More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_1295 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02284  formyl-coenzyme A transferase  100 
 
 		 416 aa  869    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1283  formyl-CoA transferase  100 
 
 		 416 aa  869    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2743  formyl-coenzyme A transferase  99.76 
 
 		 416 aa  868    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2662  formyl-coenzyme A transferase  100 
 
 		 416 aa  869    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02245  hypothetical protein  100 
 
 		 416 aa  869    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2511  formyl-coenzyme A transferase  100 
 
 		 416 aa  869    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.479078  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2524  formyl-coenzyme A transferase  100 
 
 		 416 aa  869    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.494058  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3606  formyl-coenzyme A transferase  99.76 
 
 		 416 aa  868    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.480404 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1295  formyl-coenzyme A transferase  100 
 
 		 416 aa  869    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3617  formyl-coenzyme A transferase  70.91 
 
 		 416 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.200752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4663  formyl-coenzyme A transferase  70.19 
 
 		 416 aa  608  1e-173  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0489  formyl-coenzyme A transferase  71.08 
 
 		 417 aa  605  9.999999999999999e-173  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2760  formyl-coenzyme A transferase  69.95 
 
 		 416 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6741  formyl-coenzyme A transferase  69.71 
 
 		 416 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.215977  normal  0.679038 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4052  formyl-coenzyme A transferase  70.19 
 
 		 416 aa  595  1e-169  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.739861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0638  formyl-coenzyme A transferase  68.99 
 
 		 416 aa  596  1e-169  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1146  formyl-coenzyme A transferase  69.71 
 
 		 416 aa  591  1e-168  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5582  formyl-coenzyme A transferase  68.99 
 
 		 416 aa  585  1e-166  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.392607 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4840  formyl-coenzyme A transferase  69.95 
 
 		 416 aa  587  1e-166  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.284165  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1367  formyl-coenzyme A transferase  68.75 
 
 		 416 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1207  formyl-coenzyme A transferase  68.75 
 
 		 416 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0710009 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2267  formyl-coenzyme A transferase  64.42 
 
 		 415 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6032  formyl-coenzyme A transferase  64.18 
 
 		 415 aa  581  1.0000000000000001e-165  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.763483 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2801  formyl-coenzyme A transferase  67.22 
 
 		 423 aa  574  1.0000000000000001e-163  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.365022  normal  0.557329 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0640  formyl-coenzyme A transferase  62.26 
 
 		 415 aa  576  1.0000000000000001e-163  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2501  formyl-CoA transferase  67.46 
 
 		 425 aa  572  1.0000000000000001e-162  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4694  formyl-coenzyme A transferase  62.74 
 
 		 415 aa  559  1e-158  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.437044  normal  0.0320891 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4484  formyl-coenzyme A transferase  63.13 
 
 		 416 aa  558  1e-158  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3614  formyl-coenzyme A transferase  62.74 
 
 		 415 aa  559  1e-158  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4486  formyl-coenzyme A transferase  66.51 
 
 		 423 aa  557  1e-157  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2803  formyl-coenzyme A transferase  62.02 
 
 		 415 aa  551  1e-156  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.36661  normal  0.554562 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0487  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  62.2 
 
 		 425 aa  531  1e-150  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8713  formyl-coenzyme A transferase  61.72 
 
 		 425 aa  529  1e-149  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.670256  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2027  formyl-coenzyme A transferase  62.44 
 
 		 425 aa  531  1e-149  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.203866 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4823  formyl-coenzyme A transferase  61.96 
 
 		 425 aa  529  1e-149  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00285231  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3113  formyl-coenzyme A transferase  60.77 
 
 		 425 aa  530  1e-149  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.429937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2571  formyl-coenzyme A transferase  61.24 
 
 		 425 aa  530  1e-149  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.474909  normal  0.579933 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2499  formyl-CoA transferase  60.1 
 
 		 412 aa  524  1e-147  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.934756  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3427  formyl-coenzyme A transferase  61 
 
 		 425 aa  522  1e-147  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.113815 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2789  formyl-CoA transferase  59.09 
 
 		 425 aa  520  1e-146  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.490914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1854  formyl-coenzyme A transferase  60.29 
 
 		 426 aa  519  1e-146  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.780367 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2155  formyl-coenzyme A transferase  61.15 
 
 		 425 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.710897  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1157  formyl-CoA transferase  59.9 
 
 		 429 aa  504  1e-141  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.766519  normal  0.43923 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1378  formyl-CoA transferase  59.9 
 
 		 429 aa  503  1e-141  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.712903  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1217  formyl-CoA transferase  59.9 
 
 		 429 aa  503  1e-141  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.345062 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4361  formyl-coenzyme A transferase  53.4 
 
 		 410 aa  454  1.0000000000000001e-126  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0378127 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4669  formyl-coenzyme A transferase  54.13 
 
