45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2693 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



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Replicon accession

Locus tag

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Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

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E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2693  hypothetical protein  100 
 
 
63 aa  130  5e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.21506  normal  0.157244 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1474  cell surface protein  78.79 
 
 
581 aa  56.6  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.12576  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1472  cell surface protein  86.67 
 
 
658 aa  56.6  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.055223  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0724  cell surface protein  78.79 
 
 
713 aa  55.8  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1479  cell surface protein  86.67 
 
 
669 aa  55.8  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1473  cell surface protein  60.42 
 
 
679 aa  55.5  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00112835  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1798  cell surface protein  71.43 
 
 
1300 aa  54.3  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1478  cell surface protein  75.76 
 
 
675 aa  54.3  0.0000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3736  hypothetical protein  71.43 
 
 
978 aa  53.9  0.0000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  68.57 
 
 
2036 aa  53.9  0.0000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.993129 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1993  cell surface protein  68.57 
 
 
1969 aa  53.9  0.0000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.147717  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0726  hypothetical protein  80 
 
 
560 aa  53.5  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1989  cell surface protein  68.57 
 
 
1241 aa  53.1  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.565549  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3738  putative surface layer protein  71.43 
 
 
575 aa  52.4  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.576213  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2136  cell surface protein  71.43 
 
 
1120 aa  52.4  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.641314  normal  0.113779 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  68.57 
 
 
1842 aa  52.4  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  68.57 
 
 
1682 aa  52  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0809  surface layer protein B  75.76 
 
 
735 aa  52.8  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  51.85 
 
 
2272 aa  51.6  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1995  cell surface protein  68.57 
 
 
1882 aa  52  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00993075  normal  0.508368 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2782  cell surface protein  68.57 
 
 
2122 aa  52  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.759691  hitchhiker  0.00484383 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1471  cell surface protein  76.67 
 
 
685 aa  51.2  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.133477  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  80 
 
 
752 aa  51.2  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2918  hypothetical protein  79.31 
 
 
791 aa  50.4  0.000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000682782 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2783  cell surface protein  65.71 
 
 
2000 aa  50.4  0.000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.992151  normal  0.0101574 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0725  hypothetical protein  76.67 
 
 
70 aa  48.1  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2794  hypothetical protein  67.65 
 
 
551 aa  47.8  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000111545 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2853  surface layer protein B  75.86 
 
 
547 aa  47.8  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0013219  hitchhiker  0.00194524 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  68.75 
 
 
1094 aa  47.4  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2692  hypothetical protein  70 
 
 
859 aa  46.2  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71129  normal  0.0975365 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  70 
 
 
1667 aa  46.2  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3575  putative surface layer protein  73.33 
 
 
561 aa  47  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.840675  normal  0.236267 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1627  hypothetical protein  63.64 
 
 
615 aa  47  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1626  hypothetical protein  72.41 
 
 
644 aa  47  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1794  cell surface protein  57.14 
 
 
1328 aa  46.2  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.193749  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1485  putative surface layer protein  50 
 
 
184 aa  45.4  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.461481  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2600  hypothetical protein  70.37 
 
 
178 aa  43.9  0.0008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00823962  normal  0.575459 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0859  PKD domain containing protein  54.55 
 
 
488 aa  43.5  0.0009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0425  PKD  70.37 
 
 
1231 aa  43.5  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  54.29 
 
 
930 aa  41.6  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0426  PKD  62.5 
 
 
816 aa  41.2  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1955  hypothetical protein  56.25 
 
 
1282 aa  41.2  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1907  PKD domain-containing protein  50 
 
 
910 aa  40.8  0.006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1764  PKD domain containing protein  50 
 
 
958 aa  40.4  0.009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3494  hypothetical protein  63.33 
 
 
861 aa  40  0.01  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00785016  normal  0.357624 
 
 
-
 
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