28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0023 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_0023  Polysulphide reductase NrfD  100 
 
 		 366 aa  711    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.14854 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1604  Polysulphide reductase NrfD  54.86 
 
 		 370 aa  280  2e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.110974  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5222  polysulphide reductase, NrfD  52.88 
 
 		 318 aa  270  2e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5310  polysulphide reductase, NrfD  52.88 
 
 		 318 aa  270  2e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.373187  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3730  polysulphide reductase NrfD  52.88 
 
 		 326 aa  264  2e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0861929  normal  0.0225451 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5602  polysulphide reductase, NrfD  54.17 
 
 		 315 aa  263  4.999999999999999e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0832881  normal  0.536935 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0346  Polysulphide reductase NrfD  51.19 
 
 		 346 aa  258  9e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5278  Polysulphide reductase NrfD  47.85 
 
 		 323 aa  248  1e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3577  Polysulphide reductase NrfD  49.52 
 
 		 361 aa  246  3e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.629636  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19170  formate-dependent nitrite reductase, membrane component  49.85 
 
 		 357 aa  209  7e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0135014  normal  0.524347 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09620  formate-dependent nitrite reductase, membrane component  46.15 
 
 		 371 aa  204  2e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.79137  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04220  formate-dependent nitrite reductase, membrane component  43.81 
 
 		 412 aa  196  4.0000000000000005e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0739759  normal  0.0894023 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2726  polysulphide reductase, NrfD  51.67 
 
 		 318 aa  170  3e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0680334  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0822  polysulphide reductase, NrfD  38.89 
 
 		 399 aa  144  4e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0870  Polysulphide reductase NrfD  38.4 
 
 		 399 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2179  Polysulphide reductase NrfD  33.72 
 
 		 345 aa  125  8.000000000000001e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0860  polysulphide reductase NrfD  39.69 
 
 		 389 aa  125  1e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.104175 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0874  Polysulphide reductase NrfD  40.82 
 
 		 399 aa  124  3e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2293  polysulphide reductase, NrfD  35.76 
 
 		 373 aa  113  7.000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.882646  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5826  polysulphide reductase NrfD  35.8 
 
 		 385 aa  107  5e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.122979  normal  0.087256 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0862  cyclic nucleotide-binding protein  31.4 
 
 		 327 aa  100  4e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0343  polysulphide reductase, NrfD  39.42 
 
 		 345 aa  51.6  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.443953  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1207  Polysulphide reductase NrfD  32 
 
 		 305 aa  47.8  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0610  Polysulphide reductase NrfD  33.14 
 
 		 309 aa  44.3  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2564  polysulphide reductase, NrfD  33.63 
 
 		 331 aa  43.1  0.007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.564055  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1196  Polysulphide reductase NrfD  34.12 
 
 		 348 aa  43.1  0.008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1464  polysulphide reductase NrfD  27 
 
 		 347 aa  42.7  0.009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1162  Polysulphide reductase NrfD  24.07 
 
 		 323 aa  42.7  0.01  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.130935  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>