154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_0610 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013525  Tter_0610  Polysulphide reductase NrfD  100 
 
 		 309 aa  596  1e-169  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0862  cyclic nucleotide-binding protein  27.71 
 
 		 327 aa  95.1  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2044  polysulfide reductase, subunit C, putative  27.87 
 
 		 304 aa  94  3e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.292161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3577  Polysulphide reductase NrfD  36.02 
 
 		 361 aa  85.9  9e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.629636  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2429  cytochrome c nitrite reductase, NrfD subunit  28.53 
 
 		 320 aa  85.5  0.000000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3984  polysulphide reductase, NrfD  27.02 
 
 		 298 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1636  Polysulphide reductase NrfD  28.93 
 
 		 292 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.280095  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1337  Polysulphide reductase NrfD  27.16 
 
 		 304 aa  83.2  0.000000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.794344  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2917  Polysulphide reductase NrfD  30.16 
 
 		 297 aa  82.8  0.000000000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5602  polysulphide reductase, NrfD  34.2 
 
 		 315 aa  81.6  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0832881  normal  0.536935 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1874  polysulphide reductase, NrfD  26.38 
 
 		 309 aa  82  0.00000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.51495  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2318  tRNA uridine 5-carboxymethylaminomethyl modification enzyme GidA  29.6 
 
 		 294 aa  80.9  0.00000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0910  Polysulphide reductase NrfD  31.89 
 
 		 330 aa  80.9  0.00000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.241015  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4106  polysulphide reductase NrfD  30.38 
 
 		 311 aa  80.9  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.354906  normal  0.247792 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0822  polysulphide reductase, NrfD  33.51 
 
 		 399 aa  80.1  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0343  polysulphide reductase, NrfD  30.96 
 
 		 345 aa  80.1  0.00000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.443953  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2732  cytochrome c nitrite reductase, NrfD subunit  26.96 
 
 		 320 aa  80.5  0.00000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0870  Polysulphide reductase NrfD  32.81 
 
 		 399 aa  78.2  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1772  protein NrfD  29.86 
 
 		 323 aa  77.4  0.0000000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5278  Polysulphide reductase NrfD  34.76 
 
 		 323 aa  77  0.0000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5222  polysulphide reductase, NrfD  34.72 
 
 		 318 aa  76.3  0.0000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5310  polysulphide reductase, NrfD  34.72 
 
 		 318 aa  76.3  0.0000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.373187  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3359  Polysulphide reductase NrfD  29.49 
 
 		 313 aa  74.7  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000572761  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0509  polysulphide reductase, NrfD  26.2 
 
 		 314 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4539  cytochrome c nitrite reductase, NrfD subunit  26.84 
 
 		 318 aa  74.3  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3178  cytochrome c nitrite reductase, NrfD subunit  27.48 
 
 		 318 aa  74.3  0.000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.15313  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2293  polysulphide reductase, NrfD  35.05 
 
 		 373 aa  73.6  0.000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.882646  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0874  Polysulphide reductase NrfD  32.98 
 
 		 399 aa  73.2  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0498  polysulphide reductase, NrfD  24.68 
 
 		 315 aa  73.2  0.000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0700  Polysulphide reductase NrfD  27.19 
 
 		 318 aa  72.8  0.000000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.000000375278  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0613  polysulphide reductase, NrfD  28.11 
 
 		 313 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09620  formate-dependent nitrite reductase, membrane component  31.56 
 
 		 371 aa  72  0.00000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.79137  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2564  polysulphide reductase, NrfD  28.14 
 
 		 331 aa  71.2  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.564055  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0387  phosphatidylglycerophosphatase A  29.11 
 
 		 311 aa  71.2  0.00000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.682978  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4535  nrfD protein  26.03 
 
 		 318 aa  71.2  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4594  nrfD protein  26.03 
 
 		 318 aa  70.9  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3249  cytochrome c nitrite reductase, NrfD subunit  27.65 
 
 		 318 aa  71.2  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2179  Polysulphide reductase NrfD  29.35 
 
 		 345 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0952  polysulfide reductase, subunit C, putative  28.42 
 
 		 304 aa  70.1  0.00000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.18668  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03945  formate-dependent nitrite reductase, membrane subunit  26.03 
 
 		 318 aa  69.7  0.00000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3919  cytochrome c nitrite reductase, NrfD subunit  26.03 
 
 		 318 aa  69.7  0.00000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03905  hypothetical protein  26.03 
 
 		 318 aa  69.7  0.00000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4318  nrfD protein  26.03 
 
 		 318 aa  69.7  0.00000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4629  nrfD protein  26.03 
 
 		 318 aa  69.7  0.00000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04220  formate-dependent nitrite reductase, membrane component  34.9 
 
 		 412 aa  70.1  0.00000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0739759  normal  0.0894023 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3954  cytochrome c nitrite reductase, NrfD subunit  25.71 
 
 		 318 aa  70.1  0.00000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.790103 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0618  formate-dependent nitrite reductase membrane component-like  29.27 
 
 		 330 aa  68.9  0.00000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0787087  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4623  cytochrome c nitrite reductase NrfD subunit  26.53 
 
 		 318 aa  68.9  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.872874  normal  0.549107 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1798  Polysulphide reductase NrfD  26.89 
 
