More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCAP_0192 on replicon NC_007633
Organism: Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007633  MCAP_0192  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 239 aa  476  1e-133  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7245  GntR family transcriptional regulator  23.79 
 
 		 286 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.375803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3704  GntR family transcriptional regulator  25.47 
 
 		 240 aa  58.9  0.00000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.317205 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2024  transcriptional regulator, GntR family  22.51 
 
 		 290 aa  57.4  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.205752  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1446  transcriptional regulator, GntR family  22.51 
 
 		 290 aa  57.4  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04882  histidine utilization repressor  28.57 
 
 		 234 aa  56.6  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4270  GntR family transcriptional regulator  22.32 
 
 		 254 aa  56.6  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00000212772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5870  GntR family transcriptional regulator  21.5 
 
 		 260 aa  55.8  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1232  GntR-like  32.93 
 
 		 252 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6600  GntR domain-containing protein  32.93 
 
 		 252 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.587938  normal  0.274665 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1664  GntR family transcriptional regulator  20.9 
 
 		 240 aa  55.8  0.0000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00697714  normal  0.132461 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04070  transcriptional regulator, GntR family  27.71 
 
 		 234 aa  55.5  0.0000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000763  2-aminoethylphosphonate uptake and metabolism regulator  27.89 
 
 		 233 aa  55.1  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3959  GntR family transcriptional regulator  22.33 
 
 		 219 aa  54.3  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0354607  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1319  GntR family transcriptional regulator  25 
 
 		 237 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.966684 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl316  transcription regulator  25.13 
 
 		 232 aa  53.5  0.000003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000386925  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1276  GntR family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 237 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.471351  normal  0.413626 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03128  histidine utilization repressor  30.94 
 
 		 246 aa  53.1  0.000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0165  GntR family transcriptional regulator  24.11 
 
 		 234 aa  53.1  0.000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.899806  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2122  transcriptional regulator, GntR family  25.43 
 
 		 244 aa  52.8  0.000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3772  GntR family transcriptional regulator  24.55 
 
 		 252 aa  52.4  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4392  GntR family transcriptional regulator  21.65 
 
 		 257 aa  52  0.000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.599846 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0910  histidine utilization repressor  27.96 
 
 		 245 aa  51.2  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0542  putative repressor protein PhnR  26.83 
 
 		 234 aa  50.8  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.706261  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1727  GntR family transcriptional regulator  25 
 
 		 237 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00877685 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1870  GntR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 476 aa  51.2  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0949  GntR family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 248 aa  50.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6308  GntR family transcriptional regulator  25.6 
 
 		 243 aa  51.2  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.818564  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1100  GntR family transcriptional regulator  23.6 
 
 		 253 aa  50.8  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1061  phosphonate metabolism transcriptional regulator PhnF  23.6 
 
 		 253 aa  50.8  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.488956  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2257  GntR family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 248 aa  50.4  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0943  regulatory protein GntR HTH  37.5 
 
 		 242 aa  50.4  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1100  GntR family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 248 aa  50.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.100378  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2130  GntR family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 248 aa  50.4  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0754  GntR family transcriptional regulator  24.57 
 
 		 248 aa  50.8  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.304598  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18050  transcriptional regulator, GntR family  36.23 
 
 		 232 aa  50.8  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0337814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14010  transcriptional regulator  23.08 
 
 		 253 aa  50.4  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.646916  normal  0.765571 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3992  GntR family transcriptional regulator  25 
 
 		 237 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.204883  normal  0.364758 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0552  GntR family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 248 aa  50.4  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.689242  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0946  GntR family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 248 aa  50.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.406281  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0291  GntR family transcriptional regulator  21.08 
 
 		 249 aa  50.4  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0913  GntR family transcriptional regulator  21.55 
 
 		 241 aa  50.4  0.00003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0856  GntR family transcriptional regulator  21.55 
 
 		 241 aa  50.4  0.00003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.333354  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0953  transcriptional regulator, GntR family  23.91 
 
 		 244 aa  50.1  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3004  transcriptional regulator, GntR family  29.11 
 
 		 252 aa  50.1  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000311693  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7380  putative transcriptional regulator, GntR family  44.64 
 
 		 251 aa  50.1  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.92051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2920  transcriptional regulator GntR  35.71 
 
 		 239 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.430067 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6745  GntR domain-containing protein  38.71 
 
 		 243 aa  49.7  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4206  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  28.57 
 
