More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0639 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_0639  ribonuclease H  100 
 
 		 199 aa  381  1e-105  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.000711247  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3007  ribonuclease HII  63.92 
 
 		 224 aa  221  7e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.654478  normal  0.32816 
 
 
-
 
NC_002978  WD1103  ribonuclease HII  50 
 
 		 198 aa  186  2e-46  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0120  ribonuclease HII  56.28 
 
 		 212 aa  186  2e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.105458 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1470  ribonuclease HII  56.28 
 
 		 212 aa  186  3e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.281309  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2650  ribonuclease HII  57.07 
 
 		 229 aa  182  2.0000000000000003e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2102  ribonuclease HII  56 
 
 		 210 aa  182  3e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.497942 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3209  ribonuclease HII  58.88 
 
 		 218 aa  181  5.0000000000000004e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1492  ribonuclease HII  50.27 
 
 		 202 aa  175  4e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1428  ribonuclease HII  50.27 
 
 		 202 aa  175  4e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.982643  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0391  ribonuclease H  52.82 
 
 		 199 aa  174  5e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.451839 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0067  ribonuclease HII  55.28 
 
 		 212 aa  175  5e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.970815 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0482  ribonuclease HII  53.76 
 
 		 211 aa  174  8e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0278  ribonuclease HII  53.3 
 
 		 283 aa  172  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0554  Ribonuclease H  52.76 
 
 		 214 aa  172  2.9999999999999996e-42  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.14554 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1531  Ribonuclease H  48.63 
 
 		 203 aa  172  3.9999999999999995e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00536473  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1166  ribonuclease HII  51.91 
 
 		 206 aa  171  5.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4574  ribonuclease H  54.12 
 
 		 202 aa  171  6.999999999999999e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.690757 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38850  ribonuclease HII  54.92 
 
 		 207 aa  170  1e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.234048  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0300  ribonuclease HII  53.3 
 
 		 283 aa  170  1e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0289  ribonuclease HII  52.75 
 
 		 283 aa  170  2e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.267831  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1324  ribonuclease HII  49.46 
 
 		 191 aa  168  5e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0173  ribonuclease HII  45.54 
 
 		 209 aa  168  5e-41  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0879  ribonuclease HII  54.4 
 
 		 215 aa  168  5e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00106841 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0508  RNase HII  51.23 
 
 		 213 aa  167  7e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.261807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1497  ribonuclease HII  54.64 
 
 		 201 aa  167  1e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17230  ribonuclease HII  54.64 
 
 		 201 aa  167  1e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1327  ribonuclease HII  48.39 
 
 		 191 aa  165  4e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2962  ribonuclease H  46.39 
 
 		 204 aa  165  4e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.118797 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3847  Ribonuclease H  48.91 
 
 		 208 aa  164  5.9999999999999996e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.297829  normal  0.541693 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03223  ribonuclease HII  48.63 
 
 		 212 aa  164  1.0000000000000001e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0706  ribonuclease HII  46.45 
 
 		 212 aa  162  2.0000000000000002e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2583  ribonuclease HII  50.82 
 
 		 199 aa  162  3e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.584045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1568  ribonuclease HII  47.87 
 
 		 214 aa  162  3e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0878508  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1989  ribonuclease HII  51.53 
 
 		 260 aa  162  4.0000000000000004e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002761  ribonuclease HII  48.9 
 
 		 211 aa  162  4.0000000000000004e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0154  RNase HII  50.82 
 
 		 198 aa  161  5.0000000000000005e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.142664  hitchhiker  0.0000294513 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0302  ribonuclease HII  52.82 
 
 		 338 aa  161  6e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0995743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1837  ribonuclease HII  52.17 
 
 		 240 aa  161  6e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2400  ribonuclease HII  48.04 
 
 		 254 aa  161  6e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.105442  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2871  ribonuclease HII  47.28 
 
 		 203 aa  160  8.000000000000001e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.035191  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1012  ribonuclease HII  42.78 
 
 		 253 aa  160  1e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0454013  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2621  ribonuclease HII  46.88 
 
 		 208 aa  160  1e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.322497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3039  ribonuclease HII  51.3 
 
 		 208 aa  160  1e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.982104  normal  0.582676 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3147  ribonuclease HII  47.21 
 
 		 213 aa  160  1e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.236655  normal  0.0126167 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2966  ribonuclease HII  49.73 
 
 		 198 aa  160  1e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.208356  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2534  ribonuclease H  48.39 
 
 		 227 aa  160  1e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2343  ribonuclease HII  51.26 
 
 		 292 aa  159  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.391883 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1096  Ribonuclease H  42.71 
 
 		 277 aa  159  2e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0149417  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0955  ribonuclease HII  51.37 
 
