c nitrite reductase, NrfD subunit  25.4 
 
 
320 aa  46.6  0.0006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0487  polysulphide reductase, NrfD  29.73 
 
 
315 aa  45.8  0.0009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3960  polysulphide reductase, NrfD  36.46 
 
 
313 aa  45.1  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3872  polysulphide reductase NrfD  29.35 
 
 
315 aa  45.1  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0484  polysulphide reductase NrfD  33.7 
 
 
315 aa  45.8  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.682806  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3997  polysulphide reductase NrfD  28.25 
 
 
315 aa  45.1  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4472  polysulphide reductase NrfD  33.7 
 
 
315 aa  45.4  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2436  Polysulphide reductase NrfD  30.95 
 
 
416 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.136872  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4225  Polysulphide reductase NrfD  24.86 
 
 
389 aa  45.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000782128  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0484  formate-dependent nitrite reductase, nrfD protein  29.35 
 
 
311 aa  45.1  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1424  polysulphide reductase, NrfD  30.95 
 
 
416 aa  44.3  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3762  polysulphide reductase, NrfD  36.46 
 
 
313 aa  45.1  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3835  polysulphide reductase, NrfD  36.46 
 
 
313 aa  45.1  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3158  polysulphide reductase, NrfD  33.33 
 
 
313 aa  45.1  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0498  polysulphide reductase, NrfD  27.32 
 
 
315 aa  44.7  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3561  polysulphide reductase, NrfD  27.86 
 
 
316 aa  44.7  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.90261  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3249  cytochrome c nitrite reductase, NrfD subunit  27.86 
 
 
318 aa  45.1  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03110  formate-dependent nitrite reductase, membrane component  30.48 
 
 
320 aa  45.1  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1636  Polysulphide reductase NrfD  31.4 
 
 
292 aa  44.3  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.280095  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1367  Polysulphide reductase NrfD  29.79 
 
 
317 aa  43.9  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0825  hypothetical protein  59.26 
 
 
320 aa  43.9  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.201019  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>