74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2293 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_2293  polysulphide reductase, NrfD  100 
 
 
373 aa  747    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.882646  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0822  polysulphide reductase, NrfD  41.16 
 
 
399 aa  173  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0870  Polysulphide reductase NrfD  52.66 
 
 
399 aa  162  7e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0874  Polysulphide reductase NrfD  52.22 
 
 
399 aa  154  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2179  Polysulphide reductase NrfD  36.36 
 
 
345 aa  147  3e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0860  polysulphide reductase NrfD  42.76 
 
 
389 aa  146  6e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.104175 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0346  Polysulphide reductase NrfD  39.74 
 
 
346 aa  144  2e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5278  Polysulphide reductase NrfD  37.7 
 
 
323 aa  140  3e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3730  polysulphide reductase NrfD  36.69 
 
 
326 aa  139  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0861929  normal  0.0225451 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0023  Polysulphide reductase NrfD  35.86 
 
 
366 aa  133  6e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.14854 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3577  Polysulphide reductase NrfD  34.55 
 
 
361 aa  131  2.0000000000000002e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.629636  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0862  cyclic nucleotide-binding protein  31.88 
 
 
327 aa  127  5e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1604  Polysulphide reductase NrfD  39.93 
 
 
370 aa  126  6e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.110974  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04220  formate-dependent nitrite reductase, membrane component  34.69 
 
 
412 aa  114  3e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0739759  normal  0.0894023 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5602  polysulphide reductase, NrfD  36.73 
 
 
315 aa  112  9e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0832881  normal  0.536935 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2726  polysulphide reductase, NrfD  48.85 
 
 
318 aa  107  5e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0680334  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09620  formate-dependent nitrite reductase, membrane component  32.23 
 
 
371 aa  106  6e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.79137  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5310  polysulphide reductase, NrfD  34.32 
 
 
318 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.373187  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5222  polysulphide reductase, NrfD  34.32 
 
 
318 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19170  formate-dependent nitrite reductase, membrane component  40 
 
 
357 aa  98.2  2e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0135014  normal  0.524347 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5826  polysulphide reductase NrfD  42.26 
 
 
385 aa  96.3  9e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.122979  normal  0.087256 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0610  Polysulphide reductase NrfD  35.05 
 
 
309 aa  78.6  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1772  protein NrfD  27.75 
 
 
323 aa  62.4  0.00000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3965  polysulphide reductase NrfD  26.75 
 
 
313 aa  59.3  0.00000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3359  Polysulphide reductase NrfD  26.88 
 
 
313 aa  57.4  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000572761  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0516  formate-dependent nitrite reductase, nrfD protein  26.2 
 
 
313 aa  57.4  0.0000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2564  polysulphide reductase, NrfD  30.65 
 
 
331 aa  56.2  0.0000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.564055  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1162  Polysulphide reductase NrfD  23.36 
 
 
323 aa  56.2  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.130935  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0387  phosphatidylglycerophosphatase A  27.57 
 
 
311 aa  55.8  0.000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.682978  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1207  Polysulphide reductase NrfD  28.07 
 
 
305 aa  55.1  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1464  polysulphide reductase NrfD  29.79 
 
 
347 aa  54.7  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1196  Polysulphide reductase NrfD  30.72 
 
 
348 aa  53.9  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1636  Polysulphide reductase NrfD  28.98 
 
 
292 aa  53.9  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.280095  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1424  Polysulphide reductase NrfD  30.25 
 
 
348 aa  53.5  0.000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.270293  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0557  polysulphide reductase NrfD  28.98 
 
 
315 aa  52.8  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0533  polysulphide reductase NrfD  29.94 
 
 
315 aa  52  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0613  polysulphide reductase, NrfD  28.41 
 
 
315 aa  51.6  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0910  Polysulphide reductase NrfD  31.61 
 
 
330 aa  51.2  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.241015  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3779  polysulphide reductase, NrfD  29.38 
 
 
315 aa  50.4  0.00005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.245778  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0267  Polysulphide reductase NrfD  29.32 
 
 
321 aa  50.4  0.00005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0128763  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1916  polysulphide reductase  29.38 
 
 
324 aa  49.7  0.00007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2917  Polysulphide reductase NrfD  26.52 
 
 
297 aa  49.7  0.00008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2044  polysulfide reductase, subunit C, putative  24.68 
 
 
304 aa  49.3  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.292161  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0561  Polysulphide reductase NrfD  27.68 
 
 
315 aa  48.9  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2423  polysulphide reductase, NrfD  29.01 
 
 
348 aa  49.3  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00497953  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0243  polysulphide reductase, NrfD  25.08 
 
 
313 aa  48.9  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0242  cytochrome c nitrite reductase, NrfD subunit  27.24 
 
 
313 aa  48.9  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0613  polysulphide reductase, NrfD  26.43 
 
 
313 aa  47.8  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0343  polysulphide reductase, NrfD  30.05 
 
 
345 aa  47.4  0.0004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.443953  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4045  polysulfide reductase, subunit C  27.37 
 
 
313 aa  47.4  0.0005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0509  polysulphide reductase, NrfD  25.33 
 
 
314 aa  46.6  0.0006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4568  formate-dependent nitrite reductase, nrfD protein  25.32 
 
 
313 aa  46.6  0.0008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0634  polysulphide reductase, NrfD  26.67 
 
 
364 aa  45.8  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00082842 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1798  Polysulphide reductase NrfD  28.29 
 
 
391 aa  46.2  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16800  formate-dependent nitrite reductase, membrane component  25.77 
 
 
334 aa  45.8  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2000  cytochrome c-type biogenesis protein NrfD  28.93 
 
 
318 aa  46.2  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3442  polysulphide reductase, NrfD  27.43 
 
 
314 aa  45.1  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3617  polysulphide reductase, NrfD  27.43 
 
 
314 aa  45.1  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0606  polysulphide reductase, NrfD  27.59 
 
 
313 aa  45.1  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.865603 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4245  polysulphide reductase NrfD  29.82 
 
 
347 aa  44.7  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.370954  normal  0.113587 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02723  hypothetical protein  27.18 
 
 
323 aa  44.3  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4060  polysulfide reductase, subunit C  27.27 
 
 
314 aa  43.9  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0952  polysulfide reductase, subunit C, putative  24.32 
 
 
304 aa  44.3  0.004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.18668  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2318  tRNA uridine 5-carboxymethylaminomethyl modification enzyme GidA  25.7 
 
 
294 aa  43.9  0.004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3861  polysulphide reductase NrfD  26.56 
 
 
360 aa  44.3  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.773503 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0034  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  26.41 
 
 
517 aa  44.3  0.004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1865  Polysulphide reductase NrfD  25 
 
 
304 aa  43.9  0.004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0342025 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1337  Polysulphide reductase NrfD  24.62 
 
 
304 aa  44.3  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.794344  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3037  polysulphide reductase NrfD  25.42 
 
 
315 aa  43.5  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0271  Polysulphide reductase NrfD  24.84 
 
 
322 aa  43.9  0.005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2001  polysulphide reductase, NrfD  26.29 
 
 
313 aa  43.5  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.438759  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1229  Polysulphide reductase NrfD  33.33 
 
 
304 aa  43.5  0.007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0634  polysulphide reductase, NrfD  26.15 
 
 
364 aa  42.7  0.009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00221682 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003117  NrfD protein  27.41 
 
 
323 aa  42.7  0.01  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.894563  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>