43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_04220 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_04220  formate-dependent nitrite reductase, membrane component  100 
 
 		 412 aa  795    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0739759  normal  0.0894023 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3577  Polysulphide reductase NrfD  56.65 
 
 		 361 aa  318  1e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.629636  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5278  Polysulphide reductase NrfD  54.23 
 
 		 323 aa  301  2e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09620  formate-dependent nitrite reductase, membrane component  49.25 
 
 		 371 aa  234  3e-60  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.79137  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1604  Polysulphide reductase NrfD  45.73 
 
 		 370 aa  221  1.9999999999999999e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.110974  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0023  Polysulphide reductase NrfD  43.77 
 
 		 366 aa  219  8.999999999999998e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.14854 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5222  polysulphide reductase, NrfD  43.67 
 
 		 318 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5310  polysulphide reductase, NrfD  43.67 
 
 		 318 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.373187  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0346  Polysulphide reductase NrfD  45.48 
 
 		 346 aa  193  4e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5602  polysulphide reductase, NrfD  44.41 
 
 		 315 aa  193  5e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0832881  normal  0.536935 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3730  polysulphide reductase NrfD  44.98 
 
 		 326 aa  192  9e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0861929  normal  0.0225451 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19170  formate-dependent nitrite reductase, membrane component  45.76 
 
 		 357 aa  175  9.999999999999999e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0135014  normal  0.524347 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0822  polysulphide reductase, NrfD  35.11 
 
 		 399 aa  138  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0870  Polysulphide reductase NrfD  35.69 
 
 		 399 aa  129  8.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2179  Polysulphide reductase NrfD  30.72 
 
 		 345 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0860  polysulphide reductase NrfD  35.71 
 
 		 389 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.104175 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0874  Polysulphide reductase NrfD  34.8 
 
 		 399 aa  120  6e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2726  polysulphide reductase, NrfD  42.19 
 
 		 318 aa  117  3e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0680334  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2293  polysulphide reductase, NrfD  35.19 
 
 		 373 aa  109  9.000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.882646  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5826  polysulphide reductase NrfD  40.11 
 
 		 385 aa  105  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.122979  normal  0.087256 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0862  cyclic nucleotide-binding protein  29.45 
 
 		 327 aa  85.5  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0610  Polysulphide reductase NrfD  35.03 
 
 		 309 aa  61.2  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1772  protein NrfD  28.64 
 
 		 323 aa  55.1  0.000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1196  Polysulphide reductase NrfD  34.44 
 
 		 348 aa  53.5  0.000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2172  cyclic nucleotide-binding protein  31.85 
 
 		 565 aa  52.4  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.653365  hitchhiker  0.000000233561 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1874  polysulphide reductase, NrfD  29.48 
 
 		 309 aa  52.4  0.00002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.51495  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0613  polysulphide reductase, NrfD  29.44 
 
 		 313 aa  52.4  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1613  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  29.44 
 
 		 531 aa  51.2  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4782  Polysulphide reductase NrfD  29.95 
 
 		 400 aa  51.2  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1798  Polysulphide reductase NrfD  34.71 
 
 		 391 aa  50.4  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4568  formate-dependent nitrite reductase, nrfD protein  29.76 
 
 		 313 aa  48.1  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3537  polysulphide reductase, NrfD  26.32 
 
 		 315 aa  47  0.0006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3617  polysulphide reductase, NrfD  28.48 
 
 		 314 aa  45.4  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0343  polysulphide reductase, NrfD  30.99 
 
 		 345 aa  45.1  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.443953  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0484  polysulphide reductase NrfD  24.84 
 
 		 315 aa  44.3  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.682806  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0613  polysulphide reductase, NrfD  28.31 
 
 		 315 aa  43.9  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0509  polysulphide reductase, NrfD  27.05 
 
 		 314 aa  43.9  0.006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2933  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.51 
 
 		 505 aa  43.9  0.006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0561  Polysulphide reductase NrfD  27.54 
 
 		 315 aa  43.5  0.007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1792  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  27.62 
 
 		 565 aa  43.5  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3442  polysulphide reductase, NrfD  30.56 
 
 		 314 aa  43.5  0.008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3965  polysulphide reductase NrfD  30.24 
 
 		 313 aa  43.1  0.008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0315  polysulphide reductase, NrfD  28.3 
 
 		 313 aa  43.1  0.008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.52148  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>