More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_2128 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_2128  Ribonuclease H  100 
 
 		 216 aa  426  1e-118  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.851112 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1792  ribonuclease H  97.69 
 
 		 216 aa  414  9.999999999999999e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.862706 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1744  Ribonuclease H  86.3 
 
 		 232 aa  360  7.0000000000000005e-99  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0818518  normal  0.411209 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3673  ribonuclease H  75 
 
 		 232 aa  250  1e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.279643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5363  ribonuclease H  67.19 
 
 		 209 aa  227  1e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0267673 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6079  ribonuclease HII/HIII  64.06 
 
 		 211 aa  221  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0936  ribonuclease HII  49.72 
 
 		 279 aa  139  3e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0120  ribonuclease HII  47.34 
 
 		 212 aa  138  6e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.105458 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1470  ribonuclease HII  47.34 
 
 		 212 aa  138  7e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.281309  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0391  ribonuclease H  48.89 
 
 		 199 aa  138  7.999999999999999e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.451839 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0963  ribonuclease HII  47.22 
 
 		 198 aa  135  4e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.765501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0067  ribonuclease HII  47.87 
 
 		 212 aa  131  6.999999999999999e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.970815 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0921  ribonuclease H  46.49 
 
 		 210 aa  131  9e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952016  normal  0.218653 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4934  ribonuclease HII  46.19 
 
 		 235 aa  131  9e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.207973  normal  0.116655 
 
 
-
 
NC_002978  WD1103  ribonuclease HII  39.79 
 
 		 198 aa  130  1.0000000000000001e-29  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0173  ribonuclease HII  38.89 
 
 		 209 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0516  ribonuclease HII  47.22 
 
 		 229 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.337743  normal  0.991257 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0560  ribonuclease HII  46.67 
 
 		 229 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2343  ribonuclease HII  49.44 
 
 		 292 aa  128  5.0000000000000004e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.391883 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0045  ribonuclease HII  37.02 
 
 		 181 aa  128  7.000000000000001e-29  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1282  ribonuclease HII  42.08 
 
 		 225 aa  127  1.0000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000227459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0011  ribonuclease HII  45.16 
 
 		 208 aa  126  3e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00000000150276  normal  0.177364 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2164  ribonuclease HII  49.48 
 
 		 203 aa  125  3e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.159466  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3209  ribonuclease HII  50 
 
 		 218 aa  125  3e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3221  ribonuclease HII  50 
 
 		 267 aa  126  3e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1837  ribonuclease HII  41.75 
 
 		 206 aa  125  4.0000000000000003e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3054  Ribonuclease H  39.38 
 
 		 197 aa  125  5e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4574  ribonuclease H  45.55 
 
 		 202 aa  125  7e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.690757 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0879  ribonuclease HII  43.85 
 
 		 215 aa  125  7e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00106841 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1696  ribonuclease HII  44.17 
 
 		 248 aa  124  8.000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.915201  normal  0.585229 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1166  ribonuclease HII  43.65 
 
 		 206 aa  124  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2441  ribonuclease HII  42.51 
 
 		 248 aa  124  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0813221  normal  0.0206101 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1724  hypothetical protein  40.22 
 
 		 196 aa  124  2e-27  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0420025 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0451  ribonuclease HII  46.67 
 
 		 216 aa  123  2e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.286866  normal  0.12494 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0018  ribonuclease HII  42.65 
 
 		 206 aa  123  2e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000692909  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0667  ribonuclease H  39.05 
 
 		 221 aa  122  3e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.368068  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5315  ribonuclease HII  44.75 
 
 		 214 aa  122  3e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.120662  normal  0.147211 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6072  ribonuclease HII  45.05 
 
 		 214 aa  122  3e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.236887  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0482  ribonuclease HII  44.86 
 
 		 211 aa  122  3e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2005  ribonuclease HII  45.05 
 
 		 214 aa  122  3e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3007  ribonuclease HII  45.83 
 
 		 224 aa  122  4e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.654478  normal  0.32816 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2025  ribonuclease HII  45.05 
 
 		 214 aa  122  4e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.179353  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1271  ribonuclease HII  45.3 
 
 		 210 aa  122  6e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.329181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1094  Ribonuclease H  44.81 
 
 		 205 aa  121  7e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1065  Ribonuclease H  44.81 
 
 		 205 aa  121  7e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0038  ribonuclease HII  40.21 
 
 		 205 aa  121  8e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1993  ribonuclease HII  40.2 
 
 		 206 aa  120  9.999999999999999e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2825  RNase HII  39.89 
 
 		 202 aa  120  9.999999999999999e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002761  ribonuclease HII  39.61 
 
