42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2726 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2726  polysulphide reductase, NrfD  100 
 
 		 318 aa  600  1.0000000000000001e-171  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0680334  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0023  Polysulphide reductase NrfD  52.38 
 
 		 366 aa  256  3e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.14854 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5310  polysulphide reductase, NrfD  46.91 
 
 		 318 aa  239  4e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.373187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5222  polysulphide reductase, NrfD  46.91 
 
 		 318 aa  239  4e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0346  Polysulphide reductase NrfD  52.04 
 
 		 346 aa  238  1e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5602  polysulphide reductase, NrfD  49.15 
 
 		 315 aa  233  3e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0832881  normal  0.536935 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1604  Polysulphide reductase NrfD  49.5 
 
 		 370 aa  223  3e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.110974  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5278  Polysulphide reductase NrfD  45 
 
 		 323 aa  223  4e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3730  polysulphide reductase NrfD  48.7 
 
 		 326 aa  221  1.9999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0861929  normal  0.0225451 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3577  Polysulphide reductase NrfD  39.43 
 
 		 361 aa  203  3e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.629636  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19170  formate-dependent nitrite reductase, membrane component  52.84 
 
 		 357 aa  201  9.999999999999999e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0135014  normal  0.524347 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04220  formate-dependent nitrite reductase, membrane component  41.36 
 
 		 412 aa  192  8e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0739759  normal  0.0894023 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0822  polysulphide reductase, NrfD  50.68 
 
 		 399 aa  188  1e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0870  Polysulphide reductase NrfD  49.17 
 
 		 399 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0860  polysulphide reductase NrfD  49.03 
 
 		 389 aa  182  7e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.104175 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0874  Polysulphide reductase NrfD  48.84 
 
 		 399 aa  176  5e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09620  formate-dependent nitrite reductase, membrane component  40.86 
 
 		 371 aa  171  1e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.79137  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2293  polysulphide reductase, NrfD  52.69 
 
 		 373 aa  152  7e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.882646  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2179  Polysulphide reductase NrfD  40.33 
 
 		 345 aa  152  8e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0862  cyclic nucleotide-binding protein  34.94 
 
 		 327 aa  130  3e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5826  polysulphide reductase NrfD  38.51 
 
 		 385 aa  106  5e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.122979  normal  0.087256 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0610  Polysulphide reductase NrfD  35.48 
 
 		 309 aa  72  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1464  polysulphide reductase NrfD  31.22 
 
 		 347 aa  54.3  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1196  Polysulphide reductase NrfD  30.91 
 
 		 348 aa  53.5  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1613  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  35.54 
 
 		 531 aa  52.8  0.000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1798  Polysulphide reductase NrfD  35.05 
 
 		 391 aa  49.7  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4106  polysulphide reductase NrfD  38.71 
 
 		 311 aa  48.9  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.354906  normal  0.247792 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0343  polysulphide reductase, NrfD  31.36 
 
 		 345 aa  48.9  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.443953  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0910  Polysulphide reductase NrfD  26.73 
 
 		 330 aa  48.1  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.241015  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2564  polysulphide reductase, NrfD  31.68 
 
 		 331 aa  47  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.564055  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1207  Polysulphide reductase NrfD  28.12 
 
 		 305 aa  45.8  0.0009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0825  hypothetical protein  32.74 
 
 		 320 aa  45.4  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.201019  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4782  Polysulphide reductase NrfD  32.14 
 
 		 400 aa  45.8  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3984  polysulphide reductase, NrfD  30.63 
 
 		 298 aa  45.8  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1424  Polysulphide reductase NrfD  34 
 
 		 348 aa  43.9  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.270293  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3245  polysulphide reductase, NrfD  23.64 
 
 		 298 aa  44.3  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.832914 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2423  polysulphide reductase, NrfD  34 
 
 		 348 aa  43.9  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00497953  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1636  Polysulphide reductase NrfD  32.73 
 
 		 292 aa  43.5  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.280095  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2044  polysulfide reductase, subunit C, putative  25.64 
 
 		 304 aa  43.5  0.005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.292161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1865  Polysulphide reductase NrfD  23.96 
 
 		 304 aa  43.1  0.007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0342025 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4568  formate-dependent nitrite reductase, nrfD protein  33.7 
 
 		 313 aa  42.7  0.008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1965  Fe-S-cluster-containing hydrogenase components 1-like  28.64 
 
 		 517 aa  42.4  0.01  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>