52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_19170 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_19170  formate-dependent nitrite reductase, membrane component  100 
 
 		 357 aa  696    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0135014  normal  0.524347 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5602  polysulphide reductase, NrfD  65.29 
 
 		 315 aa  352  5.9999999999999994e-96  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0832881  normal  0.536935 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5222  polysulphide reductase, NrfD  64.35 
 
 		 318 aa  348  7e-95  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5310  polysulphide reductase, NrfD  64.35 
 
 		 318 aa  348  7e-95  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.373187  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5278  Polysulphide reductase NrfD  52.48 
 
 		 323 aa  276  5e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0023  Polysulphide reductase NrfD  50.64 
 
 		 366 aa  264  2e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.14854 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3577  Polysulphide reductase NrfD  47.2 
 
 		 361 aa  263  3e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.629636  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1604  Polysulphide reductase NrfD  52.65 
 
 		 370 aa  261  8.999999999999999e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.110974  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3730  polysulphide reductase NrfD  47.22 
 
 		 326 aa  220  1.9999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0861929  normal  0.0225451 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09620  formate-dependent nitrite reductase, membrane component  46.06 
 
 		 371 aa  220  1.9999999999999999e-56  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.79137  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0346  Polysulphide reductase NrfD  48.71 
 
 		 346 aa  215  8e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04220  formate-dependent nitrite reductase, membrane component  45.35 
 
 		 412 aa  200  3.9999999999999996e-50  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0739759  normal  0.0894023 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2726  polysulphide reductase, NrfD  50.5 
 
 		 318 aa  154  2e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0680334  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0822  polysulphide reductase, NrfD  43.14 
 
 		 399 aa  145  1e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0870  Polysulphide reductase NrfD  45.13 
 
 		 399 aa  140  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0874  Polysulphide reductase NrfD  44.84 
 
 		 399 aa  133  5e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0862  cyclic nucleotide-binding protein  35.47 
 
 		 327 aa  125  8.000000000000001e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0860  polysulphide reductase NrfD  39.41 
 
 		 389 aa  123  4e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.104175 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2179  Polysulphide reductase NrfD  32.77 
 
 		 345 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2293  polysulphide reductase, NrfD  41.79 
 
 		 373 aa  109  6e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.882646  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5826  polysulphide reductase NrfD  45.45 
 
 		 385 aa  104  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.122979  normal  0.087256 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0610  Polysulphide reductase NrfD  34.57 
 
 		 309 aa  72  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1464  polysulphide reductase NrfD  31.31 
 
 		 347 aa  63.9  0.000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0910  Polysulphide reductase NrfD  28.08 
 
 		 330 aa  61.6  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.241015  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1613  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  35.71 
 
 		 531 aa  60.8  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2564  polysulphide reductase, NrfD  28.06 
 
 		 331 aa  58.5  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.564055  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1162  Polysulphide reductase NrfD  27.08 
 
 		 323 aa  56.2  0.0000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.130935  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0343  polysulphide reductase, NrfD  30.3 
 
 		 345 aa  53.9  0.000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.443953  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1207  Polysulphide reductase NrfD  32.71 
 
 		 305 aa  51.6  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3037  polysulphide reductase NrfD  31.31 
 
 		 315 aa  48.9  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2172  cyclic nucleotide-binding protein  32.89 
 
 		 565 aa  49.3  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.653365  hitchhiker  0.000000233561 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2001  polysulphide reductase, NrfD  26.94 
 
 		 313 aa  48.1  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.438759  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4045  polysulfide reductase, subunit C  28.87 
 
 		 313 aa  47.4  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2141  Polysulphide reductase NrfD  28.15 
 
 		 330 aa  47  0.0005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0724041  normal  0.879505 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0618  formate-dependent nitrite reductase membrane component-like  26.67 
 
 		 330 aa  46.6  0.0007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0787087  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1772  protein NrfD  25.27 
 
 		 323 aa  46.2  0.0008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2402  Polysulphide reductase NrfD  29.57 
 
 		 331 aa  45.4  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000296698  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0444  Polysulphide reductase NrfD  29.19 
 
 		 288 aa  45.4  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.638298  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1196  Polysulphide reductase NrfD  26.79 
 
 		 348 aa  45.8  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3359  Polysulphide reductase NrfD  27.05 
 
 		 313 aa  45.1  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000572761  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1792  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  28.38 
 
 		 565 aa  44.7  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0825  hypothetical protein  30.34 
 
 		 320 aa  44.7  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.201019  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1337  Polysulphide reductase NrfD  30.65 
 
 		 304 aa  44.3  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.794344  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4782  Polysulphide reductase NrfD  35.37 
 
 		 400 aa  43.9  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2523  Polysulphide reductase NrfD  33.33 
 
 		 416 aa  43.9  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0509  polysulphide reductase, NrfD  25.22 
 
 		 314 aa  43.9  0.005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2388  Polysulphide reductase NrfD  38.24 
 
 		 330 aa  43.5  0.006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.31766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0510  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  30.82 
 
 		 559 aa  43.1  0.008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0098001  normal  0.0322264 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3245  polysulphide reductase, NrfD  28.47 
 
 		 298 aa  42.7  0.009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.832914 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2436  Polysulphide reductase NrfD  32.14 
 
 		 416 aa  42.7  0.009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.136872  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0449  Polysulphide reductase NrfD  30.36 
 
 		 288 aa  42.7  0.01  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2933  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  28.46 
 
 		 505 aa  42.7  0.01  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>