56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_0862 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013525  Tter_0862  cyclic nucleotide-binding protein  100 
 
 		 327 aa  655    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5602  polysulphide reductase, NrfD  34.53 
 
 		 315 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0832881  normal  0.536935 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5278  Polysulphide reductase NrfD  33.65 
 
 		 323 aa  127  3e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5222  polysulphide reductase, NrfD  33.33 
 
 		 318 aa  124  3e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5310  polysulphide reductase, NrfD  33.33 
 
 		 318 aa  124  3e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.373187  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0822  polysulphide reductase, NrfD  34.05 
 
 		 399 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0870  Polysulphide reductase NrfD  33.95 
 
 		 399 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0860  polysulphide reductase NrfD  35.06 
 
 		 389 aa  117  3e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.104175 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0874  Polysulphide reductase NrfD  33.96 
 
 		 399 aa  116  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3577  Polysulphide reductase NrfD  34.83 
 
 		 361 aa  110  5e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.629636  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2293  polysulphide reductase, NrfD  38.74 
 
 		 373 aa  109  7.000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.882646  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0023  Polysulphide reductase NrfD  31.45 
 
 		 366 aa  105  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.14854 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1604  Polysulphide reductase NrfD  36.6 
 
 		 370 aa  101  2e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.110974  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2179  Polysulphide reductase NrfD  28.08 
 
 		 345 aa  99  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19170  formate-dependent nitrite reductase, membrane component  40.36 
 
 		 357 aa  97.4  3e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0135014  normal  0.524347 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09620  formate-dependent nitrite reductase, membrane component  35.56 
 
 		 371 aa  93.2  5e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.79137  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3730  polysulphide reductase NrfD  30.31 
 
 		 326 aa  92.8  8e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0861929  normal  0.0225451 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0346  Polysulphide reductase NrfD  33.17 
 
 		 346 aa  92.4  9e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04220  formate-dependent nitrite reductase, membrane component  29.41 
 
 		 412 aa  91.7  2e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0739759  normal  0.0894023 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0610  Polysulphide reductase NrfD  28.03 
 
 		 309 aa  87.4  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5826  polysulphide reductase NrfD  31.25 
 
 		 385 aa  82.4  0.000000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.122979  normal  0.087256 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2726  polysulphide reductase, NrfD  40.98 
 
 		 318 aa  80.9  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0680334  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1636  Polysulphide reductase NrfD  29.18 
 
 		 292 aa  66.2  0.0000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.280095  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1337  Polysulphide reductase NrfD  31.88 
 
 		 304 aa  63.9  0.000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.794344  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2044  polysulfide reductase, subunit C, putative  27.97 
 
 		 304 aa  61.6  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.292161  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1207  Polysulphide reductase NrfD  34 
 
 		 305 aa  58.9  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1196  Polysulphide reductase NrfD  25.56 
 
 		 348 aa  57.4  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4782  Polysulphide reductase NrfD  25.71 
 
 		 400 aa  57  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1162  Polysulphide reductase NrfD  25.93 
 
 		 323 aa  54.7  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.130935  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1772  protein NrfD  28.95 
 
 		 323 aa  52.4  0.00001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0387  phosphatidylglycerophosphatase A  26.77 
 
 		 311 aa  51.2  0.00002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.682978  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3359  Polysulphide reductase NrfD  27.42 
 
 		 313 aa  50.8  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000572761  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2001  polysulphide reductase, NrfD  30.19 
 
 		 313 aa  50.4  0.00004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.438759  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2318  tRNA uridine 5-carboxymethylaminomethyl modification enzyme GidA  27.46 
 
 		 294 aa  49.7  0.00007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0509  polysulphide reductase, NrfD  26.32 
 
 		 314 aa  49.7  0.00008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1865  Polysulphide reductase NrfD  29.7 
 
 		 304 aa  49.3  0.00008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0342025 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0343  polysulphide reductase, NrfD  30.05 
 
 		 345 aa  49.3  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.443953  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1916  polysulphide reductase  23.15 
 
 		 324 aa  48.5  0.0001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2564  polysulphide reductase, NrfD  28.8 
 
 		 331 aa  48.9  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.564055  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3617  polysulphide reductase, NrfD  26.15 
 
 		 314 aa  47.8  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0952  polysulfide reductase, subunit C, putative  28.87 
 
 		 304 aa  48.1  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.18668  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4045  polysulfide reductase, subunit C  25.93 
 
 		 313 aa  48.1  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1874  polysulphide reductase, NrfD  27.75 
 
 		 309 aa  47.8  0.0003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.51495  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0825  hypothetical protein  27.75 
 
 		 320 aa  47.4  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.201019  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0533  polysulphide reductase NrfD  26.38 
 
 		 315 aa  46.6  0.0006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0271  Polysulphide reductase NrfD  24.52 
 
 		 322 aa  46.2  0.0007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3442  polysulphide reductase, NrfD  25.39 
 
 		 314 aa  46.2  0.0007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0634  polysulphide reductase, NrfD  32.14 
 
 		 364 aa  46.2  0.0007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00082842 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0557  polysulphide reductase NrfD  26.99 
 
 		 315 aa  46.2  0.0007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3779  polysulphide reductase, NrfD  26.38 
 
 		 315 aa  46.2  0.0008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.245778  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4060  polysulfide reductase, subunit C  25.77 
 
 		 314 aa  46.2  0.0008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0613  polysulphide reductase, NrfD  25.99 
 
 		 315 aa  45.4  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0606  polysulphide reductase, NrfD  25.93 
 
 		 313 aa  45.1  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.865603 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0561  Polysulphide reductase NrfD  26.38 
 
 		 315 aa  44.7  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0634  polysulphide reductase, NrfD  32.67 
 
 		 364 aa  43.5  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00221682 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0700  Polysulphide reductase NrfD  25.65 
 
 		 318 aa  42.7  0.009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.000000375278  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>