 		 410 aa  449  1e-125  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4121  formyl-CoA transferase  54.2 
 
 		 409 aa  446  1.0000000000000001e-124  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0247  formyl-coenzyme A transferase  53.27 
 
 		 452 aa  416  9.999999999999999e-116  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000134335 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1246  formyl-coenzyme A transferase  51.08 
 
 		 409 aa  413  1e-114  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0826548 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3108  putative formyl-CoA transferase  58.72 
 
 		 334 aa  392  1e-108  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.14895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1217  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  66.44 
 
 		 290 aa  389  1e-107  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.263756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0495  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  58.76 
 
 		 284 aa  315  9.999999999999999e-85  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000445287  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1038  Alpha-methylacyl-CoA racemase  33.65 
 
 		 413 aa  232  9e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000337447  normal  0.997405 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0244  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  35.01 
 
 		 395 aa  231  2e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3227  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  34.2 
 
 		 410 aa  218  1e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2971  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  33.58 
 
 		 419 aa  218  1e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.315436  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5109  putative L-carnitine dehydrogenase  33.72 
 
 		 408 aa  216  4e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.367445  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0683  Formyl-CoA transferase  34.7 
 
 		 416 aa  217  4e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.521571  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4160  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  32.94 
 
 		 407 aa  216  5e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3824  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  35.22 
 
 		 423 aa  215  9.999999999999999e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.647007  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0558  Formyl-CoA transferase  32.45 
 
 		 396 aa  215  9.999999999999999e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4151  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  34.82 
 
 		 423 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.387273  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0047  Formyl-CoA transferase  31.89 
 
 		 412 aa  213  3.9999999999999995e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.386629  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3860  Formyl-CoA transferase  32.69 
 
 		 396 aa  213  5.999999999999999e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0478269 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1057  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  33.09 
 
 		 395 aa  210  3e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4420  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  34.04 
 
 		 413 aa  210  3e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00966775  normal  0.217151 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3751  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  32.52 
 
 		 388 aa  209  6e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0039  Formyl-CoA transferase  31.89 
 
 		 406 aa  209  7e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0204  Alpha-methylacyl-CoA racemase  33.26 
 
 		 435 aa  208  2e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0491396  normal  0.983612 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1080  Formyl-CoA transferase  32.77 
 
 		 419 aa  206  4e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.982565  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0937  Formyl-CoA transferase  33.65 
 
 		 407 aa  206  5e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5148  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  32.09 
 
 		 407 aa  206  5e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.392977  normal  0.592286 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0409  Formyl-CoA transferase  32.78 
 
 		 396 aa  206  5e-52  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1673  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  33.88 
 
 		 406 aa  206  7e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.147245  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0458  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  33.65 
 
 		 429 aa  206  7e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1735  Formyl-CoA transferase  33.74 
 
 		 448 aa  205  1e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.186489 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2408  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  35.62 
 
 		 418 aa  205  1e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7291  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  32.55 
 
 		 412 aa  205  1e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.402433 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2980  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  35.62 
 
 		 418 aa  205  1e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0846  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  33.25 
 
 		 415 aa  204  2e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2751  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  31.5 
 
 		 416 aa  204  2e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.31729 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3421  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  31.25 
 
 		 416 aa  204  3e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1422  CAIB/BAIF family protein  31.76 
 
 		 568 aa  203  4e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.498676  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0894  CAIB/BAIF family protein  31.76 
 
 		 577 aa  203  4e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.846716  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3310  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  32.28 
 
 		 422 aa  203  4e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0704  CAIB/BAIF family protein  32 
 
 		 406 aa  203  5e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.504433  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1635  CAIB/BAIF family protein  32 
 
 		 406 aa  203  5e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0382163  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1814  CAIB/BAIF family protein  31.76 
 
 		 544 aa  203  5e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00543882  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0456  CAIB/BAIF family protein  32 
 
 		 406 aa  203  5e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.367298  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1658  CAIB/BAIF family protein  32 
 
 		 406 aa  203  5e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0837995  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5625  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  32.6 
 
 		 415 aa  203  5e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.344287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0899  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  33.41 
 
 		 407 aa  203  6e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3330  formyl-CoA transferase  31.25 
 
 		 411 aa  202  7e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1907  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  32.94 
 
 		 452 aa  202  7e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.323218 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0050  Formyl-CoA transferase  31.58 
 
 		 404 aa  202  9.999999999999999e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.337885 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1329  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  31.98 
 
 		 423 aa  201  1.9999999999999998e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.94269  normal  0.646992 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03190  expressed protein  33.18 
 
 		 450 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0170398  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0057  L-carnitine dehydratase/bile acid-inducible protein F  32.54 
 
 		 415 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1581  Formyl-CoA transferase  34.19 
 
 		 413 aa  200  3.9999999999999996e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.102552  hitchhiker  0.00374434 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>