More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_4052 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_1207  formyl-coenzyme A transferase  88.46 
 
 		 416 aa  760    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0710009 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0638  formyl-coenzyme A transferase  83.17 
 
 		 416 aa  701    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4486  formyl-coenzyme A transferase  78.38 
 
 		 423 aa  652    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1367  formyl-coenzyme A transferase  88.46 
 
 		 416 aa  760    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3617  formyl-coenzyme A transferase  84.13 
 
 		 416 aa  711    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.200752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4663  formyl-coenzyme A transferase  84.62 
 
 		 416 aa  712    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4840  formyl-coenzyme A transferase  94.95 
 
 		 416 aa  798    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.284165  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5582  formyl-coenzyme A transferase  90.38 
 
 		 416 aa  767    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.392607 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2801  formyl-coenzyme A transferase  77.91 
 
 		 423 aa  653    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.365022  normal  0.557329 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2760  formyl-coenzyme A transferase  85.34 
 
 		 416 aa  720    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0489  formyl-coenzyme A transferase  85.78 
 
 		 417 aa  726    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6741  formyl-coenzyme A transferase  85.1 
 
 		 416 aa  716    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.215977  normal  0.679038 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1146  formyl-coenzyme A transferase  88.22 
 
 		 416 aa  757    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4052  formyl-coenzyme A transferase  100 
 
 		 416 aa  864    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.739861  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2501  formyl-CoA transferase  73.44 
 
 		 425 aa  615  1e-175  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6032  formyl-coenzyme A transferase  68.75 
 
 		 415 aa  607  1e-173  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.763483 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2267  formyl-coenzyme A transferase  68.51 
 
 		 415 aa  608  1e-173  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3614  formyl-coenzyme A transferase  68.27 
 
 		 415 aa  599  1e-170  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4694  formyl-coenzyme A transferase  68.27 
 
 		 415 aa  599  1e-170  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.437044  normal  0.0320891 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0640  formyl-coenzyme A transferase  65.38 
 
 		 415 aa  593  1e-168  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4484  formyl-coenzyme A transferase  67.95 
 
 		 416 aa  589  1e-167  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02284  formyl-coenzyme A transferase  70.19 
 
 		 416 aa  582  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1283  formyl-CoA transferase  70.19 
 
 		 416 aa  582  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1295  formyl-coenzyme A transferase  70.19 
 
 		 416 aa  582  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02245  hypothetical protein  70.19 
 
 		 416 aa  582  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2524  formyl-coenzyme A transferase  70.19 
 
 		 416 aa  582  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.494058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2662  formyl-coenzyme A transferase  70.19 
 
 		 416 aa  582  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2511  formyl-coenzyme A transferase  70.19 
 
 		 416 aa  582  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.479078  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3606  formyl-coenzyme A transferase  69.95 
 
 		 416 aa  580  1e-164  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.480404 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2743  formyl-coenzyme A transferase  70.19 
 
 		 416 aa  581  1e-164  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2803  formyl-coenzyme A transferase  66.11 
 
 		 415 aa  577  1.0000000000000001e-163  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.36661  normal  0.554562 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3113  formyl-coenzyme A transferase  65.31 
 
 		 425 aa  565  1e-160  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.429937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2027  formyl-coenzyme A transferase  65.55 
 
 		 425 aa  561  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.203866 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2499  formyl-CoA transferase  63.94 
 
 		 412 aa  559  1e-158  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.934756  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3427  formyl-coenzyme A transferase  65.07 
 
 		 425 aa  560  1e-158  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.113815 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1854  formyl-coenzyme A transferase  65.55 
 
 		 426 aa  561  1e-158  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.780367 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2155  formyl-coenzyme A transferase  64.59 
 
 		 425 aa  558  1e-158  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.710897  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8713  formyl-coenzyme A transferase  65.31 
 
 		 425 aa  558  1e-158  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.670256  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2571  formyl-coenzyme A transferase  66.5 
 
 		 425 aa  556  1e-157  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.474909  normal  0.579933 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0487  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  65.31 
 
 		 425 aa  555  1e-157  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4823  formyl-coenzyme A transferase  66.5 
 
 		 425 aa  557  1e-157  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00285231  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2789  formyl-CoA transferase  63.64 
 
 		 425 aa  547  1e-154  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.490914  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1157  formyl-CoA transferase  63.88 
 
 		 429 aa  536  1e-151  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.766519  normal  0.43923 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1378  formyl-CoA transferase  63.64 
 
 		 429 aa  533  1e-150  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.712903  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1217  formyl-CoA transferase  63.64 
 
 		 429 aa  532  1e-150  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.345062 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4669  formyl-coenzyme A transferase  56.76 
 
