44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3730 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_3730  polysulphide reductase NrfD  100 
 
 		 326 aa  612  9.999999999999999e-175  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0861929  normal  0.0225451 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0023  Polysulphide reductase NrfD  53.55 
 
 		 366 aa  282  5.000000000000001e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.14854 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5310  polysulphide reductase, NrfD  51.29 
 
 		 318 aa  257  1e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.373187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5222  polysulphide reductase, NrfD  51.29 
 
 		 318 aa  257  1e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5278  Polysulphide reductase NrfD  49.84 
 
 		 323 aa  253  3e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0346  Polysulphide reductase NrfD  51.89 
 
 		 346 aa  251  1e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5602  polysulphide reductase, NrfD  51.94 
 
 		 315 aa  243  3e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0832881  normal  0.536935 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3577  Polysulphide reductase NrfD  46.47 
 
 		 361 aa  235  1.0000000000000001e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.629636  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1604  Polysulphide reductase NrfD  48.25 
 
 		 370 aa  231  1e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.110974  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04220  formate-dependent nitrite reductase, membrane component  46.32 
 
 		 412 aa  201  1.9999999999999998e-50  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0739759  normal  0.0894023 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19170  formate-dependent nitrite reductase, membrane component  47.22 
 
 		 357 aa  192  6e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0135014  normal  0.524347 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09620  formate-dependent nitrite reductase, membrane component  42.48 
 
 		 371 aa  179  8e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.79137  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2726  polysulphide reductase, NrfD  49.68 
 
 		 318 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0680334  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2179  Polysulphide reductase NrfD  37.06 
 
 		 345 aa  152  7e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0860  polysulphide reductase NrfD  42.73 
 
 		 389 aa  150  4e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.104175 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0822  polysulphide reductase, NrfD  42.35 
 
 		 399 aa  148  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2293  polysulphide reductase, NrfD  37.69 
 
 		 373 aa  140  3e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.882646  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0870  Polysulphide reductase NrfD  42.86 
 
 		 399 aa  139  8.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0874  Polysulphide reductase NrfD  39.75 
 
 		 399 aa  123  4e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0862  cyclic nucleotide-binding protein  30.25 
 
 		 327 aa  104  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5826  polysulphide reductase NrfD  36.9 
 
 		 385 aa  79.7  0.00000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.122979  normal  0.087256 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1464  polysulphide reductase NrfD  33.78 
 
 		 347 aa  56.6  0.0000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1865  Polysulphide reductase NrfD  24.89 
 
 		 304 aa  55.5  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0342025 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1162  Polysulphide reductase NrfD  31.16 
 
 		 323 aa  54.3  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.130935  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2044  polysulfide reductase, subunit C, putative  25.33 
 
 		 304 aa  52  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.292161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0613  polysulphide reductase, NrfD  28 
 
 		 313 aa  52.4  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3561  polysulphide reductase, NrfD  29 
 
 		 316 aa  52.4  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.90261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0952  polysulfide reductase, subunit C, putative  26.64 
 
 		 304 aa  50.4  0.00004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.18668  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0610  Polysulphide reductase NrfD  28.57 
 
 		 309 aa  50.1  0.00005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2564  polysulphide reductase, NrfD  29.84 
 
 		 331 aa  47.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.564055  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0267  Polysulphide reductase NrfD  26.59 
 
 		 321 aa  46.6  0.0005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0128763  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02723  hypothetical protein  26.19 
 
 		 323 aa  46.6  0.0006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0910  Polysulphide reductase NrfD  28.57 
 
 		 330 aa  46.6  0.0006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.241015  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0516  formate-dependent nitrite reductase, nrfD protein  30.77 
 
 		 313 aa  46.2  0.0007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2000  cytochrome c-type biogenesis protein NrfD  24.51 
 
 		 318 aa  46.2  0.0007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4283  cytochrome c nitrite reductase, NrfD subunit  32.67 
 
 		 313 aa  45.8  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.137693 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4151  polysulphide reductase NrfD  32.67 
 
 		 313 aa  45.8  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0183  polysulphide reductase, NrfD  32.67 
 
 		 313 aa  45.8  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0184  cytochrome c nitrite reductase, NrfD subunit  32.67 
 
 		 313 aa  45.8  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4568  formate-dependent nitrite reductase, nrfD protein  26.83 
 
 		 313 aa  45.8  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003117  NrfD protein  26.07 
 
 		 323 aa  44.3  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.894563  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1196  Polysulphide reductase NrfD  27.88 
 
 		 348 aa  42.7  0.008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0309  Polysulphide reductase NrfD  24.5 
 
 		 299 aa  42.7  0.008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000856639  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1337  Polysulphide reductase NrfD  26.74 
 
 		 304 aa  42.7  0.008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.794344  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>