31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0346 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_0346  Polysulphide reductase NrfD  100 
 
 		 346 aa  676    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0023  Polysulphide reductase NrfD  51 
 
 		 366 aa  286  2.9999999999999996e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.14854 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5278  Polysulphide reductase NrfD  51.79 
 
 		 323 aa  267  2e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3730  polysulphide reductase NrfD  49.85 
 
 		 326 aa  256  3e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0861929  normal  0.0225451 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1604  Polysulphide reductase NrfD  51.22 
 
 		 370 aa  256  4e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.110974  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5222  polysulphide reductase, NrfD  48.86 
 
 		 318 aa  248  1e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5310  polysulphide reductase, NrfD  48.86 
 
 		 318 aa  248  1e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.373187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5602  polysulphide reductase, NrfD  49.19 
 
 		 315 aa  241  2e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0832881  normal  0.536935 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3577  Polysulphide reductase NrfD  43.83 
 
 		 361 aa  236  4e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.629636  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04220  formate-dependent nitrite reductase, membrane component  45.18 
 
 		 412 aa  218  1e-55  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0739759  normal  0.0894023 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19170  formate-dependent nitrite reductase, membrane component  46.71 
 
 		 357 aa  204  3e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0135014  normal  0.524347 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09620  formate-dependent nitrite reductase, membrane component  41.14 
 
 		 371 aa  196  7e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.79137  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2726  polysulphide reductase, NrfD  52.78 
 
 		 318 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0680334  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0860  polysulphide reductase NrfD  42.28 
 
 		 389 aa  155  1e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.104175 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0822  polysulphide reductase, NrfD  41.39 
 
 		 399 aa  151  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2293  polysulphide reductase, NrfD  38.14 
 
 		 373 aa  150  4e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.882646  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0870  Polysulphide reductase NrfD  41.72 
 
 		 399 aa  139  4.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0874  Polysulphide reductase NrfD  41.81 
 
 		 399 aa  136  5e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2179  Polysulphide reductase NrfD  34.56 
 
 		 345 aa  129  6e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5826  polysulphide reductase NrfD  43.79 
 
 		 385 aa  104  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.122979  normal  0.087256 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0862  cyclic nucleotide-binding protein  29.58 
 
 		 327 aa  95.1  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0610  Polysulphide reductase NrfD  33.18 
 
 		 309 aa  57.8  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4568  formate-dependent nitrite reductase, nrfD protein  29.28 
 
 		 313 aa  49.3  0.00009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2564  polysulphide reductase, NrfD  27.44 
 
 		 331 aa  48.5  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.564055  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1162  Polysulphide reductase NrfD  28.93 
 
 		 323 aa  45.8  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.130935  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2933  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  43.21 
 
 		 505 aa  45.4  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0613  polysulphide reductase, NrfD  26.27 
 
 		 313 aa  45.8  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0910  Polysulphide reductase NrfD  24.68 
 
 		 330 aa  43.9  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.241015  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0449  Polysulphide reductase NrfD  27.73 
 
 		 288 aa  43.1  0.007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1464  polysulphide reductase NrfD  28.79 
 
 		 347 aa  43.1  0.007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2044  polysulfide reductase, subunit C, putative  28.22 
 
 		 304 aa  43.1  0.007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.292161  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>