 		 410 aa  474  1e-133  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4361  formyl-coenzyme A transferase  56.39 
 
 		 410 aa  472  1e-132  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0378127 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4121  formyl-CoA transferase  54.01 
 
 		 409 aa  448  1e-125  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1246  formyl-coenzyme A transferase  53.96 
 
 		 409 aa  449  1e-125  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0826548 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3108  putative formyl-CoA transferase  63 
 
 		 334 aa  421  1e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.14895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1217  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  70.24 
 
 		 290 aa  414  1e-114  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.263756  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0247  formyl-coenzyme A transferase  50.36 
 
 		 452 aa  389  1e-107  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000134335 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0495  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  56.62 
 
 		 284 aa  306  3e-82  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000445287  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3227  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  36.99 
 
 		 410 aa  248  2e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0244  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  35.58 
 
 		 395 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3421  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  33.33 
 
 		 416 aa  223  3e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5148  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  33.72 
 
 		 407 aa  223  4.9999999999999996e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.392977  normal  0.592286 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3751  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  36.01 
 
 		 388 aa  221  1.9999999999999999e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1038  Alpha-methylacyl-CoA racemase  33.17 
 
 		 413 aa  219  5e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000337447  normal  0.997405 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1218  formyl-coenzyme A transferase  85.47 
 
 		 117 aa  214  1.9999999999999998e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.437775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0683  Formyl-CoA transferase  35.12 
 
 		 416 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.521571  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0409  Formyl-CoA transferase  34.44 
 
 		 396 aa  212  9e-54  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3310  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  34.71 
 
 		 422 aa  211  2e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3860  Formyl-CoA transferase  33.25 
 
 		 396 aa  210  3e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0478269 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1080  Formyl-CoA transferase  34.47 
 
 		 419 aa  210  4e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.982565  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1673  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  33.8 
 
 		 406 aa  210  4e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.147245  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3824  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  35.53 
 
 		 423 aa  209  8e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.647007  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0558  Formyl-CoA transferase  33.18 
 
 		 396 aa  209  9e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4151  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  35.06 
 
 		 423 aa  208  1e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.387273  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0937  Formyl-CoA transferase  33.17 
 
 		 407 aa  208  2e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3495  Formyl-CoA transferase  31.53 
 
 		 402 aa  207  2e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.36601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3093  Formyl-CoA transferase  31.38 
 
 		 402 aa  208  2e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0159656  normal  0.100643 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0458  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  33.17 
 
 		 429 aa  208  2e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2971  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  32.2 
 
 		 419 aa  207  2e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.315436  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0047  Formyl-CoA transferase  32.13 
 
 		 412 aa  207  3e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.386629  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3563  Formyl-CoA transferase  29.98 
 
 		 399 aa  207  4e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6621  Formyl-CoA transferase  31.87 
 
 		 398 aa  206  5e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0212408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0039  Formyl-CoA transferase  32.13 
 
 		 406 aa  206  5e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7291  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  34.46 
 
 		 412 aa  206  6e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.402433 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0050  Formyl-CoA transferase  31.73 
 
 		 404 aa  205  1e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.337885 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1234  Formyl-CoA transferase  34.22 
 
 		 402 aa  205  1e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.704005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4420  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  34.04 
 
 		 413 aa  205  1e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00966775  normal  0.217151 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1698  succinyl-CoA:(R)-citramalate CoA-transferase  31.59 
 
 		 404 aa  205  1e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000862475  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3276  hypothetical protein  33.89 
 
 		 400 aa  204  2e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000379613  normal  0.0373612 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1057  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  32.94 
 
 		 395 aa  204  2e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0057  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  32.47 
 
 		 415 aa  204  2e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0206  Formyl-CoA transferase  32.85 
 
 		 393 aa  204  2e-51  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.640391 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3426  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  33.66 
 
 		 403 aa  204  3e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0253848 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0899  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  32.93 
 
 		 407 aa  204  3e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2980  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  33.64 
 
 		 418 aa  202  6e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2408  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  33.64 
 
 		 418 aa  202  6e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6300  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  32.39 
 
 		 399 aa  202  9e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5106  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  33.49 
 
 		 407 aa  202  9e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.912284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0899  Formyl-CoA transferase  31.4 
 
 		 427 aa  202  9.999999999999999e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24920  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  35.66 
 
 		 407 aa  202  9.999999999999999e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.534139  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2484  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  32.79 
 
 		 407 aa  202  9.999999999999999e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0601081  normal  0.0181338 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5109  putative L-carnitine dehydrogenase  33.41 
 
 		 408 aa  202  9.999999999999999e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.367445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3087  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  32.53 
 
 		 411 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2644  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  33.89 
 
 		 412 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0846  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  33.58 
 
 		 415 aa  201  1.9999999999999998e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>