More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4669 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B4669  formyl-coenzyme A transferase  100 
 
 		 410 aa  843    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4361  formyl-coenzyme A transferase  85.37 
 
 		 410 aa  739    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0378127 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1246  formyl-coenzyme A transferase  67.32 
 
 		 409 aa  566  1e-160  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0826548 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2267  formyl-coenzyme A transferase  61.99 
 
 		 415 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4121  formyl-CoA transferase  66.41 
 
 		 409 aa  537  1e-151  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6032  formyl-coenzyme A transferase  61.99 
 
 		 415 aa  536  1e-151  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.763483 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2155  formyl-coenzyme A transferase  62.8 
 
 		 425 aa  531  1e-150  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.710897  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0640  formyl-coenzyme A transferase  63.24 
 
 		 415 aa  534  1e-150  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3113  formyl-coenzyme A transferase  62.32 
 
 		 425 aa  532  1e-150  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.429937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4694  formyl-coenzyme A transferase  61.26 
 
 		 415 aa  530  1e-149  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.437044  normal  0.0320891 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3614  formyl-coenzyme A transferase  61.26 
 
 		 415 aa  530  1e-149  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0487  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  62.32 
 
 		 425 aa  526  1e-148  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3427  formyl-coenzyme A transferase  62.32 
 
 		 425 aa  523  1e-147  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.113815 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2027  formyl-coenzyme A transferase  62.32 
 
 		 425 aa  523  1e-147  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.203866 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2571  formyl-coenzyme A transferase  61.11 
 
 		 425 aa  518  1e-146  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.474909  normal  0.579933 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1854  formyl-coenzyme A transferase  61.59 
 
 		 426 aa  519  1e-146  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.780367 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2789  formyl-CoA transferase  59.9 
 
 		 425 aa  511  1e-144  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.490914  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4823  formyl-coenzyme A transferase  60.63 
 
 		 425 aa  511  1e-144  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00285231  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8713  formyl-coenzyme A transferase  60.39 
 
 		 425 aa  512  1e-144  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.670256  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4484  formyl-coenzyme A transferase  58.65 
 
 		 416 aa  504  1e-141  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2803  formyl-coenzyme A transferase  59.31 
 
 		 415 aa  503  1e-141  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.36661  normal  0.554562 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2499  formyl-CoA transferase  58.77 
 
 		 412 aa  493  9.999999999999999e-139  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.934756  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1157  formyl-CoA transferase  59.18 
 
 		 429 aa  486  1e-136  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.766519  normal  0.43923 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1217  formyl-CoA transferase  58.94 
 
 		 429 aa  483  1e-135  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.345062 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1378  formyl-CoA transferase  58.94 
 
 		 429 aa  484  1e-135  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.712903  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5582  formyl-coenzyme A transferase  57.73 
 
 		 416 aa  463  1e-129  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.392607 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1207  formyl-coenzyme A transferase  57.52 
 
 		 416 aa  457  1e-127  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0710009 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0638  formyl-coenzyme A transferase  56.28 
 
 		 416 aa  455  1e-127  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1367  formyl-coenzyme A transferase  57.52 
 
 		 416 aa  457  1e-127  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1146  formyl-coenzyme A transferase  56.55 
 
 		 416 aa  451  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3617  formyl-coenzyme A transferase  55.56 
 
 		 416 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.200752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4052  formyl-coenzyme A transferase  56.76 
 
 		 416 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.739861  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4840  formyl-coenzyme A transferase  57 
 
 		 416 aa  451  1e-125  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.284165  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0489  formyl-coenzyme A transferase  55.23 
 
 		 417 aa  445  1.0000000000000001e-124  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6741  formyl-coenzyme A transferase  55.31 
 
 		 416 aa  443  1e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.215977  normal  0.679038 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4486  formyl-coenzyme A transferase  54.37 
 
 		 423 aa  442  1e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2760  formyl-coenzyme A transferase  55.07 
 
 		 416 aa  442  1e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4663  formyl-coenzyme A transferase  54.3 
 
 		 416 aa  439  9.999999999999999e-123  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2801  formyl-coenzyme A transferase  53.9 
 
 		 423 aa  435  1e-121  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.365022  normal  0.557329 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02284  formyl-coenzyme A transferase  54.13 
 
 		 416 aa  412  1e-114  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1283  formyl-CoA transferase  54.13 
 
 		 416 aa  412  1e-114  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3606  formyl-coenzyme A transferase  54.37 
 
 		 416 aa  413  1e-114  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.480404 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1295  formyl-coenzyme A transferase  54.13 
 
 		 416 aa  412  1e-114  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02245  hypothetical protein  54.13 
 
 		 416 aa  412  1e-114  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2662  formyl-coenzyme A transferase  54.13 
 
 		 416 aa  412  1e-114  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2524  formyl-coenzyme A transferase  54.13 
 