 		 211 aa  120  1.9999999999999998e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4361  ribonuclease HII  49.44 
 
 		 266 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.4593  normal  0.0104654 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2871  ribonuclease HII  43.58 
 
 		 203 aa  119  3e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.035191  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03223  ribonuclease HII  38.65 
 
 		 212 aa  119  3e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1175  Ribonuclease H  46.99 
 
 		 202 aa  119  3e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0023  ribonuclease HII  46.35 
 
 		 206 aa  119  3.9999999999999996e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0404773  normal  0.332013 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0974  ribonuclease HII  37.7 
 
 		 206 aa  119  3.9999999999999996e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000438708  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2598  ribonuclease HII  48.33 
 
 		 258 aa  119  3.9999999999999996e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.354425 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2485  Ribonuclease H  40.2 
 
 		 198 aa  118  4.9999999999999996e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2681  ribonuclease HII  44.39 
 
 		 199 aa  119  4.9999999999999996e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.474695  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0736  ribonuclease HII  41.05 
 
 		 201 aa  118  6e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2568  ribonuclease HII  45.03 
 
 		 214 aa  118  6e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.446358  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1772  ribonuclease HII  41.79 
 
 		 208 aa  118  6e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0435907 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1237  ribonuclease HII  46.41 
 
 		 209 aa  118  7.999999999999999e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2571  ribonuclease HII  46.41 
 
 		 209 aa  118  7.999999999999999e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.480513  normal  0.0641 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0398  ribonuclease HII  46.32 
 
 		 220 aa  118  7.999999999999999e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2102  ribonuclease HII  45.56 
 
 		 210 aa  118  7.999999999999999e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.497942 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2422  ribonuclease HII  44.5 
 
 		 214 aa  117  9e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000428257  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38850  ribonuclease HII  45.86 
 
 		 207 aa  117  9.999999999999999e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.234048  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1452  ribonuclease HII  45.6 
 
 		 209 aa  117  9.999999999999999e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.44522 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0668  ribonuclease H  44.86 
 
 		 199 aa  117  9.999999999999999e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0544972  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2041  ribonuclease HII  44.5 
 
 		 214 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000010241  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0703  ribonuclease HII  45.9 
 
 		 258 aa  117  9.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.414695  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2038  ribonuclease HII  44.75 
 
 		 217 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.886397  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0386  ribonuclease HII  46.32 
 
 		 220 aa  116  1.9999999999999998e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1541  ribonuclease HII  44.5 
 
 		 214 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0283248  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1907  ribonuclease HII  44.75 
 
 		 217 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.420407 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3270  ribonuclease HII  44.5 
 
 		 214 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000000737319  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1313  ribonuclease HII  44.5 
 
 		 214 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00162066  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2041  ribonuclease HII  44.5 
 
 		 214 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00230414  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2478  ribonuclease HII  44.5 
 
 		 214 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0544675  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0703  ribonuclease H  43.33 
 
 		 269 aa  116  3e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.076303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0404  ribonuclease HII  38.25 
 
 		 203 aa  116  3e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.505687 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1678  ribonuclease HII  34.15 
 
 		 272 aa  115  3e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.652859  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1837  ribonuclease HII  46.96 
 
 		 240 aa  115  3.9999999999999997e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3147  ribonuclease HII  42.25 
 
 		 213 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.236655  normal  0.0126167 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0701  ribonuclease HII  40.11 
 
 		 195 aa  115  5e-25  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1960  ribonuclease HII  34.15 
 
 		 272 aa  115  6e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.317166  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2147  ribonuclease HII  43.06 
 
 		 220 aa  115  6e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07370  Ribonuclease H  40.32 
 
 		 308 aa  114  8.999999999999998e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000149287  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1702  ribonuclease HII  36.61 
 
 		 242 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.778683  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1266  ribonuclease HII  48.95 
 
 		 249 aa  114  1.0000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.672881 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2020  Ribonuclease H  42.93 
 
 		 197 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.395926  normal  0.178485 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0799  RNase HII  48.62 
 
 		 204 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0639  ribonuclease H  50.83 
 
 		 199 aa  114  1.0000000000000001e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.000711247  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1185  hypothetical protein  39.01 
 
 		 194 aa  114  1.0000000000000001e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.130682 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0508  RNase HII  41.18 
 
 		 213 aa  114  1.0000000000000001e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.261807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0018  ribonuclease HII  39.38 
 
 		 207 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000987865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2621  ribonuclease HII  43.96 
 
 		 208 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.322497  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1096  Ribonuclease H  38.46 
 
 		 277 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0149417  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0946  ribonuclease HII  38.67 
 
 		 209 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.630405  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1596  Ribonuclease H  44.75 
 
 		 208 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0869663 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>