21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0825 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_0825  hypothetical protein  100 
 
 		 320 aa  633  1e-180  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.201019  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0862  cyclic nucleotide-binding protein  27.75 
 
 		 327 aa  57.8  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5222  polysulphide reductase, NrfD  57.89 
 
 		 318 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5310  polysulphide reductase, NrfD  57.89 
 
 		 318 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.373187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5602  polysulphide reductase, NrfD  56.41 
 
 		 315 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0832881  normal  0.536935 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0860  polysulphide reductase NrfD  37.17 
 
 		 389 aa  54.3  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.104175 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3577  Polysulphide reductase NrfD  29.15 
 
 		 361 aa  52  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.629636  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19170  formate-dependent nitrite reductase, membrane component  65.62 
 
 		 357 aa  51.6  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0135014  normal  0.524347 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1604  Polysulphide reductase NrfD  60.61 
 
 		 370 aa  48.1  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.110974  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04220  formate-dependent nitrite reductase, membrane component  30.43 
 
 		 412 aa  48.1  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0739759  normal  0.0894023 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0346  Polysulphide reductase NrfD  35.34 
 
 		 346 aa  47.8  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5278  Polysulphide reductase NrfD  29.17 
 
 		 323 aa  47.4  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2293  polysulphide reductase, NrfD  32.26 
 
 		 373 aa  47  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.882646  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0023  Polysulphide reductase NrfD  48 
 
 		 366 aa  46.6  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.14854 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0870  Polysulphide reductase NrfD  66.67 
 
 		 399 aa  47  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0874  Polysulphide reductase NrfD  66.67 
 
 		 399 aa  46.6  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0822  polysulphide reductase, NrfD  32.06 
 
 		 399 aa  46.6  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2179  Polysulphide reductase NrfD  36.28 
 
 		 345 aa  45.8  0.0009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5826  polysulphide reductase NrfD  35.42 
 
 		 385 aa  45.4  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.122979  normal  0.087256 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2726  polysulphide reductase, NrfD  44.9 
 
 		 318 aa  43.5  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0680334  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3730  polysulphide reductase NrfD  52.78 
 
 		 326 aa  42.7  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0861929  normal  0.0225451 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>