 		 416 aa  412  1e-114  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.494058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2511  formyl-coenzyme A transferase  54.13 
 
 		 416 aa  412  1e-114  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.479078  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2743  formyl-coenzyme A transferase  54.13 
 
 		 416 aa  411  1e-113  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2501  formyl-CoA transferase  51.56 
 
 		 425 aa  409  1e-113  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3108  putative formyl-CoA transferase  60.62 
 
 		 334 aa  400  9.999999999999999e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.14895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0247  formyl-coenzyme A transferase  44.08 
 
 		 452 aa  322  9.000000000000001e-87  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000134335 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1217  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  57.54 
 
 		 290 aa  300  4e-80  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.263756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0495  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  49.45 
 
 		 284 aa  253  3e-66  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000445287  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0244  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  38.27 
 
 		 395 aa  246  6.999999999999999e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1673  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  37.68 
 
 		 406 aa  238  2e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.147245  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1581  Formyl-CoA transferase  38.15 
 
 		 413 aa  231  2e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.102552  hitchhiker  0.00374434 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0846  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  35.65 
 
 		 415 aa  225  9e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3824  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  37.23 
 
 		 423 aa  225  1e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.647007  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7291  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  36.96 
 
 		 412 aa  224  2e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.402433 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3227  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  36.04 
 
 		 410 aa  222  9e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0118  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  35.71 
 
 		 406 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000440239  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0159  CAIB/BAIF family protein  35.48 
 
 		 406 aa  220  3e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  unclonable  0.0000839359  hitchhiker  0.0000973372 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6621  Formyl-CoA transferase  34.96 
 
 		 398 aa  220  3e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0212408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5148  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  35.07 
 
 		 407 aa  220  3e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.392977  normal  0.592286 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0178  Formyl-CoA transferase  35.24 
 
 		 406 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  unclonable  0.0000000000710796  normal  0.705206 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0176  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  35 
 
 		 406 aa  220  5e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000247826  normal  0.235552 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0872  Formyl-CoA transferase  36.03 
 
 		 397 aa  219  6e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00148474  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4151  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  36.96 
 
 		 423 aa  219  7.999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.387273  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2211  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  33.99 
 
 		 426 aa  218  1e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.859864 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5877  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  33.49 
 
 		 422 aa  217  2.9999999999999998e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0281  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  34.13 
 
 		 424 aa  216  7e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0409  Formyl-CoA transferase  36.67 
 
 		 396 aa  215  9.999999999999999e-55  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5067  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  35.66 
 
 		 406 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000000803065  hitchhiker  0.00823437 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0899  Formyl-CoA transferase  34.44 
 
 		 427 aa  215  9.999999999999999e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24920  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  36.32 
 
 		 407 aa  214  1.9999999999999998e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.534139  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2644  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  35.59 
 
 		 412 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4428  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  35 
 
 		 407 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000000922953  normal  0.414571 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3421  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  35.54 
 
 		 416 aa  214  2.9999999999999995e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4420  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  35.58 
 
 		 413 aa  214  2.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00966775  normal  0.217151 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5460  CAIB/BAIF family protein  34.68 
 
 		 406 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0019674  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1900  CAIB/BAIF family protein  37.1 
 
 		 401 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.894155  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0204  Alpha-methylacyl-CoA racemase  34.67 
 
 		 435 aa  212  9e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0491396  normal  0.983612 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3414  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  34.23 
 
 		 412 aa  212  1e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0057  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  35.05 
 
 		 415 aa  211  2e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6581  acyl-CoA transferase/carnitine dehydratase  37.19 
 
 		 385 aa  211  2e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.377335  normal  0.24257 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3771  Formyl-CoA transferase  32.92 
 
 		 395 aa  211  2e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.531066  normal  0.292423 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0143  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  34.14 
 
 		 413 aa  211  2e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.235606 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2745  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  35.77 
 
 		 418 aa  211  3e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3871  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  35.04 
 
 		 397 aa  210  3e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.39623  normal  0.242924 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6417  Formyl-CoA transferase  31.71 
 
 		 418 aa  210  5e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.478883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0849  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  34.2 
 
 		 433 aa  209  5e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0223  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  34.59 
 
 		 415 aa  209  6e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.16835 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2908  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  33.33 
 
 		 411 aa  209  7e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.35571  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2730  acyl-CoA transferases/carnitine dehydratase  33.81 
 
 		 405 aa  209  7e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.743365  normal  0.0955095 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0830  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  33.81 
 
 		 406 aa  209  8e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0441069  normal  0.0516739 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5748  Formyl-CoA transferase  35.75 
 
 		 397 aa  209  9e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0050  Formyl-CoA transferase  34.06 
 
 		 404 aa  209  9e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.337885 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1386  hypothetical protein  34.31 
 
 		 399 aa  209  1e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0255273  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1621  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  34.87 
 
 		 396 aa  208  1e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2751  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  32.84 
 
 		 416 aa  208  2e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.31729 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>