 		 391 aa  68.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3965  polysulphide reductase NrfD  27.27 
 
 		 313 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4625  cytochrome c nitrite reductase, NrfD subunit  25.82 
 
 		 318 aa  68.9  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4674  cytochrome c nitrite reductase, NrfD subunit  25.82 
 
 		 318 aa  68.2  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02723  hypothetical protein  23.94 
 
 		 323 aa  68.2  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003117  NrfD protein  25.08 
 
 		 323 aa  67.4  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.894563  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0860  polysulphide reductase NrfD  36.41 
 
 		 389 aa  67.4  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.104175 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4532  cytochrome c nitrite reductase, NrfD subunit  25 
 
 		 318 aa  67  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02110  formate-dependent nitrite reductase, membrane component  29.58 
 
 		 297 aa  67  0.0000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1872  Polysulphide reductase NrfD  29.87 
 
 		 287 aa  66.6  0.0000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0177217 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3442  polysulphide reductase, NrfD  26.2 
 
 		 314 aa  66.6  0.0000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1865  Polysulphide reductase NrfD  28.05 
 
 		 304 aa  66.6  0.0000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0342025 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5578  nrfD protein  25.4 
 
 		 318 aa  65.9  0.0000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3617  polysulphide reductase, NrfD  26.2 
 
 		 314 aa  65.9  0.0000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2000  cytochrome c-type biogenesis protein NrfD  25 
 
 		 318 aa  65.5  0.000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3779  polysulphide reductase, NrfD  26.45 
 
 		 315 aa  64.3  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.245778  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0533  polysulphide reductase NrfD  26.45 
 
 		 315 aa  64.3  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4045  polysulfide reductase, subunit C  25.49 
 
 		 313 aa  64.3  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0444  Polysulphide reductase NrfD  26.71 
 
 		 288 aa  64.3  0.000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.638298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0557  polysulphide reductase NrfD  27.01 
 
 		 315 aa  64.7  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0267  Polysulphide reductase NrfD  26.16 
 
 		 321 aa  64.3  0.000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0128763  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0933  Polysulphide reductase NrfD  28.62 
 
 		 314 aa  65.1  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.702618  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3997  polysulphide reductase NrfD  25.28 
 
 		 315 aa  64.3  0.000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0242  cytochrome c nitrite reductase, NrfD subunit  27.21 
 
 		 313 aa  63.9  0.000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0561  Polysulphide reductase NrfD  26.21 
 
 		 315 aa  63.5  0.000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0243  polysulphide reductase, NrfD  23.95 
 
 		 313 aa  63.2  0.000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5826  polysulphide reductase NrfD  34.76 
 
 		 385 aa  62.8  0.000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.122979  normal  0.087256 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2001  polysulphide reductase, NrfD  25.66 
 
 		 313 aa  62.8  0.000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.438759  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0613  polysulphide reductase, NrfD  26.69 
 
 		 315 aa  62  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0449  Polysulphide reductase NrfD  25.08 
 
 		 288 aa  62  0.00000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2456  Polysulphide reductase NrfD  25.46 
 
 		 300 aa  61.6  0.00000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1464  polysulphide reductase NrfD  27.05 
 
 		 347 aa  62  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4060  polysulfide reductase, subunit C  25.24 
 
 		 314 aa  61.6  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4568  formate-dependent nitrite reductase, nrfD protein  27.74 
 
 		 313 aa  61.2  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0346  Polysulphide reductase NrfD  33.13 
 
 		 346 aa  61.2  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1162  Polysulphide reductase NrfD  25.16 
 
 		 323 aa  61.2  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.130935  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1604  Polysulphide reductase NrfD  34.62 
 
 		 370 aa  59.7  0.00000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.110974  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4782  Polysulphide reductase NrfD  24.38 
 
 		 400 aa  58.9  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3175  polysulfide reductase, subunit C  25.84 
 
 		 328 aa  58.9  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3537  polysulphide reductase, NrfD  27.19 
 
 		 315 aa  58.2  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19170  formate-dependent nitrite reductase, membrane component  34.56 
 
 		 357 aa  57.8  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0135014  normal  0.524347 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0516  formate-dependent nitrite reductase, nrfD protein  27.27 
 
 		 313 aa  58.2  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16800  formate-dependent nitrite reductase, membrane component  25.1 
 
 		 334 aa  58.2  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3037  polysulphide reductase NrfD  27.39 
 
 		 315 aa  57.8  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1196  Polysulphide reductase NrfD  24.53 
 
 		 348 aa  57.8  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0484  formate-dependent nitrite reductase, nrfD protein  24.31 
 
 		 311 aa  57.4  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1637  Polysulphide reductase NrfD  29.64 
 
 		 285 aa  57  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000405044  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3872  polysulphide reductase NrfD  24.31 
 
 		 315 aa  57  0.0000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0023  Polysulphide reductase NrfD  34.15 
 
 		 366 aa  56.2  0.0000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.14854 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0309  Polysulphide reductase NrfD  27.3 
 
 		 299 aa  55.8  0.0000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000856639  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1916  polysulphide reductase  25.86 
 
 		 324 aa  54.3  0.000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0451  Polysulphide reductase NrfD  28.26 
 
 		 445 aa  54.3  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>