60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_0822 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_0822  polysulphide reductase, NrfD  100 
 
 
399 aa  756    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0870  Polysulphide reductase NrfD  94.74 
 
 
399 aa  633  1e-180  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0874  Polysulphide reductase NrfD  93.23 
 
 
399 aa  583  1.0000000000000001e-165  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0860  polysulphide reductase NrfD  68.78 
 
 
389 aa  411  1e-113  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.104175 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2179  Polysulphide reductase NrfD  40.17 
 
 
345 aa  212  7.999999999999999e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5278  Polysulphide reductase NrfD  42.02 
 
 
323 aa  166  5.9999999999999996e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2293  polysulphide reductase, NrfD  41.09 
 
 
373 aa  164  2.0000000000000002e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.882646  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0023  Polysulphide reductase NrfD  37.71 
 
 
366 aa  158  1e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.14854 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3577  Polysulphide reductase NrfD  38.64 
 
 
361 aa  155  1e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.629636  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0346  Polysulphide reductase NrfD  41.14 
 
 
346 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04220  formate-dependent nitrite reductase, membrane component  36.96 
 
 
412 aa  144  4e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0739759  normal  0.0894023 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5310  polysulphide reductase, NrfD  38.65 
 
 
318 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.373187  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5222  polysulphide reductase, NrfD  38.65 
 
 
318 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5602  polysulphide reductase, NrfD  38.89 
 
 
315 aa  140  4.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0832881  normal  0.536935 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09620  formate-dependent nitrite reductase, membrane component  38.31 
 
 
371 aa  135  9e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.79137  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1604  Polysulphide reductase NrfD  38.76 
 
 
370 aa  133  6e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.110974  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0862  cyclic nucleotide-binding protein  33.13 
 
 
327 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3730  polysulphide reductase NrfD  38.51 
 
 
326 aa  131  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0861929  normal  0.0225451 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2726  polysulphide reductase, NrfD  54.67 
 
 
318 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0680334  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19170  formate-dependent nitrite reductase, membrane component  41.72 
 
 
357 aa  115  1.0000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0135014  normal  0.524347 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5826  polysulphide reductase NrfD  33.76 
 
 
385 aa  106  9e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.122979  normal  0.087256 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0610  Polysulphide reductase NrfD  34.03 
 
 
309 aa  80.9  0.00000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1865  Polysulphide reductase NrfD  30.32 
 
 
304 aa  60.8  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0342025 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2564  polysulphide reductase, NrfD  27.81 
 
 
331 aa  58.9  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.564055  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2318  tRNA uridine 5-carboxymethylaminomethyl modification enzyme GidA  30.46 
 
 
294 aa  56.2  0.000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0910  Polysulphide reductase NrfD  28.21 
 
 
330 aa  55.1  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.241015  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1464  polysulphide reductase NrfD  32.31 
 
 
347 aa  54.7  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1196  Polysulphide reductase NrfD  29.76 
 
 
348 aa  53.1  0.000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4782  Polysulphide reductase NrfD  27.75 
 
 
400 aa  51.6  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3359  Polysulphide reductase NrfD  34.32 
 
 
313 aa  50.4  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000572761  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1337  Polysulphide reductase NrfD  29.44 
 
 
304 aa  50.1  0.00007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.794344  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2044  polysulfide reductase, subunit C, putative  27.23 
 
 
304 aa  49.3  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.292161  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1207  Polysulphide reductase NrfD  27.08 
 
 
305 aa  49.3  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0618  formate-dependent nitrite reductase membrane component-like  27.84 
 
 
330 aa  48.9  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0787087  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0343  polysulphide reductase, NrfD  30.34 
 
 
345 aa  48.5  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.443953  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0387  phosphatidylglycerophosphatase A  27.72 
 
 
311 aa  48.5  0.0002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.682978  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1798  Polysulphide reductase NrfD  31.43 
 
 
391 aa  47.4  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2000  cytochrome c-type biogenesis protein NrfD  27.13 
 
 
318 aa  47.4  0.0005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1772  protein NrfD  24.62 
 
 
323 aa  46.6  0.0008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1636  Polysulphide reductase NrfD  37.58 
 
 
292 aa  46.2  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.280095  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4106  polysulphide reductase NrfD  28.85 
 
 
311 aa  46.2  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.354906  normal  0.247792 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0916  Polysulphide reductase NrfD  32.95 
 
 
394 aa  46.2  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.451801  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0516  formate-dependent nitrite reductase, nrfD protein  29.05 
 
 
313 aa  45.8  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4283  cytochrome c nitrite reductase, NrfD subunit  28.49 
 
 
313 aa  45.4  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.137693 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0613  polysulphide reductase, NrfD  30.39 
 
 
313 aa  45.1  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2933  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.75 
 
 
505 aa  45.1  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4151  polysulphide reductase NrfD  28.49 
 
 
313 aa  45.4  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0183  polysulphide reductase, NrfD  28.49 
 
 
313 aa  45.4  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4568  formate-dependent nitrite reductase, nrfD protein  28.57 
 
 
313 aa  45.4  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0184  cytochrome c nitrite reductase, NrfD subunit  28.49 
 
 
313 aa  45.4  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0034  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  28.63 
 
 
517 aa  44.7  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0825  hypothetical protein  33.33 
 
 
320 aa  44.3  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.201019  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1162  Polysulphide reductase NrfD  28.42 
 
 
323 aa  44.3  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.130935  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02723  hypothetical protein  26.74 
 
 
323 aa  43.9  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1613  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  35.1 
 
 
531 aa  43.9  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4245  polysulphide reductase NrfD  35.22 
 
 
347 aa  43.5  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.370954  normal  0.113587 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0952  polysulfide reductase, subunit C, putative  28.5 
 
 
304 aa  43.5  0.006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.18668  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3537  polysulphide reductase, NrfD  27.85 
 
 
315 aa  43.1  0.009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003117  NrfD protein  25.27 
 
 
323 aa  42.7  0.01  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.894563  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0315  polysulphide reductase, NrfD  27.33 
 
 
313 aa  43.1  0.01  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.52148  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>