 		 198 aa  159  2e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0144418  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1160  ribonuclease HII  51.37 
 
 		 207 aa  159  2e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.392772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1357  ribonuclease HII  47.54 
 
 		 211 aa  159  2e-38  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1153  ribonuclease HII  51.63 
 
 		 206 aa  159  3e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.344887  normal  0.712948 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3421  ribonuclease HII  48.37 
 
 		 198 aa  158  4e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.329934  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3151  ribonuclease HII  51.37 
 
 		 198 aa  159  4e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0033757  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1027  ribonuclease HII  48.37 
 
 		 198 aa  158  4e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0812  ribonuclease HII  45.36 
 
 		 256 aa  158  5e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000539552  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3776  ribonuclease HII  49.73 
 
 		 197 aa  158  5e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0312514  hitchhiker  0.00441554 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2485  Ribonuclease H  51.67 
 
 		 198 aa  158  6e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1282  ribonuclease HII  50 
 
 		 225 aa  158  6e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000227459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0920  ribonuclease HII  43.59 
 
 		 255 aa  158  6e-38  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6108  Ribonuclease H  50.83 
 
 		 191 aa  157  7e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4068  ribonuclease HII  50.82 
 
 		 207 aa  157  7e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0312759 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1080  ribonuclease HII  48.37 
 
 		 198 aa  157  7e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0921  ribonuclease H  48.26 
 
 		 210 aa  157  8e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952016  normal  0.218653 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1237  ribonuclease HII  53.26 
 
 		 209 aa  157  1e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2571  ribonuclease HII  53.26 
 
 		 209 aa  157  1e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.480513  normal  0.0641 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1548  ribonuclease HII  49.73 
 
 		 217 aa  156  1e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3221  ribonuclease HII  52.26 
 
 		 267 aa  156  1e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_686  ribonuclease HII  46.15 
 
 		 211 aa  157  1e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0780  ribonuclease HII  45.6 
 
 		 211 aa  156  2e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1115  ribonuclease HII  47.67 
 
 		 213 aa  156  2e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4934  ribonuclease HII  53.26 
 
 		 235 aa  156  2e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.207973  normal  0.116655 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1605  ribonuclease HII  50.82 
 
 		 207 aa  155  3e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.388739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1204  ribonuclease HII  50 
 
 		 268 aa  155  3e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000113775  normal  0.267558 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2413  ribonuclease HII  46.99 
 
 		 207 aa  155  3e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3346  ribonuclease HII  49.73 
 
 		 198 aa  155  3e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.114641  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4172  ribonuclease HII  50.82 
 
 		 207 aa  155  3e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.709481  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1284  ribonuclease HII  48.91 
 
 		 212 aa  155  3e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.103887  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0765  ribonuclease HII  45.13 
 
 		 253 aa  155  3e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.587559  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3935  ribonuclease HII  44.67 
 
 		 257 aa  155  3e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000395689  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0023  ribonuclease HII  50.26 
 
 		 206 aa  155  4e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0404773  normal  0.332013 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0404  ribonuclease HII  45.9 
 
 		 203 aa  155  4e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.505687 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00181  ribonuclease HII  49.73 
 
 		 198 aa  155  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0135226  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3477  ribonuclease HII  49.73 
 
 		 198 aa  155  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000111932  normal  0.110141 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3660  ribonuclease HII  44.16 
 
 		 257 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00273984  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2681  ribonuclease HII  49.46 
 
 		 199 aa  155  5.0000000000000005e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.474695  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1481  Ribonuclease H  52.2 
 
 		 226 aa  155  5.0000000000000005e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.581957  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00180  hypothetical protein  49.73 
 
 		 198 aa  155  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.010735  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1175  Ribonuclease H  50.78 
 
 		 202 aa  154  7e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3757  ribonuclease HII  46.7 
 
 		 216 aa  154  8e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00155926  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2598  ribonuclease HII  50.75 
 
 		 258 aa  154  8e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.354425 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0667  ribonuclease H  51.32 
 
 		 221 aa  154  8e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.368068  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3420  Ribonuclease H  49.73 
 
 		 198 aa  154  9e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00118566  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0185  ribonuclease HII  49.73 
 
 		 198 aa  154  9e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000292767  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0187  ribonuclease HII  49.73 
 
 		 198 aa  154  9e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000269157  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1756  ribonuclease HII  53.26 
 
 		 196 aa  153  1e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.384083  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0193  ribonuclease HII  49.73 
 
 		 198 aa  154  1e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.614653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0176  ribonuclease HII  49.73 
 
 		 198 aa  154  1e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0723713  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0194  ribonuclease HII  49.73 
 
 		 198 aa  154  1e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00608058  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>