 		 249 aa  49.3  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1012  regulatory protein GntR HTH  34.48 
 
 		 370 aa  49.3  0.00006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2381  transcriptional regulator, GntR family  27.01 
 
 		 248 aa  48.9  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.770781 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2489  GntR family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 248 aa  48.9  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2288  transcriptional regulator, GntR family  27.01 
 
 		 248 aa  48.9  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.545924  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0929  GntR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 232 aa  48.9  0.00006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0628731  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2332  GntR family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 248 aa  48.9  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.491871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2377  GntR family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 248 aa  48.9  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0977965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4489  GntR family transcriptional regulator  24.83 
 
 		 236 aa  48.9  0.00007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.666836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0071  GntR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 496 aa  48.9  0.00007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1636  GntR domain-containing protein  39.71 
 
 		 266 aa  48.5  0.00008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000195276  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4094  transcriptional regulator, GntR family  22.51 
 
 		 261 aa  48.5  0.00008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4206  transcriptional regulator, GntR family  22.51 
 
 		 261 aa  48.5  0.00008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0704  histidine utilization repressor  25.3 
 
 		 234 aa  48.5  0.00009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.240109  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5703  transcriptional regulator GntR family  28.09 
 
 		 246 aa  48.5  0.00009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1063  transcriptional regulator, GntR family  24.36 
 
 		 242 aa  48.5  0.00009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.188898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0721  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  26.72 
 
 		 237 aa  47.8  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.274282  normal  0.4322 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3877  transcriptional regulator, GntR family  25.95 
 
 		 239 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.211891  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0972  GntR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 245 aa  48.1  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0552  GntR family transcriptional regulator  23.14 
 
 		 248 aa  48.1  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0339408 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5389  GntR family transcriptional regulator  22.86 
 
 		 260 aa  48.1  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1473  transcriptional regulator, GntR family  24.38 
 
 		 285 aa  47.8  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4644  GntR domain-containing protein  39.66 
 
 		 274 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.028465  normal  0.119949 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2915  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 		 249 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0076  transcriptional regulator, GntR family  30.3 
 
 		 235 aa  48.1  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.15859  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1823  histidine utilization repressor  25.65 
 
 		 267 aa  48.1  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.325999  normal  0.489419 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0151  GntR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 237 aa  48.1  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0732  GntR family transcriptional regulator  36 
 
 		 241 aa  48.1  0.0001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.128467  decreased coverage  0.000000465533 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0632  transcriptional regulator, GntR family  26.24 
 
 		 261 aa  48.1  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0543  trehalose operon repressor  29.01 
 
 		 235 aa  48.1  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.405615  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0527  trehalose operon transcriptional repressor  28.83 
 
 		 235 aa  48.1  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3526  transcriptional regulator  24.73 
 
 		 477 aa  48.1  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0763  GntR family transcriptional regulator  23.5 
 
 		 248 aa  47.8  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00237996 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5903  GntR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 288 aa  47.8  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.210517  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3752  GntR family transcriptional regulator  32 
 
 		 513 aa  47.4  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.840218  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0503  GntR domain protein  21.25 
 
 		 234 aa  47.4  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.232387 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1313  regulatory protein GntR HTH  29.63 
 
 		 232 aa  47.4  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4170  histidine utilization repressor  24.86 
 
 		 234 aa  47.8  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0447  GntR-like  29.7 
 
 		 264 aa  47.8  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1092  GntR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 238 aa  47  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.191594 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1002  transcriptional regulator, GntR family  26.24 
 
 		 248 aa  47.8  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0422  GntR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 240 aa  47.8  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0207613  normal  0.0264294 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2930  transcriptional regulator, GntR family  35.19 
 
 		 259 aa  47.4  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000160523  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4840  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  24.61 
 
 		 267 aa  47  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.180839 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3981  GntR domain-containing protein  50 
 
 		 233 aa  47.4  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2580  GntR family transcriptional regulator  22.75 
 
 		 258 aa  47.4  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.496201  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5125  GntR domain-containing protein  36.07 
 
 		 234 aa  47  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3829  GntR domain-containing protein  33.8 
 
 		 237 aa  47  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.710957  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2450  GntR family transcriptional regulator  22.75 
 
 		 258 aa  47.4  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000263261 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1877  GntR domain protein  37.1 
 
 		 236 aa  47.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.380896  normal  0.264595 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3856  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I protein  27.56 
 
 		 477 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5539  regulatory protein GntR HTH  40.35 
 
 		 237 aa  47  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>